Result of FASTA (omim) for pF1KE3496
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3496, 1970 aa
  1>>>pF1KE3496     1970 - 1970 aa - 1970 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  64092750 residues in 91774 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.6099+/-0.000698; mu= -39.3276+/- 0.044
 mean_var=1222.3770+/-260.197, 0's: 0 Z-trim(119.1): 332  B-trim: 0 in 0/58
 Lambda= 0.036684
 statistics sampled from 33615 (33933) to 33615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.37), width:  16
 Scan time: 10.610

The best scores are:                                      opt bits E(91774)
NP_000928 (OMIM: 180660) DNA-directed RNA polymera (1970) 13279 721.1 2.9e-206
NP_008986 (OMIM: 264090,607694,614258) DNA-directe (1390) 1364 90.4 1.5e-16
XP_011521400 (OMIM: 164010,614961) charged multive ( 408)  977 69.4 9.3e-11
NP_001352825 (OMIM: 601234) nascent polypeptide-as (2078)  746 57.9 1.4e-06
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289)  741 58.0 3.4e-06
NP_775082 (OMIM: 602372) zonadhesin isoform 6 prec (2721)  684 54.7 1.7e-05
NP_003377 (OMIM: 602372) zonadhesin isoform 3 prec (2812)  684 54.7 1.7e-05
NP_056240 (OMIM: 616404,616462) DNA-directed RNA p (1720)  648 52.6 4.5e-05
NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [H (5654)  552 48.0  0.0036
NP_009096 (OMIM: 600796) splicing factor 3A subuni ( 464)  495 44.0  0.0048
XP_011514857 (OMIM: 602372) zonadhesin isoform X2  (2498)  528 46.4  0.0048
NP_001138422 (OMIM: 618194) soluble scavenger rece (1573)  504 44.9  0.0084
XP_011537078 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5525)  527 46.7  0.0089
XP_006719679 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5536)  527 46.7  0.0089
XP_005269219 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5537)  527 46.7  0.0089
NP_003473 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine N-m (5537)  527 46.7  0.0089
XP_006719677 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5540)  527 46.7  0.0089
XP_011537076 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5549)  527 46.7  0.0089
XP_011537075 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5552)  527 46.7  0.0089
XP_011537074 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5553)  527 46.7  0.0089
XP_011537073 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5555)  527 46.7  0.0089
XP_011537072 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine  (5556)  527 46.7  0.0089


>>NP_000928 (OMIM: 180660) DNA-directed RNA polymerase I  (1970 aa)
 initn: 13279 init1: 13279 opt: 13279  Z-score: 3824.5  bits: 721.1 E(91774): 2.9e-206
Smith-Waterman score: 13279; 100.0% identity (100.0% similar) in 1970 aa overlap (1-1970:1-1970)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 SNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 HGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 RYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 HVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 FSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYII
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 RDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 TFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 TLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 NCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 GHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 HNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKIN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 ISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 MGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGES
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 VEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 EDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 VIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 AHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 VFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 DFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 IMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKI
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 IITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALER
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 ELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLM
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 EAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 MFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPG
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 YSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSP
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 SYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 ISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQ-GSARNQDDLTHKLADIVKI
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pF1KE3 NNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGK
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pF1KE3 EGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELV
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NP_008 QNGPEVHPGANFIQQRHTQMKRFLKYGNREKMAQELKYGDIVERHLIDGDVVLFNRQPSL
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pF1KE3 HKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRM
       ::.:.:.: .:. :  :::.:  : ::::::::::::::::::. :..::   :  .   
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pF1KE3 IVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLM-FLSTWDGKV----PQPAI
       .:::....:... .:: ::..  .: .:.:..:... ...  .:   : :.    : :.:
NP_008 LVTPRNGEPLIAAIQDFLTGAYLLTLKDTFFDRAKACQIIASILVGKDEKIKVRLPPPTI
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pF1KE3 LKPRPLWTGKQIFSLII-PGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMG
       :::  :::::::::.:. :.  : .:..      .  :  . .  .:. :...:.::. :
NP_008 LKPVTLWTGKQIFSVILRPSDDNPVRANLRTKGKQYCGKGEDLCANDSYVTIQNSELMSG
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pF1KE3 ILCKKSLGT-SAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSK
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NP_008 SMDKGTLGSGSKNNIFYILLRDWGQNEAADAMSRLARLAPVYLSNRGFSIGIGDVTPGQG
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pF1KE3 TYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQ
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NP_008 LLKAKYELLNAGYKKCDEYIEALNTGKLQQQPGCTAEETLEALILKELSVIRDHAGSACL
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pF1KE3 KSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGP
       . :.. :.  .:.. :.::: :::::.:: :::: . :.:.: ::..:.:::: : .  :
NP_008 RELDKSNSPLTMALCGSKGSFINISQMIACVGQQAISGSRVPDGFENRSLPHFEKHSKLP
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pF1KE3 ESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDA
        ..::: ::. .::::::::::.:.:::::.:::::::::::.::::.::.:..  .:: 
NP_008 AAKGFVANSFYSGLTPTEFFFHTMAGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCSQYDL
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pF1KE3 TVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQED
       :::.: ....:. :: :::              :.  :.: :               .: 
NP_008 TVRSSTGDIIQFIYGGDGL-------------DPA--AMEGK---------------DEP
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pF1KE3 LVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHIN
       :                ::.:. ..   ....::   :. .:  :  ..: ....:.. .
NP_008 L----------------EFKRVLDN---IKAVFPC-PSEPALSKN--ELILTTESIMKKS
                      920          930        940         950      

