seq1 = pF1KB5924.tfa, 1560 bp
seq2 = pF1KB5924/gi568815586f_106674746.tfa (gi568815586f:106674746_106986012), 311267 bp

>pF1KB5924 1560
>gi568815586f:106674746_106986012 (Chr12)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-132  (109252-109299)   100% ->
133-741  (139951-140559)   100% ->
742-836  (150981-151075)   100% ->
837-1065  (167844-168072)   100% ->
1066-1161  (169107-169202)   100% ->
1162-1306  (176705-176849)   100% ->
1307-1451  (185523-185667)   100% ->
1452-1560  (211159-211267)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAGGAGCGCGCCCTCTACATCGTCCGGGCCGGCGAAGCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGAGGAGCGCGCCCTCTACATCGTCCGGGCCGGCGAAGCAGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCGAGCGGGTCCTGAGGGATTACAGCGACAAG         CATAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 TATCGAGCGGGTCCTGAGGGATTACAGCGACAAGGTA...CAGCATAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTACTTTCAAATTTGAATCAACAGATGAAGATAAAAGAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 109259 CTACTTTCAAATTTGAATCAACAGATGAAGATAAAAGAAAGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAACTCTGTGAAGGCATATTTAAAGTCCTTATAAAGGACATCCCAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139951 AAACTCTGTGAAGGCATATTTAAAGTCCTTATAAAGGACATCCCAACAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATGTCAAGTGTCCTGCCTGGAAGTACTCCGCATTCTCTCCAGAGACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140001 ATGTCAAGTGTCCTGCCTGGAAGTACTCCGCATTCTCTCCAGAGACAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGTTTTAGTTCCTGTGACAACTAAGGAAAATATGCAGATACTGCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140051 AGGTTTTAGTTCCTGTGACAACTAAGGAAAATATGCAGATACTGCTGCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTAGCCAAGCTAAATGAGTTAGATGATTCTTTGGAGAAAGTATCAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140101 CTAGCCAAGCTAAATGAGTTAGATGATTCTTTGGAGAAAGTATCAGAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCAGTTATTGTGGAGTCATTAAAATGTCTGTGTAATATAGTGTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140151 CCCAGTTATTGTGGAGTCATTAAAATGTCTGTGTAATATAGTGTTCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCAGATGGCACAGCAGCTCAGCCTGGAACTTAATCTTGCTGCAAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140201 GTCAGATGGCACAGCAGCTCAGCCTGGAACTTAATCTTGCTGCAAAGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGTAACCTCCTGAGAAAGTGCAAGGACCGGAAATTTATCAATGACATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140251 TGTAACCTCCTGAGAAAGTGCAAGGACCGGAAATTTATCAATGACATTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTGCTTTGACTTGCGCTTGCTCTTCCTTCTGTCACTTTTGCACACCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140301 GTGCTTTGACTTGCGCTTGCTCTTCCTTCTGTCACTTTTGCACACCGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCAGGTCACAATTGCGCTATGAGCTCCAGGGACTACCGCTGCTAACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140351 TCAGGTCACAATTGCGCTATGAGCTCCAGGGACTACCGCTGCTAACGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATCTTGGAAAGTGCCTTTAGCATCAAGTGGACCGATGAGTATGAATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140401 ATCTTGGAAAGTGCCTTTAGCATCAAGTGGACCGATGAGTATGAATCGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CATAGACCATAATGGACCTCCTCTCTCACCTCAGGAGACAGACTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140451 CATAGACCATAATGGACCTCCTCTCTCACCTCAGGAGACAGACTGTGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTGAGGCCCTCAAAGCTCTCTTCAATGTGACGGTAGACAGTTGGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140501 TTGAGGCCCTCAAAGCTCTCTTCAATGTGACGGTAGACAGTTGGAAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CATAAAGAG         AGTGATTCTCATCAGTTCCGTGTAATGGCAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 140551 CATAAAGAGGTA...TAGAGTGATTCTCATCAGTTCCGTGTAATGGCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGTCCTTCGTCATTGTTTACTAATCGTAGGTCCAACTGAAGACAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151013 TGTCCTTCGTCATTGTTTACTAATCGTAGGTCCAACTGAAGACAAAACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AAGAGCTACACAG         CAATGCAGTCAACCTTTTAAGCAATGTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 151063 AAGAGCTACACAGGTG...CAGCAATGCAGTCAACCTTTTAAGCAATGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCAGTCTCTTGTTTGGATGTTCTCATTTGTCCGTTAACCCATGAAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167872 CCAGTCTCTTGTTTGGATGTTCTCATTTGTCCGTTAACCCATGAAGAAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGCCCAAGAGGCAACGACTCTAGATGAACTGCCCAGTAATAAAACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167922 AGCCCAAGAGGCAACGACTCTAGATGAACTGCCCAGTAATAAAACAGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGAAAGAAACAGTTTTGAAAAACAATACCATGGTATACAATGGTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167972 AGAAAGAAACAGTTTTGAAAAACAATACCATGGTATACAATGGTATGAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ATGGAGGCCATTCATGTTTTACTGAATTTTATGGAGAAGAGAATAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168022 ATGGAGGCCATTCATGTTTTACTGAATTTTATGGAGAAGAGAATAGACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 G         GGAAGCAGCTATAGAGAGGGTCTAACTCCAGTTCTCAGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168072 GGTA...TAGGGAAGCAGCTATAGAGAGGGTCTAACTCCAGTTCTCAGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TATTAACCGAATGTTCCCGAGCCCATCGAAACATCCGAAAATTTCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169147 TATTAACCGAATGTTCCCGAGCCCATCGAAACATCCGAAAATTTCTCAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GATCAG         GTTTTACCACCGTTGAGGGATGTGACAAATCGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169197 GATCAGGTA...CAGGTTTTACCACCGTTGAGGGATGTGACAAATCGACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGAAGTTGGCTCAACTGTGAGAAATAAGCTGGTGCGCCTCATGACACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176740 TGAAGTTGGCTCAACTGTGAGAAATAAGCTGGTGCGCCTCATGACACATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TTGACCTTGGAGTCAAGCAAATTGCTGCTGAATTCCTTTTTGTCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176790 TTGACCTTGGAGTCAAGCAAATTGCTGCTGAATTCCTTTTTGTCCTTTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AAAGAGAGAG         TGGATAGTCTGCTGAAATACACTGGCTATGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 176840 AAAGAGAGAGGTA...CAGTGGATAGTCTGCTGAAATACACTGGCTATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GAATGCTGCAGGACTGTTGGCGGCCAGGGGCCTCTTGGCTGGAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185554 GAATGCTGCAGGACTGTTGGCGGCCAGGGGCCTCTTGGCTGGAGGAAGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GAGATAATTGGTACTCAGAGGATGAGGACACAGACACTGAAGAATACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185604 GAGATAATTGGTACTCAGAGGATGAGGACACAGACACTGAAGAATACAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AATGCAAAACCAAA         AGAGGAGTTGCTTAAACCAATGGGACT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 185654 AATGCAAAACCAAAGTA...TAGAGAGGAGTTGCTTAAACCAATGGGACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 AAAACCTGATGGGACAATAACGCCTTTGGAGGAAGCACTCAACCAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211186 AAAACCTGATGGGACAATAACGCCTTTGGAGGAAGCACTCAACCAGTACT

   1600     .    :    .    :    .    :
   1529 CTGTCATCGAAGAGACCAGCTCTGACACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 211236 CTGTCATCGAAGAGACCAGCTCTGACACAGAC