Result of FASTA (ccds) for pF1KE2607
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2607, 1104 aa
  1>>>pF1KE2607     1104 - 1104 aa - 1104 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0621+/-0.0013; mu= 23.2088+/- 0.078
 mean_var=70.1566+/-13.795, 0's: 0 Z-trim(100.1): 64  B-trim: 94 in 2/45
 Lambda= 0.153123
 statistics sampled from 5943 (5995) to 5943 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.184), width:  16
 Scan time:  3.530

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33407.1 TRPM8 gene_id:79054|Hs108|chr2         (1104) 7398 1644.8       0
CCDS13710.1 TRPM2 gene_id:7226|Hs108|chr21         (1503) 1536 349.9 2.4e-95
CCDS82681.1 TRPM2 gene_id:7226|Hs108|chr21         (1553) 1533 349.3   4e-95
CCDS31340.1 TRPM5 gene_id:29850|Hs108|chr11        (1165)  812 189.9 2.8e-47
CCDS10024.2 TRPM1 gene_id:4308|Hs108|chr15         (1603)  604 144.1 2.4e-33
CCDS58346.1 TRPM1 gene_id:4308|Hs108|chr15         (1625)  604 144.1 2.5e-33
CCDS58347.1 TRPM1 gene_id:4308|Hs108|chr15         (1642)  604 144.1 2.5e-33
CCDS65064.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9         (1556)  593 141.6 1.3e-32
CCDS6634.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9          (1566)  593 141.6 1.3e-32
CCDS6636.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9          (1569)  593 141.6 1.3e-32
CCDS6635.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9          (1579)  593 141.6 1.3e-32
CCDS43835.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9         (1707)  593 141.7 1.4e-32
CCDS6637.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9          ( 230)  523 125.6 1.3e-28
CCDS56098.1 TRPM4 gene_id:54795|Hs108|chr19        (1069)  415 102.2 6.6e-21
CCDS33073.1 TRPM4 gene_id:54795|Hs108|chr19        (1214)  415 102.2 7.3e-21
CCDS55318.1 TRPM6 gene_id:140803|Hs108|chr9        (2017)  367 91.8 1.7e-17
CCDS55319.1 TRPM6 gene_id:140803|Hs108|chr9        (2017)  367 91.8 1.7e-17
CCDS6647.1 TRPM6 gene_id:140803|Hs108|chr9         (2022)  367 91.8 1.7e-17


>>CCDS33407.1 TRPM8 gene_id:79054|Hs108|chr2              (1104 aa)
 initn: 7398 init1: 7398 opt: 7398  Z-score: 8825.6  bits: 1644.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7398; 100.0% identity (100.0% similar) in 1104 aa overlap (1-1104:1-1104)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSFRAARLSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSFRAARLSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 SKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSRLIYIAQSKGAWIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSRLIYIAQSKGAWIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 LMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 IVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 FLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 QDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLEN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 GLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKLVANFRRGFRKEDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKLVANFRRGFRKEDR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 NGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 VEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 KKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFC
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 DEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 LRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 RSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLPRFPEWITIPLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLPRFPEWITIPLV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 CIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 FYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRH
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100    
pF1KE2 RFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK
             1090      1100    

>>CCDS13710.1 TRPM2 gene_id:7226|Hs108|chr21              (1503 aa)
 initn: 2604 init1: 704 opt: 1536  Z-score: 1825.1  bits: 349.9 E(32554): 2.4e-95
Smith-Waterman score: 2894; 41.7% identity (71.2% similar) in 1116 aa overlap (38-1096:56-1162)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE2 LSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKDSKATEN-
                                     . .: ..:  :.::.:::.:...:: ..  
CCDS13 DLGMVSNLRRSNSSLFKSWRLQCPFGNNDKQESLSSWIPENIKKKECVYFVESSKLSDAG
          30        40        50        60        70        80     

           70         80          90       100       110        120
pF1KE2 --VCKCGYAQSQHME-GTQIN--QSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKK-GKYIRL
         ::.:::.. ::.: .:. .  :. .:. :::..:.:::::::: :  :..:  ::.:.
CCDS13 KVVCQCGYTHEQHLEEATKPHTFQGTQWDPKKHVQEMPTDAFGDIVFTGLSQKVKKYVRV
          90       100       110       120       130       140     

              130       140       150       160        170         
pF1KE2 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWI
       : :: . ..:.:.:::: : .:::.:::::::::: .:::...:: : :. .::. ::::
CCDS13 SQDTPSSVIYHLMTQHWGLDVPNLLISVTGGAKNFNMKPRLKSIFRRGLVKVAQTTGAWI
         150       160       170       180       190       200     

     180       190       200        210       220       230        
pF1KE2 LTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEEN-IVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLA
       .:::.: :.:: .::.::: ..: : .:. ...::.:.:: :  :. ::.     : : :
CCDS13 ITGGSHTGVMKQVGEAVRDFSLSSSYKEGELITIGVATWGTVHRREGLIH---PTGSFPA
         210       220       230       240       250          260  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 QYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGK
       .:..:.  .  :  ::.::.:..:::.: ::.  ::  ::..:::.:::.: . .. . :
CCDS13 EYILDEDGQGNLTCLDSNHSHFILVDDGTHGQYGVEIPLRTRLEKFISEQTKERGGVAIK
            270       280       290       300       310       320  

      300       310       320       330       340        350       
pF1KE2 IPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVE-DALTSSAVKEK
       ::::: .  ::  ::..:...  :  :::::::::..:::::.....  . .: : ...:
CCDS13 IPIVCVVLEGGPGTLHTIDNATTNGTPCVVVEGSGRVADVIAQVANLPVSDITISLIQQK
            330       340       350       360       370       380  

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 LVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFS
       :  :. .    . : .   : : ...:..  .::::..  . :.. :. ::  :: ::  
CCDS13 LSVFFQEMFETFTESRIVEWTKKIQDIVRRRQLLTVFREGKDGQQDVDVAILQALLKASR
            390       400       410       420       430       440  

       420        430       440       450       460       470      
pF1KE2 TSEQ-DKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRL
       ....  ..::. :::: . ::..:.: .::: .. .:. .::. .: .:::...:.::.:
CCDS13 SQDHFGHENWDHQLKLAVAWNRVDIARSEIFMDEWQWKPSDLHPTMTAALISNKPEFVKL
            450       460       470       480       490       500  

