Result of FASTA (ccds) for pF1KE2709
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2709, 1647 aa
  1>>>pF1KE2709     1647 - 1647 aa - 1647 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.5819+/-0.00138; mu= -18.6137+/- 0.084
 mean_var=758.4586+/-155.122, 0's: 0 Z-trim(116.5): 153  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.046570
 statistics sampled from 17027 (17163) to 17027 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.527), width:  16
 Scan time:  3.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647) 11097 762.2 3.2e-219
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616) 8576 592.8 3.1e-168
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613) 8568 592.3 4.4e-168
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617) 8565 592.1 5.1e-168
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614) 8563 591.9 5.6e-168
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572) 5584 391.8 9.8e-108
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590) 5584 391.8 9.8e-108
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514) 2006 151.4 2.2e-35
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997) 1124 92.4 2.5e-17
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905) 1051 87.3 5.4e-16
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912) 1051 87.3 5.4e-16
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954) 1045 86.9 7.2e-16
CCDS75807.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        ( 248) 1010 83.7 8.3e-16
CCDS83339.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        ( 276) 1010 83.8 8.9e-16
CCDS75808.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        ( 278) 1010 83.8   9e-16
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581) 1042 86.8   1e-15
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966) 1031 86.0 1.4e-15
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000) 1031 86.0 1.4e-15
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059) 1031 86.0 1.4e-15
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302) 1004 84.2 5.5e-15
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715)  999 83.9 7.8e-15
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881)  985 83.0 1.6e-14
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897)  985 83.0 1.6e-14
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  897 76.9   6e-13
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  858 74.2 3.6e-12
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  822 72.1 3.4e-11


>>CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19            (1647 aa)
 initn: 11097 init1: 11097 opt: 11097  Z-score: 4049.2  bits: 762.2 E(32554): 3.2e-219
Smith-Waterman score: 11097; 100.0% identity (100.0% similar) in 1647 aa overlap (1-1647:1-1647)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 HCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 DSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 KKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE2 IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSV
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KE2 RQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGS
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640       
pF1KE2 RAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
             1630      1640       

>>CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19            (1616 aa)
 initn: 9635 init1: 8553 opt: 8576  Z-score: 3134.0  bits: 592.8 E(32554): 3.1e-168
Smith-Waterman score: 10753; 97.8% identity (97.8% similar) in 1650 aa overlap (1-1647:1-1616)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
               10        20        30        40        50        60

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
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pF1KE2 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
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pF1KE2 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
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pF1KE2 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
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pF1KE2 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
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pF1KE2 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
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pF1KE2 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
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pF1KE2 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE2 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
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pF1KE2 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
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pF1KE2 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
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pF1KE2 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
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pF1KE2 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
              790       800       810       820       830       840

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pF1KE2 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
              850       860       870       880       890       900

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pF1KE2 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
              910       920       930       940       950       960

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pF1KE2 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS45 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDE--
             1210      1220      1230      1240      1250          

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 HCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 -------------------------------EEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                    1260      1270      1280       

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
      1290      1300      1310      1320      1330      1340       

             1390         1400      1410      1420      1430       
pF1KE2 DSLTEKQWLK---AIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDES
       ::::::::::   :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDES
      1350      1360      1370      1380      1390      1400       

      1440      1450      1460      1470      1480      1490       
pF1KE2 KKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS45 KKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSS-GRQLSEVFIQLPSRKELPEY
      1410      1420      1430      1440       1450      1460      

      1500      1510      1520      1530      1540      1550       
pF1KE2 YELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVF
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

      1560      1570      1580      1590      1600      1610       
pF1KE2 TSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPS
       1530      1540      1550      1560      1570      1580      

      1620      1630      1640       
pF1KE2 RGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       1590      1600      1610      

>>CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19            (1613 aa)
 initn: 9635 init1: 8553 opt: 8568  Z-score: 3131.1  bits: 592.3 E(32554): 4.4e-168
Smith-Waterman score: 10769; 97.9% identity (97.9% similar) in 1647 aa overlap (1-1647:1-1613)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
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               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE2 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
              730       740       750       760       770       780

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pF1KE2 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
              850       860       870       880       890       900