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pF1KE3 PRL---PSDLHPIK-VVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRR
         :    : :. ::  ..::.:  ::          .:.        ..:.  .:   : 
NP_008 EFLCCQDSFLQEIKKFIKGVSEKIKK----------TRDK-------YGINDNGTTEPRV
        960       970       980                        990         

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pF1KE3 MAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVS
       . .  :..    . .:   ..:. .:  .::  :::: :::.:::.:::::.:::.:::.
NP_008 LYQLDRITPTQVEKFLETCRDKYMRAQMEPGSAVGALCAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVA
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pF1KE3 AKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANT
       . :.::::::.::.:: ::  .:: .:. :  ..  ::. :. .  :.:.: : ...   
NP_008 SMNITLGVPRIKEIINASKAISTPIITAQL--DKDDDADYARLVKGRIEKTLLGEIS---
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pF1KE3 AIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPD--FDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQI
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NP_008 -----------------EYIEEVF-LPDDCFILVKLS--LERIRLLRLEVNAETVRYSIC
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pF1KE3 AEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESN
       . :. .  ::         ..: .:     ..  ::. .    :.. . .:         
NP_008 TSKLRVKPGDVAV------HGEAVVC----VTPRENSKSSMYYVLQFLKED---------
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pF1KE3 MLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKD
        :  ...::: ..:.. .:. . ..:.:        .: : :      : .:  :.. . 
NP_008 -LPKVVVQGIPEVSRAVIHIDEQSGKEK--------YKLLVE------GDNLRAVMATHG
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pF1KE3 VDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHL
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NP_008 VKGTRTTSNNTYEVEKTLGIEAARTTIINEIQYTMVNHGMSIDRRHVMLLSDLMTYKGEV
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pF1KE3 MAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCF
       ..::: :. ..  . ::  :::.:.: :..::  :..: . :::: :..:     ::: :
NP_008 LGITRFGLAKMKESVLMLASFEKTADHLFDAAYFGQKDSVCGVSECIIMGIPMNIGTGLF
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pF1KE3 DLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAW
        ::  :..                                                    
NP_008 KLLHKADRDPNPPKRPLIFDTNEFHIPLVT                              
             1370      1380      1390                              

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                                     ::  .:::..  ::. .::: ..:: .: .
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pF1KE3 SPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTS
        :::  .:: .: .  :: ..:: .: .  :: ..:: .: .  :: ..:: .: .  ::
XP_011 VPTSAAFSPPTPRWVSTSAAFSPPTPRWVSTSAAFSPPTPRWVSTSAAFSPPTPRWVSTS
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pF1KE3 PSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYS
        ..:: .: .  :: ..:: .: .  :: ..:: .: . ::: ..:: .: . :::  .:
XP_011 AAFSPPTPRWVSTSAAFSPPTPRWVSTSAAFSPPTPRWVPTSAAFSPPTPRWVPTSAAFS
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pF1KE3 PTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSP
       : .: ..::: ..:: .: . :::  ..: .: . ::: ..:: .: .  :: ..:: .:
XP_011 PPTPRWVPTSAAFSPPTPRWVPTSAAFSPPTPRWVPTSAAFSPPTPRWVSTSAAFSPRTP
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pF1KE3 RYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSP
       :..  : ...: .: . :.: ..:: .:... :: ..:: .:...:::  .:: .:.. :
XP_011 RWVSTSAAFSPPTPRWVPTSAAFSPPTPRWVSTSAAFSPPTPRWVPTSAAFSPPTPRWVP
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       ::  .:: .: . ::.  .:: .: .  :: ...: .:..  :: ..:: .:..      
XP_011 TSAAFSPPTPRWVPTSAAFSPPTPHWVSTSAAFSPLTPHWVSTSAAFSPLTPHWVSMAFS
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pF1KE3 YSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN
                                                
