Result of FASTA (ccds) for pF1KE2510
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2510, 1126 aa
  1>>>pF1KE2510     1126 - 1126 aa - 1126 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6468+/-0.00111; mu= -8.7195+/- 0.066
 mean_var=536.2202+/-111.862, 0's: 0 Z-trim(116.5): 147  B-trim: 185 in 1/52
 Lambda= 0.055386
 statistics sampled from 17201 (17345) to 17201 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.519), width:  16
 Scan time:  2.970

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19    (1126) 7921 648.6 2.4e-185
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19    (1123) 3601 303.4   2e-81
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11      (2087) 1301 119.9 6.5e-26
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11      (1738) 1235 114.5 2.2e-24
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs109|chr3      (1444) 1059 100.4 3.3e-20
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1      ( 890) 1031 97.9 1.1e-19
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1     (1101) 1031 98.0 1.3e-19


>>CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19         (1126 aa)
 initn: 7921 init1: 7921 opt: 7921  Z-score: 3441.2  bits: 648.6 E(33420): 2.4e-185
Smith-Waterman score: 7921; 100.0% identity (100.0% similar) in 1126 aa overlap (1-1126:1-1126)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MVARSTDSLDGPGEGSVQPLPTAGGPSVKGKPGKRLSAPRGPFPRLADCAHFHYENVDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MVARSTDSLDGPGEGSVQPLPTAGGPSVKGKPGKRLSAPRGPFPRLADCAHFHYENVDFG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 HIQLLLSPDREGPSLSGENELVFGVQVTCQGRSWPVLRSYDDFRSLDAHLHRCIFDRRFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HIQLLLSPDREGPSLSGENELVFGVQVTCQGRSWPVLRSYDDFRSLDAHLHRCIFDRRFS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 CLPELPPPPEGARAAQMLVPLLLQYLETLSGLVDSNLNCGPVLTWMELDNHGRRLLLSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CLPELPPPPEGARAAQMLVPLLLQYLETLSGLVDSNLNCGPVLTWMELDNHGRRLLLSEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ASLNIPAVAAAHVIKRYTAQAPDELSFEVGDIVSVIDMPPTEDRSWWRGKRGFQVGFFPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASLNIPAVAAAHVIKRYTAQAPDELSFEVGDIVSVIDMPPTEDRSWWRGKRGFQVGFFPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 ECVELFTERPGPGLKADADGPPCGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECVELFTERPGPGLKADADGPPCGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 RLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELES
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 VGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPST
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 RLLTLEEAQARTQGRLGTPTEPTTPKAPASPAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLLTLEEAQARTQGRLGTPTEPTTPKAPASPAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 PSVPRKKPLPWLGGTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSVPRKKPLPWLGGTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASAT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 PTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESPLPPPPLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESPLPPPPLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 LLRPGGAPPPPPKNPARLMALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLRPGGAPPPPPKNPARLMALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 EPLGTSGSGPPPNSLAHPGAWVPGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EPLGTSGSGPPPNSLAHPGAWVPGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 QLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPKPGLYPLGPPSFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPKPGLYPLGPPSFQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 PSSPAPVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRLNASYGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSSPAPVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRLNASYGM
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 LGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQHPARRPTPPEPLYVNLALGPRGPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQHPARRPTPPEPLYVNLALGPRGPSP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 ASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPGPWGPPEPLLLYRAAPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPGPWGPPEPLLLYRAAPPA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      
pF1KE2 YGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQTRSYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQTRSYC
             1090      1100      1110      1120      

>>CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19         (1123 aa)
 initn: 5537 init1: 3450 opt: 3601  Z-score: 1575.6  bits: 303.4 E(33420): 2e-81
Smith-Waterman score: 5579; 82.0% identity (82.0% similar) in 1050 aa overlap (137-1025:1-1022)

        110       120       130       140       150       160      
pF1KE2 DAHLHRCIFDRRFSCLPELPPPPEGARAAQMLVPLLLQYLETLSGLVDSNLNCGPVLTWM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54                               MLVPLLLQYLETLSGLVDSNLNCGPVLTWM
                                             10        20        30

