Result of FASTA (ccds) for pF1KE1875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1875, 398 aa
  1>>>pF1KE1875     398 - 398 aa - 398 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5683+/-0.000878; mu= 3.6504+/- 0.053
 mean_var=180.5995+/-36.041, 0's: 0 Z-trim(113.6): 11  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.095437
 statistics sampled from 14182 (14192) to 14182 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.436), width:  16
 Scan time:  3.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9         ( 398) 2723 386.7 2.1e-107
CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1          ( 372) 1339 196.1 4.5e-50
CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1        ( 401) 1339 196.1 4.8e-50
CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1         ( 393) 1122 166.2 4.7e-41
CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3         ( 344)  937 140.7   2e-33
CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20       ( 388)  833 126.4 4.4e-29
CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18       ( 343)  788 120.2 2.9e-27
CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18       ( 382)  780 119.1 6.8e-27
CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5        ( 327)  430 70.9 1.9e-12


>>CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9              (398 aa)
 initn: 2723 init1: 2723 opt: 2723  Z-score: 2041.8  bits: 386.7 E(32554): 2.1e-107
Smith-Waterman score: 2723; 100.0% identity (100.0% similar) in 398 aa overlap (1-398:1-398)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLAGRDLSRLPQLVGVSTPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLAGRDLSRLPQLVGVSTPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 HTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 YTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 NGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390        
pF1KE1 HTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
              370       380       390        

>>CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1               (372 aa)
 initn: 1323 init1: 809 opt: 1339  Z-score: 1012.4  bits: 196.1 E(32554): 4.5e-50
Smith-Waterman score: 1366; 54.0% identity (74.2% similar) in 383 aa overlap (16-397:6-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLAGRDLSRLPQLVGVSTPL
                      :..:.:.:. .. .: ::. :... :.   :.    .:.  :   
CCDS50           MSRLLGGTLERVCKAVLLLCLLHFLVAVILYF---DV-YAQHLAFFSRFS
                         10        20        30            40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVP
         :   :   . ::.   .. .::    ..:. :.       : .. :::          
CCDS50 ARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPE-------VPSALPGP----------
         50        60        70        80                          

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 HTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
         :: .:: ::.  : ::: .::::. :. :: : ..::.: :::::.: ::.  . ::.
CCDS50 --TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQRENPGVLMGGRYTPPDCTPAQTVAV
        90       100       110       120       130       140       

              190       200       210       220       230          
pF1KE1 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALK-DY
       :::::.:..::.:::.::::.:.::.: ::.::::: :.  ::::::::::: :::: : 
CCDS50 IIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEALKEDA
       150       160       170       180       190       200       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE1 DYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLT
        : ::.::::::.::.:.: ::: .::::...::::::: :::. ::::::.::: ::: 
CCDS50 AYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKAQFLR
       210       220       230       240       250       260       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE1 INGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRI
       ::::::.::::::::::::::. . ::.::::.  .:: :::.:.:::.:::::::: .:
CCDS50 INGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQRFTKI
       270       280       290       300       310       320       

     360       370       380       390              
pF1KE1 AHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS      
        .:: ::  ::..:. ::::.:.: ::.:.:::::: :       
CCDS50 QNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG
       330       340       350       360       370  

>>CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1             (401 aa)
 initn: 1323 init1: 809 opt: 1339  Z-score: 1011.9  bits: 196.1 E(32554): 4.8e-50
Smith-Waterman score: 1370; 53.5% identity (73.8% similar) in 389 aa overlap (10-397:29-394)

                                  10        20        30        40 
pF1KE1                    MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYY
                                   : . . :..:.:.:. .. .: ::. :... :
CCDS55 MAVEVQEQWPCLPAAGCPGPLGGPVAACGMSRLLGGTLERVCKAVLLLCLLHFLVAVILY
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80        90       100 
pF1KE1 LAGRDLSRLPQLVGVSTPLQGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSS
       .   :.    .:.  :     :   :   . ::.   .. .::    ..:. :.      
CCDS55 F---DV-YAQHLAFFSRFSARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPE------
                   70        80        90       100       110      

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE1 PVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNV
        : .. :::            :: .:: ::.  : ::: .::::. :. :: : ..::.:
CCDS55 -VPSALPGP------------TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQRENPGV
                           120       130       140       150       