XP_011 VELVVFP                                  
                                                

>>NP_001352825 (OMIM: 601234) nascent polypeptide-associ  (2078 aa)
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                                     :::.: :.   :: .. .:.:  .   :  
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pF1KE3 GVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGG
       . . . .    .:   :  .:    .  : :    :..: . .:. .      ::::.. 
NP_001 AKGTSTYTTTASPFLEGTVSLAPKNHPVKEGTL--TTLPLVPTASEN---CPVAPSPQNT
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pF1KE3 ISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVG-SGMTPGAAGFSPSAASDASGFSP-GYSPAWSPTPG
        .:  :       :  .. :::.  .:  ::.   .  . : .:...: . ::   ::  
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pF1KE3 SPGSPGPSSP----YI---PSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSP---
       : .:   ::     :.   ::: : .: : .   :  .  : :  :: .   ::.::   
NP_001 SGASATASSKGTLTYLADSPSPLG-VSVSPQTKRPPTKKGSAGPDTPIGNLSSPVSPVEA
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pF1KE3 SYSPTSPSYSPTSPNYSP-TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYS
       :. : . : :  . . :: :. : .: ::. .::  . .: ::.     :. .::    .
NP_001 SFLPEN-SLSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPTPSVVN
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pF1KE3 PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP
          :. .:..:.    .:. : :: : . .  . .: .   :: ::. .:: :. .: ::
NP_001 LPFPKEGPATPA-PKQAPALSMTSSSPKKARATPAPKGIPASP-SPKGAPTPPAATPPSP
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pF1KE3 SYSPT--SPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSY--SPTSPNYTPTSPNYSPTSPSY--SPT
       . .:.  ::...:: :  :: ::. .:..::   .:: :  :: ::. .:..::   .::
NP_001 KGGPATPSPKWAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPT
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pF1KE3 SPSYSPTSPSYSPSS---PRYTPQSPTYTPSSPSYSPSS---PSYSPTSPKYTPTSPSYS
        :. .: ::. ::..   :. .   :. :: ::. ::..   :. .::.:  :  ::. .
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pF1KE3 PSSPEY--TPTSPKYSPTSPKYSPT--SPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTY--SPTSPV
       :..:    .:: :  .: ::: .:.  ::: .:  :. .: .:: . ..: .  .::.:.
NP_001 PATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPMPPAATPPSPKGGLATPPHKGAPTTPA
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pF1KE3 YTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAI
        :: ::: . ..:   :  :: .::.:. .: ::::.  .:   : .::.:         
NP_001 ATPPSPKGGLATP---P--PKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKG-APTTPAATPPSPKG
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pF1KE3 SPDDSDEEN                                                   
                                                                   
NP_001 GLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTP
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>>NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo sapie  (5289 aa)
 initn: 1191 init1: 429 opt: 741  Z-score: 232.9  bits: 58.0 E(91774): 3.4e-06
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NP_002 EDQFGNGPFGLCYDYKIRVNCCWPMDKCITTP-SPPTTTPSPP--PTSTTTLPPTTTPSP
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pF1KE3 PAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY
       :.    .:   :  ::  . :.     :.::  : : . .:  :. .:. :. .:. :. 
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       .:. :. . :.:  . .:. :. .: .:  : :.  :. .:. :. . :.:  . .:. :
NP_002 TPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPASTTTLPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPP
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pF1KE3 SYSPTSPSYSPTS--PSYSPTSPSYSPTSP--SYSPTSPNYS-PTSPNYTPTSPSYSPTS
       . .: .:  : :.  :. .:. :  . :.:  . .:. :. . :. :. : :.:   ::.
NP_002 TTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPP--PTT
           1550      1560      1570      1580      1590        1600

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pF1KE3 PSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTS--PSYSPSSPRYTPQSP--TYTPSS
           ::. . ::  :. .:. :. .: .:  : :.  :. .:: :  :  .:  : ::: 
NP_002 TPSPPTTTTTTPP-PTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSP
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       :. .  ::  . :.   :  ::.:: . .:: :  : :  ::  .:.::  . :.:. : 
NP_002 PTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPS-ST
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       :.:.  :::  ..  ::: .:. :. : :. :  . .:: : .:  :. .:  ::.:: :
NP_002 TTPSPPPTT--MTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITP--PTFSPFS
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pF1KE3 PKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN                        
           : .::.:                                                 
NP_002 ----TTTPTTPCVPLCNWTGWLDSGKPNFHKPGGDTELIGDVCGPGWAANISCRATMYPD
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>>NP_775082 (OMIM: 602372) zonadhesin isoform 6 precurso  (2721 aa)
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Smith-Waterman score: 753; 32.4% identity (52.5% similar) in 516 aa overlap (1480-1963:443-948)