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       :::::..:..:.: :.:  :. :   : : . .::  ....    :            . 
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       . :.::::.::..::. .:: :.. :  :::. ::.:: :.: ..: ... :   ::.::
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       ::.:.:: .:. ... :.::.. ::     ..:: ::::. ::.:.: :::.::::.:..
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pF1KE2 QYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGK
       .:..:.  .  :  ::.::.:..:::.: ::.  ::  ::..:::.:::.: . .. . :
CCDS82 EYILDEDGQGNLTCLDSNHSHFILVDDGTHGQYGVEIPLRTRLEKFISEQTKERGGVAIK
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pF1KE2 DLKGLLKEIANKIK                                              
                                                                   
CCDS82 WGSRTSSVCKSRQFLHLTVVESRGSEKAPVTTLACLQGCLGKHGRVDAMVDLLDLDPLKR
    1160      1170      1180      1190      1200      1210         

>>CCDS31340.1 TRPM5 gene_id:29850|Hs108|chr11             (1165 aa)
 initn: 1700 init1: 403 opt: 812  Z-score: 962.3  bits: 189.9 E(32554): 2.8e-47
Smith-Waterman score: 1995; 34.8% identity (64.1% similar) in 1102 aa overlap (104-1104:26-1103)

            80        90       100       110        120       130  
pF1KE2 QSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKK-GKYIRLSCDTDAEILYEL
                                     :...:   ::: ::..:.   .   .:..:
CCDS31      MQDVQGPRPGSPGDAEDRRELGLHRGEVNFGGSGKKRGKFVRVPSGVAPSVLFDL
                    10        20        30        40        50     

            140       150       160        170       180       190 
pF1KE2 LTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKY
       :  .::: .::::.:..:  . ::.:  .: .. . :.  ::: ::::::.. . :: ..
CCDS31 LLAEWHLPAPNLVVSLVGEEQPFAMKSWLRDVLRKGLVKAAQSTGAWILTSALRVGLARH
          60        70        80        90       100       110     

             200        210       220       230       240          
pF1KE2 IGEVVRDNTI-SRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDF-TRDP
       .:..:::... : :..  .::.:.:. : : .:  :    .:.  : ..:  ::  .. :
CCDS31 VGQAVRDHSLASTSTKVRVVAVGMASLGRVLHRRIL---EEAQEDFPVHYPEDDGGSQGP
         120       130       140       150          160       170  

     250       260       270       280       290           300     
pF1KE2 LYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGG----KIPIVCFA
       :  ::.: .:..::. :  :.    ..:: .:::.:::   : ..:::    .::..:. 
CCDS31 LCSLDSNLSHFILVEPGPPGKGDGLTELRLRLEKHISE---QRAGYGGTGSIEIPVLCLL
            180       190       200       210          220         

         310       320       330       340       350       360     
pF1KE2 QGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVRFLPRT
        .:  .::. :. ....  : ... ::: ::::.:.::.    :. ....... . .:  
CCDS31 VNGDPNTLERISRAVEQAAPWLILVGSGGIADVLAALVNQPHLLVPKVAEKQFKEKFPS-
     230       240       250       260       270       280         

         370       380       390       400       410       420     
pF1KE2 VSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSEQDKDN
        ...  :.   : : :..:   .:::::  .:. :.: ....:  :: :: ..  :. ..
CCDS31 -KHFSWEDIVRWTKLLQNITSHQHLLTVYDFEQEGSEELDTVILKALVKACKSHSQEPQD
       290       300       310       320       330       340       

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE2 WNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLENGLNLR
       .  .::: . :...:.:..:::..: .:.: ::.:::  ::....:.:::::..:: .. 
CCDS31 YLDELKLAVAWDRVDIAKSEIFNGDVEWKSCDLEEVMVDALVSNKPEFVRLFVDNGADVA
       350       360       370       380       390       400       

         490        500       510       520                        
pF1KE2 KFLTHDVLTELF-SNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDAL-------------------LTFVW
        :::.  : ::. :   ..:..  ::  ..    .:                   :  : 
CCDS31 DFLTYGRLQELYRSVSRKSLLFDLLQRKQEEARLTLAGLGTQQAREPPAGPPAFSLHEVS
       410       420       430       440       450       460       

         530           540                  550       560       570
pF1KE2 KLVANFR----RGFRKEDRNG-----------RDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAIL
       ... .:     ::: .. : :           :   .  : :..  ...: . ::.::.:
CCDS31 RVLKDFLQDACRGFYQDGRPGDRRRAEKGPAKRPTGQKWLLDLNQKSENPWRDLFLWAVL
       470       480       490       500       510       520       

              580       590       600       610       620       630
pF1KE2 QNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFT
       ::..:..  .: . .  . :::.: :.:: ....... .::  ..:   .::  :..::.
CCDS31 QNRHEMATYFWAMGQEGVAAALAACKILKEMSHLETEAEAARATRE--AKYERLALDLFS
       530       540       550       560       570         580     

              640       650       660       670       680       690
pF1KE2 ECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDT
       ::::..:  :  :::   . :. ..::.::.::  . :.:. ::: ::.. :.:...  :
CCDS31 ECYSNSEARAFALLVRRNRCWSKTTCLHLATEADAKAFFAHDGVQAFLTRIWWGDMAAGT
         590       600       610       620       630       640     

              700        710                                       
pF1KE2 KNWKIILCLFIIP-LVGCGFVSF---------------------RKKPV-----------
          .. :  :. : ::  ....:                     .:.:.           
CCDS31 PILRL-LGAFLCPALVYTNLITFSEEAPLRTGLEDLQDLDSLDTEKSPLYGLQSRVEELV
         650        660       670       680       690       700    

              720          730       740       750       760       
pF1KE2 -------DKHKK---LLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPH-P
              :.  .   ::  .  :. .: .::  :::.:.:::.::.::::.::.  :. :
CCDS31 EAPRAQGDRGPRAVFLLTRWRKFWGAPVTVFLGNVVMYFAFLFLFTYVLLVDFRPPPQGP
          710       720       730       740       750       760    

          770       780       790                800       810     
pF1KE2 --PELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNG-----VNYFT----DLWNVMDTLGLFYFIAGIVF
         ::..::  ::.:  .:.:: . .      :. ::    : ::  : ...: ::.:.. 
CCDS31 SGPEVTLYFWVFTLVLEEIRQGFFTDEDTHLVKKFTLYVGDNWNKCDMVAIFLFIVGVTC
          770       780       790       800       810       820    

         820       830       840       850       860       870     
pF1KE2 RLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFA
       :.     :.. .::... .:...:::::::::.. ..::::::...::. :::::::...
CCDS31 RML---PSAFEAGRTVLAMDFMVFTLRLIHIFAIHKQLGPKIIVVERMMKDVFFFLFFLS
             830       840       850       860       870       880 

