Result of SIM4 for pF1KE5284

seq1 = pF1KE5284.tfa, 630 bp
seq2 = pF1KE5284/gi568815579r_55051837.tfa (gi568815579r:55051837_55257134), 205298 bp

>pF1KE5284 630
>gi568815579r:55051837_55257134 (Chr19)

(complement)

24-108  (100001-100085)   100% ->
109-150  (100491-100532)   100% ->
151-282  (100803-100934)   100% ->
283-372  (102305-102394)   100% ->
373-549  (102929-103105)   100% ->
550-630  (105218-105298)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     24 GGCTAGGGAACCTCGCCCTGCACCAGCCCCAATCAGACGCCGCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GGCTAGGGAACCTCGCCCTGCACCAGCCCCAATCAGACGCCGCTCCTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     74 ACTACCGCGCTTATGCCACGGAGCCGCACGCCAAG         AAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 ACTACCGCGCTTATGCCACGGAGCCGCACGCCAAGGTG...CAGAAAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    115 TCTAAGATCTCCGCCTCGAGAAAATTGCAGCTGAAG         ACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100497 TCTAAGATCTCCGCCTCGAGAAAATTGCAGCTGAAGGTG...CAGACTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    156 GCTGCTGCAGATTGCAAAGCAAGAGCTGGAGCGAGAGGCGGAGGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100808 GCTGCTGCAGATTGCAAAGCAAGAGCTGGAGCGAGAGGCGGAGGAGCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    206 GCGGAGAGAAGGGGCGCGCTCTGAGCACCCGCTGCCAGCCGCTGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100858 GCGGAGAGAAGGGGCGCGCTCTGAGCACCCGCTGCCAGCCGCTGGAGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    256 GCCGGGCTGGGCTTCGCGGAGCTGCAG         GACTTGTGCCGACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100908 GCCGGGCTGGGCTTCGCGGAGCTGCAGGTA...CAGGACTTGTGCCGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297 GCTCCACGCCCGTGTGGACAAGGTGGATGAAGAGAGATACGACATAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102319 GCTCCACGCCCGTGTGGACAAGGTGGATGAAGAGAGATACGACATAGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    347 CAAAAGTCACCAAGAACATCACGGAG         ATTGCAGATCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102369 CAAAAGTCACCAAGAACATCACGGAGGTG...CAGATTGCAGATCTGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388 CAGAAGATCTTTGACCTTCGAGGCAAGTTTAAGCGGCCCACCCTGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102944 CAGAAGATCTTTGACCTTCGAGGCAAGTTTAAGCGGCCCACCCTGCGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    438 AGTGAGGATCTCTGCAGATGCCATGATGCAGGCGCTGCTGGGGGCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102994 AGTGAGGATCTCTGCAGATGCCATGATGCAGGCGCTGCTGGGGGCCCGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 CTAAGGAGTCCCTGGACCTGCGGGCCCACCTCAAGCAGGTGAAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103044 CTAAGGAGTCCCTGGACCTGCGGGCCCACCTCAAGCAGGTGAAGAAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GACACCGAGAAG         GAAAACCGGGAGGTGGGAGACTGGCGCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103094 GACACCGAGAAGGTG...CAGGAAAACCGGGAGGTGGGAGACTGGCGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 GAACATCGATGCACTGAGTGGAATGGAGGGCCGCAAGAAAAAGTTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105247 GAACATCGATGCACTGAGTGGAATGGAGGGCCGCAAGAAAAAGTTTGAGA

    650 
    629 GC
        ||
 105297 GC

Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com