Result of FASTA (ccds) for pF1KB7818
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7818, 598 aa
  1>>>pF1KB7818     598 - 598 aa - 598 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5671+/-0.000785; mu= 10.2248+/- 0.048
 mean_var=148.8679+/-29.792, 0's: 0 Z-trim(113.4): 128  B-trim: 61 in 1/53
 Lambda= 0.105117
 statistics sampled from 14046 (14186) to 14046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.424), width:  16
 Scan time:  1.770

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2           ( 598) 4148 640.7 1.6e-183
CCDS86887.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2          ( 535) 3735 578.0 1.1e-164
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12          ( 598) 1922 303.1 6.8e-82
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12         ( 611) 1922 303.1 6.9e-82
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12         ( 652) 1922 303.1 7.3e-82
CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9           ( 626) 1822 288.0 2.6e-77
CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9           ( 637) 1822 288.0 2.6e-77
CCDS6744.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9           ( 443)  883 145.4 1.5e-34
CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17          ( 457)  731 122.4 1.3e-27
CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17          ( 462)  723 121.2   3e-27
CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12          ( 443)  716 120.1 6.1e-27
CCDS2642.1 RARB gene_id:5915|Hs109|chr3            ( 448)  714 119.8 7.6e-27
CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12           ( 454)  709 119.1 1.3e-26
CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12          ( 382)  701 117.8 2.6e-26
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1          ( 470)  687 115.7 1.4e-25
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1           ( 435)  685 115.4 1.6e-25
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1          ( 458)  685 115.4 1.6e-25
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs109|chr14          ( 508)  648 109.9 8.7e-24
CCDS58237.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12          ( 432)  605 103.3   7e-22
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs109|chr19         ( 404)  580 99.5 9.2e-21
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11         ( 423)  564 97.1 5.1e-20
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11         ( 422)  560 96.5 7.8e-20
CCDS4068.1 NR2F1 gene_id:7025|Hs109|chr5           ( 423)  527 91.4 2.5e-18
CCDS46775.1 RARB gene_id:5915|Hs109|chr3           ( 336)  518 90.0 5.4e-18
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6            ( 533)  520 90.5 6.3e-18
CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs109|chr15         ( 414)  518 90.1 6.3e-18
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6           ( 537)  514 89.5 1.2e-17
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 474)  500 87.4 4.7e-17
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 481)  500 87.4 4.7e-17
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 495)  500 87.4 4.8e-17
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14           ( 530)  500 87.4 5.1e-17
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs109|chr9           ( 462)  462 81.6 2.5e-15
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5           ( 777)  458 81.2 5.7e-15
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5          ( 742)  457 81.0 6.1e-15
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5          ( 778)  446 79.3   2e-14
CCDS60383.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs109|chr1          ( 469)  404 72.8 1.1e-12
CCDS1400.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs109|chr1           ( 495)  404 72.8 1.2e-12
CCDS1401.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs109|chr1           ( 541)  404 72.9 1.3e-12
CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs109|chr1            ( 463)  395 71.5 2.9e-12
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs109|chr1           ( 340)  390 70.6 3.8e-12
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX              ( 388)  377 68.7 1.6e-11
CCDS6856.1 NR5A1 gene_id:2516|Hs109|chr9           ( 461)  378 68.9 1.7e-11
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX              ( 920)  377 68.9 3.3e-11
CCDS13331.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20         ( 417)  369 67.5   4e-11
CCDS46605.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20         ( 464)  369 67.5 4.4e-11
CCDS41821.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs109|chr12         ( 467)  369 67.5 4.4e-11
CCDS13330.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20         ( 474)  369 67.5 4.5e-11
CCDS44953.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs109|chr12         ( 483)  369 67.5 4.5e-11
CCDS68131.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20         ( 395)  367 67.2 4.8e-11
CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 439)  367 67.2 5.2e-11


>>CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2                (598 aa)
 initn: 4148 init1: 4148 opt: 4148  Z-score: 3408.3  bits: 640.7 E(33420): 1.6e-183
Smith-Waterman score: 4148; 100.0% identity (100.0% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-598)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITATTSLPSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITATTSLPSF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 STFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 STFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 YYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 SPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 PVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 AEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 EWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590        
pF1KB7 FNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 FNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
              550       560       570       580       590        

