FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2695, 2339 aa 1>>>pF1KE2695 2339 - 2339 aa - 2339 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7917+/-0.00126; mu= 8.0869+/- 0.076 mean_var=324.4238+/-66.917, 0's: 0 Z-trim(111.7): 102 B-trim: 155 in 1/51 Lambda= 0.071206 statistics sampled from 12463 (12561) to 12463 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.386), width: 16 Scan time: 6.640 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2339) 15721 1631.0 0 CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2237) 14545 1510.1 0 CCDS55665.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2251) 7061 741.3 1.2e-212 CCDS45999.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2261) 4580 486.4 6.4e-136 CCDS45998.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2506) 4512 479.5 8.7e-134 CCDS53443.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2270) 3766 402.8 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CCDS55 PIPVRQNCFTVNRSLFIFGEDNIVRKYAKKLIDWPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 GDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALGFVFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILA ::::::.::. :::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::.:::.:::: CCDS55 DDKTPMSRRLEKTEPYFIGIFCFEAGIKIVALGFIFHKGSYLRNGWNVMDFIVVLSGILA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 TAGTDF----DLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMKAMVPLLQIGLLLFFAILM :::: : ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: CCDS55 TAGTHFNTHVDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQIVLKSIMKAMVPLLQIGLLLFFAILM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 FAIIGLEFYMGKFHKACFPNSTDAEPVGD--FPCGKEAPARLCEGDTECREYWPGPNFGI ::::::::: ::.:.::: :.. : ::: .. : . ::.. : ::: :: CCDS55 FAIIGLEFYSGKLHRACFMNNSGILEGFDPPHPCGVQG----CPAGYECKD-WIGPNDGI 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 TNFDNILFAILTVFQCITMEGWTDILYNTNDAAGNTWNWLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGV :.:::::::.::::::::::::: .::::::: : :::::::::::::::::.::::::: CCDS55 TQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTTVLYNTNDALGATWNWLYFIPLIIIGSFFVLNLVLGV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYLEWIFKAEEVMLAEEDRNAEEKSPLD ::::::::::::::::::.::::::::::::::: :: ::::::::::..:: : :. CCDS55 LSGEFAKERERVENRRAFMKLRRQQQIERELNGYRAWIDKAEEVMLAEENKNAGT-SALE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 VLKRAATKKSRNDLIHAEEGEDRFADLCAVGSPFARASLKSGKTESSSYFRRKEKMFRFF ::.::. :.::.. . . .... .:. .::.:.::::.::.:... ::::.::...:. CCDS55 VLRRATIKRSRTEAMTRDSSDEHCVDISSVGTPLARASIKSAKVDGVSYFRHKERLLRIS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 IRRMVKAQSFYWVVLCVVALNTLCVAMVHYNQPRRLTTTLYFAEFVFLGLFLTEMSLKMY ::.:::.: :::.:: .::::: :::.::.:::. :: ::.:::.:::::: ::::::: CCDS55 IRHMVKSQVFYWIVLSLVALNTACVAIVHHNQPQWLTHLLYYAEFLFLGLFLLEMSLKMY 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 GLGPRSYFRSSFNCFDFGVIVGSVFEVVWAAIKPGSSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWSS :.::: ::.:::::::::: :::.:::::: ..::.:::::::::::::::::.::::.: CCDS55 GMGPRLYFHSSFNCFDFGVTVGSIFEVVWAIFRPGTSFGISVLRALRLLRIFKITKYWAS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 LRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLFGGQFNFQDETPTTNFDTFPAAIL ::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::.: ::..:::::::::. 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CCDS55 SNT---IGSAPPLRHSWQ-MPNGHYRRRRRGGPGPGMMCGAVNNLLSDTEEDDKC 2210 2220 2230 2240 2250 >>CCDS45999.