        170       180       190       200       210       220      
pF1KE2 ELDNHGRRLLLSEEASLNIPAVAAAHVIKRYTAQAPDELSFEVGDIVSVIDMPPTEDRSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELDNHGRRLLLSEEASLNIPAVAAAHVIKRYTAQAPDELSFEVGDIVSVIDMPPTEDRSW
               40        50        60        70        80        90

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE2 WRGKRGFQVGFFPSECVELFTERPGPGLKADADGPPCGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WRGKRGFQVGFFPSECVELFTERPGPGLKADADGPPCGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLA
              100       110       120       130       140       150

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE2 GLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVD
              160       170       180       190       200       210

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE2 GIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLY
              220       230       240       250       260       270

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE2 GKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLLRHLARMARHSANTSMHARNLAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLLRHLARMARHSANTSMHARNLAI
              280       290       300       310       320       330

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE2 VWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCL
              340       350       360       370       380       390

        530       540       550       560       570       580      
pF1KE2 LPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPTEPTTPKAPASPAERRKGERGEKQRKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPTEPTTPKAPASPAERRKGERGEKQRKP
              400       410       420       430       440       450

        590       600       610       620       630       640      
pF1KE2 GGSSWKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLGGTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGSSWKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLGGTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASG
              460       470       480       490       500       510

                                                                   
pF1KE2 A-----------------------------------------------------------
       :                                                           
CCDS54 AGLQRLHRLRRPHSSSDAFPVGPAPAGSCESLSSSSSSESSSSESSSSSSESSAAGLGAL
              520       530       540       550       560       570

                                                                   
pF1KE2 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS54 SGSPSHRTSAWLDDGDELDFSPPRCLEGLRGLDFDPLTFRCSSPTPGDPAPPASPAPPAP
              580       590       600       610       620       630

                                                 650       660     
pF1KE2 ------------------------------------------ELLGAGGAPASATPTPAL
                                                 ::::::::::::::::::
CCDS54 ASAFPPRVTPQAISPRGPTSPASPAALDISEPLAVSVPPAVLELLGAGGAPASATPTPAL
              640       650       660       670       680       690

         670       680       690       700       710       720     
pF1KE2 SPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESPLPPPPLSLLRPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESPLPPPPLSLLRPG
              700       710       720       730       740       750

         730       740       750       760       770       780     
pF1KE2 GAPPPPPKNPARLMALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGGEPLGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GAPPPPPKNPARLMALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGGEPLGT
              760       770       780       790       800       810

         790       800       810       820       830       840     
pF1KE2 SGSGPPPNSLAHPGAWVPGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
CCDS54 SGSGPPPNSLAHPGAWVPGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQV-------
              820       830       840       850       860          

         850       860       870       880       890       900     
pF1KE2 GGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPKPGLYPLGPPSFQPSSPA
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ---------------------PTPGFFSPAPRECLPPFLGVPKPGLYPLGPPSFQPSSPA
                                870       880       890       900  

         910       920       930       940       950       960     
pF1KE2 PVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRLNASYGMLGQSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRLNASYGMLGQSP
            910       920       930       940       950       960  

         970       980       990      1000      1010      1020     
pF1KE2 PLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQHPARRPTPPEPLYVNLALGPRGPSPASSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQHPARRPTPPEPLYVNLALGPRGPSPASSSS
            970       980       990      1000      1010      1020  

        1030      1040      1050      1060      1070      1080     
pF1KE2 SSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPGPWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGG
                                                                   
CCDS54 SSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPGPWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGG
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

>--
 initn: 782 init1: 782 opt: 782  Z-score: 358.2  bits: 78.1 E(33420): 1.3e-13
Smith-Waterman score: 782; 100.0% identity (100.0% similar) in 101 aa overlap (1026-1126:1023-1123)

        1000      1010      1020      1030      1040      1050     
pF1KE2 HPARRPTPPEPLYVNLALGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HPARRPTPPEPLYVNLALGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGP
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

        1060      1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KE2 RTPHRVPGPWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RTPHRVPGPWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWS
           1060      1070      1080      1090      1100      1110  

