Result of SIM4 for pF1KB9939

seq1 = pF1KB9939.tfa, 1581 bp
seq2 = pF1KB9939/gi568815584r_49547293.tfa (gi568815584r:49547293_49788203), 240911 bp

>pF1KB9939 1581
>gi568815584r:49547293_49788203 (Chr14)

(complement)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-169  (104511-104611)   100% ->
170-245  (108404-108479)   100% ->
246-323  (113777-113854)   100% ->
324-417  (113988-114081)   100% ->
418-492  (118606-118680)   100% ->
493-576  (121791-121874)   100% ->
577-636  (123041-123099)   96% ->
637-682  (123533-123578)   100% ->
683-755  (124817-124889)   100% ->
756-928  (132361-132533)   100% ->
929-1018  (133110-133199)   100% ->
1019-1073  (133366-133420)   100% ->
1074-1133  (133990-134049)   100% ->
1134-1211  (134137-134214)   100% ->
1212-1320  (136827-136935)   100% ->
1321-1497  (137763-137939)   100% ->
1498-1565  (140844-140911)   100% ->
1566-1581  (144534-144549)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCGGAGCGGCTGCGGAGCCGGGCGCTCTCCGCCTTCAAGTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCGGAGCGGCTGCGGAGCCGGGCGCTCTCCGCCTTCAAGTTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTTGCTGCTCCGTGG         TGAAGCTATTAAGTACCTCACAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTTGCTGCTCCGTGGGTG...TAGTGAAGCTATTAAGTACCTCACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGCTCTTCAGTCTATCAGTGAATTAGAGCTTGAAGATAAACTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104534 AAGCTCTTCAGTCTATCAGTGAATTAGAGCTTGAAGATAAACTGGAAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATAATTAATGCAGTTGAGAAGCAACCCT         TGTCATCAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104584 ATAATTAATGCAGTTGAGAAGCAACCCTGTA...CAGTGTCATCAAACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATTGAACGATCTGTGGTGGAAGCAGCAGTCCAGGAATGCAGTCAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108417 GATTGAACGATCTGTGGTGGAAGCAGCAGTCCAGGAATGCAGTCAGTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGATGAAACTAT         AGAGCACGTTTTCAATATCATAGGAGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 108467 TTGATGAAACTATGTA...CAGAGAGCACGTTTTCAATATCATAGGAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGATATTCCACGCTTTGTGTACAATTCAGAAAGAAAAAAATTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113805 TTTGATATTCCACGCTTTGTGTACAATTCAGAAAGAAAAAAATTTCTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324          TCTGTTAATGACCAACCACCCTGCACCAAATTTATTTGGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113855 GTA...TAGTCTGTTAATGACCAACCACCCTGCACCAAATTTATTTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CACCAAGAGATAAAGCAGAGATGTTTCGTGAGCGATATACCATTTTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114029 CACCAAGAGATAAAGCAGAGATGTTTCGTGAGCGATATACCATTTTGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAG         AGGACCCACAGGCATGAATTATTTACTCCTCCGGTGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114079 CAGGTA...TAGAGGACCCACAGGCATGAATTATTTACTCCTCCGGTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGGTTCTCACCCTGATGAAAGCGGAAGCAAATTCCAG         CTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118644 AGGTTCTCACCCTGATGAAAGCGGAAGCAAATTCCAGGTT...TAGCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AAACAATAGAAACCTTATTGGGTAGTACAACCAAAATCGGAGATGCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121795 AAACAATAGAAACCTTATTGGGTAGTACAACCAAAATCGGAGATGCGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTTCTTGGAATGATAACGCAGTTAAAAGAG         GGAAAATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121845 GTTCTTGGAATGATAACGCAGTTAAAAGAGGTA...TAGGGAAAATTTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TCTGGAAGATCCTACTGGAACAGTCCAACTAGACCTTAGTAAAGCTCAG 
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| >