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pF1KE2 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
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pF1KE2 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS54 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDE--
             1210      1220      1230      1240      1250          

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 HCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -------------------------------EEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                    1260      1270      1280       

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
      1290      1300      1310      1320      1330      1340       

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 DSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQ
      1350      1360      1370      1380      1390      1400       

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 KKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSS-GRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
      1410      1420      1430      1440       1450      1460      

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE2 IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSV
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE2 RQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGS
       1530      1540      1550      1560      1570      1580      

             1630      1640       
pF1KE2 RAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       1590      1600      1610   

>>CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19            (1617 aa)
 initn: 10185 init1: 8553 opt: 8565  Z-score: 3130.0  bits: 592.1 E(32554): 5.1e-168
Smith-Waterman score: 10770; 97.8% identity (97.8% similar) in 1650 aa overlap (1-1647:1-1617)

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pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
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pF1KE2 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
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pF1KE2 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE2 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE2 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
              370       380       390       400       410       420

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pF1KE2 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
              430       440       450       460       470       480

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pF1KE2 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE2 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
              550       560       570       580       590       600

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pF1KE2 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS45 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDE--
             1210      1220      1230      1240      1250          

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 HCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 -------------------------------EEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                    1260      1270      1280       

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
      1290      1300      1310      1320      1330      1340       

             1390         1400      1410      1420      1430       
pF1KE2 DSLTEKQWLK---AIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDES
       ::::::::::   :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDES
      1350      1360      1370      1380      1390      1400       

      1440      1450      1460      1470      1480      1490       
pF1KE2 KKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEY
      1410      1420      1430      1440      1450      1460       

      1500      1510      1520      1530      1540      1550       
pF1KE2 YELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVF
      1470      1480      1490      1500      1510      1520       

      1560      1570      1580      1590      1600      1610       
pF1KE2 TSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPS
      1530      1540      1550      1560      1570      1580       

      1620      1630      1640       
pF1KE2 RGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
      1590      1600      1610       

>>CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19            (1614 aa)
 initn: 8553 init1: 8553 opt: 8563  Z-score: 3129.2  bits: 591.9 E(32554): 5.6e-168
Smith-Waterman score: 10786; 98.0% identity (98.0% similar) in 1647 aa overlap (1-1647:1-1614)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRK
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE2 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEE
              910       920       930       940       950       960

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pF1KE2 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS54 VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDE--
             1210      1220      1230      1240      1250          

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 HCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -------------------------------EEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMD
                                    1260      1270      1280       

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYS
      1290      1300      1310      1320      1330      1340       

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 DSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQ
      1350      1360      1370      1380      1390      1400       

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 KKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
      1410      1420      1430      1440      1450      1460       

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE2 IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSV
      1470      1480      1490      1500      1510      1520       

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pF1KE2 RQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGS
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pF1KE2 RAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
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>>CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9             (1572 aa)
 initn: 6217 init1: 3300 opt: 5584  Z-score: 2047.7  bits: 391.8 E(32554): 9.8e-108
Smith-Waterman score: 8053; 75.0% identity (87.2% similar) in 1658 aa overlap (1-1647:1-1570)

               10        20        30          40        50        
pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
       ::::  : :. :.:::::::::::: .:::::::  ::::.::::::::::::..::.::
CCDS34 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
                10        20        30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
       .:   .::..:::::::....:.::. .: . ..::: :::   : ::::: ::::::::
CCDS34 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
      60        70        80        90       100        110        

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pF1KE2 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
       ::    :::::. ::.:::. ..::.  :::  .  :: . : ::::..: ::::.::. 
CCDS34 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
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          180       190       200       210       220       230    
pF1KE2 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
        :::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::.      .          
CCDS34 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
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          240       250       260       270       280       290    
pF1KE2 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
                    . .. . .  :.. :: :.     .  : :.      : ::  . ..
CCDS34 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
                   230       240           250       260       270 

          300       310         320       330       340       350  
pF1KE2 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
       : ::::::  : : :::::::::.  ::::. :  :.. .:. :.::.:.. :.::::::
CCDS34 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
              280       290       300        310        320        

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
       .:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::  :::::::.::::::::::
CCDS34 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
      330       340       350       360       370       380        

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
       :::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS34 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
      390       400       410       420       430       440        