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2261 aa) initn: 6649 init1: 1858 opt: 4580 Z-score: 2553.7 bits: 486.4 E(32554): 6.4e-136 Smith-Waterman score: 8832; 63.9% identity (80.4% similar) in 2234 aa overlap (61-2163:64-2261) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 GPGPGGLQPGQRVLYKQSIAQRARTMALYNPIPVKQNCFTVNRSLFVFSEDNVVRKYAKR ::::.:::.:::::::.::::::::::::. 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CCDS45 STDLTVGKIYAAMMIMEYYRQSKAKKLQAMREEQDRTPLMFQRMEPPS---PTQ----EG 1950 1960 1970 1980 1990 2000 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 QPAVLRGARVFLRQKSSTSLSNGGAIQNQESGIKESVSWGTQRTQDAPHEARP--PLERG : : .. ::.:. :::.. .:::.::: :: :::.:. ... : :.: CCDS45 GP----GQNAL----PSTQLDPGGALMAHESGLKESPSWVTQRAQEMFQKTGTWSP-EQG 2010 2020 2030 2040 2050 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KE2 HSTEIPVGRSGALAVDVQMQSITRRG-PDGEPQPGLESQGRAASMPRLAAETQ-----P- :..: .. .. .: .:. . : : :.: .:.:::::::::: ::.: : CCDS45 PPTDMPNSQPNSQSV--EMREMGRDGYSDSEHYLPMEGQGRAASMPRLPAENQRRRGRPR 2060 2070 2080 2090 2100 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KE2 ------VTDASPMKRSISTLAQRPRGTHLCSTTPDRPPPSQASSHHHHHRCHRRRDRKQR ..:.:::::: :.:. :.. .: . . .: :: . . ::. :::::..: CCDS45 GNNLSTISDTSPMKRSASVLG--PKARRLDDYSLERVPPEENQRHHQ-----RRRDRSHR 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KE2 SLEKGPSLSADMDGAPSSAVGPGLPPGEGPTGCRRERERRQERGRSQERRQPSSSSSEKQ . :.. . .:.: . .. .. :. :. .:: ::::: ..:.. . ... CCDS45 ASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPS-----KERDQERGRPKDRKHRQHHHHHHH 2170 2180 2190 2200 2210 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 RFY----SCDRFGGREPPKPKPSLSSH--PTSPTAGQEPGPHPQGSGSVNGSPLLSTSGA . . . ::.. ..: . . .. ::. :.: : : CCDS45 HHHPPPPDKDRYAQERPDHGRARARDQRWSRSPSEGREHMAHRQ 2220 2230 2240 2250 2260 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KE2 STPGRGGRRQLPQTPLTPRPSITYKTANSSPIHFAGAQTSLPAFSPGRLSRGLSEHNALL >>CCDS45998.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2506 aa) initn: 7307 init1: 2644 opt: 4512 Z-score: 2515.4 bits: 479.5 E(32554): 8.7e-134 Smith-Waterman score: 9297; 62.7% identity (79.4% similar) in 2413 aa overlap (1-2268:1-2375) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MVRFGDELGGRYGGPGGGERAR---GGGAG-GAGGPGPGGLQPGQRVLYKQSIAQRARTM :.:::::. .:::: :.: : :.:.: :::: :: ::: . .::::.::::::: CCDS45 MARFGDEMPARYGGGGSGAAAGVVVGSGGGRGAGGSRQGG-QPGAQRMYKQSMAQRARTM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ALYNPIPVKQNCFTVNRSLFVFSEDNVVRKYAKRITEWPPFEYMILATIIANCIVLALEQ ::::::::.:::.:::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: CCDS45 ALYNPIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITEWPPFEYMILATIIANCIVLALEQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 HLPDGDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALGFVFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLT :::: :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS45 HLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALGFAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GILATAGTDFDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMKAMVPLLQIGLLLFFAILM :::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::. 