seq1 = pF1KB5968.tfa, 1668 bp
seq2 = pF1KB5968/gi568815583r_60397458.tfa (gi568815583r:60397458_60727374), 329917 bp

>pF1KB5968 1668
>gi568815583r:60397458_60727374 (Chr15)

(complement)

1-137  (100001-100137)   100% ->
138-219  (169069-169150)   100% ->
220-295  (170447-170522)   100% ->
296-381  (195524-195609)   100% ->
382-523  (212618-212759)   100% ->
524-919  (215754-216149)   100% ->
920-1041  (221746-221867)   100% ->
1042-1174  (223708-223840)   100% ->
1175-1282  (224508-224615)   100% ->
1283-1393  (226306-226416)   100% ->
1394-1506  (227371-227483)   100% ->
1507-1668  (229756-229917)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGAGGGGGCCCCAGGAGACAGTGACTTAGAGACTGAGGCAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGAGGGGGCCCCAGGAGACAGTGACTTAGAGACTGAGGCAAGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGTGGTCAATCATGGGTCATTGTCTTCGAACTGGACAGGCCAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGTGGTCAATCATGGGTCATTGTCTTCGAACTGGACAGGCCAGAATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCCACACCCACACCTGCAGGTGAAGGAGCCAGAAG         GGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100101 CTGCCACACCCACACCTGCAGGTGAAGGAGCCAGAAGGTA...CAGGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAACTTTTTGGGATTCTCCAAATACTCCATCAGTGTATCCTGTCTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169073 GAACTTTTTGGGATTCTCCAAATACTCCATCAGTGTATCCTGTCTTCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATGCTTTTGTTCTTACTGGCGTCTGT         TGTTCCTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 169123 TGATGCTTTTGTTCTTACTGGCGTCTGTGTA...AAGTGTTCCTGGAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAATGGCAAGCCACCATATTCACAAAAGGAAGATAAGGAAGTACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170460 AGAATGGCAAGCCACCATATTCACAAAAGGAAGATAAGGAAGTACAAACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGATACATGAATG         CTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 170510 GGATACATGAATGGTG...CAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195552 CTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCTGCAAG         GGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 195602 GCTGCAAGGTA...CAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212651 ACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212701 AAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTCGAGATG         CTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 212751 CTCGAGATGGTG...CAGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215786 AGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215836 GCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215886 ACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215936 TACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215986 CAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216036 TCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216086 TTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CATGGCAGAATTAG         AACACCTTGCACAGAATATATCTAAAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 216136 CATGGCAGAATTAGGTA...TAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221773 CGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 221823 TGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGGTA..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042     CAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221873 .CAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223754 CTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAG         GTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 223804 CTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTA...TAGGTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224512 TCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224562 ACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTAG         GTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224612 TTAGGTA...CAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226343 AAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTGCATTTGTACTGATGTCAGCAG         ATCGCTCATGGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 226393 CTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGGTA...TAGATCGCTCATGGCTGCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227388 GAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 227438 ACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGGTG.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507      TTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227488 ..CAGTTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229801 ACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229851 TCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAG

   1750     .    :    .
   1652 CAATGCAAATTGATGGG
        |||||||||||||||||
 229901 CAATGCAAATTGATGGG