FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2709, 1647 aa 1>>>pF1KE2709 1647 - 1647 aa - 1647 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.5819+/-0.00138; mu= -18.6137+/- 0.084 mean_var=758.4586+/-155.122, 0's: 0 Z-trim(116.5): 153 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.046570 statistics sampled from 17027 (17163) to 17027 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.527), width: 16 Scan time: 3.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 11097 762.2 3.2e-219 CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 8576 592.8 3.1e-168 CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 8568 592.3 4.4e-168 CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 8565 592.1 5.1e-168 CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 8563 591.9 5.6e-168 CCDS34978.1 SMARCA2 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CCDS34 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP :::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. . CCDS34 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ---------- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA . .. . . :.. :: :. . : :. : :: . .. CCDS34 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI : :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.:::::: CCDS34 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF .:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::: CCDS34 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH :::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.:::::::::::::::::::: CCDS34 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA :::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.::::::::::::: CCDS34 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKA--E :::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: : CCDS34 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE :::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.:::::::::: CCDS34 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA :::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.: CCDS34 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN ::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.::::: CCDS34 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.::::::::::: CCDS34 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH :.::::.:: ::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..:::: CCDS34 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV :::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:.. CCDS34 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT .: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: :::::::: CCDS34 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA :.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: CCDS34 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE :::::..: ::::::::::.::::::.: CCDS34 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE 1230 1240 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: CCDS34 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS ::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.: :. CCDS34 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA----- 1310 1320 1330 1340 1350 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPS :.: : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.::::: ::::::::::::: CCDS34 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSS-GRQLSEVFIQLPS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDS ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: ::::: CCDS34 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDS 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 IVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRL ::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. CCDS34 IVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKG 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1610 1620 1630 1640 pF1KE2 KGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... :: : CCDS34 KG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE 1540 1550 1560 1570 >>CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590 aa) initn: 6199 init1: 3300 opt: 5584 Z-score: 2047.6 bits: 391.8 E(32554): 9.8e-108 Smith-Waterman score: 8022; 74.3% identity (86.3% similar) in 1675 aa overlap (1-1647:1-1588) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT :::: : :. :.:::::::::::: .::::::: ::::.::::::::::::..::.:: CCDS34 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ .: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: :::::::: CCDS34 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ :: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::. CCDS34 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP :::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. . CCDS34 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ---------- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA . .. . . :.. :: :. . : :. : :: . .. CCDS34 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI : :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.:::::: CCDS34 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF .:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::: CCDS34 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH :::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.:::::::::::::::::::: CCDS34 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA :::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.::::::::::::: CCDS34 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKA--E :::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: : CCDS34 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE :::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.:::::::::: CCDS34 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA :::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.: CCDS34 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN ::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.::::: CCDS34 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.::::::::::: CCDS34 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH :.::::.:: ::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..:::: CCDS34 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV :::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:.. CCDS34 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT .: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: :::::::: CCDS34 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA :.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: CCDS34 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE :::::..: ::::::::::.::::::.: CCDS34 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE 1230 1240 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: CCDS34 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS ::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.: :. CCDS34 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA----- 1310 1320 1330 1340 1350 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKD---------------- :.: : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.::: CCDS34 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIE 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 -SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLC .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: CCDS34 GNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLC 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 QNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSV .:::::::::: :::::::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..:: CCDS34 HNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSV 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KE2 KVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED ::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... :: : CCDS34 KVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE 1540 1550 1560 1570 1580 1590 >>CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514 aa) initn: 4782 init1: 1865 opt: 2006 Z-score: 748.7 bits: 151.4 E(32554): 2.2e-35 Smith-Waterman score: 7537; 71.7% identity (83.7% similar) in 1658 aa overlap (1-1647:1-1512) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT :::: : :. :.:::::::::::: .::::::: ::::.::::::::::::..::.:: CCDS83 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ .: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: :::::::: CCDS83 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ :: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::. CCDS83 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP :::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. . CCDS83 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ---------- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA . .. . . :.. :: :. . : :. : :: . .. CCDS83 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI : :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.:::::: CCDS83 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF .:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::: CCDS83 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH :::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.:::::::::::::::::::: CCDS83 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA :::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.::::::::::::: CCDS83 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKA--E :::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: : CCDS83 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE :::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.:::::::::: CCDS83 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA :::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.: CCDS83 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN ::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.::::: CCDS83 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.::::::::::: CCDS83 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH :.::::.:: ::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT :::::: CCDS83 CKLTQV------------------------------------------------------ 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..:::: CCDS83 ----DLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH 870 880 890 900 910 920 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV :::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:.. CCDS83 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI 930 940 950 960 970 980 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT .: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: :::::::: CCDS83 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT 990 1000 1010 1020 1030 1040 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA :.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: CCDS83 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE :::::..: ::::::::::.::::::.: CCDS83 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE 1170 1180 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: CCDS83 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS ::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.: :. CCDS83 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA----- 1250 1260 1270 1280 1290 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPS :.: : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.::::: ::::::::::::: CCDS83 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSS-GRQLSEVFIQLPS 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDS ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: ::::: CCDS83 RKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 IVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRL ::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. CCDS83 IVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKG 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1610 1620 1630 1640 pF1KE2 KGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... :: : CCDS83 KG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE 1480 1490 1500 1510 >>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997 aa) initn: 1193 init1: 599 opt: 1124 Z-score: 424.6 bits: 92.4 E(32554): 2.5e-17 Smith-Waterman score: 1469; 27.7% identity (55.7% similar) in 1420 aa overlap (46-1345:229-1581) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 PSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQGPGGYP--QDNMHQMH . :: .: .: :.:. : . ...:.: CCDS47 SMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSH-VPQQSPSMAPSLRHSVQQFH 200 210 220 230 240 250 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 K-PMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGYPSPLGGSEHASS . : ..: .... .::.. . .... : ....:: ::: .. : CCDS47 HHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQ------QGAVRPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYS 260 270 280 290 300 310 140 150 160 170 180 pF1KE2 PVPASGPSSGPQMSSG-------PGGAPLDGADPQ---ALG-QQNRGPTPFNQNQLHQLR : :. ..: ..: ...:.. . :. :.: .: : ..:. .: CCDS47 RYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQGLMHQQPIHPSG 320 330 340 350 360 370 190 200 210 220 230 pF1KE2 A-QIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPG-P---GPGP . . : . . .:: . . :: .:.. : :::.: . : : : : CCDS47 SLNQMNTQTMHPSQPQGTY--ASPPPMSPMKAMSNPAGT-PPPQVRPGSAGIPMEVGSYP 380 390 400 410 420 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 G-PGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPP--GMPGQPPGGPPKPWPEG-PMANA . : : :. ::. :.: :: : . . : :: . : . :.: : .. CCDS47 NMPHPQPSHQPPG---AMGIGQRNMGPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGL 430 440 450 460 470 480 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AAPTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI . : . ..::: : .:. : :. :: :: : .: : :: ... CCDS47 GDPQAIQERLIPGQQ--HPGQQPSF---QQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQL 490 500 510 520 530 540 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF : .:.. : .. ... . . . . .. .. : : ... : .. CCDS47 HP--SPQNT-PQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSD-----DYLPSIEQ 550 560 570 580 590 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEK--LEKQQKIEQERKRRQ : : ... .... . . .:.. .. . . . .. :. .:. :...:.:. CCDS47 QPQQKKK----KKKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQE-EKKKKKRS 600 610 620 630 640 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 KHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRL : .. . .. :. :: .. : : :. : .:.: . : .. : .. CCDS47 KAKKDPKEP-KEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSK---KSSNKKP 650 660 670 680 690 700 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 MAEDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAE .: .:. : . :..: : . ..: . ... :.:. .: CCDS47 DSEASALKKKVNKGKTEGSENSDLDKTPPPSPPPEE--DEDPGVQKRRSSRQVKRKRYTE 710 720 730 740 750 760 600 610 620 630 640 pF1KE2 NAE---GQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVK-VIHVESG---KILTGTDAPK---AGQLE . : .. : :. : :. :. . . .:. ::... .. : .:. CCDS47 DLEFKISDEEADDADAAGRDSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEV 770 780 790 800 810 820 650 660 670 680 690 pF1KE2 AWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQP----QAAQPPTLPVEE-KKKIPDPD- :. :. . .. :. :.... .: .: : . . : . .. .:: CCDS47 EIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDY 830 840 850 860 870 880 700 710 720 730 pF1KE2 ------------SDDVSEVDARHIIENAKQDVDD-----EYGVSQALARGLQSYYAVAHA .:: .: ...... . .: . ..:: . ... .. . 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