seq1 = pF1KB5728.tfa, 2193 bp seq2 = pF1KB5728/gi568815597r_175847193.tfa (gi568815597r:175847193_176306978), 459786 bp >pF1KB5728 2193 >gi568815597r:175847193_176306978 (Chr1) (complement) 1-407 (100001-100407) 100% -> 408-467 (122287-122346) 100% -> 468-565 (130972-131069) 100% -> 566-642 (143088-143164) 100% -> 643-762 (143991-144110) 100% -> 763-831 (157905-157973) 100% -> 832-891 (170432-170491) 100% -> 892-968 (171893-171969) 100% -> 969-1026 (190298-190355) 100% -> 1027-1141 (221089-221203) 100% -> 1142-1277 (225692-225827) 100% -> 1278-1421 (260655-260798) 100% -> 1422-1530 (263161-263269) 100% -> 1531-1612 (263712-263793) 100% -> 1613-1729 (279291-279407) 100% -> 1730-1847 (317500-317617) 100% -> 1848-1972 (318567-318691) 100% -> 1973-2133 (319876-320036) 100% -> 2134-2184 (359740-359792) 96% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGG 50 . : . : . : . : . : 51 GTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGACTTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGACTTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTT 100 . : . : . : . : . : 101 CCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCGGC 150 . : . : . : . : . : 151 GGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 GGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCC 200 . : . : . : . : . : 201 TGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTATCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 TGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTATCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCA 250 . : . : . : . : . : 251 CGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGTAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 CGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGTAGGA 300 . : . : . : . : . : 301 GGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 GGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGC 350 . : . : . : . : . : 351 CCCCCTCTGCAACGGGCTCATCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 CCCCCTCTGCAACGGGCTCATCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACT 400 . : . : . : . : . : 401 TCGTATG CCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATAC |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 TCGTATGGTG...TAGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATAC 450 . : . : . : . : . : 442 ATGACAAAATGTGGCCACAGCTTTTG CTACAAGTGTATTCA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 122321 ATGACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGGTA...TAGCTACAAGTGTATTCA 500 . : . : . : . : . : 483 TCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTGTAACTATGTTGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130987 TCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTGTAACTATGTTGTGG 550 . : . : . : . : . : 533 ACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGG TGAATGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 131037 ACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGGTG...CAGTGAATGAA 600 . : . : . : . : . : 574 CTCATTCTTAAACAGAAGCAAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143096 CTCATTCTTAAACAGAAGCAAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGA 650 . : . : . : . : . : 624 CCACTCAGTGAGTAGCACC AATGGCCACAGGTGGCAGATAT |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 143146 CCACTCAGTGAGTAGCACCGTA...TAGAATGGCCACAGGTGGCAGATAT 700 . : . : . : . : . : 665 TTCAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144013 TTCAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTC 750 . : . : . : . : . : 715 AATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCAGAAGAAGAAACAACTGGAAGCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 144063 AATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCAGAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGT 800 . : . : . : . : . : 763 GAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCA >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144113 A...TAGGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCA 850 . : . : . : . : . : 806 AGGTTGCAAGAAGAAATAAGAGAGAG CAACTGGAACAGATC ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 157948 AGGTTGCAAGAAGAAATAAGAGAGAGGTA...CAGCAACTGGAACAGATC 900 . : . : . : . : . : 847 CAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 170447 CAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTGGAAGTA.. 950 . : . : . : . : . : 892 GAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGC .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 170497 .CAGGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGC 1000 . : . : . : . : . : 938 CTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATCACACAG TAGTATTATT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 171939 CTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATCACACAGGTA...CAGTAGTATTATT 1050 . : . : . : . : . : 979 GATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 190308 GATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGGT 1100 . : . : . : . : . : 1027 ACAAAGAAACAGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGAC >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190358 A...TAGACAAAGAAACAGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGAC 1150 . : . : . : . : . : 1070 GAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGTTACTTTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 221132 GAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGTTACTTTTCT 1200 . : . : . : . : . : 1120 ACAAGGATGTCTCGTATCTCAG ATGACAGTCGAACTGCAAG ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 221182 ACAAGGATGTCTCGTATCTCAGGTA...TAGATGACAGTCGAACTGCAAG 1250 . : . : . : . : . : 1161 CCAGTTGGATGAATTTCAGGAATGCTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 225711 CCAGTTGGATGAATTTCAGGAATGCTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATT 1300 . : . : . : . : . : 1211 CAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 225761 CAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATGGT 1350 . : . : . : . : . : 1261 TCCAGTATAGTCTCTAG TATTGAATTTGACCGGGATTGTGA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 225811 TCCAGTATAGTCTCTAGGTA...TAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGA 1400 . : . : . : . : . : 1302 CTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAGATTAAAGTCTATGAATATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 260679 CTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAGATTAAAGTCTATGAATATG 1450 . : . : . : . : . : 1352 ACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 260729 ACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATG 1500 . : . : . : . : . : 1402 ACCTGCAATTCGAAAATCAG CTGTATCAGTTGGAGTAGTTA ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 260779 ACCTGCAATTCGAAAATCAGGTA...CAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTA 1550 . : . : . : . : . : 1443 CCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCACTGTTATTTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263182 CCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCACTGTTATTTTAT 1600 . : . : . : . : . : 1493 GGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAG GAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 263232 GGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGTA...CAGGAG 1650 . : . : . : . : . : 1534 CATGAGAAGAGGTGTTGGAGTGTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263715 CATGAGAAGAGGTGTTGGAGTGTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACT 1700 . : . : . : . : . : 1584 CTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAG TGAAGCTGTGGT |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 263765 CTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGGTA...TAGTGAAGCTGTGGT 1750 . : . : . : . : . : 1625 CTACCAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 279303 CTACCAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTG 1800 . : . : . : . : . : 1675 TGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCAGATACCATTTGGCTTTCGGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 279353 TGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCAGATACCATTTGGCTTTCGGCTG 1850 . : . : . : . : . : 1725 TGCAG ATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTA |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 279403 TGCAGGTA...TAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTA 1900 . : . : . : . : . : 1766 AACAGCCAATCATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 317536 AACAGCCAATCATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCA 1950 . : . : . : . : . : 1816 AAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGC CTCAACAGA ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 317586 AAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCGTG...CAGCTCAACAGA 2000 . : . : . : . : . : 1857 CAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 318576 CAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCT 2050 . : . : . : . : . : 1907 TCAAGGGTCATATCAATGAAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 318626 TCAAGGGTCATATCAATGAAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGA 2100 . : . : . : . : . : 1957 GATTATATAGCTTGTG GAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 318676 GATTATATAGCTTGTGGTA...CAGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCT 2150 . : . : . : . : . : 1998 GTACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 319901 GTACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAG 2200 . : . : . : . : . : 2048 TCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCGAAAAGAAGATGATACAAATGAATTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 319951 TCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCGAAAAGAAGATGATACAAATGAATTT 2250 . : . : . : . : . : 2098 GTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGG GAGTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 320001 GTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGTA...TAGGAGTC 2300 . : . : . : . : . 2139 CAATGTGCTGATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGT GCTA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|||| 359745 CAATGTGCTGATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTAAGCTA