Result of SIM4 for pF1KB5872

seq1 = pF1KB5872.tfa, 1152 bp
seq2 = pF1KB5872/gi568815593f_134014950.tfa (gi568815593f:134014950_134246300), 231351 bp

>pF1KB5872 1152
>gi568815593f:134014950_134246300 (Chr5)

1-249  (99958-100206)   100% ->
250-316  (100372-100438)   100% ->
317-441  (100960-101084)   100% ->
442-547  (123110-123215)   100% ->
548-635  (124002-124089)   100% ->
636-755  (127236-127355)   100% ->
756-918  (127772-127934)   100% ->
919-1026  (128044-128151)   100% ->
1027-1075  (128643-128691)   100% ->
1076-1152  (131275-131351)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCAGCTGGACTCCGGCGGGGGCGGCGCGGGCGGCGGCGACGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99958 ATGCCGCAGCTGGACTCCGGCGGGGGCGGCGCGGGCGGCGGCGACGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCGCGCCGGACGAGCTGCTGGCCTTCCAGGATGAAGGCGAGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100008 CGGCGCGCCGGACGAGCTGCTGGCCTTCCAGGATGAAGGCGAGGAGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGACAAGAGCCGCGACAGCGCCGCCGGTCCCGAGCGCGACCTGGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100058 ACGACAAGAGCCGCGACAGCGCCGCCGGTCCCGAGCGCGACCTGGCCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAAGTCGTCGCTCGTGAACGAGTCCGAGGGCGCGGCCGGCGGCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100108 CTCAAGTCGTCGCTCGTGAACGAGTCCGAGGGCGCGGCCGGCGGCGCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATCCCGGGGGTCCCGGGGGCCGGCGCCGGGGCCCGCGGCGAGGCCGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100158 GATCCCGGGGGTCCCGGGGGCCGGCGCCGGGGCCCGCGGCGAGGCCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250         GCTCTCGGGCGGGAACACGCTGCGCAGAGACTCTTCCCGGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100208 TG...CAGGCTCTCGGGCGGGAACACGCTGCGCAGAGACTCTTCCCGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAACTTCCAGAGCCCCTGGAGGACG         GCCTGAAGGCCCCGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100414 AAACTTCCAGAGCCCCTGGAGGACGGTG...CAGGCCTGAAGGCCCCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTGCACCAGCGGCATGTACAAAGAGACCGTCTACTCCGCCTTCAATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100976 GTGCACCAGCGGCATGTACAAAGAGACCGTCTACTCCGCCTTCAATCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCATGCATTACCCACCCCCCTCGGGAGCAGGGCAGCACCCCCAGCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101026 TCATGCATTACCCACCCCCCTCGGGAGCAGGGCAGCACCCCCAGCCGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCCCGCTG         CACAAGGCCAATCAGCCCCCCCACGGTGTCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101076 CCCCCGCTGGTA...CAGCACAAGGCCAATCAGCCCCCCCACGGTGTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAACTCTCTCTCTACGAACATTTCAACAGCCCACATCCCACCCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123142 CCAACTCTCTCTCTACGAACATTTCAACAGCCCACATCCCACCCCTGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGCGGACATCAGCCAGAAGCAAG         TTCACAGGCCTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 123192 CTGCGGACATCAGCCAGAAGCAAGGTA...CAGTTCACAGGCCTCTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCCCTGACCTCTCTGGCTTCTACTCCCTGACCTCAGGCAGCATGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124019 ACCCCTGACCTCTCTGGCTTCTACTCCCTGACCTCAGGCAGCATGGGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTCCCCCACACTGTGAGCTG         GTTCACCCACCCATCCTTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124069 GCTCCCCCACACTGTGAGCTGGTG...CAGGTTCACCCACCCATCCTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGCTAGGTTCTGGTGTACCTGGTCACCCAGCAGCCATCCCCCACCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127256 TGCTAGGTTCTGGTGTACCTGGTCACCCAGCAGCCATCCCCCACCCGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATTGTGCCCCCCTCAGGGAAGCAGGAGCTGCAGCCCTTCGACCGCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127306 ATTGTGCCCCCCTCAGGGAAGCAGGAGCTGCAGCCCTTCGACCGCAACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756          GAAGACACAAGCAGAGTCCAAGGCAGAGAAGGAGGCCAAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127356 GTG...CAGGAAGACACAAGCAGAGTCCAAGGCAGAGAAGGAGGCCAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCCAACCATCAAGAAGCCCCTCAATGCCTTCATGCTGTACATGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127813 AGCCAACCATCAAGAAGCCCCTCAATGCCTTCATGCTGTACATGAAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATGAGAGCCAAGGTCATTGCAGAGTGCACACTTAAGGAGAGCGCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127863 ATGAGAGCCAAGGTCATTGCAGAGTGCACACTTAAGGAGAGCGCTGCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAACCAGATCCTGGGCCGCAGG         TGGCACGCGCTGTCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 127913 CAACCAGATCCTGGGCCGCAGGGTG...CAGTGGCACGCGCTGTCGCGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGAGCAGGCCAAGTACTATGAGCTGGCCCGCAAGGAGAGGCAGCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128063 AAGAGCAGGCCAAGTACTATGAGCTGGCCCGCAAGGAGAGGCAGCTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATGCAGCTATACCCAGGCTGGTCAGCGCGGGACAACTAC         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 128113 ATGCAGCTATACCCAGGCTGGTCAGCGCGGGACAACTACGTG...CAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GAAGAAGAAGAGGCGGTCGAGGGAAAAGCACCAAGAATCCACCACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128645 GAAGAAGAAGAGGCGGTCGAGGGAAAAGCACCAAGAATCCACCACAGGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1076       GAGGAAAAAGAAATGCATTCGGTACTTACCCGGAGAAGGCCGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128695 ...TAGGAGGAAAAAGAAATGCATTCGGTACTTACCCGGAGAAGGCCGCT

   1200     .    :    .    :    .    :
   1120 GCCCCAGCCCCGTTCCTTCCGATGACAGTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 131319 GCCCCAGCCCCGTTCCTTCCGATGACAGTGCTC

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