        1120      
pF1KE2 LHSEGQTRSYC
       :::::::::::
CCDS54 LHSEGQTRSYC
           1120   

>>CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11           (2087 aa)
 initn: 2258 init1: 1170 opt: 1301  Z-score: 579.0  bits: 119.9 E(33420): 6.5e-26
Smith-Waterman score: 2260; 45.8% identity (68.1% similar) in 886 aa overlap (2-828:75-914)

                                            10        20         30
pF1KE2                              MVARSTDSLDGPGEGSVQPLPTAGGP-SVKG
                                     .::..:  . ::. .   : : :.  :.: 
CCDS44 VHSEEDDFVPELHRNVHPRERPDWEETLSAMARGADVPEIPGDLT---LKTCGSTASMKV
           50        60        70        80           90       100 

               40        50        60        70          80        
pF1KE2 KPGKRLSAPRGPFPRLADCAHFHYENVDFGHIQLLLSPDREGPSLSG--ENELVFGVQVT
       :  :.:   .: ::..:.:::::::::.:: ::: :: ...    .:   .:::. ::..
CCDS44 KHVKKLPFTKGHFPKMAECAHFHYENVEFGSIQLSLSEEQNEVMKNGCESKELVYLVQIA
             110       120       130       140       150       160 

       90       100       110       120       130       140        
pF1KE2 CQGRSWPVLRSYDDFRSLDAHLHRCIFDRRFSCLPELPPPPEGARAAQMLVPLLLQYLET
       :::.:: : :::.::: :: ::: ::.::::: : :::       . . .. .:. ::  
CCDS44 CQGKSWIVKRSYEDFRVLDKHLHLCIYDRRFSQLSELPRSDTLKDSPESVTQMLMAYLSR
             170       180       190       200       210       220 

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE2 LSGLVDSNLNCGPVLTWMELDNHGRRLLLSEEASLNIPAVAAAHVIKRYTAQAPDELSFE
       ::... ...::::.:::::.::.: .::. ::.:.: :::.::::::::::.:::::..:
CCDS44 LSAIAGNKINCGPALTWMEIDNKGNHLLVHEESSINTPAVGAAHVIKRYTARAPDELTLE
             230       240       250       260       270       280 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE2 VGDIVSVIDMPPTEDRSWWRGKRGFQVGFFPSECVELFTERPGPGLKADADGPPCGIPAP
       ::::::::::::    .:::::.:::::.::..::::....                 .:
CCDS44 VGDIVSVIDMPPKVLSTWWRGKHGFQVGLFPGHCVELINQK-----------------VP
             290       300       310       320                     

      270       280           290       300       310       320    
pF1KE2 QGISSLTSAVPRP----RGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNS
       :   :.:..::.:    .:::  .:::::.:::..:.:.:::::..::::::::::: ::
CCDS44 Q---SVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNS
             330       340       350       360       370       380 

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE2 GQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHS
       : .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:.   ..:::::
CCDS44 GFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHS
             390       400       410       420       430       440 

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE2 VSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLL
       :.:::::::::::::::::::: :::.:.:.  .::::...::::::::::::::::.:.
CCDS44 VGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLM
             450       460       470       480       490       500 

          450       460       470       480       490       500    
pF1KE2 RHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLT
       :::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.:.
CCDS44 RHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILN
             510       520       530       540       550       560 

          510       520       530       540       550         560  
pF1KE2 HVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--TEP
       :::::::  .. :  .  :   : :::::  : :::.::::::::::::.....:  :: 
CCDS44 HVDVLFSGRISMAMQE--GAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTEN
             570         580       590       600       610         

               570                  580       590       600        
pF1KE2 T---TPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRKKP
           . ..::.           : ::.. .   : ..: :: :..:: ::.. :: ..: 
CCDS44 KYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMK-KSPVGS-WRSFFNLGKSSSVSKRK-
     620       630       640       650         660       670       

      610       620             630       640       650       660  
pF1KE2 LPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASATPT
          :  ... :.       .:.: .  :::::::::::.:      : .. :      : 
CCDS44 ---LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTS------LHAVDGDSKLFRPR
           680       690        700       710             720      

            670       680       690       700       710            
pF1KE2 PALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP-------LP
          : . .:   .   .: : .    :   ..  :. .:.   . : . ::       : 
CCDS44 RPRSSSDALSASFNGEML-GNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI-PALMSPHSAEDVDLS
        730       740        750       760        770       780    