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
       :::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS34 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
      450       460       470       480       490       500        

            540       550       560       570       580         590
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKA--E
       :::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....::   :
CCDS34 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
      510       520       530       540       550       560        

              600       610       620       630       640       650
pF1KE2 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
       ::::   :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
CCDS34 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
      570       580       590       600       610       620        

              660       670       680       690       700       710
pF1KE2 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
       :::::::::: :. :::.::::. .          :.: . ::.:..::: ::..:::.:
CCDS34 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
      630       640       650              660       670       680 

              720       730       740       750       760       770
pF1KE2 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN
       ::::::::.. :  ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
CCDS34 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
             690        700       710       720       730       740

              780       790       800       810       820       830
pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
CCDS34 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
              750       760       770       780       790       800

              840       850       860       870       880       890
pF1KE2 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
       :.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
              810       820       830       840       850       860

              900       910       920       930       940       950
pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
       ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
              870       880       890       900       910       920

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KE2 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
       ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS34 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
              930       940       950       960       970       980

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KE2 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
       :::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS34 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
              990      1000      1010      1020      1030      1040

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KE2 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
       .: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS34 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
             1050      1060      1070      1080      1090      1100

             1140      1150      1160      1170      1180      1190
pF1KE2 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
       :.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS34 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
             1110      1120      1130      1140      1150      1160

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
             1170      1180      1190      1200      1210      1220

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KE2 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE
       :::::..:                                 ::::::::::.::::::.:
CCDS34 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE
                                              1230      1240       

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KE2 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG
       ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS34 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KE2 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS
       ::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.:     :.     
CCDS34 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-----
      1310      1320      1330      1340      1350                 

             1440      1450      1460      1470      1480      1490
pF1KE2 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPS
         :.:  : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.::::: :::::::::::::
CCDS34 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSS-GRQLSEVFIQLPS
        1360      1370      1380      1390      1400       1410    

             1500      1510      1520      1530      1540      1550
pF1KE2 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::
CCDS34 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDS
         1420      1430      1440      1450      1460      1470    

             1560      1570      1580      1590      1600          
pF1KE2 IVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRL
       ::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. 
CCDS34 IVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKG
         1480      1490      1500      1510      1520      1530    

    1610      1620      1630      1640         
pF1KE2 KGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED  
       :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... ::  :  
CCDS34 KG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
          1540       1550      1560      1570  

>>CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9             (1590 aa)
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       ::::  : :. :.:::::::::::: .:::::::  ::::.::::::::::::..::.::
CCDS34 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
                10        20        30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
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       .:   .::..:::::::....:.::. .: . ..::: :::   : ::::: ::::::::
CCDS34 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
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       ::    :::::. ::.:::. ..::.  :::  .  :: . : ::::..: ::::.::. 
CCDS34 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
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pF1KE2 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
        :::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::.      .          
CCDS34 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
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pF1KE2 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
                    . .. . .  :.. :: :.     .  : :.      : ::  . ..
CCDS34 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
                   230       240           250       260       270 

          300       310         320       330       340       350  
pF1KE2 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
       : ::::::  : : :::::::::.  ::::. :  :.. .:. :.::.:.. :.::::::
CCDS34 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
              280       290       300        310        320        

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
       .:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::  :::::::.::::::::::
CCDS34 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
      330       340       350       360       370       380        

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
       :::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS34 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
      390       400       410       420       430       440        

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
       :::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS34 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
      450       460       470       480       490       500        

            540       550       560       570       580         590
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKA--E
       :::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....::   :
CCDS34 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
      510       520       530       540       550       560        

              600       610       620       630       640       650
pF1KE2 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
       ::::   :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
CCDS34 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
      570       580       590       600       610       620        

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pF1KE2 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
       :::::::::: :. :::.::::. .          :.: . ::.:..::: ::..:::.:
CCDS34 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
      630       640       650              660       670       680 

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pF1KE2 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN
       ::::::::.. :  ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
CCDS34 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
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pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
CCDS34 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
              750       760       770       780       790       800

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pF1KE2 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
       :.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
              810       820       830       840       850       860

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pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
       ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
              870       880       890       900       910       920

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pF1KE2 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
       ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS34 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
              930       940       950       960       970       980

