Result of FASTA (omim) for pF1KE4281
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4281, 1502 aa
  1>>>pF1KE4281 1502 - 1502 aa - 1502 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1220+/-0.000457; mu= 10.8125+/- 0.029
 mean_var=171.0552+/-34.856, 0's: 0 Z-trim(115.7): 382  B-trim: 297 in 1/55
 Lambda= 0.098063
 statistics sampled from 25907 (26294) to 25907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.308), width:  16
 Scan time: 16.050

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016876776 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 10038 1433.8       0
XP_005267692 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 10038 1433.8       0
XP_005267693 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 10038 1433.8       0
NP_001025226 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating  (1502) 10038 1433.8       0
NP_001164 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating pro (1501) 10019 1431.1       0
XP_016876777 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1501) 10019 1431.1       0
XP_011525175 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1415) 4021 582.6 7.8e-165
XP_016882203 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1499) 4021 582.6 8.2e-165
NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating pro (1499) 4021 582.6 8.2e-165
NP_001193531 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 334)  444 76.1 5.4e-13
NP_001020372 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 433)  444 76.2 6.6e-13
NP_001813 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin isofor ( 459)  444 76.2 6.9e-13
NP_001280010 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 261)  422 72.9 3.8e-12
NP_001280002 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 287)  422 72.9 4.1e-12
NP_001035025 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 332)  422 73.0 4.6e-12
NP_001280000 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 433)  422 73.0 5.7e-12
NP_001280001 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 453)  422 73.1 5.9e-12
NP_004058 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform 2  ( 468)  422 73.1 6.1e-12
NP_001279999 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 481)  422 73.1 6.2e-12
XP_011513409 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 494)  422 73.1 6.4e-12
XP_016867211 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 500)  422 73.1 6.4e-12
NP_001279998 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 543)  422 73.1 6.8e-12
XP_011513408 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 556)  422 73.1   7e-12
XP_011513407 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 569)  422 73.1 7.1e-12
XP_016867210 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 575)  422 73.1 7.2e-12
NP_954976 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating pro ( 548)  414 72.0 1.5e-11
XP_011522776 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 581)  414 72.0 1.6e-11
XP_005257185 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 667)  414 72.0 1.8e-11
XP_016879801 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 689)  414 72.0 1.8e-11
XP_011522774 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 722)  414 72.1 1.9e-11
XP_011522773 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 865)  414 72.1 2.2e-11
XP_006721810 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 867)  414 72.1 2.2e-11
NP_001269219 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating  ( 889)  414 72.1 2.2e-11
XP_006721808 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 889)  414 72.1 2.2e-11
XP_011522771 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 900)  414 72.1 2.2e-11
XP_011522770 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922)  414 72.1 2.3e-11
XP_016879800 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922)  414 72.1 2.3e-11
XP_011509785 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 397)  387 68.1 1.7e-10
XP_016859989 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 432)  387 68.1 1.8e-10
NP_060930 (OMIM: 610578) rho GTPase-activating pro ( 475)  387 68.1 1.9e-10
XP_016859988 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475)  387 68.1 1.9e-10
XP_011509781 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475)  387 68.1 1.9e-10
NP_001280005 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 274)  382 67.2   2e-10
NP_001243776 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 310)  365 64.9 1.2e-09
NP_001269078 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 641)  365 65.1 2.1e-09
NP_001153218 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 813)  365 65.2 2.5e-09
NP_001309769 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 813)  365 65.2 2.5e-09
NP_001083 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster ( 822)  365 65.2 2.5e-09
NP_068781 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster ( 859)  365 65.2 2.6e-09
XP_011523378 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1159)  366 65.4   3e-09


>>XP_016876776 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti  (1502 aa)
 initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038  Z-score: 7680.5  bits: 1433.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

         
pF1KE4 II
       ::
XP_016 II
         

>>XP_005267692 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti  (1502 aa)
 initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038  Z-score: 7680.5  bits: 1433.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

         
pF1KE4 II
       ::
XP_005 II
         

>>XP_005267693 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti  (1502 aa)
 initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038  Z-score: 7680.5  bits: 1433.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

         
pF1KE4 II
       ::
XP_005 II
         

>>NP_001025226 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating prot  (1502 aa)
 initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038  Z-score: 7680.5  bits: 1433.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

         
pF1KE4 II
       ::
NP_001 II
         

>>NP_001164 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating protein  (1501 aa)
 initn: 8263 init1: 8263 opt: 10019  Z-score: 7666.0  bits: 1431.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKK-KKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230       1240      1250         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

         
pF1KE4 II
       ::
NP_001 II
    1500 

>>XP_016876777 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti  (1501 aa)
 initn: 8263 init1: 8263 opt: 10019  Z-score: 7666.0  bits: 1431.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_016 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKK-KKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230       1240      1250         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

         
pF1KE4 II
       ::
XP_016 II
    1500 

>>XP_011525175 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase-acti  (1415 aa)
 initn: 3050 init1: 1368 opt: 4021  Z-score: 3080.3  bits: 582.6 E(85289): 7.8e-165
Smith-Waterman score: 4651; 51.2% identity (79.1% similar) in 1403 aa overlap (1-1393:2-1380)