         880       890       900       910        920       930    
pF1KE2 VWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIFRSVIYEPYLAMFGQVPSD-VDGTTYDFAHCTFTGN
       ::.::.::. :..:. .. : .:::: :.:.::: .:::.: : .: .    ..:.    
CCDS31 VWLVAYGVTTQALLHPHDGRLEWIFRRVLYRPYLQIFGQIPLDEIDEAR---VNCS----
             890       900       910       920       930           

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pF1KE2 ESKPLCVELDEHNLPR-FPEWITIPLVCIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQV
        ..:: .: :  . :  . .:..: :.  ..: ::.::.:::.:::.::  .:: : :. 
CCDS31 -THPLLLE-DSPSCPSLYANWLVILLLVTFLLVTNVLLMNLLIAMFSYTFQVVQGNADMF
           940        950       960       970       980       990  

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KE2 WKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETL
       :::::: :. ::  :  .  :::..... ..... ::   ..:  .         :....
CCDS31 WKFQRYNLIVEYHERPALAPPFILLSHLSLTLRRVFKKEAEHKREHLERDLPDPLDQKVV
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

          1060      1070       1080      1090      1100            
pF1KE2 AWEGVMKENYLVKINTKANDT-SEEMRHRFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK        
       .:: :.:::.: :.. .  :. .: .:.  ...:   . : :: .:  ..::        
CCDS31 TWETVQKENFLSKMEKRRRDSEGEVLRKTAHRVDFIAKYLGGL-REQEKRIKCLESQINY
           1060      1070      1080      1090       1100      1110 

CCDS31 CSVLVSSVADVLAQGGGPRSSQHCGEGSQLVAADHRGGLDGWEQPGAGQPPSDT
            1120      1130      1140      1150      1160     

>>CCDS10024.2 TRPM1 gene_id:4308|Hs108|chr15              (1603 aa)
 initn: 1113 init1: 266 opt: 604  Z-score: 712.0  bits: 144.1 E(32554): 2.4e-33
Smith-Waterman score: 1372; 27.7% identity (58.4% similar) in 1095 aa overlap (114-1036:69-1132)

            90       100       110       120       130       140   
pF1KE2 NQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPN
                                     :. :::.: ::  . : .:... :.:. :.
CCDS10 PEKWSVAKHTQSYPTDSYGVLEFQGGGYSNKAMYIRVSYDTKPDSLLHLMVKDWQLELPK
       40        50        60        70        80        90        

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pF1KE2 LVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTIS
       :.::: :: .:: ..:.....:.. ::  :.. ::::.:::.  :.....:....:.  :
CCDS10 LLISVHGGLQNFEMQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVSTGVISHVGDALKDH--S
      100       110       120       130       140       150        

            210       220       230       240       250       260  
pF1KE2 RSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLL
        .:.  . ::::: ::.: :.. :. . :.   .  : . . ...  : .:.:.:::..:
CCDS10 SKSRGRVCAIGIAPWGIVENKEDLV-GKDVTRVY--QTMSNPLSK--LSVLNNSHTHFIL
        160       170       180          190         200       210 

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE2 VDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKN
       .:::  :.  .:.:::  :::.:: . : ..  :  .:.: ..  :: .... .   ...
CCDS10 ADNGTLGKYGAEVKLRRLLEKHISLQKI-NTRLGQGVPLVGLVVEGGPNVVSIVLEYLQE
             220       230        240       250       260       270

              330         340       350       360       370        
pF1KE2 K--IPCVVVEGSGQIADVI--ASLVEVEDALTSSAVKEKLVRFLPRTVSRLPEEETESWI
       .  :: :. .:::. .:..  :     : .. . ...:.:.  . .: .   . .... .
CCDS10 EPPIPVVICDGSGRASDILSFAHKYCEEGGIINESLREQLLVTIQKTFNY-NKAQSHQLF
              280       290       300       310       320          

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE2 KWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQ
         . : .. ..:.::..:   :.. .  ::  :: :. ..:  :      ::.: : ::.
CCDS10 AIIMECMKKKELVTVFRMGSEGQQDIEMAILTALLKGTNVSAPD------QLSLALAWNR
     330       340       350       360       370             380   

      440       450                                                
pF1KE2 LDLANDEIFTNDRRW---------------------------------------------
       .:.: ..::.   .:                                             
CCDS10 VDIARSQIFVFGPHWPPLGSLAPPTDSKATEKEKKPPMATTKGGRGKGKGKKKGKVKEEV
           390       400       410       420       430       440   

                        460       470       480       490       500
pF1KE2 -ESAD------------LQEVMFTALIKDRPKFVRLFLENGLNLRKFLTHDVLTELFSNH
        : .:            :...:. ::. ::  ::.:..:::.:...:::   : ::....
CCDS10 EEETDPRKIELLNWVNALEQAMLDALVLDRVDFVKLLIENGVNMQHFLTIPRLEELYNTR
           450       460       470       480       490       500   

                   510         520                    530          
pF1KE2 FST-----LVYRNLQIAK--NSYNDALLT--FVWKLVA-----------NFR--------
       ..      :. :... ..   .:. .:.   .: . .            :::        
CCDS10 LGPPNTLHLLVRDVKKSNLPPDYHISLIDIGLVLEYLMGGAYRCNYTRKNFRTLYNNLFG
           510       520       530       540       550       560   

                               540       550         560       570 
pF1KE2 -------------------RGFRKEDRNGRDEMDIELHDVSPITR--HPLQALFIWAILQ
                          .: .:. .. ..:.::.. :   ..:  .:.. :..::.:.
CCDS10 PKRPKALKLLGMEDDEPPAKGKKKKKKKKEEEIDIDVDD-PAVSRFQYPFHELMVWAVLM
           570       580       590       600        610       620  

             580       590       600       610           620       
pF1KE2 NKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGE-SEELAN---EYETRAVE
       ......  .:.. .     :: : :: :..:. ... . . . :..: :   ..   :.:
CCDS10 KRQKMAVFLWQRGEESMAKALVACKLYKAMAHESSESDLVDDISQDLDNNSKDFGQLALE
            630       640       650       660       670       680  

       630       640       650       660       670       680       
pF1KE2 LFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEIS
       :. . :. ::..: .::.:  . :..:.::.::: :  . :::.   : .:. .:.:.. 
CCDS10 LLDQSYKHDEQIAMKLLTYELKNWSNSTCLKLAVAAKHRDFIAHTCSQMLLTDMWMGRLR
            690       700       710       720       730       740  

        690       700       710                                    
pF1KE2 -RDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFR----------KKPVD------------------
        : . . :.:. ... : .   :. ::          :.  :                  
CCDS10 MRKNPGLKVIMGILLPPTIL--FLEFRTYDDFSYQTSKENEDGKEKEEENTDANADAGSR
            750       760         770       780       790       800

