seq1 = pF1KB5708.tfa, 2154 bp seq2 = pF1KB5708/gi568815595f_101749629.tfa (gi568815595f:101749629_101959368), 209740 bp >pF1KB5708 2154 >gi568815595f:101749629_101959368 (Chr3) 1-289 (100001-100289) 100% -> 290-429 (102457-102596) 100% -> 430-460 (103110-103140) 100% -> 461-564 (103258-103361) 100% -> 565-1337 (103463-104235) 100% -> 1338-1443 (104950-105055) 100% -> 1444-1590 (105434-105580) 100% -> 1591-1654 (105767-105830) 100% -> 1655-1824 (106105-106274) 100% -> 1825-1935 (107445-107555) 100% -> 1936-2103 (107664-107831) 100% -> 2104-2154 (109690-109740) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGATTGTGGACAAGCTGCTGGACGACAGCCGCGGCGGAGAGGGGCTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGATTGTGGACAAGCTGCTGGACGACAGCCGCGGCGGAGAGGGGCTGCG 50 . : . : . : . : . : 51 GGACGCGGCGGGCGGCTGCGGCCTCATGACCAGCCCGCTCAACCTGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GGACGCGGCGGGCGGCTGCGGCCTCATGACCAGCCCGCTCAACCTGAGCT 100 . : . : . : . : . : 101 ACTTCTACGGCGCGTCGCCGCCCGCCGCCGCCCCGGGCGCCTGCGACGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 ACTTCTACGGCGCGTCGCCGCCCGCCGCCGCCCCGGGCGCCTGCGACGCC 150 . : . : . : . : . : 151 AGCTGCTCGGTCTTGGGCCCCTCGGCGCCCGGCTCGCCCGGCTCCGACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 AGCTGCTCGGTCTTGGGCCCCTCGGCGCCCGGCTCGCCCGGCTCCGACTC 200 . : . : . : . : . : 201 CTCCGACTTCTCCTCTGCCTCGTCGGTGTCCTCCTGCGGCGCCGTGGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CTCCGACTTCTCCTCTGCCTCGTCGGTGTCCTCCTGCGGCGCCGTGGAGT 250 . : . : . : . : . : 251 CCCGGTCGAGAGGCGGCGCCCGCGCCGAGCGCCAGCCAG TT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 100251 CCCGGTCGAGAGGCGGCGCCCGCGCCGAGCGCCAGCCAGGTA...CAGTT 300 . : . : . : . : . : 292 GAGCCCCATATGGGGGTTGGCAGGCAGCAGAGAGGCCCCTTTCAAGGTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102459 GAGCCCCATATGGGGGTTGGCAGGCAGCAGAGAGGCCCCTTTCAAGGTGT 350 . : . : . : . : . : 342 TCGGGTAAAGAACTCAGTGAAGGAACTCCTGTTGCACATCCGAAGTCATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102509 TCGGGTAAAGAACTCAGTGAAGGAACTCCTGTTGCACATCCGAAGTCATA 400 . : . : . : . : . : 392 AACAGAAGGCTTCTGGCCAAGCTGTGGATGATTTTAAG ACA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 102559 AACAGAAGGCTTCTGGCCAAGCTGTGGATGATTTTAAGGTG...TAGACA 450 . : . : . : . : . : 433 CAAGGTGTGAACATAGAACAGTTCAGAG AATTGAAGAACAC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 103113 CAAGGTGTGAACATAGAACAGTTCAGAGGTA...CAGAATTGAAGAACAC 500 . : . : . : . : . : 474 AGTATCATACAGTGGGAAAAGGAAAGGGCCCGATTCGTTGTCTGATGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103271 AGTATCATACAGTGGGAAAAGGAAAGGGCCCGATTCGTTGTCTGATGGAC 550 . : . : . : . : . : 524 CTGCTTGCAAAAGGCCAGCTCTGTTGCATTCCCAATTTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 103321 CTGCTTGCAAAAGGCCAGCTCTGTTGCATTCCCAATTTTTGGTA...CAG 600 . : . : . : . : . : 565 ACACCACCTCAAACACCAACGCCCGGGGAGAGCATGGAAGATGTTCATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103463 ACACCACCTCAAACACCAACGCCCGGGGAGAGCATGGAAGATGTTCATCT 650 . : . : . : . : . : 615 