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE1 KMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTI
        :::::.: ::.  . ::.:::::.:..::.:::.::::.:.::.: ::.::::: :.  
CCDS55 LMGGRYTPPDCTPAQTVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDT
       160       170       180       190       200       210       

             230        240       250       260       270       280
pF1KE1 FNRAKLLNVGFQEALK-DYDYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSL
       ::::::::::: :::: :  : ::.::::::.::.:.: ::: .::::...::::::: :
CCDS55 FNRAKLLNVGFLEALKEDAAYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRL
       220       230       240       250       260       270       

              290       300       310       320       330       340
pF1KE1 PYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRM
       ::. ::::::.::: ::: ::::::.::::::::::::::. . ::.::::.  .:: ::
CCDS55 PYAGYFGGVSGLSKAQFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRM
       280       290       300       310       320       330       

              350       360       370       380       390          
pF1KE1 IRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS  
       :.:.:::.:::::::: .: .:: ::  ::..:. ::::.:.: ::.:.:::::: :   
CCDS55 IKHDRDKHNEPNPQRFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSW
       340       350       360       370       380       390       

CCDS55 PPRG
       400 

>>CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1              (393 aa)
 initn: 1124 init1: 576 opt: 1122  Z-score: 850.6  bits: 166.2 E(32554): 4.7e-41
Smith-Waterman score: 1122; 55.4% identity (77.2% similar) in 307 aa overlap (97-396:39-344)

         70        80        90       100        110         120   
pF1KE1 AAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVD-SGPGPA-SNLTSVP-VPH--
                                     : :..:. : : :  . :::. .: .:   
CCDS12 PCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPRDVYSNLSHLPGAPGGP
       10        20        30        40        50        60        

             130       140        150       160       170       180
pF1KE1 TTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPV-DLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
        .  .:: :::.:::::::. . :. :: .:  ....:: :. :::: :  :    ..::
CCDS12 PAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFS-PVPSLAEIVERNPRVEPGGRYRPAGCEPRSRTAI
       70        80        90        100       110       120       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYD
       :.: : :..::.  ::.::: :::::: ::::::.:::.  :::::::::: .:::.: .
CCDS12 IVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEE
       130       140       150       160       170       180       

              250       260        270       280       290         
pF1KE1 YTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQ-PRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLT
       . :. . ::::.: :::: : :  . :::..:::.:::.:::: :::::::::. .:.: 
CCDS12 WDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLK
       190       200       210       220       230       240       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE1 INGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRI
       .:::::.::::::::::: .:. . ::.:::: . ::. .:..:  :: :: ::.::: .
CCDS12 MNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRGDKGNEENPHRFDLL
       250       260       270       280       290       300       

     360       370       380       390                             
pF1KE1 AHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS                     
       ..:...  .::.::::::.:  .  ::::.::.::::                       
CCDS12 VRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGPRAPSGPRYPPGSSQAFRQ
       310       320       330       340       350       360       

CCDS12 EMLQRRPPARPGPLSTANHTALRGSH
       370       380       390   

>>CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3              (344 aa)
 initn: 937 init1: 871 opt: 937  Z-score: 713.8  bits: 140.7 E(32554): 2e-33
Smith-Waterman score: 937; 50.4% identity (73.5% similar) in 272 aa overlap (122-393:69-339)

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE1 SQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDL
                                     :  . :  ::  :: : :   . :.  . :
CCDS29 QEIPKAKEFMANFHKTLILGKGKTLTNEASTKKVELDNCPSVSPYLRGQSKLIFKPDLTL
       40        50        60        70        80        90        

             160       170       180       190       200       210 
pF1KE1 ELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGI
       : :  .::.:. : :: :..: . ..:::..: :::..:: : : .::: ::::::::::
CCDS29 EEVQAENPKVSRG-RYRPQECKALQRVAILVPHRNREKHLMYLLEHLHPFLQRQQLDYGI
      100       110        120       130       140       150       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE1 YVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISV
       :::.::    ::::::::::. ::::. .. ::.: ::::.: :: : :.:  .:.:. :
CCDS29 YVIHQAEGKKFNRAKLLNVGYLEALKEENWDCFIFHDVDLVPENDFNLYKCEEHPKHLVV
       160       170       180       190       200       210       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE1 AMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRP
       . .. :. : :  :::::.:::..::. .::: ::::::::::::.  :. .. :.::::
CCDS29 GRNSTGYRLRYSGYFGGVTALSREQFFKVNGFSNNYWGWGGEDDDLRLRVELQRMKISRP
       220       230       240       250       260       270       