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CCDS45 YTIRILLWTFVQSFKALPYVCLLIAMLFFIYAIIGMQVFGNIGIDVEDEDSDEDEFQITE 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KE2 HNNFRTFLQALMLLFRSATGEAWHEIMLSCLSNQACDEQAN--ATECGSDFAYFYFVSFI :::::::.::::::::::::::::.:::::::.. ::.... . :::..:::::::::: CCDS45 HNNFRTFFQALMLLFRSATGEAWHNIMLSCLSGKPCDKNSGILTRECGNEFAYFYFVSFI 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KE2 FLCSFLMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHHLDEFIRVWAEYDPAACGRISYNDMFEM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::: ::. : ::..: CCDS45 FLCSFLMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHHLDEYVRVWAEYDPAAWGRMPYLDMYQM 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KE2 LKHMSPPLGLGKKCPARVAYKRLVRMNMPISNEDMTVHFTSTLMALIRTALEIKLAPAGT :.:::::::::::::::::::::.::..:... : ::::.:::::::::::.::.: .:. CCDS45 LRHMSPPLGLGKKCPARVAYKRLLRMDLPVAD-DNTVHFNSTLMALIRTALDIKIAKGGA 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1820 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KE2 KQHQCDAELRKEISVVWANLPQKTLDLLVPPHKPDEMTVGKVYAALMIFDFYKQNKTT-- ..: :::::::. ..: :: :::::::: ::: ..::::.:::.::...:.:.:. CCDS45 DKQQMDAELRKEMMAIWPNLSQKTLDLLVTPHKSTDLTVGKIYAAMMIMEYYRQSKAKKL 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE2 ---RDQMQQAPGGLSQMGPVSLFHPLKATLEQTQPAVLRGARVFLRQKSSTSLSNGGAIQ :......: ...: : : : . . : : .. ::.:. :::.. CCDS45 QAMREEQDRTPLMFQRMEPPS---PTQ----EGGP----GQNAL----PSTQLDPGGALM 1980 1990 2000 2010 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 NQESGIKESVSWGTQRTQDAPHEARP--PLERGHSTEIPVGRSGALAVDVQMQSITRRG- .:::.::: :: :::.:. ... : :.: :..: .. .. .: .:. . : : CCDS45 AHESGLKESPSWVTQRAQEMFQKTGTWSP-EQGPPTDMPNSQPNSQSV--EMREMGRDGY 2020 2030 2040 2050 2060 2070 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KE2 PDGEPQPGLESQGRAASMPRLAAETQ-----P-------VTDASPMKRSISTLAQRPRGT :.: .:.:::::::::: ::.: : ..:.:::::: :.:. :.. CCDS45 SDSEHYLPMEGQGRAASMPRLPAENQRRRGRPRGNNLSTISDTSPMKRSASVLG--PKAR 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KE2 HLCSTTPDRPPPSQASSHHHHHRCHRRRDRKQRSLEKGPSLSADMDGAPSSAVGPGLPPG .: . . .: :: . . ::. :::::..:. :.. . .:.: . .. .. : CCDS45 RLDDYSLERVPPEENQRHHQ-----RRRDRSHRASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSG 2140 2150 2160 2170 2180 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE2 EGPTGCRRERERRQERGRSQERRQPSSSSSEKQRFY----SCDRFGGREPPKPKPSLSSH . :. .:: ::::: ..:.. . .... . . ::.. ..: . . .. CCDS45 DLPS-----KERDQERGRPKDRKHRQHHHHHHHHHHPPPPDKDRYAQERPDHGRARARDQ 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KE2 --PTSPTAGQEPGPHPQGSGSVNGSPLLSTSGASTPGRGGRRQLPQTPLTPRPSITY--- ::. :.: : :::.::.::: ::::.::: : ::::::::: :::: ..: CCDS45 RWSRSPSEGREHMAHRQGSSSVSGSPAPSTSGTSTP-RRGRRQLPQTPSTPRPHVSYSPV 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2210 2220 2230 2240 2250 pF1KE2 --KTANSSPIHFAGAQTSLP----AFSPGRLSRGLSEHNALLQRDPLS--QPLAPGSRIG :...:.: . : . . ::: . . .. .::. .: . : : CCDS45 IRKAGGSGPPQQQQQQQQQQQQQAVARPGRAATSGPRRYPGPTAEPLAGDRPPTGGHSSG 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2260 2270 2280 2290 2300 2310 pF1KE2 SDPYLGQRLDSEASVHALPEDTLTFEEAVATNSGRSSRTSYVSSLTSQSHPLRRVPNGYH .: . .:. . : CCDS45 RSPRMERRVPGPARSESPRACRHGGARWPASGPHVSEGPPGPRHHGYYRGSDYDEADGPG 2370 2380 2390 2400 2410 2420 >>CCDS53443.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2270 aa) initn: 5536 init1: 2321 opt: 3766 Z-score: 2101.8 bits: 402.8 E(32554): 9.5e-111 Smith-Waterman score: 7808; 56.6% identity (74.2% similar) in 2378 aa overlap (1-2315:1-2240) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MVRFGDELGGRYGGPGGGERARGGGAGGAGGPGPGGLQPGQRVLYKQSIAQRARTMALYN :.:::. . .: ::.:. . . : : :.. :: . :::. ::::::::::: CCDS53 MARFGEAVVAR---PGSGDGDSDQSRNRQGTPVPAS---GQAAAYKQTKAQRARTMALYN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 PIPVKQNCFTVNRSLFVFSEDNVVRKYAKRITEWPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPD ::::.:::::::::::.:.:::.::::::.. .::::::::::::::::::::::::::. 