 123052 TCTGGAAGATCCTACTGGAACAGTCCAACTAGACCTTAGTAAAGCT ATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637         TTCCATAGTGGTTTATACACAGAGGCATGCTTTGTCTTAGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123101 TC...CAGTTCCATAGTGGTTTATACACAGAGGCATGCTTTGTCTTAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GAAG         GTTGGTTTGAAGATCAAGTGTTTCATGTCAATGCCTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123575 GAAGGTA...CAGGTTGGTTTGAAGATCAAGTGTTTCATGTCAATGCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TGGATTTCCACCCACTGAGCCCTCTAGTACTACTAG         GGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 124854 TGGATTTCCACCCACTGAGCCCTCTAGTACTACTAGGTA...TAGGGCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 ACTATGGAAATATTAATTTTTTTGGAGGTCCTTCTAATACATCTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132366 ACTATGGAAATATTAATTTTTTTGGAGGTCCTTCTAATACATCTGTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 ACTTCTGCAAAACTAAAACAGCTAGAAGAGGAGAATAAAGATGCTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132416 ACTTCTGCAAAACTAAAACAGCTAGAAGAGGAGAATAAAGATGCTATGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGTGTTTTTATCTGATGTTTGGTTGGACCAGGTGGAAGTATTGGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132466 TGTGTTTTTATCTGATGTTTGGTTGGACCAGGTGGAAGTATTGGAAAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TTCGCATAATGTTTGCTG         GTTATTCACCAGCACCTCCAACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 132516 TTCGCATAATGTTTGCTGGTA...TAGGTTATTCACCAGCACCTCCAACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 TGCTTTATTCTGTGTGGTAATTTTTCATCTGCACCATATGGAAAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133133 TGCTTTATTCTGTGTGGTAATTTTTCATCTGCACCATATGGAAAAAATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 AGTTCAAGCTTTGAAAG         ATTCCCTAAAAACTTTGGCAGATA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 133183 AGTTCAAGCTTTGAAAGGTA...TAGATTCCCTAAAAACTTTGGCAGATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 TAATATGTGAATACCCAGATATTCACCAAAG         TAGTCGTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 133390 TAATATGTGAATACCCAGATATTCACCAAAGGTA...CAGTAGTCGTTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084 GTGTTTGTACCTGGTCCAGAGGATCCTGGATTTGGTTCCATCTTACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134000 GTGTTTGTACCTGGTCCAGAGGATCCTGGATTTGGTTCCATCTTACCAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134          GCCACCACTTGCTGAAAGCATCACTAATGAATTCAGACAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134050 GTA...TAGGCCACCACTTGCTGAAAGCATCACTAATGAATTCAGACAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1175 GGGTACCATTTTCAGTTTTTACTACTAATCCTTGCAG         AATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 134178 GGGTACCATTTTCAGTTTTTACTACTAATCCTTGCAGGTA...CAGAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1216 CAGTACTGTACACAGGAAATTACTGTCTTCCGTGAAGACTTAGTAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136831 CAGTACTGTACACAGGAAATTACTGTCTTCCGTGAAGACTTAGTAAATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1266 AATGTGCAGAAACTGCGTCCGTTTTCCTAGCAGCAATTTGGCTATTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136881 AATGTGCAGAAACTGCGTCCGTTTTCCTAGCAGCAATTTGGCTATTCCTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1316 ATCAC         TTTGTAAAGACTATCTTATCCCAAGGACATCTGACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136931 ATCACGTA...TAGTTTGTAAAGACTATCTTATCCCAAGGACATCTGACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1357 CCCCTACCTCTTTATGTCTGCCCAGTGTATTGGGCATATGACTATGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137799 CCCCTACCTCTTTATGTCTGCCCAGTGTATTGGGCATATGACTATGCTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1407 GAGAGTGTATCCTGTGCCCGATCTACTTGTCATTGCAGACAAATATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137849 GAGAGTGTATCCTGTGCCCGATCTACTTGTCATTGCAGACAAATATGATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 CTTTCACTACGACAAATACCGAATGCCTCTGCATAAACCCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 137899 CTTTCACTACGACAAATACCGAATGCCTCTGCATAAACCCTGTA...AAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1498 GGCTCTTTTCCAAGAAGTGGATTTTCATTCAAAGTTTTTTATCCTTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140844 GGCTCTTTTCCAAGAAGTGGATTTTCATTCAAAGTTTTTTATCCTTCTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 TAAGACAGTAGAAGATAG         CAAACTTCAAGGCTTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 140894 TAAGACAGTAGAAGATAGGTA...CAGCAAACTTCAAGGCTTT

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