Result of FASTA (ccds) for pF1KE2237
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2237, 693 aa
  1>>>pF1KE2237     693 - 693 aa - 693 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7409+/-0.000989; mu= -19.5033+/- 0.058
 mean_var=440.7943+/-93.698, 0's: 0 Z-trim(116.2): 43  B-trim: 192 in 1/52
 Lambda= 0.061088
 statistics sampled from 16975 (17014) to 16975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.509), width:  16
 Scan time:  2.240

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS30875.1 CRTC2 gene_id:200186|Hs109|chr1        ( 693) 4733 431.6 1.9e-120
CCDS45348.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15        ( 618)  949 98.1 4.2e-20
CCDS32331.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15        ( 619)  946 97.8 5.1e-20
CCDS42525.1 CRTC1 gene_id:23373|Hs109|chr19        ( 650)  775 82.8 1.8e-15


>>CCDS30875.1 CRTC2 gene_id:200186|Hs109|chr1             (693 aa)
 initn: 4733 init1: 4733 opt: 4733  Z-score: 2276.1  bits: 431.6 E(33420): 1.9e-120
Smith-Waterman score: 4733; 100.0% identity (100.0% similar) in 693 aa overlap (1-693:1-693)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 YTRHIDSSPYSPAYLSPPPESSWRRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSALHTSVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTRHIDSSPYSPAYLSPPPESSWRRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSALHTSVM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 NPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLSSSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLSSSSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 RPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPPPLPTPLDPEETAYPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPPPLPTPLDPEETAYPS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 LSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSSPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSSPQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAPSYPAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAPSYPAST
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 PGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLSTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLSTD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 QRLPPYPYSSPSLVLPTQPHTPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGGQPPGRQSHYGTPYPPGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QRLPPYPYSSPSLVLPTQPHTPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGGQPPGRQSHYGTPYPPGPS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGPGFLGGEGPMGGPQDPHTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGPGFLGGEGPMGGPQDPHTF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 NHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSAAGLELGLGLEDELRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSAAGLELGLGLEDELRM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690   
pF1KE2 EPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
              670       680       690   

>>CCDS45348.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15             (618 aa)
 initn: 948 init1: 351 opt: 949  Z-score: 474.5  bits: 98.1 E(33420): 4.2e-20
Smith-Waterman score: 1208; 38.8% identity (59.8% similar) in 707 aa overlap (6-692:2-618)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
            : .:::..:   :::::::::::. ::::::: :::..: :.  .:.: :::.  
CCDS45     MAASPGSGSA---NPRKFSEKIALHTQRQAEETRAFEQLMTDLTLSRVQFQKLQQL
                   10           20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
          . : :::::::.:. :. .:::  .:.  :. :.::::::::: .:.  :.  ::.:
CCDS45 RLTQYH-GGSLPNVSQLRSSASEFQPSFHQA-DNVRGTRHHGLVERPSRN--RF-HPLHR
             60        70        80         90       100           

                   130       140        150       160       170    
pF1KE2 YT-----RHIDSSPYSPAYLSPPPESSW-RRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSA
        .     :..:.: ..  : : : . :: :.   : .   ::   ::: ::::::.::::
CCDS45 RSGDKPGRQFDGSAFGANYSSQPLDESWPRQQPPWKD---EKHPGFRLTSALNRTNSDSA
      110       120       130       140          150       160     

          180       190       200       210              220       
pF1KE2 LHTSVMNPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKV-------PAIEENLLD-DKHL
       ::::... .::: : :    :  :.   :. ::: . .        :  :::::.  : :
CCDS45 LHTSALSTKPQDPYGGGGQ-SAWPAPYMGFCDGENNGHGEVASFPGPLKEENLLNVPKPL
         170       180        190       200       210       220    

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE2 LKP-WDAKKLSSSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPP
        :  :..:...: :.:::::.: : : ::   :  ..  .  ..:::::::::::::.  
CCDS45 PKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQNLGLSPFLGTLNTGGSLPDLTNLHYST
          230       240       250       260       270       280    