>>CCDS86887.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2               (535 aa)
 initn: 3735 init1: 3735 opt: 3735  Z-score: 3070.5  bits: 578.0 E(33420): 1.1e-164
Smith-Waterman score: 3735; 100.0% identity (100.0% similar) in 535 aa overlap (64-598:1-535)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB7 FLTPEFVKFSMDLTNTEITATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86                               MDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVE
                                             10        20        30

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB7 DIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFH
               40        50        60        70        80        90

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB7 QNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVV
              100       110       120       130       140       150

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB7 DGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQ
              160       170       180       190       200       210

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB7 HYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVV
              220       230       240       250       260       270

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB7 RTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDY
              280       290       300       310       320       330

           400       410       420       430       440       450   
pF1KB7 QMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAY
              340       350       360       370       380       390

           460       470       480       490       500       510   
pF1KB7 RSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVT
              400       410       420       430       440       450

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pF1KB7 ERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRI
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           580       590        
pF1KB7 FYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
              520       530     

>>CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12               (598 aa)
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pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEIT--ATTSLP
       :::.:::::. : . ::. ...        .:: :::::.: .:::.. : .  : :.::
CCDS88 MPCIQAQYGT-P-APSPGPRDH-------LASDPLTPEFIKPTMDLASPEAAPAAPTALP
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pF1KB7 SFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMP----------------LSGQQSSIKVEDIQMHNYQQ
       :::::::.:.  .:.    :::.:                 :.. .:    .......: 
CCDS88 SFSTFMDGYTGEFDT---FLYQLPGTVQPCSSASSSASSTSSSSATSPASASFKFEDFQV
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pF1KB7 HSHLP-PQS---EEMMPHSGSVYY-KPSSPPTPTTPGFQV-QHSPMWDDPGSLHNFH--Q
       ..  : : :   .: .  ::: :: .: : :.:.::.::  : :: ::  ::. .:   :
CCDS88 YGCYPGPLSGPVDEALSSSGSDYYGSPCSAPSPSTPSFQPPQLSP-WD--GSFGHFSPSQ
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pF1KB7 NYV---ATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHH
       .:    : :... . . : .  ..:::  :::  :  :  .   .::.  . :  : .:.
CCDS88 TYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSF--SPPTGPSPSLAQ---SPLK--LFPSQA-THQ
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pF1KB7 VVDGQTFAVPN--PIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSR-GSPS-NEGLCAVCG
       . .:.....:.  :   :.:   : :.   .: .::: : :  .: :.:. .:: :::::
CCDS88 LGEGESYSMPTAFPGLAPTS---PHLE---GSGILDTPVTSTKARSGAPGGSEGRCAVCG
       220       230          240          250       260       270 

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pF1KB7 DNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVG
       :::.::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::.::::::::::
CCDS88 DNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYICLANKDCPVDKRRRNRCQFCRFQKCLAVG
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pF1KB7 MVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRF
       :::::::::::::::::::::::.:    : . :..:...:::::.::.:. ..::::.:
CCDS88 MVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQP----PDASPANLLTSLVRAHLDSGPSTAKLDYSKF
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pF1KB7 QANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELF
       :     ... .:.  .:::::::.::.:.:: :::::::::.:  ::::::.::::::::
CCDS88 QELVLPHFGKEDAGDVQQFYDLLSGSLEVIRKWAEKIPGFAELSPADQDLLLESAFLELF
       390       400       410       420       430       440       

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pF1KB7 VLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIA
       .:::::::.: :::::::.:.:::::::.::::.:::::. :: .:... .:. ::.:..
CCDS88 ILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCARGFGDWIDSILAFSRSLHSLLVDVPAFACLS
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pF1KB7 ALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCT
       ::...:.::::.::.:::::::.:..:::.::.   :  .  . ::.:::::::::::::
CCDS88 ALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKEHVAAVAGEPQPASCLSRLLGKLPELRTLCT
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       570       580       590        
pF1KB7 QGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
       :::::::::::::::::: ::::.:.:::::
CCDS88 QGLQRIFYLKLEDLVPPPPIIDKIFMDTLPF
       570       580       590        