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pF1KE2 ------KHKKLLWYYVA-----FFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPP
             .:::     ..     :...:.: : . .. :...:::: ::.:. . . :   
CCDS10 KGDEENEHKKQRSIPIGTKICEFYNAPIVKFWFYTISYLGYLLLFNYVILVRMDGWPSLQ
              810       820       830       840       850       860

       770       780       790               800       810         
pF1KE2 ELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVN--------YFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHS
       : .. : .  :  ...:.  ..  .        .. . ::. : ...  :. : ..::. 
CCDS10 EWIVISYIVSLALEKIREILMSEPGKLSQKIKVWLQEYWNITDLVAISTFMIGAILRLQ-
              870       880       890       900       910          

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pF1KE2 SNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMV
        :.  .  ::::.:.: :.. .:.. :: :.. ::: ..:. .:.::...:. .. : ..
CCDS10 -NQPYMGYGRVIYCVDIIFWYIRVLDIFGVNKYLGPYVMMIGKMMIDMLYFVVIMLVVLM
      920       930       940       950       960       970        

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pF1KE2 AFGVARQGILRQNEQ-RWRWIFRSVIYEPYLAMFGQVPSD-VDGTTYDFAHCTFTGNESK
       .::::::.::. .:.  :. . :...: ::  ..:.: .: .:          . . : .
CCDS10 SFGVARQAILHPEEKPSWK-LARNIFYMPYWMIYGEVFADQID----------LYAMEIN
      980       990       1000      1010      1020                 

       940        950            960       970       980       990 
pF1KE2 PLCVE-LDEHNLPRFPE-----WITIPLVCIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENND
       : : : : ...  :.:      :.:  :.  :.: .::::::::.:.:. :   :.  ..
CCDS10 PPCGENLYDEEGKRLPPCIPGAWLTPALMACYLLVANILLVNLLIAVFNNTFFEVKSISN
      1030      1040      1050      1060      1070      1080       

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pF1KE2 QVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNE
       :::::::: :.. . .:  .: :.:.....:... .    : :..               
CCDS10 QVWKFQRYQLIMTFHDRPVLPPPMIILSHIYIIIMRLSGRCRKKREGDQEERDRGLKLFL
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pF1KE2 TLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK       
                                                                   
CCDS10 SDEELKRLHEFEEQCVQEHFREKEDEQQSSSDERIRVTSERVENMSMRLEEINERETFMK
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>>CCDS58346.1 TRPM1 gene_id:4308|Hs108|chr15              (1625 aa)
 initn: 1113 init1: 266 opt: 604  Z-score: 711.9  bits: 144.1 E(32554): 2.5e-33
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            90       100       110       120       130       140   
pF1KE2 NQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPN
                                     :. :::.: ::  . : .:... :.:. :.
CCDS58 PEKWSVAKHTQSYPTDSYGVLEFQGGGYSNKAMYIRVSYDTKPDSLLHLMVKDWQLELPK
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE2 LVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTIS
       :.::: :: .:: ..:.....:.. ::  :.. ::::.:::.  :.....:....:.  :
CCDS58 LLISVHGGLQNFEMQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVSTGVISHVGDALKDH--S
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pF1KE2 RSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLL
        .:.  . ::::: ::.: :.. :. . :.   .  : . . ...  : .:.:.:::..:
CCDS58 SKSRGRVCAIGIAPWGIVENKEDLV-GKDVTRVY--QTMSNPLSK--LSVLNNSHTHFIL
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pF1KE2 VDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKN
       .:::  :.  .:.:::  :::.:: . : ..  :  .:.: ..  :: .... .   ...
CCDS58 ADNGTLGKYGAEVKLRRLLEKHISLQKI-NTRLGQGVPLVGLVVEGGPNVVSIVLEYLQE
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pF1KE2 K--IPCVVVEGSGQIADVI--ASLVEVEDALTSSAVKEKLVRFLPRTVSRLPEEETESWI
       .  :: :. .:::. .:..  :     : .. . ...:.:.  . .: .   . .... .
CCDS58 EPPIPVVICDGSGRASDILSFAHKYCEEGGIINESLREQLLVTIQKTFNY-NKAQSHQLF
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pF1KE2 KWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQ
         . : .. ..:.::..:   :.. .  ::  :: :. ..:  :      ::.: : ::.
CCDS58 AIIMECMKKKELVTVFRMGSEGQQDIEMAILTALLKGTNVSAPD------QLSLALAWNR
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pF1KE2 LDLANDEIFTNDRRW---------------------------------------------
       .:.: ..::.   .:                                             
CCDS58 VDIARSQIFVFGPHWPPLGSLAPPTDSKATEKEKKPPMATTKGGRGKGKGKKKGKVKEEV
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pF1KE2 -ESAD------------LQEVMFTALIKDRPKFVRLFLENGLNLRKFLTHDVLTELFSNH
        : .:            :...:. ::. ::  ::.:..:::.:...:::   : ::....
CCDS58 EEETDPRKIELLNWVNALEQAMLDALVLDRVDFVKLLIENGVNMQHFLTIPRLEELYNTR
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pF1KE2 FST-----LVYRNLQIAK--NSYNDALLT--FVWKLVA-----------NFR--------
       ..      :. :... ..   .:. .:.   .: . .            :::        
CCDS58 LGPPNTLHLLVRDVKKSNLPPDYHISLIDIGLVLEYLMGGAYRCNYTRKNFRTLYNNLFG
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pF1KE2 -------------------RGFRKEDRNGRDEMDIELHDVSPITR--HPLQALFIWAILQ
                          .: .:. .. ..:.::.. :   ..:  .:.. :..::.:.
CCDS58 PKRPKALKLLGMEDDEPPAKGKKKKKKKKEEEIDIDVDD-PAVSRFQYPFHELMVWAVLM
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pF1KE2 NKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGE-SEELAN---EYETRAVE
       ......  .:.. .     :: : :: :..:. ... . . . :..: :   ..   :.:
CCDS58 KRQKMAVFLWQRGEESMAKALVACKLYKAMAHESSESDLVDDISQDLDNNSKDFGQLALE
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pF1KE2 LFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEIS
       :. . :. ::..: .::.:  . :..:.::.::: :  . :::.   : .:. .:.:.. 
CCDS58 LLDQSYKHDEQIAMKLLTYELKNWSNSTCLKLAVAAKHRDFIAHTCSQMLLTDMWMGRLR
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pF1KE2 -RDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFR----------KKPVD------------------
        : . . :.:. ... : .   :. ::          :.  :                  
CCDS58 MRKNPGLKVIMGILLPPTIL--FLEFRTYDDFSYQTSKENEDGKEKEEENTDANADAGSR
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pF1KE2 ------KHKKLLWYYVA-----FFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPP
             .:::     ..     :...:.: : . .. :...:::: ::.:. . . :   
CCDS58 KGDEENEHKKQRSIPIGTKICEFYNAPIVKFWFYTISYLGYLLLFNYVILVRMDGWPSLQ
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pF1KE2 ELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVN--------YFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHS
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CCDS58 EWIVISYIVSLALEKIREILMSEPGKLSQKIKVWLQEYWNITDLVAISTFMIGAILRLQ-
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CCDS58 -NQPYMGYGRVIYCVDIIFWYIRVLDIFGVNKYLGPYVMMIGKMMIDMLYFVVIMLVVLM
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       .::::::.::. .:.  :. . :...: ::  ..:.: .: .:          . . : .
CCDS58 SFGVARQAILHPEEKPSWK-LARNIFYMPYWMIYGEVFADQID----------LYAMEIN
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CCDS58 PPCGENLYDEEGKRLPPCIPGAWLTPALMACYLLVANILLVNLLIAVFNNTFFEVKSISN
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CCDS58 QVWKFQRYQLIMTFHDRPVLPPPMIILSHIYIIIMRLSGRCRKKREGDQEERDRGLKLFL
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pF1KE2 TLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK       
                                                                   