         720           730       740              750              
pF1KE2 PPPLSL----LRPGGAPPPPPKNPARLMALALA-------ERAQQVAEQQ------SQQE
       :: ...    . : .    :::  .. .  . .        . .  :...      :: .
CCDS44 PPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQ
          790       800       810       820       830       840    

      760         770       780       790       800           810  
pF1KE2 CGGTPPASQ--SPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW----VPGPPPYLPRQ
         :.  .:.  ::....::      :. :   .:  .. ..:...    : .  : . :.
CCDS44 TPGSTASSEPVSPLQEKLS------PFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRK
          850       860             870       880       890        

            820       830       840       850       860       870  
pF1KE2 QSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFF
        : .  .  ..:....                                            
CCDS44 LSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVK
      900       910       920       930       940       950        

>>CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11           (1738 aa)
 initn: 1422 init1: 1117 opt: 1235  Z-score: 551.5  bits: 114.5 E(33420): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 1330; 43.2% identity (66.3% similar) in 588 aa overlap (293-828:1-565)

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE2 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
                                     :.:::..:.:.:::::..::::::::::: 
CCDS31                               MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
                                             10        20        30

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE2 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
       ::: .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:.   ..:::
CCDS31 NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
               40        50        60        70        80        90

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE2 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
       :::.:::::::::::::::::::: :::.:.:.  .::::...::::::::::::::::.
CCDS31 HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
              100       110       120       130       140       150

            450       460       470       480       490       500  
pF1KE2 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
       :.:::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.
CCDS31 LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
              160       170       180       190       200       210

            510       520       530       540       550         560
pF1KE2 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--T
       :.:::::::  .. :  . :.   : :::::  : :::.::::::::::::.....:  :
CCDS31 LNHVDVLFSGRISMAMQEGAAS--LSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVT
              220       230         240       250       260        

                 570                  580       590       600      
pF1KE2 EPT---TPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRK
       :     . ..::.           : ::.. .  .:..:   .::..:: ::.. :: ..
CCDS31 ENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ--NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKR
      270       280       290       300         310       320      

        610       620             630       640       650       660
pF1KE2 KPLPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASAT
       :    :  ... :.       .:.: .  :::::::::::.:      : .. :      
CCDS31 K----LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTS------LHAVDGDSKLFR
            330       340       350        360             370     

              670       680       690       700       710          
pF1KE2 PTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP-------
       :    : . .:   .   .: : .    :   ..  :. .:.   . : . ::       
CCDS31 PRRPRSSSDALSASFNGEML-GNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI-PALMSPHSAEDVD
         380       390        400       410       420        430   

           720           730       740              750            
pF1KE2 LPPPPLSL----LRPGGAPPPPPKNPARLMALALA-------ERAQQVAEQQ------SQ
       : :: ...    . : .    :::  .. .  . .        . .  :...      ::
CCDS31 LSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQ
           440       450       460       470       480       490   

        760         770       780       790       800           810
pF1KE2 QECGGTPPASQ--SPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW----VPGPPPYLP
        .  :.  .:.  ::....::      :. :   .:  .. ..:...    : .  : . 
CCDS31 CQTPGSTASSEPVSPLQEKLS------PFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIG
           500       510             520       530       540       

              820       830       840       850       860       870
pF1KE2 RQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPG
       :. : .  .  ..:....                                          
CCDS31 RKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQI
       550       560       570       580       590       600       

>>CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs109|chr3           (1444 aa)
 initn: 1021 init1: 923 opt: 1059  Z-score: 476.5  bits: 100.4 E(33420): 3.3e-20
Smith-Waterman score: 1114; 33.3% identity (54.1% similar) in 907 aa overlap (293-1108:1-864)

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE2 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
                                     :... ..:.:...:     .::::: :.: 
CCDS43                               MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLE
                                             10          20        

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE2 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
       .:::::: ::. :.::::.::.::::::::::.:::::::.:: :.. :.:.  ..::::
CCDS43 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI
       30        40        50        60        70        80        