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pF1KE2 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
       :::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS34 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
              990      1000      1010      1020      1030      1040

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pF1KE2 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
       .: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS34 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
             1050      1060      1070      1080      1090      1100

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pF1KE2 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
       :.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS34 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
             1110      1120      1130      1140      1150      1160

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
             1170      1180      1190      1200      1210      1220

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KE2 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE
       :::::..:                                 ::::::::::.::::::.:
CCDS34 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE
                                              1230      1240       

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KE2 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG
       ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS34 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KE2 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS
       ::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.:     :.     
CCDS34 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-----
      1310      1320      1330      1340      1350                 

             1440      1450      1460      1470                    
pF1KE2 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKD----------------
         :.:  : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.:::                
CCDS34 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIE
        1360      1370      1380      1390      1400      1410     

          1480      1490      1500      1510      1520      1530   
pF1KE2 -SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLC
        .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS34 GNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLC
        1420      1430      1440      1450      1460      1470     

          1540      1550      1560      1570      1580      1590   
pF1KE2 QNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSV
       .:::::::::: :::::::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..::
CCDS34 HNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSV
        1480      1490      1500      1510      1520      1530     

          1600       1610      1620      1630      1640         
pF1KE2 KVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED  
       ::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... ::  :  
CCDS34 KVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
        1540      1550       1560       1570      1580      1590

>>CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9             (1514 aa)
 initn: 4782 init1: 1865 opt: 2006  Z-score: 748.7  bits: 151.4 E(32554): 2.2e-35
Smith-Waterman score: 7537; 71.7% identity (83.7% similar) in 1658 aa overlap (1-1647:1-1512)

               10        20        30          40        50        
pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
       ::::  : :. :.:::::::::::: .:::::::  ::::.::::::::::::..::.::
CCDS83 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
                10        20        30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
       .:   .::..:::::::....:.::. .: . ..::: :::   : ::::: ::::::::
CCDS83 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
      60        70        80        90       100        110        

      120           130       140       150       160       170    
pF1KE2 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
       ::    :::::. ::.:::. ..::.  :::  .  :: . : ::::..: ::::.::. 
CCDS83 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
      120       130       140        150        160       170      

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE2 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
        :::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::.      .          
CCDS83 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
        180       190       200       210       220                

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE2 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
                    . .. . .  :.. :: :.     .  : :.      : ::  . ..
CCDS83 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
                   230       240           250       260       270 

          300       310         320       330       340       350  
pF1KE2 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
       : ::::::  : : :::::::::.  ::::. :  :.. .:. :.::.:.. :.::::::
CCDS83 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
              280       290       300        310        320        

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
       .:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::  :::::::.::::::::::
CCDS83 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
      330       340       350       360       370       380        

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
       :::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS83 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
      390       400       410       420       430       440        

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
       :::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS83 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
      450       460       470       480       490       500        

            540       550       560       570       580         590
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKA--E
       :::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....::   :
CCDS83 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
      510       520       530       540       550       560        

              600       610       620       630       640       650
pF1KE2 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
       ::::   :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
CCDS83 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
      570       580       590       600       610       620        

              660       670       680       690       700       710
pF1KE2 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
       :::::::::: :. :::.::::. .          :.: . ::.:..::: ::..:::.:
CCDS83 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
      630       640       650              660       670       680 

              720       730       740       750       760       770
pF1KE2 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN
       ::::::::.. :  ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
CCDS83 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
             690        700       710       720       730       740

              780       790       800       810       820       830
pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
CCDS83 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
              750       760       770       780       790       800

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pF1KE2 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
       :.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
              810       820       830       840       850       860

              900       910       920       930       940       950
pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
       ::::::                                                      
CCDS83 CKLTQV------------------------------------------------------
                                                                   

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KE2 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
           :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS83 ----DLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
            870       880       890       900       910       920  

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KE2 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
       :::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS83 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
            930       940       950       960       970       980  

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KE2 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
       .: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS83 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

             1140      1150      1160      1170      1180      1190
pF1KE2 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
       :.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS83 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
           1050      1060      1070      1080      1090      1100  

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
           1110      1120      1130      1140      1150      1160  

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KE2 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE
       :::::..:                                 ::::::::::.::::::.:
CCDS83 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE
           1170                                       1180         