CCDS58 SDEELKRLHEFEEQCVQEHFREKEDEQQSSSDERIRVTSERVENMSMRLEEINERETFMK
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>>CCDS58347.1 TRPM1 gene_id:4308|Hs108|chr15              (1642 aa)
 initn: 1113 init1: 266 opt: 604  Z-score: 711.9  bits: 144.1 E(32554): 2.5e-33
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            90       100       110       120       130       140   
pF1KE2 NQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPN
                                     :. :::.: ::  . : .:... :.:. :.
CCDS58 PEKWSVAKHTQSYPTDSYGVLEFQGGGYSNKAMYIRVSYDTKPDSLLHLMVKDWQLELPK
        80        90       100       110       120       130       

           150       160        170       180       190       200  
pF1KE2 LVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTIS
       :.::: :: .:: ..:.....:.. ::  :.. ::::.:::.  :.....:....:.  :
CCDS58 LLISVHGGLQNFEMQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVSTGVISHVGDALKDH--S
       140       150       160       170       180       190       

            210       220       230       240       250       260  
pF1KE2 RSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLL
        .:.  . ::::: ::.: :.. :. . :.   .  : . . ...  : .:.:.:::..:
CCDS58 SKSRGRVCAIGIAPWGIVENKEDLV-GKDVTRVY--QTMSNPLSK--LSVLNNSHTHFIL
         200       210       220          230         240       250

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE2 VDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKN
       .:::  :.  .:.:::  :::.:: . : ..  :  .:.: ..  :: .... .   ...
CCDS58 ADNGTLGKYGAEVKLRRLLEKHISLQKI-NTRLGQGVPLVGLVVEGGPNVVSIVLEYLQE
              260       270        280       290       300         

              330         340       350       360       370        
pF1KE2 K--IPCVVVEGSGQIADVI--ASLVEVEDALTSSAVKEKLVRFLPRTVSRLPEEETESWI
       .  :: :. .:::. .:..  :     : .. . ...:.:.  . .: .   . .... .
CCDS58 EPPIPVVICDGSGRASDILSFAHKYCEEGGIINESLREQLLVTIQKTFNY-NKAQSHQLF
     310       320       330       340       350        360        

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE2 KWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQ
         . : .. ..:.::..:   :.. .  ::  :: :. ..:  :      ::.: : ::.
CCDS58 AIIMECMKKKELVTVFRMGSEGQQDIEMAILTALLKGTNVSAPD------QLSLALAWNR
      370       380       390       400       410             420  

      440       450                                                
pF1KE2 LDLANDEIFTNDRRW---------------------------------------------
       .:.: ..::.   .:                                             
CCDS58 VDIARSQIFVFGPHWPPLGSLAPPTDSKATEKEKKPPMATTKGGRGKGKGKKKGKVKEEV
            430       440       450       460       470       480  

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pF1KE2 -ESAD------------LQEVMFTALIKDRPKFVRLFLENGLNLRKFLTHDVLTELFSNH
        : .:            :...:. ::. ::  ::.:..:::.:...:::   : ::....
CCDS58 EEETDPRKIELLNWVNALEQAMLDALVLDRVDFVKLLIENGVNMQHFLTIPRLEELYNTR
            490       500       510       520       530       540  

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pF1KE2 FST-----LVYRNLQIAK--NSYNDALLT--FVWKLVA-----------NFR--------
       ..      :. :... ..   .:. .:.   .: . .            :::        
CCDS58 LGPPNTLHLLVRDVKKSNLPPDYHISLIDIGLVLEYLMGGAYRCNYTRKNFRTLYNNLFG
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pF1KE2 -------------------RGFRKEDRNGRDEMDIELHDVSPITR--HPLQALFIWAILQ
                          .: .:. .. ..:.::.. :   ..:  .:.. :..::.:.
CCDS58 PKRPKALKLLGMEDDEPPAKGKKKKKKKKEEEIDIDVDD-PAVSRFQYPFHELMVWAVLM
            610       620       630       640        650       660 

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pF1KE2 NKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGE-SEELAN---EYETRAVE
       ......  .:.. .     :: : :: :..:. ... . . . :..: :   ..   :.:
CCDS58 KRQKMAVFLWQRGEESMAKALVACKLYKAMAHESSESDLVDDISQDLDNNSKDFGQLALE
             670       680       690       700       710       720 

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pF1KE2 LFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEIS
       :. . :. ::..: .::.:  . :..:.::.::: :  . :::.   : .:. .:.:.. 
CCDS58 LLDQSYKHDEQIAMKLLTYELKNWSNSTCLKLAVAAKHRDFIAHTCSQMLLTDMWMGRLR
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pF1KE2 -RDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFR----------KKPVD------------------
        : . . :.:. ... : .   :. ::          :.  :                  
CCDS58 MRKNPGLKVIMGILLPPTIL--FLEFRTYDDFSYQTSKENEDGKEKEEENTDANADAGSR
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pF1KE2 ------KHKKLLWYYVA-----FFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPP
             .:::     ..     :...:.: : . .. :...:::: ::.:. . . :   
CCDS58 KGDEENEHKKQRSIPIGTKICEFYNAPIVKFWFYTISYLGYLLLFNYVILVRMDGWPSLQ
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pF1KE2 ELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVN--------YFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHS
       : .. : .  :  ...:.  ..  .        .. . ::. : ...  :. : ..::. 
CCDS58 EWIVISYIVSLALEKIREILMSEPGKLSQKIKVWLQEYWNITDLVAISTFMIGAILRLQ-
     900       910       920       930       940       950         

