seq1 = pF1KE3410.tfa, 930 bp seq2 = pF1KE3410/gi568815592f_41950542.tfa (gi568815592f:41950542_42177241), 226700 bp >pF1KE3410 930 >gi568815592f:41950542_42177241 (Chr6) 1-45 (100001-100045) 100% -> 46-202 (100816-100972) 100% -> 203-301 (104990-105088) 100% -> 302-364 (105411-105473) 100% -> 365-489 (106848-106972) 100% -> 490-637 (115771-115918) 100% -> 638-780 (117924-118066) 100% -> 781-922 (126559-126700) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCCGACGCGGCGGCCACAGCTGGGGCCGGTGGCTCCGGAACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 100001 ATGGCCGACGCGGCGGCCACAGCTGGGGCCGGTGGCTCCGGAACGGTA.. 50 . : . : . : . : . : 46 AGATCGGGAAGTAAACAGTCCACTAACCCTGCCGATAACTATCATC .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 .CAGAGATCGGGAAGTAAACAGTCCACTAACCCTGCCGATAACTATCATC 100 . : . : . : . : . : 92 TGGCCCGGAGGAGAACCCTGCAGGTGGTTGTGAGCTCCTTGCTGACAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100862 TGGCCCGGAGGAGAACCCTGCAGGTGGTTGTGAGCTCCTTGCTGACAGAG 150 . : . : . : . : . : 142 GCAGGGTTTGAGAGTGCCGAGAAAGCATCCGTGGAAACGCTGACAGAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100912 GCAGGGTTTGAGAGTGCCGAGAAAGCATCCGTGGAAACGCTGACAGAGAT 200 . : . : . : . : . : 192 GCTGCAGAGCT ACATTTCAGAAATTGGGAGAAGTGCCAAGT |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 100962 GCTGCAGAGCTGTG...TAGACATTTCAGAAATTGGGAGAAGTGCCAAGT 250 . : . : . : . : . : 233 CTTACTGTGAGCACACAGCCAGGACCCAGCCCACACTGTCCGATATCGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105020 CTTACTGTGAGCACACAGCCAGGACCCAGCCCACACTGTCCGATATCGTG 300 . : . : . : . : . : 283 GTCACACTTGTTGAGATGG GTTTCAATGTGGACACTCTCCC |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 105070 GTCACACTTGTTGAGATGGGTG...TAGGTTTCAATGTGGACACTCTCCC 350 . : . : . : . : . : 324 TGCTTATGCAAAACGGTCTCAGAGGATGGTCATCACTGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 105433 TGCTTATGCAAAACGGTCTCAGAGGATGGTCATCACTGCTCGTA...CAG 400 . : . : . : . : . : 365 CTCCGGTGACCAATCAGCCAGTGACCCCCAAGGCCCTCACTGCAGGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106848 CTCCGGTGACCAATCAGCCAGTGACCCCCAAGGCCCTCACTGCAGGGCAG 450 . : . : . : . : . : 415 AACCGACCCCACCCGCCGCACATCCCCAGCCATTTTCCTGAGTTCCCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106898 AACCGACCCCACCCGCCGCACATCCCCAGCCATTTTCCTGAGTTCCCTGA 500 . : . : . : . : . : 465 TCCCCACACCTACATCAAAACTCCG ACGTACCGTGAGCCCG |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 106948 TCCCCACACCTACATCAAAACTCCGGTG...TAGACGTACCGTGAGCCCG 550 . : . : . : . : . : 506 TGTCAGACTACCAGGTCCTGCGGGAGAAGGCTGCATCCCAGAGGCGCGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115787 TGTCAGACTACCAGGTCCTGCGGGAGAAGGCTGCATCCCAGAGGCGCGAT 600 . : . : . : . : . : 556 GTGGAGCGGGCACTTACCCGTTTCATGGCCAAGACAGGCGAGACTCAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115837 GTGGAGCGGGCACTTACCCGTTTCATGGCCAAGACAGGCGAGACTCAGAG 650 . : . : . : . : . : 606 TCTTTTCAAAGATGACGTCAGCACATTTCCAT TGATTGCTG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 115887 TCTTTTCAAAGATGACGTCAGCACATTTCCATGTG...CAGTGATTGCTG 700 . : . : . : . : . : 647 CCAGACCTTTCACCATCCCCTACCTGACAGCTCTTCTTCCGTCTGAACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117933 CCAGACCTTTCACCATCCCCTACCTGACAGCTCTTCTTCCGTCTGAACTG 750 . : . : . : . : . : 697 GAGATGCAACAAATGGAAGAGACAGATTCCTCGGAGCAGGATGAACAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117983 GAGATGCAACAAATGGAAGAGACAGATTCCTCGGAGCAGGATGAACAGAC 800 . : . : . : . : . : 747 AGACACAGAGAACCTTGCTCTTCATATCAGCATG GAGGATT ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 118033 AGACACAGAGAACCTTGCTCTTCATATCAGCATGGTG...AAGGAGGATT 850 . : . : . : . : . : 788 CTGGAGCCGAGAAGGAGAACACCTCTGTCCTGCAGCAGAACCCCTCCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126566 CTGGAGCCGAGAAGGAGAACACCTCTGTCCTGCAGCAGAACCCCTCCTTG 900 . : . : . : . : . : 838 TCGGGTAGCCGGAATGGGGAGGAGAACATCATCGATAACCCTTATCTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126616 TCGGGTAGCCGGAATGGGGAGGAGAACATCATCGATAACCCTTATCTGCG 950 . : . : . : . 888 ACCGGTGAAGAAGCCCAAGATCCGCAGGAAGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||| 126666 GCCGGTGAAGAAGCCCAAGATCCGCAGGAAGAAGT