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE2 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
       : :.:::::::::::::::::.:: ::.::.:   :: .:.:...:::.::: :::::::
CCDS43 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY
       90       100       110       120       130       140        

            450       460       470       480       490       500  
pF1KE2 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
       :.::::..:  :..:.:::::::.::::::::: :.:..: .: :::  ::::.::.::.
CCDS43 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI
      150       160       170       180       190       200        

            510       520       530          540       550         
pF1KE2 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSL---AGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP
       :.::: .:..   ..  .  .:   :  :::   : : :  .:..:::::::. .  . :
CCDS43 LNHVDQIFNNGAPGSLENDENR---PIMKSLTLPALSLP-MKLVSLEEAQARSLAT-NHP
      210       220       230          240        250       260    

     560              570       580       590         600       610
pF1KE2 T-----EPTTPKA--PASPAERRKGERGEKQRKPGGSS--WKTFFALGRGPSVPRKKPLP
       .     : . :.   : .   .   :  ...:: ...:  ::..: :::. :  ..: : 
CCDS43 ARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSK-LS
           270       280       290       300       310       320   

              620       630       640        650              660  
pF1KE2 WLGGTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSS-QASGAELLG-------AGGAPASATPT
         :.. .  :  .   . .:.: ::: .:: :  . : :  :       .::    ::  
CCDS43 RNGSVFVRGQRLSV--EKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKM
            330         340       350       360       370       380

            670             680       690       700                
pF1KE2 PALSPGRS--LRPHLIPL----LLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPD-------
        . . : :  :  .        .  :::. . :. ...  :.:.:::.   :.       
CCDS43 HSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGF-DVSSDR--SHLQGAQARPPPEQLKVFRP
              390       400       410          420       430       

     710           720                    730             740      
pF1KE2 MESP----LPPPPLSLLRPGGAPP-------------PPPKNPARLM------ALALAER
       .:.:      :  :...  ..  :             : :.:  . .      :...  :
CCDS43 VEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPLR
       440       450       460       470       480       490       

        750       760              770       780              790  
pF1KE2 AQQVAEQQSQQECGGTPPASQS-------PFHRSLSLEVGG-----EPLG--TSGSGPPP
       .. :   .:   :   :   ::        :: :   : ::     .:::  ::... : 
CCDS43 VSAVISTNSTP-CRTPPKELQSLSSLEEFSFHGS---ESGGWPEEEKPLGAETSAASVPK
       500        510       520       530          540       550   

            800       810            820        830       840      
pF1KE2 NSLAHPGAWVPGPPPYLP-----RQQSDGSLLRSQRPMGT-SRRGLRGPAQVSAQLRAGG
       ..  . .  ::  :  .       :.  . : ... : .. : . :    .     ..  
CCDS43 KAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVE
           560       570       580       590       600       610   

        850       860       870       880                  890     
pF1KE2 GGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPK-----------PGLYPLG
        ::.: :  ...    :       ..    .. :   :  :.             :  : 
CCDS43 EGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLP
           620       630       640       650       660       670   

         900       910       920       930       940       950     
pF1KE2 PPSFQPSSPAPVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRLN
       ::... :   :. .:::::  : .   .:    : :  .: : : . :.        :  
CCDS43 PPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSL--PCG-SFPAPVSTPLEVWT--------RDP
           680       690       700          710               720  

         960       970       980       990        1000      1010   
pF1KE2 ASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQH--PARRPTPPEPLYVNLAL
       :. .  : :    :        :   . . :: :.  :: .  : .. .:   . :.   
CCDS43 ANQSTQGASTAASREK------PEPEQGLHPD-LASLAPLEIVPFEKASPQATVEVG---
            730             740        750       760       770     

          1020      1030      1040      1050      1060        1070 
pF1KE2 GPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPG--PWGPPEPL
       :: . ::    .  ::. :  .: :       :... .    ::   .        ::  
CCDS43 GPGNLSPPLPPAPPPPT-PLEESTPVLLSKGGPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQDSPEIS
            780        790       800       810       820       830 

            1080      1090      1100      1110      1120           
pF1KE2 LLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQTRSYC     
        : ..   :  : .. . .   .:....:.: : : :                       
CCDS43 SLCQGEE-ATPRHSDKQNS---KNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSD
              840          850       860       870       880       