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CCDS53 LSGEFAKERERVENRRAFMKLRRQQQIERELNGYRAWIDKAEEVMLAEENKNAGT-SALE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 VLKRAATKKSRNDLIHAEEGEDRFADLCAVGSPFARASLKSGKTESSSYFRRKEKMFRFF ::.::. :.::.. . . .... .:. .::.:.::::.::.:... ::::.::...:. CCDS53 VLRRATIKRSRTEAMTRDSSDEHCVDISSVGTPLARASIKSAKVDGVSYFRHKERLLRIS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 IRRMVKAQSFYWVVLCVVALNTLCVAMVHYNQPRRLTTTLYFAEFVFLGLFLTEMSLKMY ::.:::.: :::.:: .::::: :::.::.:::. :: ::.:::.:::::: ::::::: CCDS53 IRHMVKSQVFYWIVLSLVALNTACVAIVHHNQPQWLTHLLYYAEFLFLGLFLLEMSLKMY 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 GLGPRSYFRSSFNCFDFGVIVGSVFEVVWAAIKPGSSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWSS :.::: ::.:::::::::: :::.:::::: ..::.:::::::::::::::::.::::.: CCDS53 GMGPRLYFHSSFNCFDFGVTVGSIFEVVWAIFRPGTSFGISVLRALRLLRIFKITKYWAS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 LRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLFGGQFNFQDETPTTNFDTFPAAIL ::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::.: ::..:::::::::. 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CCDS53 VSFIFFCSFLMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHHLDEFVRVWAEYDRAACGRIHYTE 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE2 MFEMLKHMSPPLGLGKKCPARVAYKRLVRMNMPISNEDMTVHFTSTLMALIRTALEIKLA :.::: :::::::::.::..::::::: ::::.. :::::::::::::::::::.::.: CCDS53 MYEMLTLMSPPLGLGKRCPSKVAYKRLVLMNMPVA-EDMTVHFTSTLMALIRTALDIKIA 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KE2 PAGTKQHQCDAELRKEISVVWANLPQKTLDLLVPPHKPDEMTVGKVYAALMIFDFYKQNK .:. ..: :.::.:: ..: .: :: :::::: : ...::::.:::.::.:.:::.: CCDS53 KGGADRQQLDSELQKETLAIWPHLSQKMLDLLVPMPKASDLTVGKIYAAMMIMDYYKQSK 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE2 TTRDQMQQAPGGLSQMGPVSLFHPLKATLEQTQPAVLRGARVFLRQKSSTSLSNGGAIQN . . : :: ::. ..: .: :.. : :: CCDS53 V-KKQRQQ--------------------LEEQ-----KNAPMFQRMEPS-SLP------- 1890 1900 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 QESGIKESVSWGTQRTQDAPHEARPPLERGHSTEIPVGRSGALAVDVQMQSITRRGPDGE .: .. .. :. . :. : : :::: . :.. .:. CCDS53 -----QEIIA----NAKALPYLQQDPVS-GLS-----GRSG-------YPSMSPLSPQDI 1910 1920 1930 1940 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE2 PQPGLESQGRAASMPRLAAETQPVTDASPMKRSISTLA-QRPRGTHLCSTTPDRPPPSQA : : . : . .. ::: : :.::.::. .: .. : . .: CCDS53 FQ--LACMDPADDGQFQERQSLVVTDPSSMRRSFSTIRDKRSNSSWLEEFSMER------ 1950 1960 1970 1980 1990 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE2 SSHHHHHRCHRRRDRKQRSLEKGPSLSADMDGAPSSAVGPGLPPGEGPTGCRRERERRQE ::.. .. ..:: ... ::: .. : : .: : : CCDS53 SSENTYK-------SRRRSYHSSLRLSAHRLNSDS-----GHKSDTHRSGGR-------E 2000 2010 2020 2030 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KE2 RGRSQERRQPSSSSSEKQRFYSCDRFGGREPPKPKPSLSSHPTSPTAGQEPGPHPQGSGS ::::.::.. : . .: : .: : . .: . ::. :. :. ::.:: CCDS53 RGRSKERKH--LLSPDVSRCNSEER--GTQADWESPE-RRQSRSPSEGRSQTPNRQGTGS 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE2 VNGSPLLSTSGASTPGRGGRRQLPQTPLTPRPSITYKTANSSPIHFAGAQTSLPA----- .. : . :.: .::: :. ::::: .: ::: ..: :: :. ::. : :: CCDS53 LSESSIPSVSDTSTPRRS-RRQLPPVPPKPRPLLSY----SSLIRHAGS-ISPPADGSEE 2100 2110 2120 2130 2140 2230 2240 2250 2260 2270 pF1KE2 FSPGRLSRGLSEHNALLQRD-----PLSQPLAPGSRIGSDPYLGQRLDSEASVHALPEDT :: :..: .:: : .. : .. : .: :.:::. . ::.:: :.: CCDS53 GSP-LTSQALESNNACLTESSNSPHPQQSQHASPQRYISEPYLALHEDSHAS-DCGEEET 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2280 2290 2300 2310 2320 2330 pF1KE2 LTFEEAVATNSGRSSRTSYVSSLTSQSHPLRRVPNGYHCTLGLSSGGRARHSYHHPDQDH :::: ::::. :::. ..: : . .:::.. 