>>CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12              (611 aa)
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                            10        20        30        40       
pF1KB7              MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLT
                    :::.:::::. : . ::. ...        .:: :::::.: .:::.
CCDS55 MWLAKACWSIQSEMPCIQAQYGT-P-APSPGPRDH-------LASDPLTPEFIKPTMDLA
               10        20          30               40        50 

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pF1KB7 NTEIT--ATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMP----------------LSGQQSS
       . : .  : :.:::::::::.:.  .:.    :::.:                 :.. .:
CCDS55 SPEAAPAAPTALPSFSTFMDGYTGEFDT---FLYQLPGTVQPCSSASSSASSTSSSSATS
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pF1KB7 IKVEDIQMHNYQQHSHLP-PQS---EEMMPHSGSVYY-KPSSPPTPTTPGFQV-QHSPMW
           .......: ..  : : :   .: .  ::: :: .: : :.:.::.::  : :: :
CCDS55 PASASFKFEDFQVYGCYPGPLSGPVDEALSSSGSDYYGSPCSAPSPSTPSFQPPQLSP-W
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pF1KB7 DDPGSLHNFH--QNYV---ATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPL
       :  ::. .:   :.:    : :... . . : .  ..:::  :::  :  :  .   .::
CCDS55 D--GSFGHFSPSQTYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSF--SPPTGPSPSLAQ---SPL
         170       180       190       200         210          220

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pF1KB7 HVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPN--PIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSR-G
       .  . :  : .:.. .:.....:.  :   :.:   : :.   .: .::: : :  .: :
CCDS55 K--LFPSQA-THQLGEGESYSMPTAFPGLAPTS---PHLE---GSGILDTPVTSTKARSG
                 230       240       250             260       270 

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pF1KB7 SPS-NEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNR
       .:. .:: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS55 APGGSEGRCAVCGDNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYICLANKDCPVDKRRRNR
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KB7 CQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVD
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:    : . :..:...:::::.:
CCDS55 CQFCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQP----PDASPANLLTSLVRAHLD
             340       350       360           370       380       

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB7 SNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKAD
       :.:. ..::::.::     ... .:.  .:::::::.::.:.:: :::::::::.:  ::
CCDS55 SGPSTAKLDYSKFQELVLPHFGKEDAGDVQQFYDLLSGSLEVIRKWAEKIPGFAELSPAD
       390       400       410       420       430       440       

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pF1KB7 QDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQ
       ::::.::::::::.:::::::.: :::::::.:.:::::::.::::.:::::. :: .:.
CCDS55 QDLLLESAFLELFILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCARGFGDWIDSILAFSRSLH
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pF1KB7 NMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSK
       .. .:. ::.:..::...:.::::.::.:::::::.:..:::.::.   :  .  . ::.
CCDS55 SLLVDVPAFACLSALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKEHVAAVAGEPQPASCLSR
       510       520       530       540       550       560       

          560       570       580       590        
pF1KB7 LLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:.:::::
CCDS55 LLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPPIIDKIFMDTLPF
       570       580       590       600       610 

>>CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12              (652 aa)
 initn: 1349 init1: 1124 opt: 1922  Z-score: 1583.4  bits: 303.1 E(33420): 7.3e-82
Smith-Waterman score: 2117; 55.2% identity (75.8% similar) in 631 aa overlap (1-598:55-652)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEY
                                     :::.:::::. : . ::. ...        
CCDS73 PPRQPGSFCWALKADGIMWLAKACWSIQSEMPCIQAQYGT-P-APSPGPRDH-------L
           30        40        50        60          70            

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pF1KB7 SSDFLTPEFVKFSMDLTNTEIT--ATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMP------
       .:: :::::.: .:::.. : .  : :.:::::::::.:.  .:.    :::.:      
CCDS73 ASDPLTPEFIKPTMDLASPEAAPAAPTALPSFSTFMDGYTGEFDT---FLYQLPGTVQPC
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pF1KB7 ----------LSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSHLP-PQS---EEMMPHSGSVYY-KPSSP
                  :.. .:    .......: ..  : : :   .: .  ::: :: .: : 
CCDS73 SSASSSASSTSSSSATSPASASFKFEDFQVYGCYPGPLSGPVDEALSSSGSDYYGSPCSA
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pF1KB7 PTPTTPGFQV-QHSPMWDDPGSLHNFH--QNYV---ATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQS
       :.:.::.::  : :: ::  ::. .:   :.:    : :... . . : .  ..:::  :
CCDS73 PSPSTPSFQPPQLSP-WD--GSFGHFSPSQTYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSF--S
            200          210       220       230       240         

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pF1KB7 PPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPN--PIRKPASMGFPGLQIGH
       ::  :  :  .   .::.  . :  : .:.. .:.....:.  :   :.:   : :.   
CCDS73 PPTGPSPSLAQ---SPLK--LFPSQA-THQLGEGESYSMPTAFPGLAPTS---PHLE---
       250          260          270       280       290           

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pF1KB7 ASQLLDTQVPSPPSR-GSPS-NEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKY
       .: .::: : :  .: :.:. .:: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GSGILDTPVTSTKARSGAPGGSEGRCAVCGDNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKY
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       300       310       320       330       340       350       
pF1KB7 VCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSP
       .:::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:    :
CCDS73 ICLANKDCPVDKRRRNRCQFCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQP----P
         360       370       380       390       400       410     

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB7 PSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEII
        . :..:...:::::.::.:. ..::::.::     ... .:.  .:::::::.::.:.:
CCDS73 DASPANLLTSLVRAHLDSGPSTAKLDYSKFQELVLPHFGKEDAGDVQQFYDLLSGSLEVI
             420       430       440       450       460       470 

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB7 RGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVR
       : :::::::::.:  ::::::.::::::::.:::::::.: :::::::.:.:::::::.:
CCDS73 RKWAEKIPGFAELSPADQDLLLESAFLELFILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCAR
             480       490       500       510       520       530 

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB7 GFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKD
       :::.:::::. :: .:... .:. ::.:..::...:.::::.::.:::::::.:..:::.
CCDS73 GFGDWIDSILAFSRSLHSLLVDVPAFACLSALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKE
             540       550       560       570       580       590 

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB7 HVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLP
       ::.   :  .  . ::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:.::::
CCDS73 HVAAVAGEPQPASCLSRLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPPIIDKIFMDTLP
             600       610       620       630       640       650 

        
pF1KB7 F
       :
CCDS73 F
        

>>CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9                (626 aa)
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pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITAT--TSLP
       ::::::::. :: :.: :.:.::    .::......:...:..::: .::::::  ::::
CCDS67 MPCVQAQYSPSPPGSSYAAQTYS----SEYTTEIMNPDYTKLTMDLGSTEITATATTSLP
               10        20            30        40        50      

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pF1KB7 SFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSH-------------
       :.:::...::..:..:: :.:::    :.  ::::. .  .:..: :             
CCDS67 SISTFVEGYSSNYELKPSCVYQM----QRPLIKVEEGRAPSYHHHHHHHHHHHHHHQQQH
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pF1KB7 ----LPPQS---EEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDD--PGSLHNFHQNY
           .:: :   .:..: : :.:.: : : :::::.:  : . .::.  :..   .  . 
CCDS67 QQPSIPPASSPEDEVLP-STSMYFKQSPPSTPTTPAFPPQAGALWDEALPSAPGCIAPGP
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pF1KB7 VATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSS----CQMRFD----GPLHVPMNPEPAG
       .    :     .  .:. :: :: :::  :. :     .. .:    . : .:..   :.
CCDS67 LLDPPMKAVPTVAGARFPLFHFKPSPPHPPAPSPAGGHHLGYDPTAAAALSLPLGAAAAA
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      210       220        230          240         250       260  
pF1KB7 SHHVVDGQTFAVPNPI-RKPASMGFPGLQIGH---ASQLL--DTQVPSPPSRGSPSNEGL
       . ...  ..     :. .. : ..:: : .     ::.::  . ..::::::.: :.:: 
CCDS67 GSQAAALESHPYGLPLAKRAAPLAFPPLGLTPSPTASSLLGESPSLPSPPSRSSSSGEGT
             240       250       260       270       280       290 