CAATGAACCCAAACAGGAGAGCAGTGCTGATCTGCTTCAGAACATTATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103513 CAATGAACCCAAACAGGAGAGCAGTGCTGATCTGCTTCAGAACATTATCA 700 . : . : . : . : . : 665 ACATTAAGAATGAATGCAGCCCCGTTTCCCTGAACACAGTTCAAGTTAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103563 ACATTAAGAATGAATGCAGCCCCGTTTCCCTGAACACAGTTCAAGTTAGC 750 . : . : . : . : . : 715 TGGCTGAACCCCGTGGTGGTCCCTCAGAGCTCCCCCGCAGAGCAGTGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103613 TGGCTGAACCCCGTGGTGGTCCCTCAGAGCTCCCCCGCAGAGCAGTGTCA 800 . : . : . : . : . : 765 GGACTTCCATGGAGGGCAGGTCTTTTCTCCACCTCAGAAATGCCAACCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103663 GGACTTCCATGGAGGGCAGGTCTTTTCTCCACCTCAGAAATGCCAACCAT 850 . : . : . : . : . : 815 TCCAAGTCAGGGGCTCCCAACAAATGATAGACCAGGCTTCCCTGTACCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103713 TCCAAGTCAGGGGCTCCCAACAAATGATAGACCAGGCTTCCCTGTACCAG 900 . : . : . : . : . : 865 TATTCTCCACAGAACCAGCATGTAGAGCAGCAGCCACACTACACCCACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103763 TATTCTCCACAGAACCAGCATGTAGAGCAGCAGCCACACTACACCCACAA 950 . : . : . : . : . : 915 ACCAACTCTGGAATACAGTCCTTTTCCCATACCTCCCCAGTCCCCCGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103813 ACCAACTCTGGAATACAGTCCTTTTCCCATACCTCCCCAGTCCCCCGCTT 1000 . : . : . : . : . : 965 ATGAACCAAACCTCTTTGATGGTCCAGAATCACAGTTTTGCCCAAACCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103863 ATGAACCAAACCTCTTTGATGGTCCAGAATCACAGTTTTGCCCAAACCAA 1050 . : . : . : . : . : 1015 AGCTTAGTTTCCCTTCTTGGTGATCAAAGGGAATCTGAGAATATTGCTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103913 AGCTTAGTTTCCCTTCTTGGTGATCAAAGGGAATCTGAGAATATTGCTAA 1100 . : . : . : . : . : 1065 TCCCATGCAGACTTCCTCCAGTGTTCAGCAGCAAAATGATGCTCACTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103963 TCCCATGCAGACTTCCTCCAGTGTTCAGCAGCAAAATGATGCTCACTTGC 1150 . : . : . : . : . : 1115 ACAGCTTCAGCATGATGCCCAGCAGCGCCTGTGAGGCCATGGTGGGGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104013 ACAGCTTCAGCATGATGCCCAGCAGCGCCTGTGAGGCCATGGTGGGGCAC 1200 . : . : . : . : . : 1165 GAGATGGCCTCTGACTCTTCAAACACTTCACTGCCATTCTCAAACATGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104063 GAGATGGCCTCTGACTCTTCAAACACTTCACTGCCATTCTCAAACATGGG 1250 . : . : . : . : . : 1215 AAATCCAATGAACACCACACAGTTAGGGAAATCACTTTTTCAGTGGCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104113 AAATCCAATGAACACCACACAGTTAGGGAAATCACTTTTTCAGTGGCAGG 1300 . : . : . : . : . : 1265 TGGAGCAGGAAGAAAGCAAATTGGCAAATATTTCCCAAGACCAGTTTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104163 TGGAGCAGGAAGAAAGCAAATTGGCAAATATTTCCCAAGACCAGTTTCTT 1350 . : . : . : . : . : 1315 TCAAAGGATGCAGATGGTGACAC GTTCCTTCATATTGCTGT |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 104213 TCAAAGGATGCAGATGGTGACACGTG...CAGGTTCCTTCATATTGCTGT 1400 . : . : . : . : . : 1356 TGCCCAAGGGAGAAGGGCACTTTCCTATGTTCTTGCAAGAAAGATGAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104968 TGCCCAAGGGAGAAGGGCACTTTCCTATGTTCTTGCAAGAAAGATGAATG 1450 . : . : . : . : . : 1406 