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CCDS55 --RSGYP---SMSPLSPQDIFQLACMDPADDGQFQE----RQ-SLEPEVSELKSVQPSNH 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KE2 G---P-DGEPQPGLESQGRAASMPRLAAETQPVTDASPMKRSISTLA-QRPRGTHLCSTT : : : . . : .:::.:::::... : ::: : :.::.::. .: .. : . CCDS55 GIYLPSDTQEHAG---SGRASSMPRLTVDPQVVTDPSSMRRSFSTIRDKRSNSSWLEEFS 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KE2 PDRPPPSQASSHHHHHRCHRRRDRKQRSLEKGPSLSADMDGAPSSAVGPGLPPGEGPTGC .: ::.. .. ..:: ... ::: .. : : .: CCDS55 MER------SSENTYK-------SRRRSYHSSLRLSAHRLNSDS-----GHKSDTHRSGG 2040 2050 2060 2070 2080 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KE2 RRERERRQERGRSQERRQPSSSSSEKQRFYSCDRFGGREPPKPKPSLSSHPTSPTAGQEP : :::::.::.. : . .: : .: : . .: . ::. :. CCDS55 R-------ERGRSKERKH--LLSPDVSRCNSEER--GTQADWESPE-RRQSRSPSEGRSQ 2090 2100 2110 2120 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KE2 GPHPQGSGSVNGSPLLSTSGASTPGRGGRRQLPQTPLTPRPSITYKTANSSPIHFAGAQT :. ::.::.. : . :.: .::: :. ::::: .: ::: ..: :: :. ::. CCDS55 TPNRQGTGSLSESSIPSVSDTSTPRRS-RRQLPPVPPKPRPLLSY----SSLIRHAGS-I 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KE2 SLPA-----FSPGRLSRGLSEHNALLQRD-----PLSQPLAPGSRIGSDPYLGQRLDSEA : :: :: :..: .:: : .. : .. : .: :.:::. . ::.: CCDS55 SPPADGSEEGSP-LTSQALESNNACLTESSNSPHPQQSQHASPQRYISEPYLALHEDSHA 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KE2 SVHALPEDTLTFEEAVATNSGRSSRTSYVSSLTSQSHPLRRVPNGYHCTLGLSSGGRARH : :.::::: ::::. :::. ..: : . .:::.. CCDS55 S-DCGEEETLTFEAAVATSLGRSNT---IGSAPPLRHSWQ-MPNGHYRRRRRGGPGPGMM 2250 2260 2270 2280 2290 2330 pF1KE2 SYHHPDQDHWC CCDS55 CGAVNNLLSDTEEDDKC 2300 2310 >>CCDS82300.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2512 aa) initn: 6144 init1: 2294 opt: 3698 Z-score: 2063.5 bits: 395.9 E(32554): 1.3e-108 Smith-Waterman score: 9023; 62.6% identity (79.4% similar) in 2350 aa overlap (64-2268:67-2381) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 PGGLQPGQRVLYKQSIAQRARTMALYNPIPVKQNCFTVNRSLFVFSEDNVVRKYAKRITE :.:::.:::::::.::::::::::::.::: CCDS82 RQGGQPGAQRMYKQSMAQRARTMALYNPIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITE 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 WPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPDGDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 WPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FVFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATAGTDFDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVL :.::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 FAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVL 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 KSIMKAMVPLLQIGLLLFFAILMFAIIGLEFYMGKFHKACFPNSTD-AEPVGDFPCGKEA :::::::.::::::::::::::.:::::::::::::: .:: ..:: . . ::: : CCDS82 KSIMKAMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEE 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 PARLCEGDTECREYWPGPNFGITNFDNILFAILTVFQCITMEGWTDILYNTNDAAGNTWN ::: : . :.:. :: ::: :::.:::::::.::::::::::::::.:::.:::.::::: CCDS82 PARTCPNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWN 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 WLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYLEWI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS82 WLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYMEWI 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 FKAEEVMLAEEDRNAEEKSPLD-VLKRAATKKSRNDLIHAEEGEDRFADLCAVGSPFARA :::::.:::.. ..:.. :.: .:.:.. :::..::.. ::.::..::. .:::::::: CCDS82 SKAEEVILAEDETDGEQRHPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARA 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 SLKSGKTESSSYFRRKEKMFRFFIRRMVKAQSFYWVVLCVVALNTLCVAMVHYNQPRRLT :.::.: :.:..:..::. .::.::::::.:.:::.:: .:::::::::.::::::. :. CCDS82 SIKSAKLENSTFFHKKERRMRFYIRRMVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHYNQPEWLS 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 TTLYFAEFVFLGLFLTEMSLKMYGLGPRSYFRSSFNCFDFGVIVGSVFEVVWAAIKPGSS ::.:::.:::::..:: .:::::: : ::.::::::: :::.::.:::.::.::::.: CCDS82 DFLYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYGLGTRPYFHSSFNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIKPGTS 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 FGISVLRALRLLRIFKVTKYWSSLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLF :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 FGISVLRALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLF 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 GGQFNFQDETPTTNFDTFPAAILTVFQILTGEDWNAVMYHGIESQGGVSKGMFSSFYFIV ::::::.. :: ::::::::::.:::::::::::: ::: ::.:::::. :: :.:::: CCDS82 GGQFNFDEGTPPTNFDTFPAAIMTVFQILTGEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIV 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 LTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTK---DEEEMEEAANQKLALQKAKEVAEVSPMS ::::::::::::::::::::::::::::: ::.: :::::::::::::::::::::.: CCDS82 LTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTKVEADEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLS 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 AANISIAARQQ--NSAKARSVWEQRASQLRLQNLRASCEALYSEMDPEERLRFATTRHLR :::.:::...: :. :.::::::.:..: ::: :: ::::.::::.:: . : ::::: CCDS82 AANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEMRKQNLLASREALYNEMDPDERWKAAYTRHLR 760 770 780 790 800 810 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 PDMKTHLDRPLVVELGRDGARGPVGGKARPEAAEAPEGV----DPPRRHHRHRDKDKTPA :::::::::::::. .. . ..: ... : : :.. :..:. . :. CCDS82 PDMKTHLDRPLVVDPQENRNNNTNKSRAAEPTVDQRLGQQRAEDFLRKQARYHDRARDPS 820 830 840 850 860 870 870 880 890 900 910 pF1KE2 AGDQDRAEAPKAESGEPGAREERPRPHRS--HSKEAA----GPPEARSERGRGPGP---- .. :. : : : : .: : ..: :..:.. : :...:::.. : CCDS82 GSAGLDARRPWAGSQEAELSREGPYGRESDHHAREGSLEQPGFWEGEAERGKAGDPHRRH 880 890 900 910 920 930 920 930 940 950 960 pF1KE2 ---EGGRRHHRRGSPEEAAEREPRRHRAHRHQDPSKECAGAKGERRARHRGG--P-RAGP .:: :. : :::. .:. : :::::::. :..: :.::::::: : : :.: CCDS82 VHRQGGSRESRSGSPRTGADGEHRRHRAHRR--PGEEGPEDKAERRARHREGSRPARGGE 940 950 960 970 980 990 970 980 990 1000 pF1KE2 REAESGEEPARRHRARHKAQPAHEA-VEKETTEKEATEKE-------------------- :.:. . ::.: :: : ..:. ...: :.. ... CCDS82 GEGEGPDGGERRRRHRHGAPATYEGDARREDKERRHRRRKENQGSGVPVSGPNLSTTRPI 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 -----------AEIVEADKEKELRNHQPREPHCDLETSG----------TVTVGPMHTLP :: .. :...: . . :: .: .: .. ::: ..: CCDS82 QQDLGRQDPPLAEDIDNMKNNKLATAESAAPHGSLGHAGLPQSPAKMGNSTDPGPMLAIP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1050 1060 1070 pF1KE2 S--TCLQKVEEQ--PEDADNQRN------------VTR-MGSQP--------PDPNTIVH . : :.. . :.. : : :: :.: :: .: : CCDS82 AMATNPQNAASRRTPNNPGNPSNPGPPKTPENSLIVTNPSGTQTNSAKTARKPD-HTTVD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 IPVMLTGPLGEATVVPSGNVD---LESQAEGKKEVEADDVMRSGPRPIVPYSSMFCLSPT :: ::....: . :.. : .. : ::: : :: ..::.:. :::::: :: : CCDS82 IPPACPPPLNHTVVQVNKNANPDPLPKKEEEKKEEEEDDRGEDGPKPMPPYSSMFILSTT 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 NLLRRFCHYIVTMRYFEVVILVVIALSSIALAAEDPVRTDSPRNNALKYLDYIFTGVFTF : :::.::::...::::. ::.:::.:::::::::::. ..::::.:.:.::.::::::: CCDS82 NPLRRLCHYILNLRYFEMCILMVIAMSSIALAAEDPVQPNAPRNNVLRYFDYVFTGVFTF 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 EMVIKMIDLGLLLHPGAYFRDLWNILDFIVVSGALVAFAFSG-SKGKDINTIKSLRVLRV :::::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::.: ::::::::::::::::: CCDS82 EMVIKMIDLGLVLHQGAYFRDLWNILDFIVVSGALVAFAFTGNSKGKDINTIKSLRVLRV 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 LRPLKTIKRLPKLKAVFDCVVNSLKNVLNILIVYMLFMFIFAVIAVQLFKGKFFYCTDES :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::.::::: CCDS82 LRPLKTIKRLPKLKAVFDCVVNSLKNVFNILIVYMLFMFIFAVVAVQLFKGKFFHCTDES 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 KELERDCRGQYLDYEKEEVEAQPRQWKKYDFHYDNVLWALLTLFTVSTGEGWPMVLKHSV ::.:.::::.:: :::.::.:. :.::::.:::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS82 KEFEKDCRGKYLLYEKNEVKARDREWKKYEFHYDNVLWALLTLFTVSTGEGWPQVLKHSV 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 DATYEEQGPSPGYRMELSIFYVVYFVVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGDKVMSECSLEKN :::.:.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.: : ::::: CCDS82 DATFENQGPSPGYRMEMSIFYVVYFVVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGDKMMEEYSLEKN 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 ERACIDFAISAKPLTRYMPQNRQSFQYKTWTFVVSPPFEYFIMAMIALNTVVLMMKFYDA ::::::::::::::::.::::.:::::. : ::::::::: :::::::::.::::::: : CCDS82 ERACIDFAISAKPLTRHMPQNKQSFQYRMWQFVVSPPFEYTIMAMIALNTIVLMMKFYGA 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 PYEYELMLKCLNIVFTSMFSMECVLKIIAFGVLNYFRDAWNVFDFVTVLGSITDILVTEI :: :. .::::::.::.:::::..:::.:::::::::.:::::::::::::::::. 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CCDS82 IGMQVFGNIGIDVEDEDSDEDEFQITEHNNFRTFFQALMLLFRSATGEAWHNIMLSCLSG 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 QACDEQAN--ATECGSDFAYFYFVSFIFLCSFLMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHH . ::.... . :::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 KPCDKNSGILTRECGNEFAYFYFVSFIFLCSFLMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHH 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 LDEFIRVWAEYDPAACGRISYNDMFEMLKHMSPPLGLGKKCPARVAYKRLVRMNMPISNE :::..:::::::::: ::. : ::..::.:::::::::::::::::::::.::..:... 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CCDS82 STDLTVGKIYAAMMIMEYYRQSKAKKLQAMREEQDRTPLMFQRMEPPS---P----TQEG 1960 1970 1980 1990 2000 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 QPAVLRGARVFLRQKSSTSLSNGGAIQNQESGIKESVSWGTQRTQDAPHEARP--PLERG : : .. ::.:. :::.. .:::.::: :: :::.:. ... : :.: CCDS82 GP----GQNAL----PSTQLDPGGALMAHESGLKESPSWVTQRAQEMFQKTGTWSP-EQG 2010 2020 2030 2040 2050 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KE2 HSTEIPVGRSGALAVDVQMQSITRRG-PDGEPQPGLESQGRAASMPRLAAETQ-----P- :..: .. .. .:. :. . : : :.: .:.:::::::::: ::.: : CCDS82 PPTDMPNSQPNSQSVE--MREMGRDGYSDSEHYLPMEGQGRAASMPRLPAENQRRRGRPR 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KE2 ------VTDASPMKRSISTLAQRPRGTHLCSTTPDRPPPSQASSHHHHHRCHRRRDRKQR ..:.:::::: :.:. :.. .: . . .: :: . . ::. :::::..: CCDS82 GNNLSTISDTSPMKRSASVLG--PKARRLDDYSLERVPPEENQRHHQ-----RRRDRSHR 2120 2130 2140 2150 2160 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KE2 SLEKGPSLSADMDGAPSSAVGPGLPPGEGPTGCRRERERRQERGRSQERRQPSSSSSEKQ . :.. . .:.: . .. .. :. :. .:: ::::: ..:.. . ... CCDS82 ASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPS-----KERDQERGRPKDRKHRQHHHHHHH 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 RFY----SCDRFGGREPPKPKPSLSSH--PTSPTAGQEPGPHPQGSGSVNGSPLLSTSGA . . . ::.. ..: . . .. ::. :.: : :::.::.::: ::::. CCDS82 HHHPPPPDKDRYAQERPDHGRARARDQRWSRSPSEGREHMAHRQGSSSVSGSPAPSTSGT 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KE2 STPGRGGRRQLPQTPLTPRPSITY-----KTANSSPIHFAGAQTSLP----AFSPGRLSR ::: :: :::::::: :::: ..: :...:.: . : . . ::: . CCDS82 STPRRG-RRQLPQTPSTPRPHVSYSPVIRKAGGSGPPQQQQQQQQQQQQQAVARPGRAAT 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KE2 GLSEHNALLQRDPLS--QPLAPGSRIGSDPYLGQRLDSEASVHALPEDTLTFEEAVATNS . .. .::. .: . : : .: . .:. . : CCDS82 SGPRRYPGPTAEPLAGDRPPTGGHSSGRSPRMERRVPGPARSESPRACRHGGARWPASGP 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2290 2300 2310 2320 2330 pF1KE2 GRSSRTSYVSSLTSQSHPLRRVPNGYHCTLGLSSGGRARHSYHHPDQDHWC CCDS82 HVSEGPPGPRHHGYYRGSDYDEADGPGSGGGEEAMAGAYDAPPPVRHASSGATGRSPRTP 2410 2420 2430 2440 2450 2460 >>CCDS82302.