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pF1KB7 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
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pF1KB7 CLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSP--QEPS---PPSPPVSLISALVRAHVDSNP
       ::.:::::::::::::::::::::::::::  ::::   :::::. ...::::: .::.:
CCDS67 CLSVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPLQQEPSQPSPPSPPICMMNALVRALTDSTP
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pF1KB7 AMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDL
          .:::::.    :   .: :..:.::::.:::.:... :.::::::::.:::: :: :
CCDS67 --RDLDYSRY-CPTDQAAAGTDAEHVQQFYNLLTASIDVSRSWAEKIPGFTDLPKEDQTL
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pF1KB7 LFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMN
       :.::::::::::::. ::: .: :..::::.:::::::.::::::.::: .:: :::..:
CCDS67 LIESAFLELFVLRLSIRSNTAEDKFVFCNGLVLHRLQCLRGFGEWLDSIKDFSLNLQSLN
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pF1KB7 IDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLG
       .::.:..:..::.:.::::::::::::::: :::.. :::: .  .:   .:.  ::.::
CCDS67 LDIQALACLSALSMITERHGLKEPKRVEELCNKITSSLKDHQS--KGQALEPTE-SKVLG
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pF1KB7 KLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
        : ::: .:: :::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS67 ALVELRKICTLGLQRIFYLKLEDLVSPPSIIDKLFLDTLPF
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>>CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9                (637 aa)
 initn: 1363 init1: 741 opt: 1822  Z-score: 1501.6  bits: 288.0 E(33420): 2.6e-77
Smith-Waterman score: 2246; 56.3% identity (75.8% similar) in 641 aa overlap (1-598:12-637)

                          10        20        30        40         
pF1KB7            MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNT
                  ::::::::. :: :.: :.:.::    .::......:...:..::: .:
CCDS67 MHDSIRFGNVDMPCVQAQYSPSPPGSSYAAQTYS----SEYTTEIMNPDYTKLTMDLGST
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pF1KB7 EITAT--TSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSH--
       :::::  :::::.:::...::..:..:: :.:::    :.  ::::. .  .:..: :  
CCDS67 EITATATTSLPSISTFVEGYSSNYELKPSCVYQM----QRPLIKVEEGRAPSYHHHHHHH
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pF1KB7 ---------------LPPQS---EEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDD--
                      .:: :   .:..: : :.:.: : : :::::.:  : . .::.  
CCDS67 HHHHHHHQQQHQQPSIPPASSPEDEVLP-STSMYFKQSPPSTPTTPAFPPQAGALWDEAL
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pF1KB7 PGSLHNFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSS----CQMRFD----GP
       :..   .  . .    :     .  .:. :: :: :::  :. :     .. .:    . 
CCDS67 PSAPGCIAPGPLLDPPMKAVPTVAGARFPLFHFKPSPPHPPAPSPAGGHHLGYDPTAAAA
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       200       210       220        230          240         250 
pF1KB7 LHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPI-RKPASMGFPGLQIGH---ASQLL--DTQVPSP
       : .:..   :.. ...  ..     :. .. : ..:: : .     ::.::  . ..:::
CCDS67 LSLPLGAAAAAGSQAAALESHPYGLPLAKRAAPLAFPPLGLTPSPTASSLLGESPSLPSP
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pF1KB7 PSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRR
       :::.: :.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PSRSSSSGEGTCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRR
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pF1KB7 RNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSP--QEPS---PPSPPVSLIS
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::  ::::   :::::. ...
CCDS67 RNRCQYCRFQKCLSVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPLQQEPSQPSPPSPPICMMN
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        370       380       390       400       410       420      
pF1KB7 ALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPG
       ::::: .::.:   .:::::.    :   .: :..:.::::.:::.:... :.:::::::
CCDS67 ALVRALTDSTP--RDLDYSRY-CPTDQAAAGTDAEHVQQFYNLLTASIDVSRSWAEKIPG
             420         430        440       450       460        