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                                     :  :   .:.  .. ::: .    ...:: 
NP_775 FPNAGGHYIYLEADEFSQAGQSVRLVSRPFCAPGDICVEFAYHMYGLGEGTMLELLLGS-
            420       430       440       450       460       470  

       1510      1520        1530       1540            1550       
pF1KE3 PSPMGGISPAMTPWNQGAT--PAYGAWSPSVGSG-MTP------GAAGFSPSAASDASGF
         : :  :: .  :.. ..  : .   : .: :: . :      :  : : .:.  : ::
NP_775 --PAG--SPPIPLWKRVGSQRPYWQNTSVTVPSGHQQPMQLIFKGIQG-SNTASVVAMGF
                 480       490       500       510        520      

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pF1KE3 ---SPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYT--PQS
          .::  :.       : ::  :.    . : . .:. :  .:.   ..:.  :  :  
NP_775 ILINPGTCPVKVLPELPPVSPVSSTGPSETTGLTENPTISTKKPTVSIEKPSVTTEKPTV
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pF1KE3 PSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYS
       :. .:: :. .::  . .:: :. .:. :: .:: :: .::  . .:: :: .:: :: .
NP_775 PKEKPTIPTEKPTISTEKPTIPSEKPNMPSEKPTIPSEKPTILTEKPTIPSEKPTIPSEK
        590       600       610       620       630       640      

           1680      1690      1700      1710      1720            
pF1KE3 PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPT---------
       ::  . .:: :.  ::.:.   :.    :. :. .:. :. .:. :. .::         
NP_775 PTISTEKPTVPTEEPTTPTEETTTSMEEPVIPTEKPSIPTEKPSIPTEKPTISMEETIIS
        650       660       670       680       690       700      

               1730      1740      1750      1760      1770        
pF1KE3 --SPSYSP---TSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTP
         .:. ::   : :. .:: :. . :    .::.:.  :: :. .::    .::.:.  :
NP_775 TEKPTISPEKPTIPTEKPTIPTEKSTISPEKPTTPTEKPTIPTEKPTISPEKPTTPTEKP
        710       720       730       740       750       760      

     1780      1790      1800      1810      1820      1830        
pF1KE3 TSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSP-
       :    . : :. .:: :. .:: :. .:.     : .::   .  . .:: :  .:: : 
NP_775 TISPEKLTIPTEKPTIPTEKPTIPTEKPTISTEEPTTPTEETTISTEKPSIPMEKPTLPT
        770       780       790       800       810       820      

      1840      1850      1860      1870      1880      1890       
pF1KE3 KYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSP
       . : ::   .  : :   : :  .::    .:: :  .::    . : :  . : :: .:
NP_775 EETTTSVEETTISTEKL-TIPMEKPTISTEKPTIPTEKPTISPEKLTIPTEKLTIPTEKP
        830       840        850       860       870       880     

      1900      1910      1920      1930      1940      1950       
pF1KE3 TSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLT
       : :.   :    . : :: .::    :: .:: :  .:   : .:: :    :  : .::
NP_775 TIPIEETTISTEKLTIPTEKPT---ISPEKPTISTEKPTIPTEKPTIPTEETTISTEKLT
         890       900          910       920       930       940  

      1960      1970                                               
pF1KE3 SPAISPDDSDEEN                                               
        :. .:                                                      
NP_775 IPTEKPTISPEKLTIPTEKPTISTEKPTIPTEKLTIPTEKPTIPTEKPTIPTEKLTALRP
            950       960       970       980       990      1000  

>>NP_003377 (OMIM: 602372) zonadhesin isoform 3 precurso  (2812 aa)
 initn: 624 init1: 624 opt: 684  Z-score: 220.1  bits: 54.7 E(91774): 1.7e-05
Smith-Waterman score: 753; 32.4% identity (52.5% similar) in 516 aa overlap (1480-1963:443-948)

    1450      1460      1470      1480         1490      1500      
pF1KE3 PMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYG---MEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSA
                                     :  :   .:.  .. ::: .    ...:: 
NP_003 FPNAGGHYIYLEADEFSQAGQSVRLVSRPFCAPGDICVEFAYHMYGLGEGTMLELLLGS-
            420       430       440       450       460       470  

       1510      1520        1530       1540            1550       
pF1KE3 PSPMGGISPAMTPWNQGAT--PAYGAWSPSVGSG-MTP------GAAGFSPSAASDASGF
         : :  :: .  :.. ..  : .   : .: :: . :      :  : : .:.  : ::
NP_003 --PAG--SPPIPLWKRVGSQRPYWQNTSVTVPSGHQQPMQLIFKGIQG-SNTASVVAMGF
                 480       490       500       510        520      