CCDS43 CDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHRP
       890       900       910       920       930       940       

>>CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1           (890 aa)
 initn: 1137 init1: 996 opt: 1031  Z-score: 467.0  bits: 97.9 E(33420): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 1128; 35.0% identity (56.4% similar) in 839 aa overlap (298-1097:3-782)

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE2 PQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQD
                                     :::. ...:  ..::::::: :::..:::.
CCDS12                             MKSRQKGKKKGSAKERVFGCDLQEHLQHSGQE
                                           10        20        30  

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE2 VPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHSVSS
       :::::. :.::.: .:::::::::::::::::.::.::.::: :.:   ..::::: :::
CCDS12 VPQVLKSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQKLRQEFESERKPDLRRDVYLQDIHCVSS
             40        50        60        70        80        90  

       390       400       410       420       430       440       
pF1KE2 LCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLLRHL
       ::: ::::::.:::::.:: ::.::..:  : ::::.. .:...:: :.:::::.:.:::
CCDS12 LCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEAVGVQLEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMRHL
            100       110       120       130       140       150  

       450       460       470       480       490       500       
pF1KE2 ARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLTHVD
       ..::  ::.:.::::::::::::::::: ..:. :..:.::: ::::::.::::.:::::
CCDS12 VHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVD
            160       170       180       190       200       210  

       510       520       530       540       550       560       
pF1KE2 VLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPTE-PTTPK
        ::. .  :.:   .:   ::  .. .:: :       :. . :       : . :.  .
CCDS12 QLFGGAALSGGEVESGWRSLPGTRA-SGS-P-------EDLMPRP-----LPYHLPSILQ
            220       230        240                    250        

        570           580           590       600       610        
pF1KE2 APASPAERRKG----ERGEKQRKPGGS----SWKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLGGTRAP
       :  .: . :      : .:..::  ::    .:...: :::.    ..: ::  .  :  
CCDS12 AGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRK--GSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRK-LPRGAEDRED
      260       270       280         290       300        310     

      620       630       640       650       660       670        
pF1KE2 PQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASATPTPALSPGRSLRPHLIPL
        . .:      ::: ::: .:::. :.::          :  :   ..:. : ::   ::
CCDS12 KSNKG------TLRPAKSMDSLSA-AAGA----------SDEPEGLVGPS-SPRPS--PL
         320             330                  340        350       

      680       690       700       710       720       730        
pF1KE2 LLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESPLPPPPLSLLRPGGAPPPPPKNPARL
       : .. :    .: . :.  .   :..  : . :   :    : .: ::.     .   : 
CCDS12 LPESLENDSIEAAEGEQEPE---AEALGGTNSEPGTPRAGRSAIRAGGS-----SRAERC
         360       370          380       390       400            

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        .. ...   .:          ..::   :  . ::.  . :    .    : : :   :
CCDS12 AGVHISD-PYNVNLPLHITSILSVPPNIIS--NVSLARLTRGLECPALQHRPSPASGPGP
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       :  . ::::    . .  .: : .. :   .   . .:   .: : ..   ... . :: 
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       ..     : .   . . :::.  .     :  .::: :.   . . ::    :.. .   
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pF1KE2 -SPAPVWRSSLGPPAPLDR--GENLYYEIGASEGSPYSGPTRS-WSPFRSMPPDRLNASY
        .:.    .: ::   ...  ::...   . .. ::  ::    :.   :.  .  . . 
CCDS12 LAPSCCSLDSAGPRPEVEEENGEEVFLS-AYDDLSPLLGPKPPIWKGSGSLEGEAAGCGR
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         :::.   .   .   .    :.    .  .  :   : .: .     .:.:   :   
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       .:.::  :   ::.  .   .  ::     : ::  ::  . : .  .  .: .: .: :
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       .:  :  ..:   . :..  :.: .::::                               
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        ::. .  :.:   .:   ::  .. .:: :       :. . :       : . :.  .
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       :  .: . :      : .:..::  ::    .:...: :::.    ..: ::  .  :  
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        . .:      ::: ::: .:::. :.::          :  :   ..:. : ::   ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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