CACTTCACATGCTGGATATTAAAGAGCACAATGGACAG AGT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 105018 CACTTCACATGCTGGATATTAAAGAGCACAATGGACAGGTG...CAGAGT 1500 . : . : . : . : . : 1447 GCCTTTCAGGTGGCAGTGGCTGCCAATCAGCATCTCATTGTGCAGGATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105437 GCCTTTCAGGTGGCAGTGGCTGCCAATCAGCATCTCATTGTGCAGGATCT 1550 . : . : . : . : . : 1497 GGTGAACATCGGGGCACAGGTGAACACCACAGACTGCTGGGGAAGAACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105487 GGTGAACATCGGGGCACAGGTGAACACCACAGACTGCTGGGGAAGAACAC 1600 . : . : . : . : . : 1547 CTCTGCATGTGTGTGCTGAGAAGGGCCACTCCCAGGTGCTTCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 105537 CTCTGCATGTGTGTGCTGAGAAGGGCCACTCCCAGGTGCTTCAGGTA... 1650 . : . : . : . : . : 1591 GCGATTCAGAAGGGAGCAGTGGGAAGTAATCAGTTTGTGGATCTTGA >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105764 CAGGCGATTCAGAAGGGAGCAGTGGGAAGTAATCAGTTTGTGGATCTTGA 1700 . : . : . : . : . : 1638 GGCAACTAACTATGATG GCCTGACTCCCCTTCACTGTGCAG |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 105814 GGCAACTAACTATGATGGTA...TAGGCCTGACTCCCCTTCACTGTGCAG 1750 . : . : . : . : . : 1679 TCATAGCCCACAATGCTGTGGTCCATGAACTCCAGAGAAATCAACAGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106129 TCATAGCCCACAATGCTGTGGTCCATGAACTCCAGAGAAATCAACAGCCT 1800 . : . : . : . : . : 1729 CATTCACCTGAAGTTCAGGAGCTTTTACTGAAGAATAAGAGTCTGGTTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106179 CATTCACCTGAAGTTCAGGAGCTTTTACTGAAGAATAAGAGTCTGGTTGA 1850 . : . : . : . : . : 1779 TACCATTAAGTGCCTAATTCAAATGGGAGCAGCGGTGGAAGCGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 106229 TACCATTAAGTGCCTAATTCAAATGGGAGCAGCGGTGGAAGCGAAGGTA. 1900 . : . : . : . : . : 1825 GATCGCAAAAGTGGCCGCACAGCCCTGCATTTGGCAGCTGAAGAA ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106279 ..AAGGATCGCAAAAGTGGCCGCACAGCCCTGCATTTGGCAGCTGAAGAA 1950 . : . : . : . : . : 1870 GCAAATCTGGAACTCATTCGCCTCTTTTTGGAGCTGCCCAGTTGCCTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107490 GCAAATCTGGAACTCATTCGCCTCTTTTTGGAGCTGCCCAGTTGCCTGTC 2000 . : . : . : . : . : 1920 TTTTGTGAATGCAAAG GCTTACAATGGCAACACTGCCCTCC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 107540 TTTTGTGAATGCAAAGGTA...CAGGCTTACAATGGCAACACTGCCCTCC 2050 . : . : . : . : . : 1961 ATGTTGCTGCCAGCTTGCAGTATCGGTTGACACAATTAGATGCTGTCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107689 ATGTTGCTGCCAGCTTGCAGTATCGGTTGACACAATTAGATGCTGTCCGC 2100 . : . : . : . : . : 2011 CTGTTGATGAGGAAGGGAGCAGACCCAAGTACTCGGAACTTGGAGAACGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107739 CTGTTGATGAGGAAGGGAGCAGACCCAAGTACTCGGAACTTGGAGAACGA 2150 . : . : . : . : . : 2061 ACAGCCAGTGCATTTGGTTCCCGATGGCCCTGTGGGAGAACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 107789 ACAGCCAGTGCATTTGGTTCCCGATGGCCCTGTGGGAGAACAGGTG...C 2200 . : . : . : . : . : 2104 ATCCGACGTATCCTGAAGGGAAAGTCCATTCAGCAGAGAGCTCCACCG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109688 AGATCCGACGTATCCTGAAGGGAAAGTCCATTCAGCAGAGAGCTCCACCG 2250 2152 TAT ||| 109738 TAT