FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2129, 931 aa 1>>>pF1KE2129 931 - 931 aa - 931 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1526+/-0.000513; mu= 17.5915+/- 0.032 mean_var=116.1074+/-23.768, 0's: 0 Z-trim(111.0): 100 B-trim: 458 in 2/49 Lambda= 0.119027 statistics sampled from 19445 (19545) to 19445 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16 Scan time: 8.680 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient re ( 931) 6153 1069.0 0 XP_011541270 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 876) 5736 997.4 0 XP_016873711 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 845) 5542 964.1 0 XP_011530519 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 937) 4178 729.9 1.4e-209 XP_016864067 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 936) 4164 727.5 7.5e-209 XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 920) 3835 671.0 7.6e-192 NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient ( 921) 3835 671.0 7.6e-192 NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient re ( 848) 3832 670.4 1e-191 XP_016864068 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 893) 3827 669.6 1.9e-191 XP_016873710 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 815) 3282 576.0 2.7e-163 NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient recept ( 828) 778 146.0 7.4e-34 NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient recept ( 836) 778 146.0 7.5e-34 NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient recept ( 893) 778 146.0 7.8e-34 NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 977) 778 146.1 8.4e-34 NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 982) 778 146.1 8.4e-34 XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 661) 737 138.9 8.3e-32 XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 695) 737 138.9 8.6e-32 XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 709) 737 138.9 8.7e-32 XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 732) 737 138.9 8.9e-32 NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor ( 759) 737 138.9 9.2e-32 NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 737 138.9 9.5e-32 XP_016876213 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 557) 498 97.8 1.7e-19 XP_011533508 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 498 97.8 1.7e-19 XP_016876212 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 498 97.8 1.7e-19 NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient recept ( 804) 498 97.9 2.2e-19 XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short trans ( 973) 475 94.0 3.8e-18 NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor ( 973) 475 94.0 3.8e-18 XP_011516557 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1184) 221 50.5 6e-05 XP_016869778 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1560) 221 50.6 7.3e-05 XP_011516554 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1694) 221 50.6 7.8e-05 XP_011516553 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1779) 221 50.6 8.1e-05 XP_011516551 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1944) 221 50.7 8.6e-05 XP_011516550 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1975) 221 50.7 8.7e-05 XP_011516548 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1981) 221 50.7 8.7e-05 XP_011516547 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1991) 221 50.7 8.7e-05 NP_001170782 (OMIM: 602014,607009) transient recep (2017) 221 50.7 8.8e-05 NP_001170781 (OMIM: 602014,607009) transient recep (2017) 221 50.7 8.8e-05 XP_011516546 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (2021) 221 50.7 8.8e-05 NP_060132 (OMIM: 602014,607009) transient receptor (2022) 221 50.7 8.8e-05 XP_016877843 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1826) 220 50.5 9.2e-05 XP_016877844 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1826) 220 50.5 9.2e-05 NP_001288141 (OMIM: 105500,605692) transient recep (1864) 220 50.5 9.4e-05 NP_060142 (OMIM: 105500,605692) transient receptor (1865) 220 50.5 9.4e-05 XP_016877842 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1873) 220 50.5 9.4e-05 XP_016877841 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1874) 220 50.5 9.4e-05 XP_005254543 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1885) 220 50.5 9.5e-05 XP_016877840 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1893) 220 50.5 9.5e-05 XP_016877839 (OMIM: 105500,605692) PREDICTED: tran (1894) 220 50.5 9.5e-05 XP_016869777 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1852) 198 46.7 0.0013 XP_016869776 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1901) 198 46.7 0.0013 >>NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient recept (931 aa) initn: 6153 init1: 6153 opt: 6153 Z-score: 5716.4 bits: 1069.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6153; 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