seq1 = pF1KE9507.tfa, 975 bp
seq2 = pF1KE9507/gi568815580f_13725766.tfa (gi568815580f:13725766_13926740), 200975 bp

>pF1KE9507 975
>gi568815580f:13725766_13926740 (Chr18)

1-975  (100001-100975)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTCCTCATTTCACCTGCATTTCTTGGATCTCAACCTGAATGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTCCTCATTTCACCTGCATTTCTTGGATCTCAACCTGAATGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGGCAACCTTTCAGGACCCAATGTCAAAAACAAGTCTTCACCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGGCAACCTTTCAGGACCCAATGTCAAAAACAAGTCTTCACCATGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGACATGGGCATTGCTGTGGAGGTGTTTCTCACTCTGGGTGTCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGACATGGGCATTGCTGTGGAGGTGTTTCTCACTCTGGGTGTCATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTGGAGAACATCTTGGTCATAGGGGCCATAGTGAAGAACAAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTTGGAGAACATCTTGGTCATAGGGGCCATAGTGAAGAACAAAAACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACTCCCCCATGTACTTCTTCGTGTGCAGCCTGGCAGTGGCGGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCACTCCCCCATGTACTTCTTCGTGTGCAGCCTGGCAGTGGCGGACATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGAGCATGTCCAGTGCCTGGGAGACCATCACCATCTACCTACTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGAGCATGTCCAGTGCCTGGGAGACCATCACCATCTACCTACTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACAAGCACCTAGTGATAGCAGACGCCTTTGTGCGCCACATTGACAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACAAGCACCTAGTGATAGCAGACGCCTTTGTGCGCCACATTGACAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTTGACTCCATGATCTGCATTTCCGTGGTGGCATCCATGTGCAGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTTTGACTCCATGATCTGCATTTCCGTGGTGGCATCCATGTGCAGCTTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCCATTGCAGTGGATAGGTACGTCACCATCTTCTACGCCCTGCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCCATTGCAGTGGATAGGTACGTCACCATCTTCTACGCCCTGCGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACCACATCATGACGGCGAGGCGCTCAGGGGCCATCATCGCCGGCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACCACATCATGACGGCGAGGCGCTCAGGGGCCATCATCGCCGGCATCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCTTTCTGCACGGGCTGCGGCATTGTCTTCATCCTGTACTCAGAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCTTTCTGCACGGGCTGCGGCATTGTCTTCATCCTGTACTCAGAATCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTACGTCATCCTGTGCCTCATCTCCATGTTCTTCGCTATGCTGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTACGTCATCCTGTGCCTCATCTCCATGTTCTTCGCTATGCTGTTCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGTGTCTCTGTACATACACATGTTCCTCCTGGCGCGGACTCACGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGTGTCTCTGTACATACACATGTTCCTCCTGGCGCGGACTCACGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGGATCGCGGCTCTGCCCGGGGCCAGCTCTGCGCGGCAGAGGACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGGATCGCGGCTCTGCCCGGGGCCAGCTCTGCGCGGCAGAGGACCAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCAGGGCGCGGTCACCGTCACCATGCTGCTGGGCGTGTTTACCGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCAGGGCGCGGTCACCGTCACCATGCTGCTGGGCGTGTTTACCGTGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGGGCCCCGTTCTTCCTTCATCTCACTTTAATGCTTTCTTGCCCTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGGGCCCCGTTCTTCCTTCATCTCACTTTAATGCTTTCTTGCCCTCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCTACTGCTCTCGCTTCATGTCTCACTTCAATATGTACCTCATACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCTACTGCTCTCGCTTCATGTCTCACTTCAATATGTACCTCATACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCATGTGTAATTCCGTGATGGACCCTCTCATATATGCCTTCCGCAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCATGTGTAATTCCGTGATGGACCCTCTCATATATGCCTTCCGCAGCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGATGCGGAAGACCTTTAAGGAGATTATTTGCTGCCGTGGTTTCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGATGCGGAAGACCTTTAAGGAGATTATTTGCTGCCGTGGTTTCAGGAT

    950     .    :    .    :    .
    951 CGCCTGCAGCTTTCCCAGAAGGGAT
        |||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCCTGCAGCTTTCCCAGAAGGGAT