         1560      1570      1580      1590      1600        1610  
pF1KE3 ---SPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYT--PQS
          .::  :.       : ::  :.    . : . .:. :  .:.   ..:.  :  :  
NP_003 ILINPGTCPVKVLPELPPVSPVSSTGPSETTGLTENPTISTKKPTVSIEKPSVTTEKPTV
        530       540       550       560       570       580      

           1620      1630      1640      1650      1660      1670  
pF1KE3 PSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYS
       :. .:: :. .::  . .:: :. .:. :: .:: :: .::  . .:: :: .:: :: .
NP_003 PKEKPTIPTEKPTISTEKPTIPSEKPNMPSEKPTIPSEKPTILTEKPTIPSEKPTIPSEK
        590       600       610       620       630       640      

           1680      1690      1700      1710      1720            
pF1KE3 PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPT---------
       ::  . .:: :.  ::.:.   :.    :. :. .:. :. .:. :. .::         
NP_003 PTISTEKPTVPTEEPTTPTEETTTSMEEPVIPTEKPSIPTEKPSIPTEKPTISMEETIIS
        650       660       670       680       690       700      

               1730      1740      1750      1760      1770        
pF1KE3 --SPSYSP---TSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTP
         .:. ::   : :. .:: :. . :    .::.:.  :: :. .::    .::.:.  :
NP_003 TEKPTISPEKPTIPTEKPTIPTEKSTISPEKPTTPTEKPTIPTEKPTISPEKPTTPTEKP
        710       720       730       740       750       760      

     1780      1790      1800      1810      1820      1830        
pF1KE3 TSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSP-
       :    . : :. .:: :. .:: :. .:.     : .::   .  . .:: :  .:: : 
NP_003 TISPEKLTIPTEKPTIPTEKPTIPTEKPTISTEEPTTPTEETTISTEKPSIPMEKPTLPT
        770       780       790       800       810       820      

      1840      1850      1860      1870      1880      1890       
pF1KE3 KYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSP
       . : ::   .  : :   : :  .::    .:: :  .::    . : :  . : :: .:
NP_003 EETTTSVEETTISTEKL-TIPMEKPTISTEKPTIPTEKPTISPEKLTIPTEKLTIPTEKP
        830       840        850       860       870       880     

      1900      1910      1920      1930      1940      1950       
pF1KE3 TSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLT
       : :.   :    . : :: .::    :: .:: :  .:   : .:: :    :  : .::
NP_003 TIPIEETTISTEKLTIPTEKPT---ISPEKPTISTEKPTIPTEKPTIPTEETTISTEKLT
         890       900          910       920       930       940  

      1960      1970                                               
pF1KE3 SPAISPDDSDEEN                                               
        :. .:                                                      
NP_003 IPTEKPTISPEKLTIPTEKPTISTEKPTIPTEKLTIPTEKPTIPTEKPTIPTEKLTALRP
            950       960       970       980       990      1000  

>>NP_056240 (OMIM: 616404,616462) DNA-directed RNA polym  (1720 aa)
 initn: 1614 init1: 457 opt: 648  Z-score: 212.6  bits: 52.6 E(91774): 4.5e-05
Smith-Waterman score: 1549; 27.4% identity (53.0% similar) in 1653 aa overlap (69-1473:102-1715)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE3 GGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAK-PVFHV
                                     : : .:  .:  ::    :. : .  :..:
NP_056 SNCSGHLGHIELPLTVYNPLLFDKLYLLLRGSCLNC--HMLTCPRAVIHLLLCQLRVLEV
              80        90       100         110       120         

       100       110       120       130       140       150       
pF1KE3 GFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKG---KNIC
       : :  .... : .    ...: .. .:. ..:  . .    . . .     .:   ::.:
NP_056 GALQAVYELERIL----NRFLEENPDPSASEIREELEQYTTEIVQNNLLGSQGAHVKNVC
     130       140           150       160       170       180     

                   160       170       180       190       200     
pF1KE3 EGGEE---------MDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHV
       :.  .         :. :   .   :   . ::..      .   ..:.. .  .:   .
NP_056 ESKSKLIALFWKAHMNAKRCPHCKTGRSVVRKEHNSKLTITFPAMVHRTAGQKDSEPLGI
         190       200       210       220       230       240     

         210       220       230                 240       250     
pF1KE3 NEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVL----------GMEPRYARPEWMIVTVLPV
       .: .  :.  :.:  ..: .. .  .: : :          ::: :.  :  ...  : :
NP_056 EEAQIGKRGYLTPTSAREHLSALWKNEGFFLNYLFSGMDDDGMESRFN-PSVFFLDFLVV
         250       260       270       280       290        300    

         260         270        280       290       300            
pF1KE3 PPLSVRPAVVM--QGSARNQD-DLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDV-----
       ::   ::.  .  :  . .:  .:   . :.: : . :    :.    . .:  .     
NP_056 PPSRYRPVSRLGDQMFTNGQTVNLQAVMKDVVLIRKLLALMAQEQKLPEEVATPTTDEEK
          310       320       330       340       350       360    

