2019年発行分
第69号 2019年10月15日発行
(PDF 5,704KB) (冊子用 PDF 5,647KB) |
【目次】
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参考文献・リンク ニュースレターの記事を書くにあたり参考にした論文やウェブサイトの一覧です。 一部に専門的な論文なども含まれますが、記事には載せることのできなかった写真なども掲載されています。 |
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藻類のオイル生産を制御する遺伝子 | LIPID REMODELING REGULATOR 1 (LRL1) is differently involved in the phosphorus-depletion response from PSR1 in Chlamydomonas reinhardtii. Hidayati NA. et.al, The Plant Journal (2019) DOI:10.1111/tpj.14473 東京工業大学プレスリリース https://www.titech.ac.jp/news/2019/044801.html |
シャインマスカットのゲノム解読 | De novo whole-genome assembly in interspecific hybrid table grape, ‘Shine Muscat’. Shirasawa K. et.al, BioRχiv (2019) DOI:10.1101/730762 かずさDNA研究所プレスリリース https://www.kazusa.or.jp/news/190822/ |
キンギョのゲノム解読 | De Novo assembly of the goldfish (Carassius auratus) genome and the evolution of genes afterwhole genome duplication. Chen Z. et.al. Science Advances (2019) DOI:10.1126/sciadv.aav0547 大阪大学プレスリリース https://resou.osaka-u.ac.jp/ja/research/2019/20190627_1 |
雌雄の産み分け | Activation of Toll-like receptor 7/8 encoded by the X chromosome alters sperm motility and provides a novel simple technology for sexing sperm. Umehara T. et.al. PLOS Biology (2019) DOI:10.1371/journal.pbio.3000398 広島大学プレスリリース https://www.hiroshima-u.ac.jp/news/52779 |
ショートスリーパー遺伝子 | A Rare Mutation of β1-Adrenergic Receptor Affects Sleep/Wake Behaviors. Shi G. et.al. Neuron (2019) DOI:10.1016/j.neuron.2019.07.026 カリフォルニア大学サンフランシスコ校HPの紹介文(英語) https://www.ucsf.edu/news/2019/08/415261/after-10-year-search-scientists-find-second-short-sleep-gene |
第68号 2019年7月15日発行
(PDF 2,873KB) (冊子用 PDF 2,903KB) |
【目次】
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参考文献・リンク ニュースレターの記事を書くにあたり参考にした論文やウェブサイトの一覧です。 一部に専門的な論文なども含まれますが、記事には載せることのできなかった写真なども掲載されています。 |
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Kazusa Lab. | Plant GARDEN(β版) https://plantgarden.jp/app/pc_01.html |
かずさ遺伝子検査室 | https://www.kazusa.or.jp/genetest/ |
野生ダイズのゲノム解読 | A reference-grade wild soybean genome. Xie M. et.al. Nature communications (2019) DOI: 10.1038/s41467-019-09142-9 |
ラッカセイ栽培種のゲノム解読 | The genome sequence of segmental allotetraploid peanut Arachis hypogaea. Bertioli D.J. et.al. Nature Genetics (2019) DOI:10.1038/s41588-019-0405-z |
一般向けゲノム解析ツール:Hayai-Annotation | Hayai-Annotation Plants: an ultra-fast and comprehensive functional gene annotation system in plants. Ghelfi A., Shirasawa K., Hirakawa H. and Isobe S. Bioinformatics (2019) DOI:10.1093/bioinformatics/btz380 Hayai-Annotation Plants https://github.com/kdri-genomics/Hayai-Annotation-Plants |
貝の巻き方は遺伝子が決める!? | The development of CRISPR for a mollusc establishes the formin Lsdia1 as the long-sought gene for snail dextral/sinistral coiling Abe M, and Kuroda R. Development (2019) DOI:10.1242/dev.175976 |
カブトムシの角をつくる遺伝子 | Precise staging of beetle horn formation in Trypoxylus dichotomus reveals the pleiotropic roles of doublesex depending on the spatiotemporal developmental contexts Morita S. et.al. PLOS Genetics (2019) DOI:10.1371/journal.pgen.100806 基礎生物学研究所プレスリリース:2019年4月11日 http://www.nibb.ac.jp/press/2019/04/11.html 基礎生物学研究所プレスリリース:2018年10月5日 http://www.nibb.ac.jp/press/2018/10/05.html |
全ゲノムの3次元構造を解明 | Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs, Ohno M. et.al. Cell, (2019) DOI:10.1016/j.cell.2018.12.014 理化学研究所プレスリリース http://www.riken.jp/pr/press/2019/20190118_1/ |
全ゲノム解読の有効性 | Genetic study homes in on height’s heritability mystery. Geddes L. Nature (2019) DOI:10.1038/d41586-019-01157-y 和訳版:背丈の「失われた遺伝率」が見つかる Nature ダイジェスト Vol. 16 No. 7 DOI:10.1038/ndigest.2019.190710 Recovery of trait heritability from whole genome sequence data Wainschtein, P. et al. Preprint at bioRxiv (2019) DOI:10.1101/588020 |
第67号 2019年4月15日発行
(PDF 3,180KB) (冊子用 PDF 3,188KB) |
【目次】
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参考文献・リンク ニュースレターの記事を書くにあたり参考にした論文やウェブサイトの一覧です。 一部に専門的な論文なども含まれますが、記事には載せることのできなかった写真なども掲載されています。 |
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ソメイヨシノのゲノム解読 | Phased genome sequence of an interspecific hybrid flowering cherry, SomeiYoshino ( Cerasus x yedoensis ). Shirasawa K. et.al. bioRxiv (2019) DOI:https://doi.org/10.1101/573451データベース DBcherryhttp://cherry.kazusa.or.jp/seqcut.html |
キクタニギクのゲノム解読 | e novo whole-genome assembly in Chrysanthemum seticuspe, a model species of Chrysanthemums, and its application to genetic and gene discovery analysis. Hirakawa H. et.al. DNA Research (2019) DOI:10.1093/dnares/dsy048/5303208 ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)広義キク属http://shigen.nig.ac.jp/chrysanthemum/ |
寄生植物ストライガの養水分収奪機構 | Aberrant protein phosphatase 2C leads to abscisic acid insensitivity and high transpiration in parasitic Striga. Fujioka H. et.al. Nature Plant (2019) DOI:10.1038/s41477-019-0362-7 神戸大学プレスリリース http://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe/NEWS/news/2019_02_26_01.html |
代謝で免疫記憶システムをコントロール | ACC1 determines memory potential of individual CD4+ T cells by regulating de novo fatty acid biosynthesis. Endo Y. et. al. Nature metabolism (2019) DOI:10.1038/s42255-018-0025-4 |
タマネギの機能性成分 | Widely targeted metabolome and transcriptome landscapes of Allium fistulosum–A. cepa chromosome addition lines revealed a flavonoid hot spot on chromosome 5A. Abdelrahman M. et. al. Scientific Reports (2019) DOI:10.1038/s41598-019-39856-1 山口大学農学部園芸学研究室 http://ds.cc.yamaguchi-u.ac.jp/~shigyo/newhp/ |
イントロンの存在意義 | Intron RNA sequences help yeast cells to survive starvation. Edwards SR & Johnson TL. Nature (2019) DOI:10.1038/d41586-019-00088-y |
Hachimoji DNA | Hachimoji DNA and RNA: A genetic system with eight building blocks. Hoshika S. et. al. Science (2019) DOI: 10.1126/science.aat0971Wikipediahttps://en.wikipedia.org/wiki/Hachimoji_DNA |
ヒトの突然変異率 | Characterizing mutagenic effects of recombination through a sequence-level genetic map. Halldorsson BV. et. al. Science (2019) DOI: 10.1126/science.aaw8705Ancient genomes from Iceland reveal the making of a human population. Ebenesersdóttir SS. et. al. Science (2018) DOI: 10.1126/science.aar2625The Making of a Human Population Uncovered Through Ancient Icelandic Genomes. https://phys.org/news/2018-05-human-population-uncovered-ancient-icelandic.html |
ヒストンをもつウイルス | A Medusa virus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Yoshikawa G. et. al. Journal of Virology (2019) DOI: 10.1128/JVI.02130-18京都大学プレスリリース http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2018/190206_2.html |
木更津市鎌足桜保存会 | 地元である木更津市鎌足に咲く「鎌足桜」の保存会のみなさま → こちら |
第66号 2019年1月15日発行
(PDF 2,851KB) (冊子用 PDF 2,852KB) |
【目次】
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参考文献・リンク ニュースレターの記事を書くにあたり参考にした論文やウェブサイトの一覧です。 一部に専門的な論文なども含まれますが、記事には載せることのできなかった写真なども掲載されています。 |
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バイオエコノミーとは | バイオによるイノベーションの推進と社会貢献に向けて ~バイオ戦略への提言~ https://www8.cao.go.jp/cstp/tyousakai/bio/3kai/sanko1.pdf |
ぜんそくにおける新たなブレーキ経路の発見 | DUSP10 constrains innate IL-33-mediated cytokine production in ST2 hi memory-type pathogenic Th2 cells. Yamamoto T. et.al. Nature Communications (2018) Doi: 10.1038/s41467-018-06468-8 |
ニガウリの苦味成分合成に関わる遺伝子 | Identification of triterpene biosynthetic genes from Momordica charantia using RNA-seq analysis. Takase S. et.al. BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY, AND BIOCHEMISTRY (2018) Doi:10.1080/09168451.2018.1530096 |
ラッカセイの病気に対する抵抗性遺伝子 | Sequencing analysis of genetic loci for resistance for late leaf spot and rust in peanut (Arachis hypogaea L.) Shirasawa K. et.al. Frontiers in Plant Science (2018) Doi:10.3389/fpls.2018.01727 |
DNA検査による親戚探し | We will find you: DNA search used to nab Golden State Killer can home in on about 60% of white Americans. Kaiser J. Science (2018) Doi:10.1126/science.aav7021 |
ヒトの標準ゲノム | Assembly of a pan-genome from deep sequencing of 910 humans of African descent. Sherman RM. et.al. Nature Genetics Doi:10.1038/s41588-018-0273-y 東北大学東北メディカル・メガバンク機構 https://www.megabank.tohoku.ac.jp/ |
ホタルのゲノム | Firefly genomes illuminate parallel origins of bioluminescence in beetles. Fallon TR. et.al. Elife(2018) Doi: 10.7554/eLife.36495 基礎生物学研究所プレスリリース ホタルのゲノム解読に成功 〜ホタルの光の遺伝子の進化が明らかに〜 http://www.nibb.ac.jp/press/2018/10/16.html |