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE2 PLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQS
       :::. ::  .  . :.: :::..:.  .::::::          .. ::.:  :.::.:.
CCDS45 PLPASLDTTDHHFGSMSVGNSVNNIPAAMTHLGIR---------SSSGLQSSRSNPSIQA
          290       300       310                320       330     

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 SLSNPNLQASLSSPQPQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSS
       .:..  :..::..          ::.          .:..:  ::::   .::. : :..
CCDS45 TLNKTVLSSSLNN----------HPQTS--------VPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTT
         340                 350               360       370       

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE2 TSSPVLGAPSYPASTPGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSS
       .    :..::          ..:. :.:::.:  ::    ...: . .:.: : ::    
CCDS45 N----LSGPS----------RRRQPPVSPLTLSPGP----EAHQGFSRQLSST-SPL---
           380                 390           400       410         

         470       480         490       500        510       520  
pF1KE2 ITQGVPLDTSKLSTDQR--LPPYPYSSPSLVLPTQPH-TPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGG
           .:  ::.. ...:  :   :  . . : :  :. .:. : :: :            
CCDS45 ----APYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPPPPYPAPQELTQPLLQ-----------
             420       430       440       450       460           

            530       540       550       560       570       580  
pF1KE2 QPPGRQSHYGTPYPPGPSGHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGP
       :: .         : .:. . : .   :.:::.:   .  :. .   .. .:  ..  ::
CCDS45 QPRA---------PEAPAQQPQAASSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGP
                       470       480       490       500       510 

            590         600       610       620       630       640
pF1KE2 GFLGGEGPM--GGPQDPHTFNHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPG
       .:   . :.   : .. .   :   .  :  :: :: ::  ::: .. :.. .::::.: 
CCDS45 AF-PQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSLPNTILP-DSSTSLFKDLNSALAGLP-
              520       530       540       550        560         

              650       660       670       680       690   
pF1KE2 FEVSAAGLELGLGLEDELRMEPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
        :::  ...  . ::.::..:::.:.:::::::    : ::.:::.::.::: 
CCDS45 -EVSL-NVDTPFPLEEELQIEPLSLDGLNMLSDSSMGLLDPSVEETFRADRL 
       570        580       590       600       610         

>>CCDS32331.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15             (619 aa)
 initn: 1025 init1: 351 opt: 946  Z-score: 473.1  bits: 97.8 E(33420): 5.1e-20
Smith-Waterman score: 1217; 38.8% identity (59.8% similar) in 707 aa overlap (6-692:2-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
            : .:::..:   :::::::::::. ::::::: :::..: :.  .:.: :::.  
CCDS32     MAASPGSGSA---NPRKFSEKIALHTQRQAEETRAFEQLMTDLTLSRVQFQKLQQL
                   10           20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
          . : :::::::.:. :. .:::  .:.  :. :.::::::::: .:.  :.  ::.:
CCDS32 RLTQYH-GGSLPNVSQLRSSASEFQPSFHQA-DNVRGTRHHGLVERPSRN--RF-HPLHR
             60        70        80         90       100           

                   130       140        150       160       170    
pF1KE2 YT-----RHIDSSPYSPAYLSPPPESSW-RRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSA
        .     :..:.: ..  : : : . :: :.   : .   ::   ::: ::::::.::::
CCDS32 RSGDKPGRQFDGSAFGANYSSQPLDESWPRQQPPWKD---EKHPGFRLTSALNRTNSDSA
      110       120       130       140          150       160     

          180       190       200       210              220       
pF1KE2 LHTSVMNPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKV-------PAIEENLLD-DKHL
       ::::... .::: : :    :  :.   :. ::: . .        :  :::::.  : :
CCDS32 LHTSALSTKPQDPYGGGGQ-SAWPAPYMGFCDGENNGHGEVASFPGPLKEENLLNVPKPL
         170       180        190       200       210       220    

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE2 LKP-WDAKKLSSSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPP
        :  :..:...: :.:::::.: : : ::   :  ..  .  ..:::::::::::::.  
CCDS32 PKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQNLGLSPFLGTLNTGGSLPDLTNLHYST
          230       240       250       260       270       280    