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KE2 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG
       ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS83 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG
    1190      1200      1210      1220      1230      1240         

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KE2 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS
       ::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.:     :.     
CCDS83 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-----
    1250      1260      1270      1280      1290                   

             1440      1450      1460      1470      1480      1490
pF1KE2 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPS
         :.:  : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.::::: :::::::::::::
CCDS83 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSS-GRQLSEVFIQLPS
      1300      1310      1320      1330      1340       1350      

             1500      1510      1520      1530      1540      1550
pF1KE2 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::
CCDS83 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDS
       1360      1370      1380      1390      1400      1410      

             1560      1570      1580      1590      1600          
pF1KE2 IVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRL
       ::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. 
CCDS83 IVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKG
       1420      1430      1440      1450      1460      1470      

    1610      1620      1630      1640         
pF1KE2 KGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED  
       :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... ::  :  
CCDS83 KG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
        1480       1490      1500      1510    

>>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8               (2997 aa)
 initn: 1193 init1: 599 opt: 1124  Z-score: 424.6  bits: 92.4 E(32554): 2.5e-17
Smith-Waterman score: 1469; 27.7% identity (55.7% similar) in 1420 aa overlap (46-1345:229-1581)

          20        30        40        50        60          70   
pF1KE2 PSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQGPGGYP--QDNMHQMH
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CCDS47 SMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSH-VPQQSPSMAPSLRHSVQQFH
      200       210       220       230        240       250       

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pF1KE2 K-PMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGYPSPLGGSEHASS
       . :  ..: .... .::..    .      .... :    ....::  :::  ..    :
CCDS47 HHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQ------QGAVRPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYS
       260       270       280             290       300       310 

            140              150       160           170       180 
pF1KE2 PVPASGPSSGPQMSSG-------PGGAPLDGADPQ---ALG-QQNRGPTPFNQNQLHQLR
         : :. ..:   ..:        ...:.. . :.   :.:  .: :   ..:. .:   
CCDS47 RYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQGLMHQQPIHPSG
             320       330       340       350       360       370 

              190       200       210       220       230          
pF1KE2 A-QIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPG-P---GPGP
       . . :  . .  .::   .   .     :: .:..   : :::.:   . : :   :  :
CCDS47 SLNQMNTQTMHPSQPQGTY--ASPPPMSPMKAMSNPAGT-PPPQVRPGSAGIPMEVGSYP
             380       390         400        410       420        

         240       250       260       270         280        290  
pF1KE2 G-PGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPP--GMPGQPPGGPPKPWPEG-PMANA
       . : : :.  ::.     :.:  :: : . .   :  :: . :     .  :.: : .. 
CCDS47 NMPHPQPSHQPPG---AMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGL
      430       440          450       460       470       480     