                10        20        30        40        50         
pF1KE4  MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
        :::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
XP_011 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE4 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
        ::::::::::::::::.. .. :: ::::.:..::::::::::: ::::: ::::::::
XP_011 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE4 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
       ::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
XP_011 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE4 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
       :.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::..  :
XP_011 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280        290        
pF1KE4 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
       ..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
XP_011 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
              250       260       270       280       290       300

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE4 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
         :.:..:. ::::.::.. : .::..::.:::..::. :. .:: ::..:.:::.::.:
XP_011 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
              310       320       330       340       350       360

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE4 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
       :.  .: ::.: . .:   :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
XP_011 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
              370       380       390       400       410       420

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       :..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.::::::  .:
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pF1KE4 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
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XP_016 LSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLD
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pF1KE4 NEAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDN
       :.  .: .::::.:: :: ..::..   :: ... :.:  ::.::.::::.:: ... ::
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       . :.   .:.::  :::   :   .:  ::..: :  : :: . .:..:    .:.:.  
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       ..::::.  .    .  . . :.:::::.:::: : . .. : :   :. .. :   . :
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       :..:  :    . .:::: ::::.:.. : ..  ..:: :: :: :..:  :::  .:..
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       :..  .. ::    . . .:  : .  :: .. ...    :    ::   .:....  . 
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pF1KE4 GRHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNP
       :  : .:::   .  . .::  :: .:  . . : .. ..  ...... : : : :    
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pF1KE4 PTRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQ
        :. .:::::::.::  .:: :::::.:.:.:.:.:: ::: :::.:::::::......:
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pF1KE4 KQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHA
       .:::::::..:.  . :::.::::.:.::..:::::.::... .:.:: :: :. ..:::
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pF1KE4 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
       :::..:::   :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :.
XP_016 LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
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pF1KE4 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
       .:. .:...: ::::: :::::  :.:  . . :  ::  .. :      :..    : :
XP_016 ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
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pF1KE4 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII  
        :::   . .:: : .        
XP_016 SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
        1480      1490         

>>NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating protein  (1499 aa)
 initn: 3300 init1: 1368 opt: 4021  Z-score: 3079.9  bits: 582.6 E(85289): 8.2e-165
Smith-Waterman score: 4975; 50.8% identity (78.3% similar) in 1515 aa overlap (1-1496:2-1491)

                10        20        30        40        50         
pF1KE4  MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
        :::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
NP_004 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
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      60        70        80        90       100       110         
pF1KE4 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
        ::::::::::::::::.. .. :: ::::.:..::::::::::: ::::: ::::::::
NP_004 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
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pF1KE4 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
       ::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
NP_004 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
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pF1KE4 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
       :.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::..  :
NP_004 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
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pF1KE4 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
       ..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
NP_004 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
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pF1KE4 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
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NP_004 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
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pF1KE4 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
       :.  .: ::.: . .:   :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
NP_004 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
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pF1KE4 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
       ..: .:..::::.. ::..::   ::.::.::::.  :.:... :... :.   ..::.:
NP_004 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
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pF1KE4 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
       :..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.::::::  .:
NP_004 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
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pF1KE4 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
       ..:.:::: :::::::::: :   :.: :.:.:..: ... .    .   .. :::..::
NP_004 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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pF1KE4 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
        ::::::::.:::::::.  : ::.:..:::.:::.:::....    .... : .:.:::
NP_004 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
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pF1KE4 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
       :.:..:: ::::.. : : : : :..  :.:.....::.::::.:.: :. ...:  : .
NP_004 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
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pF1KE4 QGQQLANKLQCPFVDVPAGT---YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDL
       ::::.:.:::: :.: ::..   : :..:: ::.:.:.:.:.: :.::..::   . :::
NP_004 QGQQIASKLQCVFLD-PASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDL
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pF1KE4 SEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITI
       ...::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:.  :: ...::....
NP_004 ADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSV
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pF1KE4 LSYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFE
       ::::::...::..::::::. ::::::::..:::::: :::: ::.::::.::. .: ..
NP_004 LSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLD
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pF1KE4 NEAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDN
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NP_004 NDLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDN
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pF1KE4 TRESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYR
       . :.   .:.::  :::   :   .:  ::..: :  : :: . .:..:    .:.:.  
NP_004 AAEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLS
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pF1KE4 LDLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPR
       ..::::.  .    .  . . :.:::::.:::: : . .. : :   :. .. :   . :
NP_004 MELEGND-GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQR
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pF1KE4 KQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNT
       :..:  :    . .:::: ::::.:.. : ..  ..:: :: :: :..:  :::  .:..
NP_004 KSVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKA
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pF1KE4 QGDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRK
       :..  .. ::    . . .:  : .  :: .. ...    :    ::   .:....  . 
NP_004 QSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDEL
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pF1KE4 GRHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNP
       :  : .:::   .  . .::  :: .:  . . : .. ..  ...... : : : :    
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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