Result of FASTA (ccds) for pF1KE6355
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6355, 349 aa
  1>>>pF1KE6355     349 - 349 aa - 349 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9765+/-0.000968; mu= 18.0790+/- 0.058
 mean_var=70.6883+/-14.866, 0's: 0 Z-trim(105.3): 25  B-trim: 536 in 1/49
 Lambda= 0.152546
 statistics sampled from 8431 (8450) to 8431 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.253), width:  16
 Scan time:  1.190

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs109|chr14        ( 349) 2311 517.9  5e-147
CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs109|chr4       ( 437)  766 178.0 1.4e-44
CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs109|chr4       ( 377)  722 168.2 9.9e-42
CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs109|chr13        ( 348)  708 165.1 7.9e-41
CCDS48195.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX        ( 448)  438 105.8 7.4e-23
CCDS14755.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX        ( 477)  438 105.8 7.8e-23
CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs109|chr8      ( 438)  410 99.6 5.2e-21


>>CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs109|chr14             (349 aa)
 initn: 2311 init1: 2311 opt: 2311  Z-score: 2753.3  bits: 517.9 E(33420): 5e-147
Smith-Waterman score: 2311; 100.0% identity (100.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 LAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 PQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 SALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340         
pF1KE6 IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
              310       320       330       340         

>>CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs109|chr4            (437 aa)
 initn: 786 init1: 734 opt: 766  Z-score: 914.3  bits: 178.0 E(33420): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 766; 36.2% identity (65.5% similar) in 351 aa overlap (3-343:78-426)

                                           10           20         
pF1KE6                             MEAHNASAPFNFTLPPN---FGKRPTDLALSV
                                     : .. .::     :.   :   : . .:.:
CCDS34 LSLGPGPSFGFSPGPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNV
        50        60        70        80        90       100       

      30        40        50        60        70        80         
pF1KE6 ILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIE
       ..   : . ::.::::.. ... ::. .: :  .: . :.:..:: ::.:. .:.: .. 
CCDS34 FVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVA
       110       120       130       140       150       160       

      90       100       110       120       130       140         
pF1KE6 ALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGD
       :.:.:.::: :::::::..:: . :::::::.::  ::. :: .::: :.::: .  .  
CCDS34 AVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTP
       170       180       190       200       210       220       

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE6 LKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAIN
       . . .:   ....:  .:::  .:. .. :  .   :..: ..  .:.  :.. ....  
CCDS34 IVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTM
       230       240       250       260       270       280       

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE6 VGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTI
       .:  .. ..   . . . .::. :.  :: :..:: :   :.::: .::: ::::::..:
CCDS34 LGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAI
       290       300       310       320       330       340       

     270       280       290       300         310            320  
pF1KE6 LNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLLIAIFWCY--EKF--KTPKDK---TKMIYT
       :..::::. :: ...::::: .:: .:. ... :.  :  : .  . : :.   : . : 
CCDS34 LKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYK
       350       360       370       380       390       400       

            330       340              
pF1KE6 AATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA     
           ::    . :  : :.:.           
CCDS34 KLKEEEMADTSYG--TVKAENIIMMETAQTSL
       410       420         430       

>>CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs109|chr4            (377 aa)
 initn: 695 init1: 402 opt: 722  Z-score: 862.8  bits: 168.2 E(33420): 9.9e-42
Smith-Waterman score: 722; 38.7% identity (73.6% similar) in 292 aa overlap (24-309:31-313)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE6        MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKA
                                     .:...:. . :. ..:.::::..:. :. .
CCDS36 MRANCSSSSACPANSSEEELPVGLEVHGNLELVFTVVSTVMMGLLMFSLGCSVEIRKLWS
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE6 HLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMK
       :. .: :.:..:. :.:.::.::..:.  : :: ..:.:.:. :: :::..::.:.. . 
CCDS36 HIRRPWGIAVGLLCQFGLMPFTAYLLAISFSLKPVQAIAVLIMGCCPGGTISNIFTFWVD
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150         160       170 
pF1KE6 GDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDK--VPYKGIVISLVLVLIPCT
       :::.::: ::::::  ::::::: .:.:.   .. .:...  .::..: :.:: . :: .
CCDS36 GDMDLSISMTTCSTVAALGMMPLCIYLYT---WSWSLQQNLTIPYQNIGITLVCLTIPVA
              130       140          150       160       170       

             180       190         200       210       220         
pF1KE6 IGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMII--ILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLM
       .:. .. . :.  . ..: : ..  .::  :::   ... ..:.  .     :.. : ..
CCDS36 FGVYVNYRWPKQSKIILKIGAVVGGVLLLVVAV---AGVVLAKG-SWNSDITLLTISFIF
       180       190       200       210           220       230   