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2263 aa) initn: 6331 init1: 2294 opt: 3510 Z-score: 1959.7 bits: 376.5 E(32554): 7.8e-103 Smith-Waterman score: 8864; 64.0% identity (80.5% similar) in 2234 aa overlap (61-2163:64-2263) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 GPGPGGLQPGQRVLYKQSIAQRARTMALYNPIPVKQNCFTVNRSLFVFSEDNVVRKYAKR ::::.:::.:::::::.::::::::::::. 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CCDS82 ASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPS-----KERDQERGRPKDRKHRQHHHHHHH 2170 2180 2190 2200 2210 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 RFY----SCDRFGGREPPKPKPSLSSH--PTSPTAGQEPGPHPQGSGSVNGSPLLSTSGA . . . ::.. ..: . . .. ::. :.: : : CCDS82 HHHPPPPDKDRYAQERPDHGRARARDQRWSRSPSEGREHMAHRQ 2220 2230 2240 2250 2260 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KE2 STPGRGGRRQLPQTPLTPRPSITYKTANSSPIHFAGAQTSLPAFSPGRLSRGLSEHNALL >>CCDS82301.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19 (2266 aa) initn: 6144 init1: 2294 opt: 3510 Z-score: 1959.7 bits: 376.5 E(32554): 7.8e-103 Smith-Waterman score: 8823; 63.9% identity (80.4% similar) in 2234 aa overlap (64-2163:67-2266) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 PGGLQPGQRVLYKQSIAQRARTMALYNPIPVKQNCFTVNRSLFVFSEDNVVRKYAKRITE :.:::.:::::::.::::::::::::.::: CCDS82 RQGGQPGAQRMYKQSMAQRARTMALYNPIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITE 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 WPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPDGDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 WPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FVFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATAGTDFDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVL :.::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 FAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVL 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 KSIMKAMVPLLQIGLLLFFAILMFAIIGLEFYMGKFHKACFPNSTD-AEPVGDFPCGKEA :::::::.::::::::::::::.:::::::::::::: .:: ..:: . . ::: : CCDS82 KSIMKAMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEE 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 PARLCEGDTECREYWPGPNFGITNFDNILFAILTVFQCITMEGWTDILYNTNDAAGNTWN ::: : . :.:. :: ::: :::.:::::::.::::::::::::::.:::.:::.::::: CCDS82 PARTCPNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWN 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 WLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYLEWI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS82 WLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYMEWI 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 FKAEEVMLAEEDRNAEEKSPLD-VLKRAATKKSRNDLIHAEEGEDRFADLCAVGSPFARA :::::.:::.. ..:.. :.: .:.:.. :::..::.. ::.::..::. .:::::::: CCDS82 SKAEEVILAEDETDGEQRHPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARA 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 SLKSGKTESSSYFRRKEKMFRFFIRRMVKAQSFYWVVLCVVALNTLCVAMVHYNQPRRLT :.::.: :.:..:..::. .::.::::::.:.:::.:: .:::::::::.::::::. :. 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