        430       440       450       460       470       480      
pF1KB7 FADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSI
       :.:::: :: ::.::::::::::::. ::: .: :..::::.:::::::.::::::.:::
CCDS67 FTDLPKEDQTLLIESAFLELFVLRLSIRSNTAEDKFVFCNGLVLHRLQCLRGFGEWLDSI
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pF1KB7 VEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGL
        .:: :::..:.::.:..:..::.:.::::::::::::::: :::.. :::: .  .:  
CCDS67 KDFSLNLQSLNLDIQALACLSALSMITERHGLKEPKRVEELCNKITSSLKDHQS--KGQA
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pF1KB7 NRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
        .:.  ::.:: : ::: .:: :::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS67 LEPTE-SKVLGALVELRKICTLGLQRIFYLKLEDLVSPPSIIDKLFLDTLPF
        590        600       610       620       630       

>>CCDS6744.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9                (443 aa)
 initn: 1176 init1: 740 opt: 883  Z-score: 734.2  bits: 145.4 E(33420): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 1307; 51.3% identity (71.1% similar) in 429 aa overlap (1-386:1-418)

               10        20        30        40        50          
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITAT--TSLP
       ::::::::. :: :.: :.:.::    .::......:...:..::: .::::::  ::::
CCDS67 MPCVQAQYSPSPPGSSYAAQTYS----SEYTTEIMNPDYTKLTMDLGSTEITATATTSLP
               10        20            30        40        50      

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pF1KB7 SFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSH-------------
       :.:::...::..:..:: :.:::    :.  ::::. .  .:..: :             
CCDS67 SISTFVEGYSSNYELKPSCVYQM----QRPLIKVEEGRAPSYHHHHHHHHHHHHHHQQQH
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             110          120       130       140         150      
pF1KB7 ----LPPQS---EEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDD--PGSLHNFHQNY
           .:: :   .:..: : :.:.: : : :::::.:  : . .::.  :..   .  . 
CCDS67 QQPSIPPASSPEDEVLP-STSMYFKQSPPSTPTTPAFPPQAGALWDEALPSAPGCIAPGP
            120        130       140       150       160       170 

        160       170       180           190           200        
pF1KB7 VATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSS----CQMRFD----GPLHVPMNPEPAG
       .    :     .  .:. :: :: :::  :. :     .. .:    . : .:..   :.
CCDS67 LLDPPMKAVPTVAGARFPLFHFKPSPPHPPAPSPAGGHHLGYDPTAAAALSLPLGAAAAA
             180       190       200       210       220       230 

      210       220        230          240         250       260  
pF1KB7 SHHVVDGQTFAVPNPI-RKPASMGFPGLQIGH---ASQLL--DTQVPSPPSRGSPSNEGL
       . ...  ..     :. .. : ..:: : .     ::.::  . ..::::::.: :.:: 
CCDS67 GSQAAALESHPYGLPLAKRAAPLAFPPLGLTPSPTASSLLGESPSLPSPPSRSSSSGEGT
             240       250       260       270       280       290 

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB7 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
             300       310       320       330       340       350 

            330       340       350            360       370       
pF1KB7 CLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSP--QEPS---PPSPPVSLISALVRAHVDSNP
       ::.:::::::::::::::::::::::::::  ::::   :::::. ...::::: .::.:
CCDS67 CLSVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPLQQEPSQPSPPSPPICMMNALVRALTDSTP
             360       370       380       390       400       410 

       380       390       400       410       420       430       
pF1KB7 AMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDL
          .:::::                                                   
CCDS67 --RDLDYSRVSFMISCFQMNDQGLYLWLLVIRVD                          
               420       430       440                             

>>CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17               (457 aa)
 initn: 524 init1: 347 opt: 731  Z-score: 609.4  bits: 122.4 E(33420): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 731; 35.6% identity (62.1% similar) in 385 aa overlap (223-596:43-418)