                                  310       320       330       340
pF1KE3 ---------------------KL------LQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLK
                            ::      :: ::  . :.:.  :   :.:   :  ...
NP_056 DSLIAIDRSFLSTLPGQSLIDKLYNIWIRLQSHVNIVFDSEMDKL--MMDK--YP--GIR
          370       380       390       400         410            

              350       360       370       380       390       400
pF1KE3 QRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNID
       : :. :::  : ..::::::..::.:: ::  .. ...:.:  .:...:. . :::.:..
NP_056 QILEKKEGLFRKHMMGKRVDYAARSVICPDMYINTNEIGIPMVFATKLTYPQPVTPWNVQ
      420       430       440       450       460       470        

              410       420            430                440      
pF1KE3 RLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDR-----IDLR---------FHPKPSDLHLQTGYKV
       .:.. :  : . .:::...: ..:.:     .:.          . :  .  . :    :
NP_056 ELRQAVINGPNVHPGASMVINEDGSRTALSAVDMTQREAVAKQLLTPATGAPKPQGTKIV
      480       490       500       510       520       530        

        450       460       470        480       490       500     
pF1KE3 ERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPW-STFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHL
        ::. .:::...:::::::. :...::.::::  ...::. .    ::::::::::: :.
NP_056 CRHVKNGDILLLNRQPTLHRPSIQAHRARILPEEKVLRLHYANCKAYNADFDGDEMNAHF
      540       550       560       570       580       590        

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE3 PQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLM
       :::   :::   :: . .. ..:....:. :..:: ...  ..: :  :. : . :.:..
NP_056 PQSELGRAEAYVLACTDQQYLVPKDGQPLAGLIQDHMVSGASMTTRGCFFTREHYMELVY
      600       610       620       630       640       650        

          570         580       590            600              610
pF1KE3 F-LSTWDGKVP--QPAILKPRPLWTGKQIFSL----IIP-GHINC-------IRTHSTHP
         :.   :.:   .:.:::: :::::::. :     :::  ::         :  ..   
NP_056 RGLTDKVGRVKLLSPSILKPFPLWTGKQVVSTLLINIIPEDHIPLNLSGKAKITGKAWVK
      660       670       680       690       700       710        

               620       630       640       650       660         
pF1KE3 DDEDSGP-YKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFY
       .   : : ..  :  ...:....:::. :.: :   :.:: .:::  :  .: . .    
NP_056 ETPRSVPGFNPDSMCESQVIIREGELLCGVLDKAHYGSSAYGLVHCCYEIYGGETSGKVL
      720       730       740       750       760       770        

     670       680        690           700       710          720 
pF1KE3 SNIQTVINNWL-LIEGHTIGIGDSI----ADSKTYQDIQNTIKKAKQDV---IEVIEKAH
       . .  ... .: : .: :.:. : .    :: :  . :... . . : :   ... : : 
NP_056 TCLARLFTAYLQLYRGFTLGVEDILVKPKADVKRQRIIEESTHCGPQAVRAALNLPEAAS
      780       790       800       810       820       830        

                        730       740       750       760       770
pF1KE3 NNEL-----------EPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMV
        .:.           .    : .   :...::.  :.        . .     :... ::
NP_056 YDEVRGKWQDAHLGKDQRDFNMIDLKFKEEVNHYSNEINKACMPFGLHRQFPENSLQMMV
      840       850       860       870       880       890        

              780       790       800       810       820       830
pF1KE3 VSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAG
        :::::: .:  :.  ..:: ..::.: :.  . ..:: :   .. :.. ::: . .:.:
NP_056 QSGAKGSTVNTMQISCLLGQIELEGRRPPLMASGKSLPCFEPYEFTPRAGGFVTGRFLTG
      900       910       920       930       940       950        

              840       850       860       870       880       890
pF1KE3 LTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLR
       . : ::::: :.:::::.::::::...::.:: .:: .:...:.:: :::.: ..:::. 
NP_056 IKPPEFFFHCMAGREGLVDTAVKTSRSGYLQRCIIKHLEGLVVQYDLTVRDSDGSVVQFL
      960       970       980       990      1000      1010        

              900       910       920       930       940       950
pF1KE3 YGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQN
       ::::::   ...:     :.:      :.: :  .: ... .. .   ...::: :  ..
NP_056 YGEDGLDIPKTQF-----LQP------KQFPFLASNYEVIMKSQH---LHEVLSRADPKK
     1020      1030                 1040      1050         1060    

                   960       970       980       990      1000     
pF1KE3 ELE-----REFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLH
        :.     ....  . .  . :  : . ..:.    . :..  . .     : : :.  .
NP_056 ALHHFRAIKKWQSKHPNTLLRRGAFLSYSQKIQEAVKALKLESENR-----NGRSPGTQE
         1070      1080      1090      1100      1110              

        1010          1020      1030        1040      1050         
pF1KE3 PIKVVEGVKELSK----KLVIVNGDDPLS--RQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFR
        ...   . : :.    : . .  :  ::  :     :..  ... .    :.. : . .
NP_056 MLRMWYELDEESRRKYQKKAAACPDPSLSVWRPDIYFASVSETFETKVDDYSQEWAAQTE
    1120      1130      1140      1150      1160      1170         

    1060          1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KE3 LSGE----AFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAK
        : :    ..: :   .. :..... .::: :: :::::.:::.:::::::::.:: .  
NP_056 KSYEKSELSLDRLRTLLQLKWQRSLCEPGEAVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGEM
    1180      1190      1200      1210      1220      1230         

        1120      1130       1140      1150      1160      1170    
pF1KE3 NVTLGVPRLKELINI-SKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTA
       :::::.:::.:.. . : . ::: ..: .:. . .  .:.:..  .: .. : .:  .  
NP_056 NVTLGIPRLREILMVASANIKTPMMSVPVLN-TKKALKRVKSLKKQLTRVCLGEVLQKID
    1240      1250      1260      1270       1280      1290        

         1180      1190      1200        1210      1220        1230
pF1KE3 IYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDF--DVARISPWLLRVELDRKHMTDR--KLTMEQ
       .      .:  . : :.  .::    .:   .   .   :: :   . :  :  :: ::.
NP_056 VQ-----ESFCMEEKQNKFQVYQLRFQFLPHAYYQQEKCLRPEDILRFMETRFFKLLMES
     1300           1310      1320      1330      1340      1350   

                                  1240      1250      1260         
pF1KE3 IAEKIN--------------------AG-FGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMN-----S
       : .: :                    :: .: . .   .:.. :  ..  .  .     :
NP_056 IKKKNNKASAFRNVNTRRATQRDLDNAGELGRSRGEQEGDEEEEGHIVDAEAEEGDADAS
          1360      1370      1380      1390      1400      1410   

         1270      1280      1290                                  
pF1KE3 DENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMT---------------------------
       : .. ...:: ::  ...   :  : :   ::                            
NP_056 DAKRKEKQEEEVDYESEEEEEREGEENDDEDMQEERNPHREGARKTQEQDEEVGLGTEED
          1420      1430      1440      1450      1460      1470   

                                  1300                      1310   
pF1KE3 ----------------------------LQGIEQIS----------------KVYMHLP-
                                   .:....:                 .: ..:: 
NP_056 PSLPALLTQPRKPTHSQEPQGPEAMERRVQAVREIHPFIDDYQYDTEESLWCQVTVKLPL
          1480      1490      1500      1510      1520      1530   

                                1320      1330      1340      1350 
pF1KE3 ---------------------QTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKD
                             : .  . ...:  . :  .: .:.:.:..: ....  .
NP_056 MKINFDMSSLVVSLAHGAVIYATKGITRCLLNETTNNKNEKELVLNTEGINLPELFKYAE
          1540      1550      1560      1570      1580      1590   

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KE3 V-DPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGH
       : :  :  ::::  : .. ::::. ...:.:.  :..  :  :. :::.:. : :  .: 
NP_056 VLDLRRLYSNDIHAIANTYGIEAALRVIEKEIKDVFAVYGIAVDPRHLSLVADYMCFEGV
          1600      1610      1620      1630      1640      1650   

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pF1KE3 LMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGC
          ..: :. :....::.. .:: . . : .:.  :  : ... :  ...:... .::: 
NP_056 YKPLNRFGI-RSNSSPLQQMTFETSFQFLKQATMLGSHDELRSPSACLVVGKVVRGGTGL
          1660       1670      1680      1690      1700      1710  

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KE3 FDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGA
       :.:                                                         
NP_056 FELKQPLR                                                    
           1720                                                    

>>NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [Homo   (5654 aa)
 initn: 998 init1: 370 opt: 552  Z-score: 178.4  bits: 48.0 E(91774): 0.0036
Smith-Waterman score: 571; 29.4% identity (55.2% similar) in 493 aa overlap (1495-1963:4107-4593)