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE2 PLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQS
       :::. ::  .  . :.: :::..:.  .::::::          .. ::.:  :.::.:.
CCDS32 PLPASLDTTDHHFGSMSVGNSVNNIPAAMTHLGIR---------SSSGLQSSRSNPSIQA
          290       300       310                320       330     

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 SLSNPNLQASLSSPQPQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSS
       .:..  :..::..          ::.          .:..:  ::::   .::. : :..
CCDS32 TLNKTVLSSSLNN----------HPQTS--------VPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTT
         340                 350               360       370       

         410       420       430       440       450       460     
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       .    :..::          ..:. :.:::.:  ::    ...: . .:.: : ::    
CCDS32 N----LSGPS----------RRRQPPVSPLTLSPGP----EAHQGFSRQLSST-SPL---
           380                 390           400       410         

         470       480         490       500        510       520  
pF1KE2 ITQGVPLDTSKLSTDQR--LPPYPYSSPSLVLPTQPH-TPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGG
           .:  ::.. ...:  :   :  . . : :  :. .:. : :: :            
CCDS32 ----APYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPPPPYPAPQELTQPLLQ-----------
             420       430       440       450       460           

            530       540       550       560       570       580  
pF1KE2 QPPGRQSHYGTPYPPGPSGHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGP
       :: .         : .:. . : .   :.:::.:   .  :. .   .. .:  ..  ::
CCDS32 QPRA---------PEAPAQQPQAASSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGP
                       470       480       490       500       510 

            590         600       610       620       630       640
pF1KE2 GFLGGEGPM--GGPQDPHTFNHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPG
       .:   . :.   : .. .   :   .  :  :: :: ::  ::: .. :.. .::::.: 
CCDS32 AF-PQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSLPNTILPEDSSTSLFKDLNSALAGLP-
              520       530       540       550       560          

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pF1KE2 FEVSAAGLELGLGLEDELRMEPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
        :::  ...  . ::.::..:::.:.:::::::    : ::.:::.::.::: 
CCDS32 -EVSL-NVDTPFPLEEELQIEPLSLDGLNMLSDSSMGLLDPSVEETFRADRL 
      570        580       590       600       610          

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CCDS42             MATSNNPRKFSEKIALHNQKQAEETAAFEEVMKDLSLTRAARLQLQKS
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         :.:. .:...::::::::::::::  .  ::                .:..:  ::.:
CCDS42 QYLQLGPSRGQYYGGSLPNVNQIGSGTMDLPFQPSGFLGEALAAAPVSLTPFQSSGLDTS
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       :.:::::::.:: :.  :. :: ::      . :. :: ::.  ::::: ..:::::   
CCDS42 RTTRHHGLVDRVYRERGRLGSPHRRPLSVDKHGRQADSCPYGTMYLSPPADTSWRRT---
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CCDS42 --------------------NSDSALHQSTMTPTQPESFSSGSQD--VHQKRVLLLT---
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     210       220         230       240       250       260       
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CCDS42 ---VPGMEETTSEADKNLSKQAWDTKK---TGSRPKSCEVPGINIFPSADQENTTALIPA
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       . :::::::::::.::: :::::::::: ..:.::...::.::. ..:::::.   : : 
CCDS42 THNTGGSLPDLTNIHFPSPLPTPLDPEEPTFPALSSSSSTGNLAANLTHLGIG---GAGQ
          260       270       280       290       300          310 

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       :...::  ::  .:.  : ::       ::.   . :.:   :.: : : ... : . . 
CCDS42 GMSTPG-SSPQHRPAGVSPLS-------LSTEARRQQAS---PTLSPLSPITQAVAMDAL
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       :: . .:    .....:..   .:    :  :::   :   : .  : : : . :   :.
CCDS42 SL-EQQLPYAFFTQAGSQQPPPQPQPPPPPPPASQQPPPPPPPQAPVRLPPGGPLLPSAS
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CCDS42 LTRGPQ--PPPLAVTV-P--SSLPQSPPENPGQPSMGIDIA----SAPALQQYRTSAGSP
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CCDS42 AN-QSPTSPVSNQGF--SPGSSPQHTSTLGSVF--GDAYYEQQMAARQANALS-HQLEQF
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