かずさDNA研究所（白澤健太室長）は、北里大学（吉武和敏講師）、千葉大学（菊池真司准教授ら）、東京海洋大学（小祝敬一郎准教授）、東京大学（藤井壮太教授）と共同で、海岸や砂地に生育するアブラナ科植物「サンドストック」の全ゲノムの解読に成功しました。

サンドストック（学名はマルコルミア・リットリア）は、海岸や砂地などの環境に生育するアブラナ科の植物です。高塩分、養分不足、強風の環境に適応しており、「生殖隔離」という種の進化と関わる現象の研究材料としても注目されています。しかし、サンドストックでは十分な精度のゲノム情報が整備されていませんでした。

本研究では、高精度な長鎖DNA分析技術を用いてゲノムを解読するとともに、一粒の花粉から遺伝情報を解析する「単一花粉ジェノタイピング法」を新たに開発しました。これによって、染色体の構造を反映した正確な全ゲノム塩基配列を決定することができました。

今回の成果によって、沿岸植物の環境適応やアブラナ科植物の進化、生殖隔離の分子基盤を解明する上で重要な手がかりとなることが期待されます。

論文タイトル：Chromosome-scale genome assembly of Malcolmia littorea using long-read sequencing and single-pollen genotyping technologies
著者：Kenta Shirasawa, Kazutoshi Yoshitake, Haruka Kondo, Shinji Kikuchi, Keiichiro Koiwai, and Sota Fujii
掲載誌：DNA Research
DOI：https://doi.org/10.1093/dnares/dsag001

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