         1470      1480      1490      1500          1510      1520
pF1KE3 PAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPS----PMGGISPAMTPW
                                     .:  :. . .:.::    :  . . : :  
NP_001 PTQSTSSWQKSRTTTLVTTSTTSTPQTSTTSAPTTSTIPASTPSTTSAPTTSTTSAPTTS
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pF1KE3 NQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSP
       . .:     . .:.... ..: ..  . :: . ... .:  :   . : .. ..:  :. 
NP_001 TTSAPTHRTTSGPTTSTTLAPTTS--TTSAPTTSTNSAPTTSTISASTTSTISAPTTSTI
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pF1KE3 YIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTS
         :. . . .:. : :: :    . :. :  ::  . .. : : :: . .::.   . ..
NP_001 SSPTSSTTSTPQTSKTSAATSSTTSGSGTTPSPVPTTSTTSASTTSTTSAPTTS--TTSG
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pF1KE3 PSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYS-PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY
       :. .: ::  : .. : . :: . .::. . : :::   :  . . ::.  . . ..:. 
NP_001 PGTTP-SPVPSTSTTSAATTSTTSAPTTRTTSAPTSSMTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTT
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pF1KE3 SPTS-PSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSP-TSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTP
       : :: :. .: ::  . .. :   :: . .: ..::  ::. . :  . . . .:   : 
NP_001 STTSGPGTTP-SPVPTTSTTSAPITSTTSGPGSTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTASTT
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pF1KE3 TSPSYSPTS-PSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSP
       ..:. .:.  :. : ::   : :.   . .. :   ..::  ::. . :  . : :: : 
NP_001 SGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTRTTSASTASTTSGPGSTPSPVPTTSTTSAPTTRTTPAST
             4380      4390      4400      4410      4420      4430

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pF1KE3 TYTPSSPSYSPSS-PSYSPTSPKYTPTS--PSYSPSSPEYTP--TSPKYSPTS-PKYSPT
       . : :.:. .::  :. : :: . : :   :. : .:   :   ..:  .:.  :  : :
NP_001 ASTTSGPGTTPSPVPTTSTTSASTTSTISLPTTSTTSAPITSMTSGPGTTPSPVPTTSTT
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pF1KE3 S-PKYSPTSPTYSPTT--PKYSPTS-PTYSPTS-PVYTPTSPKYSPTS--P--TYSPTSP
       : :  : :: . . ::  :  .:.  :: : :: :. . :: . . :.  :  . ::.  
NP_001 SAPTTSTTSASTASTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTASTTSGPGTSLSPVPT
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            1930      1940      1950       1960      1970          
pF1KE3 KYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTS-PAISPDDSDEEN          
         . ..:: : ::  :.: ::.    . ..:: : :: :. .:                 
NP_001 TSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTPVSKTSTS
             4560      4570      4580      4590      4600      4610

NP_001 HLSVSKTTHSQPVTSDCHPLCAWTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEKICRRPEE
             4620      4630      4640      4650      4660      4670

>>NP_009096 (OMIM: 600796) splicing factor 3A subunit 2   (464 aa)
 initn: 188 init1:  86 opt: 495  Z-score: 176.1  bits: 44.0 E(91774): 0.0048
Smith-Waterman score: 507; 29.2% identity (49.2% similar) in 264 aa overlap (1595-1857:217-464)

         1570      1580      1590      1600      1610      1620    
pF1KE3 WSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSP
                                     : .:   : .: :     :      :   :
NP_009 EIDKAEGKFWTHWNRETKQFFLQFHFKMEKPPAPPSLPAGPPGVKRPPPPLMNGLPPRPP
        190       200       210       220       230       240      

         1630      1640      1650      1660      1670      1680    
pF1KE3 TSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
          :  :  :.  :  : . ::.:  .:..:   :  :.  : .:.  : .:   : . .
NP_009 LPESLPPPPPGGLPL-PPMPPTGP--APSGP---PGPPQLPPPAPGVHPPAPVVHPPASG
        250       260          270          280       290       300

         1690      1700      1710      1720      1730      1740    
pF1KE3 YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPT
         : .:.  : .:.  : .:.  : . .  : .:.  : .:.  : .:.  : .:.  : 
NP_009 VHPPAPGVHPPAPGVHPPAPGVHPPTSGVHPPAPGVHPPAPGVHPPAPGVHPPAPGVHPP
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         1750      1760      1770      1780      1790      1800    
pF1KE3 SPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY
       .:.  :      : : .  : .:.  :..:   : .:.  : .:.. : .:.  :  :. 
NP_009 APGVHP------PPSAGVHPQAPGVHPAAPAVHPQAPGVHPPAPGMHPQAPGVHPQPPGV
                    370       380       390       400       410    

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pF1KE3 SPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSS-PEYTPTSPKYSPT
        ::.:   :: :   ::.:.  :  :  .:  :   :  :: .:.. :   ::.      
NP_009 HPSAPGVHPQPPGVHPSNPGVHP--P--TPMPPMLRPPLPSEGPGNIPPPPPTN      
          420       430           440       450       460          

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pF1KE3 SPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKY




1970 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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