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pF1KE2 SNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMV
        :.  .  ::::.:.: :.. .:.. :: :.. ::: ..:. .:.::...:. .. : ..
CCDS58 -NQPYMGYGRVIYCVDIIFWYIRVLDIFGVNKYLGPYVMMIGKMMIDMLYFVVIMLVVLM
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pF1KE2 AFGVARQGILRQNEQ-RWRWIFRSVIYEPYLAMFGQVPSD-VDGTTYDFAHCTFTGNESK
       .::::::.::. .:.  :. . :...: ::  ..:.: .: .:          . . : .
CCDS58 SFGVARQAILHPEEKPSWK-LARNIFYMPYWMIYGEVFADQID----------LYAMEIN
      1020      1030       1040      1050                1060      

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pF1KE2 PLCVE-LDEHNLPRFPE-----WITIPLVCIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENND
       : : : : ...  :.:      :.:  :.  :.: .::::::::.:.:. :   :.  ..
CCDS58 PPCGENLYDEEGKRLPPCIPGAWLTPALMACYLLVANILLVNLLIAVFNNTFFEVKSISN
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pF1KE2 QVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNE
       :::::::: :.. . .:  .: :.:.....:... .    : :..               
CCDS58 QVWKFQRYQLIMTFHDRPVLPPPMIILSHIYIIIMRLSGRCRKKREGDQEERDRGLKLFL
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pF1KE2 TLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK       
                                                                   
CCDS58 SDEELKRLHEFEEQCVQEHFREKEDEQQSSSDERIRVTSERVENMSMRLEEINERETFMK
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>>CCDS65064.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9              (1556 aa)
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Smith-Waterman score: 1477; 29.0% identity (59.6% similar) in 1102 aa overlap (117-1090:2-1060)

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pF1KE2 EKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVI
                                     :.:.: ::  ..: .:.:..:.:. :.:.:
CCDS65                              MYVRVSFDTKPDLLLHLMTKEWQLELPKLLI
                                            10        20        30 

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pF1KE2 SVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSS
       :: :: .:: :.:.....:.. ::  :.. ::::.:::.. :.....:....:.  . .:
CCDS65 SVHGGLQNFELQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVNTGVIRHVGDALKDH--ASKS
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pF1KE2 EENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDN
       . .: .:::: ::.: :.. ::    .. :   : . . ...  : .:.. :.:..:.::
CCDS65 RGKICTIGIAPWGIVENQEDLIGRDVVRPY---QTMSNPMSK--LTVLNSMHSHFILADN
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pF1KE2 GCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKNK--
       :  :.  .:.::: ::::.:: . : ..  :  .:.: .   :: .... .   ...   
CCDS65 GTTGKYGAEVKLRRQLEKHISLQKI-NTRIGQGVPVVALIVEGGPNVISIVLEYLRDTPP
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pF1KE2 IPCVVVEGSGQIADVIA--SLVEVEDALTSSAVKEKLVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWL
       .: :: .:::. .:..:       : .: . .....:.  . .: .    .  . .:  :
CCDS65 VPVVVCDGSGRASDILAFGHKYSEEGGLINESLRDQLLVTIQKTFTYTRTQAQHLFII-L
           210       220       230       240       250       260   

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pF1KE2 KEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQLDL
        : .. ..:.::..:   : . .. ::  :: :. ..:  :      ::.: : ::..:.
CCDS65 MECMKKKELITVFRMGSEGHQDIDLAILTALLKGANASAPD------QLSLALAWNRVDI
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pF1KE2 ANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLENGLNLRKFLTHDVLTELFSNHF
       : ..::   ..:  ..:...:. ::. ::  ::.:..:::.....::: . : ::.... 
CCDS65 ARSQIFIYGQQWPVGSLEQAMLDALVLDRVDFVKLLIENGVSMHRFLTISRLEELYNTRH
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pF1KE2 ---STLVYRNLQIAKNSYN-------------DALLTFV-WKLVANF-----------RR
          .:: .   .. :  :              :  ....   :: ..           :.
CCDS65 GPSNTLYHLVRDVKKREYPGFGWIYFKGNLPPDYRISLIDIGLVIEYLMGGAYRCNYTRK
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pF1KE2 GFR---------KED----RNGR-------DEMDIELHDVSPITRH---PLQALFIWAIL
        ::         :.:    : ::       .:.::.: :  :   :   :.. :..::.:
CCDS65 RFRTLYHNLFGPKRDDIPLRRGRKTTKKREEEVDIDLDD--PEINHFPFPFHELMVWAVL
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pF1KE2 QNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGE-SEELAN---EYETRAV
       .......  .:.. .     :: : :: :..:.  .. . . . :.:: .   ..   ::
CCDS65 MKRQKMALFFWQHGEEAMAKALVACKLCKAMAHEASENDMVDDISQELNHNSRDFGQLAV
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pF1KE2 ELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEI
       ::. . :..::.:: .::.:  . :....::.::: :  . :::.   : .:. .:.:..
CCDS65 ELLDQSYKQDEQLAMKLLTYELKNWSNATCLQLAVAAKHRDFIAHTCSQMLLTDMWMGRL
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pF1KE2 S-RDTKNWKIILCLFIIP-LVGCGFV----------------------------------
         : ... :.:: ... : ...  :                                   
CCDS65 RMRKNSGLKVILGILLPPSILSLEFKNKDDMPYMSQAQEIHLQEKEAEEPEKPTKEKEEE
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                                720         730       740       750
pF1KE2 --------------SFRKKPVD----KHK--KLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLL
                     : :::  .    ::.   :      :...:.: : . .. ::..:.
CCDS65 DMELTAMLGRNNGESSRKKDEEEVQSKHRLIPLGRKIYEFYNAPIVKFWFYTLAYIGYLM
          680       690       700       710       720       730    

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pF1KE2 LFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVN--------YFTDLWNVMD
       :: :..:. ..  :   : .. : .:.:  ...:.  ..  .        .. . ::: :
CCDS65 LFNYIVLVKMERWPSTQEWIVISYIFTLGIEKMREILMSEPGKLLQKVKVWLQEYWNVTD
          740       750       760       770       780       790    

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pF1KE2 TLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQR
        .... : .:...::...   :  .::::.:.. : . .::. :: :.. ::: ..:. .
CCDS65 LIAILLFSVGMILRLQDQPFRS--DGRVIYCVNIIYWYIRLLDIFGVNKYLGPYVMMIGK
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pF1KE2 MLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQ-RWRWIFRSVIYEPYLAMFGQVPSD-VD
       :.::...:.... : ...::::::.::  ::.  :. . ....: ::  ..:.: .: .:
CCDS65 MMIDMMYFVIIMLVVLMSFGVARQAILFPNEEPSWK-LAKNIFYMPYWMIYGEVFADQID
            860       870       880        890       900       910 

