seq1 = pF1KE2661.tfa, 1935 bp seq2 = pF1KE2661/gi568815595r_143166705.tfa (gi568815595r:143166705_143948322), 781618 bp >pF1KE2661 1935 >gi568815595r:143166705_143948322 (Chr3) (complement) 1-175 (100001-100175) 100% -> 176-378 (116102-116304) 100% -> 379-456 (151420-151497) 100% -> 457-533 (153246-153322) 100% -> 534-649 (255016-255131) 100% -> 650-755 (295963-296068) 100% -> 756-899 (369600-369743) 97% <- 900-1000 (374135-374235) 100% -> 1001-1089 (395873-395961) 100% -> 1090-1203 (452875-452988) 100% -> 1204-1315 (454559-454670) 100% -> 1316-1469 (481133-481286) 99% == 1521-1604 (584756-584839) 100% -> 1605-1710 (679343-679448) 100% -> 1711-1935 (681394-681618) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCA 50 . : . : . : . : . : 51 ACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCTTGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 ACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCTTGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTA 100 . : . : . : . : . : 101 CCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGCAT 150 . : . : . : . : . : 151 GAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATG GCCTTATAATGGGACT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 100151 GAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGTG...TAGGCCTTATAATGGGACT 200 . : . : . : . : . : 192 AATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGATATTGAAAGTGGAACTGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116118 AATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGATATTGAAAGTGGAACTGTCT 250 . : . : . : . : . : 242 ATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116168 ATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATC 300 . : . : . : . : . : 292 ACTGACCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116218 ACTGACCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAA 350 . : . : . : . : . : 342 CATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATACTTGAAAAG ATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 116268 CATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATACTTGAAAAGGTA...CAGATGA 400 . : . : . : . : . : 383 CATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151424 CATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTT 450 . : . : . : . : . : 433 CATGCAGGATATAGTCTAAAGAAG AGACACTTTTTTCAAAA ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 151474 CATGCAGGATATAGTCTAAAGAAGGTA...CAGAGACACTTTTTTCAAAA 500 . : . : . : . : . : 474 CTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTCCTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153263 CTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTCCTGCA 550 . : . : . : . : . : 524 TCGTCATAGG GTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 153313 TCGTCATAGGGTA...CAGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATG 600 . : . : . : . : . : 565 ATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAGACTTTCATTTCACTGACTGTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 255047 ATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAGACTTTCATTTCACTGACTGTTT 650 . : . : . : . : . : 615 ATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAG TGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 255097 ATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGGTA...TAGTGACAG 700 . : . : . : . : . : 656 TGCTGGCCATTTTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295969 TGCTGGCCATTTTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTC 750 . : . : . : . : . : 706 TTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGCCATAGTCCTTACATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 296019 TTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGCCATAGTCCTTACATA 800 . : . : . : . : . : 756 TTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCAT >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 296069 GTA...CAGTTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCAT 850 . : . : . : . : . : 797 TTGATGCCGCAGCATTCTTCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 369641 TTGATGCCGCAGCATTCTTCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTC 900 . : . : . : . : . : 847 GCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACAGCACTGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 369691 GCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACAGCACTGAT 950 . : . : . : . : . : 897 GAC CAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAA |<<<...<<<|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 369741 ATCCTT...GACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAA 1000 . : . : . : . : . : 938 CCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTGGAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 374173 CCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTGGAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCT 1050 . : . : . : . : . : 988 GCCGGCCTAACAG GGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGT |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 374223 GCCGGCCTAACAGGTC...CAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGT 1100 . : . : . : . : . : 1029 CACACAAGCACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 395901 CACACAAGCACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAA 1150 . : . : . : . : . : 1079 GAACTAAACAG TTGTTTGAATTTATGAACTTTTTGGCGGAG |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 395951 GAACTAAACAGGTA...CAGTTGTTTGAATTTATGAACTTTTTGGCGGAG 1200 . : . : . : . : . : 1120 AACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 452905 AACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCA 1250 . : . : . : . : . : 1170 TATCTTTAATGCTCTTTTTATACTTGGAGCCTTT CTAGCAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 452955 TATCTTTAATGCTCTTTTTATACTTGGAGCCTTTGTA...CAGCTAGCAA 1300 . : . : . : . : . : 1211 TTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 454566 TTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGAAT 1350 . : . : . : . : . : 1261 CTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 454616 CTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTT 1400 . : . : . : . : . : 1311 TTCAG GTTTGCGAGGAGCTATCGCATTTGCCTTAGCTATTC |||||>>>...>>>||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 454666 TTCAGGTA...AAGGTTTGCGAGGAGCGATCGCATTTGCCTTAGCTATTC 1450 . : . : . : . : . : 1352 GGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 481169 GGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTC 1500 . : . : . : . : . : 1402 CTCGTGTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 481219 CTCGTGTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTT 1550 . : . 1452 GACTTGGCTTCAGATCAG |||||||||||||||||| 481269 GACTTGGCTTCAGATCAG 0 . : . : . : . : . : 1521 CCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACGAAAGCAGAGAGTGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 584756 CCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACGAAAGCAGAGAGTGCTC 50 . : . : . : . : . : 1571 GGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAA GTATCTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 584806 GGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTA...CAGGTATCTG 100 . : . : . : . : . : 1612 AAACCAATTTTAACCCACTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 679350 AAACCAATTTTAACCCACTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGA 150 . : . : . : . : . : 1662 ATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAGCCTATGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 679400 ATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAGCCTATGGGG 200 . : . : . : . : . : 1711 GAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAG >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 679450 TA...CAGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAG 250 . : . : . : . : . : 1753 GATGAACTAGCCATAAATTACCAGGAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 681436 GATGAACTAGCCATAAATTACCAGGAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCC 300 . : . : . : . : . : 1803 TCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 681486 TCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGGCA 350 . : . : . : . : . : 1853 AGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 681536 AGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAG 400 . : . : . : 1903 CTTGAGCAAACTTTGGGTCAATCCCAGTTGAAT ||||||||||||||||||||||||||||||||| 681586 CTTGAGCAAACTTTGGGTCAATCCCAGTTGAAT