Miyakogusa Predicted Gene
- chr1.CM0017.200.nc
BLASTN 2.2.18 [Mar-02-2008]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= chr1.CM0017.200.nc
(2054 letters)
Database: lotus_EST_unigene
20,423 sequences; 9,996,863 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KMC005424A_C01 KMC005424A_c01 1084 0.0
KMC003023A_C01 KMC003023A_c01 1068 0.0
>KMC005424A_C01 KMC005424A_c01;
Length = 575
Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0
Identities = 559/563 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1157 ggaactacaactatgggcaatgcggaagagcaattggtgcggacttgctgaacaacccag 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 ggaactacaactatgggcaatgcggaagagcaattggtgcggacttgctgaacaacccag 505
Query: 1217 atgctgtagcaactgacgcagtgatctcattcaagacagcgatctggttctggatgacgg 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 atgctgtagcaactgacgcagtgatctcattcaagacagcgatctggttctggatgacgg 445
Query: 1277 cacaatcaccgaagccttcatgccacgacgtcatcaccggaagatggagtccatcaagtg 1336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 cacaatcaccgaagccttcatgccacgacgtcatcaccggaagatggagtccatcaagtg 385
Query: 1337 ctgatcaggcagcagggagggtttccgggtacggcactgtcaccaacatcatcaacggtg 1396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 ctgatcaggcagcagggagggtttccgggtacggcactgtcaccaacatcatcaacggtg 325
Query: 1397 gacttgaatgcgggaaagggcaggatagcagggtgcaggatcgcatagggttttataaga 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 gacttgaatgcgggaaagggcaggatagcagggtgcaggatcgcatagggttttataaga 265
Query: 1457 gatactgtgacttgcttggagttgggtatggcaataaccttgactgtgcttctcagagac 1516
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 gatactgtgacttgcttggagttgggtatggccataaccttgactgtgcttctcagagac 205
Query: 1517 catttggctctaattcacagctccttctcgacaccatctagttactttttgttttaataa 1576
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 cctttggctctaattcacagctccttctcgacaccatctagttactttttgttttaataa 145
Query: 1577 ataaataacctgaacatcaccagtgcgggttcattgggttgggttgggtctggccgtgac 1636
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 ataaataacctgaacatcacccgtgcgggttcattgggttgggttgggtctggccgtgac 85
Query: 1637 ttgttactgtttcatctctgatcagatcatgatcatagatcacctcctatgtatggaata 1696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 84 ttgttactgtttcatctctgatcagatcatgatcatagatcacctcctatgtatggaata 25
Query: 1697 aaataatctgaacattttctgtc 1719
||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 24 aaataatctgaaccttttctgtc 2
>KMC003023A_C01 KMC003023A_c01;
Length = 599
Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0
Identities = 562/567 (99%), Gaps = 2/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 505 tcaaaatgaagatgaggttgggaatagcaatactggtgtcgtttatactagtaggatggt 564
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 tcaaaatgaagatgaggt-gggaatagcaatactggtgtcgtttatactagtaggatggt 68
Query: 565 gcaggggagagcaatgcggaagccaagcagggggtgctctg-tgtcccggtgggatatgt 623
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 69 gcagaggagagcaatgcggaagccaagcagggggtgctctggtgtcccggtgggatatgt 128
Query: 624 tgcagcaaatacgggtggtgcggttcaacttctgagtactgcggcgaaggttgccagagt 683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 tgcagcaaatacgggtggtgcggttcaacttctgagtactgcggcgaaggttgccagagt 188
Query: 684 caatgtggtggcagtaccggtggtggtgaccttgggagcatcatctcaagggacaccttc 743
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 caaggtggtggcagtaccggtggtggtgaccttgggagcatcatctcaagggacaccttc 248
Query: 744 aacacgatgctcaagcatcgtgatgatggagggtgtccagctaaagggttttacacctat 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 aacacgatgctcaagcatcgtgatgatggagggtgtccagctaaagggttttacacctat 308
Query: 804 gatgcttttatttcagctgccaaggcttaccccagctttggtaccaccggcgatacctcc 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 gatgcttttatttcagctgccaaggcttaccccagctttggtaccaccggcgatacctcc 368
Query: 864 actcgcaaaagagaaattgctgctttcttcggccaaacttctcatgaaactactgggggt 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 actcgcaaaagagaaattgctgctttcttcggccaaacttctcatgaaactactgggggt 428
Query: 924 tgggctactgcaccggatggcccttacgcttggggatattgctttgttagggaacaaaac 983
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 agggctactgcaccggatggcccttacgcttggggatattgctttgttagggaacaaaac 488
Query: 984 ccaagtgcctattgctccccaagttctcaatggccttgtgcttctggcaagcaatactat 1043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 ccaagtgcctattgctccccaagttctcaatggccttgtgcttctggcaagcaatactat 548
Query: 1044 ggtcgcggtccaatccaaatcacatgg 1070
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 ggtcgcggtccaatccaaatcacatgg 575
Score = 52.0 bits (26), Expect = 4e-06
Identities = 26/26 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1157 ggaactacaactatgggcaatgcgga 1182
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 574 ggaactacaactatgggcaatgcgga 599