FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3145, 354 aa 1>>>pF1KE3145 354 - 354 aa - 354 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3818+/-0.00106; mu= 16.4743+/- 0.064 mean_var=70.8979+/-13.717, 0's: 0 Z-trim(103.4): 48 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.152320 statistics sampled from 7356 (7402) to 7356 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16 Scan time: 2.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 2320 519.2 2.1e-147 CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1940 435.7 2.9e-122 CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1860 418.1 5.6e-117 CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1697 382.3 3.5e-106 CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1685 379.6 2.1e-105 CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1678 378.1 6.2e-105 CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1562 352.6 2.7e-97 CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1562 352.6 2.8e-97 CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 1483 335.2 4.4e-92 CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 1481 334.8 5.9e-92 CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1470 332.4 3.6e-91 CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1459 330.0 1.9e-90 CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1407 318.5 5.3e-87 CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1114 254.1 1.3e-67 CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1106 252.4 4.4e-67 CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1103 251.7 6.9e-67 CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 932 214.2 1.5e-55 CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 873 201.2 1.2e-51 CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 869 200.3 2.2e-51 CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 825 190.7 1.8e-48 CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 818 189.1 5.1e-48 CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 818 189.1 5.2e-48 CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 812 187.8 1.5e-47 CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 727 169.1 4.7e-42 CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 660 154.3 1.1e-37 CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 648 151.8 9.3e-37 CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 648 151.8 9.3e-37 CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 648 152.0 2.1e-36 CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 629 147.5 1.4e-35 CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 360 88.3 5.4e-18 >>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 (354 aa) initn: 2320 init1: 2320 opt: 2320 Z-score: 2759.8 bits: 519.2 E(32554): 2.1e-147 Smith-Waterman score: 2320; 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68.7% identity (90.7% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-355) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG :: .:.:.: .:.::: ..:.:.::.:. :: ::::::::::::::::::::::::..: CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT :::.:: ...::.::::.:::.:::::: .: ::...: :.: :::.:.. : :. :. CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 PQ-LAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRV :. :. ::.::: : :.:::: :. :::::::::::::::.::. : :.:..::::..:: CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KTTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEE :::::.::.:.::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.::::::.::.:::: CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VNRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDA .::::::..::.::::.:.:. :::.:::::::.:.::.:. :.:::::::: : ...: CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF ..::...: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::::::: CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF 310 320 330 340 350 >>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa) initn: 1685 init1: 1685 opt: 1685 Z-score: 2005.6 bits: 379.6 E(32554): 2.1e-105 Smith-Waterman score: 1685; 68.4% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG :: .:.:.: ...::: ....:.::.:. :: ::::::::::::::::::::::::. : CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT :::.:: ..:::.::::.:::.::..:: : ::. . :.: :::...:.. :.: :: CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK .:: ::::::.: :.::::.:. ::::::::::::::::::. .:.:..::::..::: CCDS55 AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV ::::.::.:.::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::::. CCDS55 TTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG ::::::..::.::::.:.:. :::.:::::::.:.::. : :.::.:::.: ::.:.:. CCDS55 NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF ::. :: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::::::: CCDS55 AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF 310 320 330 340 350 >>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa) initn: 1678 init1: 1678 opt: 1678 Z-score: 1997.3 bits: 378.1 E(32554): 6.2e-105 Smith-Waterman score: 1678; 67.5% identity (90.4% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG :: .:.:.: ...::: ....:.::.:. :. ::::::::::::::::::::::::..: CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT :::.:: ..:.:.::::.:::.::..:: : ::. . :.: :::...:.. :.: :: CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK :.:: :::::::: :.:::: :. ::::::::.:::::::::. :.:.:..::::..::: CCDS80 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV ::::.::.:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::::. CCDS80 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG ::::::..::.::::.:.:. :::.:::::::.:.::. . :.::.::::: ::.:.:. CCDS80 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF ::. :: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::. CCDS80 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY 310 320 330 340 350 >>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (318 aa) initn: 1222 init1: 1222 opt: 1562 Z-score: 1860.2 bits: 352.6 E(32554): 2.7e-97 Smith-Waterman score: 1562; 70.3% identity (91.5% similar) in 316 aa overlap (40-354:3-318) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 KESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNGYSEQECMEF ::::::::::::::::::..::::.:: .. 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CCDS59 MKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSII 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 AIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMTPQLAEVIKRLWRDPGIQACFER ::..:: : ::. . :.: :::...:.. :.: :: .:: ::::::.: :.::::.: CCDS59 AIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNR 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 ASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVKTTGIIETQFSFKDLHFRMFDVG . ::::::::::::::::::. .:.:..::::..:::::::.::.:.::::::.::::: CCDS59 SREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVG 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 GQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEVNRMHESLHLFNSICNHKYFSTT ::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::::.::::::..::.::::.:.:. : CCDS59 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDT 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAGNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSH ::.:::::::.:.::. : :.::.:::.: ::.:.:. ::. :: ::: .:. ::::.: CCDS59 SIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTH 220 230 240 250 260 270 330 340 350 pF1KE3 MTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF .::::::.::.::::::::.:::.:::::::: CCDS59 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF 280 290 300 354 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 19:57:38 2016 done: Mon Nov 7 19:57:39 2016 Total Scan time: 2.600 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]