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE1 NAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQIT
          ::.  :. :.::: :: : .:.  . .....  .:::.: .:....:.. ::: .::
CCDS29 LPEVGKYTMVFHTRDKGNEVNAERMKLLHQVSRVWRTDGLSSCSYKLVSVEHNPLYINIT
       280       290       300       310       320       330       

              
pF1KE1 VDIGTPS
       ::     
CCDS29 VDFWFGA
       340    

>>CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20            (388 aa)
 initn: 786 init1: 713 opt: 833  Z-score: 635.6  bits: 126.4 E(32554): 4.4e-29
Smith-Waterman score: 833; 43.6% identity (71.6% similar) in 303 aa overlap (99-397:82-380)

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE1 AIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHT-TALSL
                                     ::.  .: . . .   :.. .:.  : .. 
CCDS13 LIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFAN
              60        70        80        90       100       110 

       130       140          150       160       170       180    
pF1KE1 PACPEESPLLVGPMLI---EFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPF
        .:::. : . ::. :   :..:    :: .: .:..:.::.. : ::.   ::::.:::
CCDS13 HTCPERLPSMKGPIDINMSEIGMDYIHELFSK-DPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPF
             120       130       140        150       160       170

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE1 RNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCF
       :::.:::   . .: :.::::.:....::..:.:   :::: :.:::::::.:: :. :.
CCDS13 RNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCL
              180       190       200       210       220       230

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE1 VFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFP
       .: ::: :: .:.: : : ..:::... .::. . :::...:::::.:. .::  :::::
CCDS13 IFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFP
              240       250       260       270       280       290

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE1 NNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKE
       : .:::::::::..::.   :.:.:::.. .:. . : : . . .     :.  . ..::
CCDS13 NAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPH-HHRGEVQFLGRYALLRKSKE
              300       310       320        330       340         

          370       380       390               
pF1KE1 TMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS       
        .  ::::.:.:   ..    :: .:::.. ::        
CCDS13 RQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNL-TPELAQVNEY
     350       360        370        380        

>>CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18            (343 aa)
 initn: 757 init1: 692 opt: 788  Z-score: 602.9  bits: 120.2 E(32554): 2.9e-27
Smith-Waterman score: 788; 40.6% identity (70.3% similar) in 303 aa overlap (96-394:36-333)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KE1 SAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTAL
                                     :: :     .:.   ... : .:   : . 
CCDS82 RMMRVSNRSLLAFIFFFSLSSSCLYFIYVAPGIDYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSP
          10        20        30        40        50        60     

         130       140        150        160       170       180   
pF1KE1 SLPACPEESPLLVGPMLIEFN-MPVD-LELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIP
        :: :::. : . : . .. . .  : .. . ... ... ::.. :.::    :::..::
CCDS82 YLP-CPEKLPYMRGFLNVNVSEVSFDEIHQLFSKDLDIEPGGHWRPKDCKPRWKVAVLIP
           70        80        90       100       110       120    

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE1 FRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTC
       ::::.:::  .. .: :.::.:.:....:::.:.:   :::: :.::::.::.::  . :
CCDS82 FRNRHEHLPIFFLHLIPMLQKQRLEFAFYVIEQTGTQPFNRAMLFNVGFKEAMKDSVWDC
          130       140       150       160       170       180    

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE1 FVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGF
        .: ::: .: ::.: : :  .:::... .::. . ::: ..:::::.:. .::  ::::
CCDS82 VIFHDVDHLPENDRNYYGCGEMPRHFAAKLDKYMYILPYKEFFGGVSGLTVEQFRKINGF
          190       200       210       220       230       240    

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE1 PNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTK
       :: .:::::::::..::. . :....::.. .:. . : : . . .     :.  . ..:
CCDS82 PNAFWGWGGEDDDLWNRVHYAGYNVTRPEGDLGKYKSIPH-HHRGEVQFLGRYKLLRYSK
          250       260       270       280        290       300   