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pF1KE2 GTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLP--RFPEWITIPLVCIYMLSTNILLVNLLVAM
               :    ::..    .    .::  .   ::.  ..  :.: .::::::::.:.
CCDS65 PP------C--GQNETRE---DGKIIQLPPCKTGAWIVPAIMACYLLVANILLVNLLIAV
                     920          930       940       950       960

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pF1KE2 FGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFKCCCKEKNM
       :. :   :.  ..:::::::: :.. .  :  .: :.:.:... :. .   . ::. .. 
CCDS65 FNNTFFEVKSISNQVWKFQRYQLIMTFHERPVLPPPLIIFSHMTMIFQ---HLCCRWRKH
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pF1KE2 ESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLDTKLNDLKGLLKE
       ::      . :..  . .  . .. : :..   ..  ::.   ::. : ..:        
CCDS65 ES------DPDERDYGLKLFITDDELKKVHDFEEQCIEEY---FREKDDRFNSSNDERIR
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pF1KE2 IANKIK                                                      
                                                                   
CCDS65 VTSERVENMSMRLEEVNEREHSMKASLQTVDIRLAQLEDLIGRMATALERLTGLERAESN
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>>CCDS6634.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9               (1566 aa)
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         90       100       110       120       130       140      
pF1KE2 EKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVI
                                     :.:.: ::  ..: .:.:..:.:. :.:.:
CCDS66                              MYVRVSFDTKPDLLLHLMTKEWQLELPKLLI
                                            10        20        30 

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pF1KE2 SVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSS
       :: :: .:: :.:.....:.. ::  :.. ::::.:::.. :.....:....:.  . .:
CCDS66 SVHGGLQNFELQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVNTGVIRHVGDALKDH--ASKS
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pF1KE2 EENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDN
       . .: .:::: ::.: :.. ::    .. :   : . . ...  : .:.. :.:..:.::
CCDS66 RGKICTIGIAPWGIVENQEDLIGRDVVRPY---QTMSNPMSK--LTVLNSMHSHFILADN
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pF1KE2 GCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKNK--
       :  :.  .:.::: ::::.:: . : ..  :  .:.: .   :: .... .   ...   
CCDS66 GTTGKYGAEVKLRRQLEKHISLQKI-NTRIGQGVPVVALIVEGGPNVISIVLEYLRDTPP
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pF1KE2 IPCVVVEGSGQIADVIA--SLVEVEDALTSSAVKEKLVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWL
       .: :: .:::. .:..:       : .: . .....:.  . .: .    .  . .:  :
CCDS66 VPVVVCDGSGRASDILAFGHKYSEEGGLINESLRDQLLVTIQKTFTYTRTQAQHLFII-L
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pF1KE2 KEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQLDL
        : .. ..:.::..:   : . .. ::  :: :. ..:  :      ::.: : ::..:.
CCDS66 MECMKKKELITVFRMGSEGHQDIDLAILTALLKGANASAPD------QLSLALAWNRVDI
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pF1KE2 ANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLENGLNLRKFLTHDVLTELFSNHF
       : ..::   ..:  ..:...:. ::. ::  ::.:..:::.....::: . : ::.... 
CCDS66 ARSQIFIYGQQWPVGSLEQAMLDALVLDRVDFVKLLIENGVSMHRFLTISRLEELYNTRH
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pF1KE2 ---STLVYRNLQIAKNSYN-------------DALLTFV-WKLVANF-----------RR
          .:: .   .. :  :              :  ....   :: ..           :.
CCDS66 GPSNTLYHLVRDVKKREYPGFGWIYFKGNLPPDYRISLIDIGLVIEYLMGGAYRCNYTRK
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pF1KE2 GFRK-------------------ED----RNGR-------DEMDIELHDVSPITRH---P
        ::                    ::    : ::       .:.::.: :  :   :   :
CCDS66 RFRTLYHNLFGPKRPKALKLLGMEDDIPLRRGRKTTKKREEEVDIDLDD--PEINHFPFP
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pF1KE2 LQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGE-SEELAN
       .. :..::.:.......  .:.. .     :: : :: :..:.  .. . . . :.:: .
CCDS66 FHELMVWAVLMKRQKMALFFWQHGEEAMAKALVACKLCKAMAHEASENDMVDDISQELNH
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pF1KE2 ---EYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQN
          ..   ::::. . :..::.:: .::.:  . :....::.::: :  . :::.   : 
CCDS66 NSRDFGQLAVELLDQSYKQDEQLAMKLLTYELKNWSNATCLQLAVAAKHRDFIAHTCSQM
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pF1KE2 FLSKQWYGEIS-RDTKNWKIILCLFIIP-LVGCGFV------------------------
       .:. .:.:..  : ... :.:: ... : ...  :                         
CCDS66 LLTDMWMGRLRMRKNSGLKVILGILLPPSILSLEFKNKDDMPYMSQAQEIHLQEKEAEEP
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pF1KE2 ------------------------SFRKKPVD----KHK--KLLWYYVAFFTSPFVVFSW
                               : :::  .    ::.   :      :...:.: : .
CCDS66 EKPTKEKEEEDMELTAMLGRNNGESSRKKDEEEVQSKHRLIPLGRKIYEFYNAPIVKFWF
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pF1KE2 NVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVN--------
        .. ::..:.:: :..:. ..  :   : .. : .:.:  ...:.  ..  .        
CCDS66 YTLAYIGYLMLFNYIVLVKMERWPSTQEWIVISYIFTLGIEKMREILMSEPGKLLQKVKV
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pF1KE2 YFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRN
       .. . ::: : .... : .:...::...   :  .::::.:.. : . .::. :: :.. 
CCDS66 WLQEYWNVTDLIAILLFSVGMILRLQDQPFRS--DGRVIYCVNIIYWYIRLLDIFGVNKY
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pF1KE2 LGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQ-RWRWIFRSVIYEPYLAM
       ::: ..:. .:.::...:.... : ...::::::.::  ::.  :. . ....: ::  .
CCDS66 LGPYVMMIGKMMIDMMYFVIIMLVVLMSFGVARQAILFPNEEPSWK-LAKNIFYMPYWMI
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pF1KE2 FGQVPSD-VDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLP--RFPEWITIPLVCIYMLSTN
       .:.: .: .:        :    ::..    .    .::  .   ::.  ..  :.: .:
CCDS66 YGEVFADQIDPP------C--GQNETRE---DGKIIQLPPCKTGAWIVPAIMACYLLVAN
             920               930          940       950       960