     230       240         250       260       270       280       
pF1KE6 PFIGFLLGYVLSALFCLNG--RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPL
       :.:: . :..: :::  ..  ::: :.:.::: ::.:.: :.:...:  : .  .. :::
CCDS36 PLIGHVTGFLL-ALFTHQSWQRCR-TISLETGAQNIQMCITMLQLSFTAEHLVQMLSFPL
           240        250        260       270       280       290 

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE6 LYMIFQLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPC
        : .::: .:.:..: .  :..                                      
CCDS36 AYGLFQLIDGFLIVAAYQTYKRRLKNKHGKKNSGCTEVCHTRKSTSSRETNAFLEVNEEG
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs109|chr13             (348 aa)
 initn: 690 init1: 401 opt: 708  Z-score: 846.7  bits: 165.1 E(33420): 7.9e-41
Smith-Waterman score: 708; 38.4% identity (73.4% similar) in 297 aa overlap (25-319:32-322)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE6       MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAH
                                     ..::..:...: ..:.:.::..:..:. .:
CCDS95 NDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLGH
              10        20        30        40        50        60 

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE6 LWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKG
       . .: :. .... :.::::::.:.:. .: .  ..:...:. :: :::. ::...  . :
CCDS95 IKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVDG
              70        80        90       100       110       120 

          120       130       140        150       160       170   
pF1KE6 DMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYD-GDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIG
       ::.::. ::::::. ::::::: : ::..   : :..   .:: .:  ::: ...: .::
CCDS95 DMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSI--VIPYDNIGTSLVSLVVPVSIG
             130       140       150         160       170         

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE6 IVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIG
       . .. : ::  . ..: : :   .  : ..:...:   .. ..:  : :   ....:  :
CCDS95 MFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIA--PKLWIIGTIFPVAG
     180       190       200       210       220         230       

           240        250       260       270       280       290  
pF1KE6 FLLGYVLSALFCLNG-RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIF
       . ::..:. .  :   ::: ::..::: ::.::::::....: :: .. .: :::.: ::
CCDS95 YSLGFLLARIAGLPWYRCR-TVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIF
       240       250        260       270       280       290      

            300       310       320       330       340         
pF1KE6 QLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
       ::. . ......  :.: .  :.:...                              
CCDS95 QLAFAAIFLGFYVAYKKCHG-KNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK    
        300       310        320       330       340            

>>CCDS48195.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX             (448 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 524.0  bits: 105.8 E(33420): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:166-408)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
CCDS48 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
         140       150       160       170       180       190     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
CCDS48 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
         200       210       220       230       240       250     

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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
CCDS48 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
         260       270       280        290       300       310    

     180          190       200       210       220       230      
pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
CCDS48 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
CCDS48 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
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pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
CCDS48 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
              440                                           

>>CCDS14755.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs109|chrX             (477 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 523.7  bits: 105.8 E(33420): 7.8e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:195-437)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
CCDS14 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
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pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
CCDS14 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
          230       240       250       260       270       280    

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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
CCDS14 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
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pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
CCDS14 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
CCDS14 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
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pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
CCDS14 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
     460       470                                          

>>CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs109|chr8           (438 aa)
 initn: 382 init1: 227 opt: 410  Z-score: 490.9  bits: 99.6 E(33420): 5.2e-21
Smith-Waterman score: 410; 30.1% identity (65.0% similar) in 286 aa overlap (30-304:143-418)

                10        20        30        40           50      
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLS---LGCTMEFSKIKAHLW
                                     ::...: .:.:.   .:: .:.. ... .:
CCDS34 RLIEEIKNVKVKVLKQKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQT-VW
            120       130       140       150       160        170 

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pF1KE6 K-PKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAI-LVCGCSPGGNLSNVFSLAMKG
       : :  . .. :.:. .::. .:.:...  : . .:... ..: : :::. . .:.: . :
CCDS34 KRPLPVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTC-PGGGGGYLFALLLDG
             180       190       200       210        220       230

          120       130       140        150       160       170   
pF1KE6 DMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGI-YDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIG
       :..:.:.::  ::. :: :::.  ::::: .  .: .  ..: . :: .:...:.: .::
CCDS34 DFTLAILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTF--HIPVSKIVSTLLFILVPVSIG
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pF1KE6 IVLKSKRPQ---YMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLL--IATSSL
       ::.: . :.   ... .:.   .:... .. .:    ..::  ..:  :  :  :  . :
CCDS34 IVIKHRIPEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLT----FTVG--LVFLKTDNLEVILLGLL
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pF1KE6 MPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLL
       .: .:.:.:: .. .  :     .::..:.:  :  :  ......::    .     :. 
CCDS34 VPALGLLFGYSFAKVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFT
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pF1KE6 YMIFQLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCT
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CCDS34 VAMCSGCEMLLIILVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI                        
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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