           370         380       390              
pF1KE1 ETMLSDGLNSLTY--QVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS      
       : .  ::::.: :  ..: :.:  :::.:.:..          
CCDS82 ERQYIDGLNNLIYRPKIL-VDR--LYTNISVNLMPELAPIEDY
           310       320          330       340   

>>CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18            (382 aa)
 initn: 757 init1: 692 opt: 780  Z-score: 596.3  bits: 119.1 E(32554): 6.8e-27
Smith-Waterman score: 780; 40.4% identity (70.2% similar) in 302 aa overlap (97-394:76-372)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE1 AAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTALS
                                     : :     .:.   ... : .:   : .  
CCDS11 VQARGIMLRENVKTIGHMIRLYTNKNSTLNGTDYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSPY
          50        60        70        80        90       100     

        130       140        150        160       170       180    
pF1KE1 LPACPEESPLLVGPMLIEFN-MPVD-LELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPF
       :: :::. : . : . .. . .  : .. . ... ... ::.. :.::    :::..:::
CCDS11 LP-CPEKLPYMRGFLNVNVSEVSFDEIHQLFSKDLDIEPGGHWRPKDCKPRWKVAVLIPF
          110       120       130       140       150       160    

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE1 RNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCF
       :::.:::  .. .: :.::.:.:....:::.:.:   :::: :.::::.::.::  . : 
CCDS11 RNRHEHLPIFFLHLIPMLQKQRLEFAFYVIEQTGTQPFNRAMLFNVGFKEAMKDSVWDCV
          170       180       190       200       210       220    

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE1 VFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFP
       .: ::: .: ::.: : :  .:::... .::. . ::: ..:::::.:. .::  :::::
CCDS11 IFHDVDHLPENDRNYYGCGEMPRHFAAKLDKYMYILPYKEFFGGVSGLTVEQFRKINGFP
          230       240       250       260       270       280    

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE1 NNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKE
       : .:::::::::..::. . :....::.. .:. . : : . . .     :.  . ..::
CCDS11 NAFWGWGGEDDDLWNRVHYAGYNVTRPEGDLGKYKSIPH-HHRGEVQFLGRYKLLRYSKE
          290       300       310       320        330       340   

          370         380       390              
pF1KE1 TMLSDGLNSLTY--QVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS      
        .  ::::.: :  ..: :.:  :::.:.:..          
CCDS11 RQYIDGLNNLIYRPKIL-VDR--LYTNISVNLMPELAPIEDY
           350       360          370       380  

>>CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5             (327 aa)
 initn: 398 init1: 193 opt: 430  Z-score: 336.8  bits: 70.9 E(32554): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 430; 35.1% identity (64.9% similar) in 208 aa overlap (175-378:92-294)

          150       160       170       180       190       200    
pF1KE1 FNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQR
                                     ::..:...:::.: :.:  .. ...  :.:
CCDS44 RGQGQETSGPPRACPPEPPPEHWEEDASWGPHRLAVLVPFRERFEELLVFVPHMRRFLSR
              70        80        90       100       110       120 

          210       220       230       240       250       260    
pF1KE1 QQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFS
       ... . :::.::.    :::: :.:::: :. .. ::  ... ::::.:.:..  :  : 
CCDS44 KKIRHHIYVLNQVDHFRFNRAALINVGFLESSNSTDY--IAMHDVDLLPLNEELDYG-FP
             130       140       150         160       170         

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE1 QPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFR
       .   . ::  ..     :  : ::.  ::::..   ::. : .:::: :::... :.   
CCDS44 EAGPFHVASPELHPLYHYKTYVGGILLLSKQHYRLCNGMSNRFWGWGREDDEFYRRIKGA
      180       190       200       210       220       230        

          330       340       350       360           370       380
pF1KE1 GMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKETMLS----DGLNSLTYQVLD
       :... ::....   . .:: .:   .   :.  :::  :. ...     :::.. :.:  
CCDS44 GLQLFRPSGITTGYKTFRHLHDPAWRKRDQK--RIAAQKQEQFKVDREGGLNTVKYHVAS
      240       250       260         270       280       290      

              390                     
pF1KE1 VQRYPLYTQITVDIGTPS             
                                      
CCDS44 RTALSVGGAPCTVLNIMLDCDKTATPWCTFS
        300       310       320       




398 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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