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 AAPTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
       . : .  ..::: :   .:.  :        :. ::    ::   : .:  : ::  ...
CCDS47 GDPQAIQERLIPGQQ--HPGQQPSF---QQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQL
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pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
        :  .:..  : ..  ...   .  . . . .. .. :  :  ...        :  .. 
CCDS47 HP--SPQNT-PQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSD-----DYLPSIEQ
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pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEK--LEKQQKIEQERKRRQ
       : : ...     .... . .   .:.. ..   .  . .  ..  :. .:. :...:.:.
CCDS47 QPQQKKK----KKKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQE-EKKKKKRS
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pF1KE2 KHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRL
       : ..  .   .. :. :: ..  : :  :. :     .:.:   . : ..   :   .. 
CCDS47 KAKKDPKEP-KEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSK---KSSNKKP
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pF1KE2 MAEDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAE
        .:     .:.   : .      :..:        :   .  ..:  . ... :.:. .:
CCDS47 DSEASALKKKVNKGKTEGSENSDLDKTPPPSPPPEE--DEDPGVQKRRSSRQVKRKRYTE
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       . :   ..  :   :.   :  :. :.   .  . .:.    ::... .. :   .:.  
CCDS47 DLEFKISDEEADDADAAGRDSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEV
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pF1KE2 AWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQP----QAAQPPTLPVEE-KKKIPDPD-
          :.   :.       . .. :. :.... .:     .: :  .  . : . .. .:: 
CCDS47 EIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDY
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pF1KE2 ------------SDDVSEVDARHIIENAKQDVDD-----EYGVSQALARGLQSYYAVAHA
                   .:: .:  ......  .   .:     .  ..::  . ... ..  . 
CCDS47 VEVDRIMDFARSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMS-REP
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        ::::..  :              :. :..::..:..::.  . :  : :::::::::::
CCDS47 ETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKT
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pF1KE2 IQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAARRAFV-
       ::.:... : .  : :.::::.:.::::. ::  ::  :.   : : :.:: :.::..  
CCDS47 IQSITFL-YEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTELNV-VVYHGSQASRRTIQL
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pF1KE2 -------PQLR----SGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLT
              :: :    : ::....::.:.:. :   : .: :. ...::.::.::..::: 
CCDS47 YEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLL
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pF1KE2 QVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKV
       . :.   .  ...::::::::: . ::..::.:: :. : : .:: : :.          
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       ::. :: .   ..:. .:.:..:::::..:: .:  : : .:. ... .:.  :: .  :
CCDS47 DLKTEEQV---QKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEK
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       . ..:. :.     :.... .:.::.:.::: :::::...  ::.. :..  : .     
CCDS47 NFTFLSKGG-----GQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPD
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        :   . .:.::. :.:..::::.: .:.::.: ::.  . :.:::.  : . : :.:: 
CCDS47 FQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGR
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pF1KE2 TKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDR
       .... :   .  :..: :. :.::: :::::::.:: .::: :::::::::..::::: :
CCDS47 VRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQAR
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pF1KE2 AHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQA--GMFD-----QKSSSHE
        :::::.. :.. :: : :: :....  :. ::..:. :.:.  :  .     :. :..:
CCDS47 CHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKE
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pF1KE2 -----RRAFLQAILEHEEQDESRHC------------------STGSGSASFAHTAPPPA
            :..   :... ::.. :. :                  : :.:: .::...   .
CCDS47 IEDLLRKGAYGALMD-EEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGS-TFAKASFVAS
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pF1KE2 GVNPD--LEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEAR--NPKRKP
       :   :  :..: . ..     .  .. . .:..      . .:  : :...:  .  .. 
CCDS47 GNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNN------LVIDTPRVRKQTRLYSAVKED
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pF1KE2 RLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEG
       .::: ..: :                                                  
CCDS47 ELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYK
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>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12               (1905 aa)
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CCDS76 RGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLR
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         . .. . :::::::::::.:: ...  :... . .::::. .::::. ::  ::. ::
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pF1KE2 PSVVKVSYKGSPAARRAFVPQ---------LRSGK------------FNVLLTTYEYIIK
       :..  :.: :.  .: :.. .         .:.::            :.::::.:: :  
CCDS76 PDMYVVTYVGDKDSR-AIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITI
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CCDS76 DMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNG-YSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLL
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pF1KE2 NFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVE
       ::: :  :..   : . :          .:. .:.    :..:: .: : .::::: .: 
CCDS76 NFLTPERFHNLEGFLEEF----------ADIAKEDQ---IKKLHDMLGPHMLRRLKADVF
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pF1KE2 AQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
        ..: :.: ... ..: .:.  :..     .:  .    . .: :.  .:.:..:.:.: 
CCDS76 KNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKY-----ILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKC
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CCDS76 CNHPYLFP---VAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQM
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CCDS76 TKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINL
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pF1KE2 QSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVD
        .::::::.:::::::.:.:: .:::::::...: . :. :  ::::.:  .:: :. . 
CCDS76 ATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLT
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pF1KE2 QKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDL
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CCDS76 HLVVRPGL-GSKTGSMSKQE-LDDILKFGTEELFKDEATDGG------------GDNKEG
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pF1KE2 EEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPK---RKPRLMEEDE
       :.  . . :    :....... :...: .    . ...     .  .   :. .. ::.:
CCDS76 EDSSVIHYD----DKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEE
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pF1KE2 LPSWIIKDDAEVE--------RLTCEEEEEKM---FGRGSRHRKEVDYSD-SLTEKQWLK
       .   :::..  :.        :   :...: .   .:.:.: ::.:.:.: :  ...:  
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