      970       980       990      1000      1010      1020        
pF1KE2 ILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVKKC
       :::::::.:.:. :   :.  ..:::::::: :.. .  :  .: :.:.:... :. .  
CCDS66 ILLVNLLIAVFNNTFFEVKSISNQVWKFQRYQLIMTFHERPVLPPPLIIFSHMTMIFQ--
              970       980       990      1000      1010          

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pF1KE2 FKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLDTK
        . ::. .. ::      . :..  . .  . .. : :..   ..  ::.   ::. : .
CCDS66 -HLCCRWRKHES------DPDERDYGLKLFITDDELKKVHDFEEQCIEEY---FREKDDR
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pF1KE2 LNDLKGLLKEIANKIK                                            
       .:                                                          
CCDS66 FNSSNDERIRVTSERVENMSMRLEEVNEREHSMKASLQTVDIRLAQLEDLIGRMATALER
     1070      1080      1090      1100      1110      1120        

>>CCDS6636.1 TRPM3 gene_id:80036|Hs108|chr9               (1569 aa)
 initn: 1106 init1: 263 opt: 593  Z-score: 699.0  bits: 141.6 E(32554): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 1451; 28.9% identity (59.3% similar) in 1114 aa overlap (117-1090:2-1073)

         90       100       110       120       130       140      
pF1KE2 EKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVI
                                     :.:.: ::  ..: .:.:..:.:. :.:.:
CCDS66                              MYVRVSFDTKPDLLLHLMTKEWQLELPKLLI
                                            10        20        30 

        150       160        170       180       190       200     
pF1KE2 SVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSS
       :: :: .:: :.:.....:.. ::  :.. ::::.:::.. :.....:....:.  . .:
CCDS66 SVHGGLQNFELQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVNTGVIRHVGDALKDH--ASKS
              40        50        60        70        80           

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pF1KE2 EENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDN
       . .: .:::: ::.: :.. ::    .. :   : . . ...  : .:.. :.:..:.::
CCDS66 RGKICTIGIAPWGIVENQEDLIGRDVVRPY---QTMSNPMSK--LTVLNSMHSHFILADN
      90       100       110          120         130       140    

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pF1KE2 GCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQ---------DS---------------NYGGKIPI
       :  :.  .:.::: ::::.:: . :.         ::               . :  .:.
CCDS66 GTTGKYGAEVKLRRQLEKHISLQKINTRCLPFFSLDSRLFYSFWGSCQLDSVGIGQGVPV
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pF1KE2 VCFAQGGGKETLKAINTSIKNK--IPCVVVEGSGQIADVIA--SLVEVEDALTSSAVKEK
       : .   :: .... .   ...   .: :: .:::. .:..:       : .: . .....
CCDS66 VALIVEGGPNVISIVLEYLRDTPPVPVVVCDGSGRASDILAFGHKYSEEGGLINESLRDQ
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pF1KE2 LVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFS
       :.  . .: .    .  . .:  : : .. ..:.::..:   : . .. ::  :: :. .
CCDS66 LLVTIQKTFTYTRTQAQHLFII-LMECMKKKELITVFRMGSEGHQDIDLAILTALLKGAN
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pF1KE2 TSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLF
       .:  :      ::.: : ::..:.: ..::   ..:  ..:...:. ::. ::  ::.:.
CCDS66 ASAPD------QLSLALAWNRVDIARSQIFIYGQQWPVGSLEQAMLDALVLDRVDFVKLL
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pF1KE2 LENGLNLRKFLTHDVLTELFSNHF--STLVYRNLQIAK--NSYNDALLTFV-WKLVANF-
       .:::.....::: . : ::....   :. .:. .. .:  :   :  ....   :: .. 
CCDS66 IENGVSMHRFLTISRLEELYNTRHGPSNTLYHLVRDVKKGNLPPDYRISLIDIGLVIEYL
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pF1KE2 ----------RRGFR---------KED----RNGR-------DEMDIELHDVSPITRH--
                 :. ::         :.:    : ::       .:.::.: :  :   :  
CCDS66 MGGAYRCNYTRKRFRTLYHNLFGPKRDDIPLRRGRKTTKKREEEVDIDLDD--PEINHFP
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pF1KE2 -PLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGE-SEEL
        :.. :..::.:.......  .:.. .     :: : :: :..:.  .. . . . :.::
CCDS66 FPFHELMVWAVLMKRQKMALFFWQHGEEAMAKALVACKLCKAMAHEASENDMVDDISQEL
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pF1KE2 AN---EYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGV
        .   ..   ::::. . :..::.:: .::.:  . :....::.::: :  . :::.   
CCDS66 NHNSRDFGQLAVELLDQSYKQDEQLAMKLLTYELKNWSNATCLQLAVAAKHRDFIAHTCS
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pF1KE2 QNFLSKQWYGEIS-RDTKNWKIILCLFIIP-LVGCGFV----------------------
       : .:. .:.:..  : ... :.:: ... : ...  :                       
CCDS66 QMLLTDMWMGRLRMRKNSGLKVILGILLPPSILSLEFKNKDDMPYMSQAQEIHLQEKEAE
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CCDS66 EPEKPTKEKEEEDMELTAMLGRNNGESSRKKDEEEVQSKHRLIPLGRKIYEFYNAPIVKF
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pF1KE2 SWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVN------
        . .. ::..:.:: :..:. ..  :   : .. : .:.:  ...:.  ..  .      
CCDS66 WFYTLAYIGYLMLFNYIVLVKMERWPSTQEWIVISYIFTLGIEKMREILMSEPGKLLQKV
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pF1KE2 --YFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVS
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CCDS66 KVWLQEYWNVTDLIAILLFSVGMILRLQDQPFRS--DGRVIYCVNIIYWYIRLLDIFGVN
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pF1KE2 RNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQ-RWRWIFRSVIYEPYL
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        ..:.: .: .:        :    ::..    .    .::  .   ::.  ..  :.: 
CCDS66 MIYGEVFADQIDPP------C--GQNETRE---DGKIIQLPPCKTGAWIVPAIMACYLLV
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pF1KE2 TNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVK
       .::::::::.:.:. :   :.  ..:::::::: :.. .  :  .: :.:.:... :. .
CCDS66 ANILLVNLLIAVFNNTFFEVKSISNQVWKFQRYQLIMTFHERPVLPPPLIIFSHMTMIFQ
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pF1KE2 KCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLD
          . ::. .. ::      . :..  . .  . .. : :..   ..  ::.   ::. :
CCDS66 ---HLCCRWRKHES------DPDERDYGLKLFITDDELKKVHDFEEQCIEEY---FREKD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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