            200       210       220       230       240       250  
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                                     :.: :   :  . .:   :.  .  :::::
CCDS42 NPFLVVDFYNQNRACLLPEKGLPAPGPYSTPLRTPLWNG-SNHSIETQSSSSEEIVPSPP
             20        30        40        50         60        70 

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pF1KB7 SRGS-PSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRR
       :    :     : :: :...  :::: .::::::::.:..:::  :.:  .::: ..:  
CCDS42 SPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSACEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVT
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pF1KB7 RNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVS-LISALVR
       ::::::::.:::. ::: :: ::.:  : .. ..: ::.  .:    .: :. ::  . .
CCDS42 RNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNK-KKKEVP-KPEC-SESYTLTPEVGELIEKVRK
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pF1KB7 AHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADL
       :: .. ::. .:  .    : . :  . : .  ..: .: :  .     .:...:::. :
CCDS42 AHQETFPALCQLG-KYTTNNSSEQRVSLDIDLWDKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTL
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pF1KB7 PKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVR-GFGEWIDSIVEF
         :::  :...: :....::.  : .: .  . : .:..:.: :    :::   : .  :
CCDS42 TIADQITLLKAACLDILILRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAF
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pF1KB7 SSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVT-ERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNR
       ...:  ...: .  . ..:. ..  .:. :..: ::. ::. ... :: .:       .:
CCDS42 ANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGDRQDLEQPDRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRP--SR
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pF1KB7 PNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVP---PPAIIDKLF----LDTLPF   
       :... :.: :. .::.. ..: .:.. ::.:  .:   :: : . :     ::::     
CCDS42 PHMFPKMLMKITDLRSISAKGAERVITLKME--IPGSMPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPG
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CCDS42 GGGRDGGGLAPPPGSCSPSLSPSSNRSSPATHSP
           430       440       450       

>>CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17               (462 aa)
 initn: 524 init1: 347 opt: 723  Z-score: 602.8  bits: 121.2 E(33420): 3e-27
Smith-Waterman score: 724; 33.6% identity (59.6% similar) in 426 aa overlap (184-596:18-423)

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                                     : ::    . :  :.   ..:  : .  .:
CCDS11              MASNSSSCPTPGGGHLNGYPVPPYAFFFP-PMLGGLSPPGALTTLQH
                            10        20         30        40      

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pF1KB7 VVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSRGS-PSNEGLCAVCGDNA
        .  . ...:.:             :   :.  .  ::::::    :     : :: :..
CCDS11 QLPVSGYSTPSPAT-----------IETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKS
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pF1KB7 ACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVK
       .  :::: .::::::::.:..:::  :.:  .::: ..:  ::::::::.:::. ::: :
CCDS11 SGYHYGVSACEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSK
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pF1KB7 EVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVS-LISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQA
       : ::.:  : .. ..: ::.  .:    .: :. ::  . .:: .. ::. .:  .    
CCDS11 ESVRNDRNK-KKKEVP-KPEC-SESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLG-KYTTN
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pF1KB7 NPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVL
       : . :  . : .  ..: .: :  .     .:...:::. :  :::  :...: :....:
CCDS11 NSSEQRVSLDIDLWDKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKAACLDILIL
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pF1KB7 RLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVR-GFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAA
       :.  : .: .  . : .:..:.: :    :::   : .  :...:  ...: .  . ..:
CCDS11 RICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSA
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pF1KB7 LAMVT-ERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCT
       . ..  .:. :..: ::. ::. ... :: .:       .::... :.: :. .::.. .
CCDS11 ICLICGDRQDLEQPDRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRP--SRPHMFPKMLMKITDLRSISA
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pF1KB7 QGLQRIFYLKLEDLVP---PPAIIDKLF----LDTLPF                      
       .: .:.. ::.:  .:   :: : . :     ::::                        
CCDS11 KGAERVITLKME--IPGSMPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPGGGGRDGGGLAPPPGSCSPS
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CCDS11 LSPSSNRSSPATHSP
       450       460  




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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