seq1 = pF1KE2094.tfa, 2388 bp seq2 = pF1KE2094/gi568815597f_156760935.tfa (gi568815597f:156760935_156981639), 220705 bp >pF1KE2094 2388 >gi568815597f:156760935_156981639 (Chr1) 1-212 (100001-100212) 99% -> 213-287 (103420-103494) 100% -> 288-359 (103794-103865) 100% -> 360-428 (105976-106044) 100% -> 429-574 (107170-107315) 100% -> 575-717 (107571-107713) 100% -> 718-850 (110689-110821) 100% -> 851-1177 (112699-113025) 100% -> 1178-1251 (113621-113692) 88% -> 1252-1354 (113972-114074) 100% -> 1355-1501 (114586-114732) 100% -> 1502-1632 (115146-115276) 100% -> 1633-1805 (115466-115638) 100% -> 1806-2046 (118188-118428) 99% -> 2047-2205 (119065-119223) 100% -> 2206-2388 (120523-120705) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGC 50 . : . : . : . : . : 51 GGAGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCG || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCG 100 . : . : . : . : . : 101 CACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGATGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGATGC 150 . : . : . : . : . : 151 ACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 ACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAA 200 . : . : . : . : . : 201 CCTGACTGAGCT CTACATCGAGAACCAGCAGCATCTGCAGC ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CCTGACTGAGCTGTG...CAGCTACATCGAGAACCAGCAGCATCTGCAGC 250 . : . : . : . : . : 242 ATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 103449 ATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTGTG. 300 . : . : . : . : . : 288 CACCATCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTT ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103499 ..CAGCACCATCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTT 350 . : . : . : . : . : 333 CCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCT GAATCTCTCCTTCA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 103839 CCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGTG...CAGGAATCTCTCCTTCA 400 . : . : . : . : . : 374 ACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105990 ACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAG 450 . : . : . : . : . : 424 GAACT GGTCCTGTCGGGGAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106040 GAACTGTG...CAGGGTCCTGTCGGGGAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGC 500 . : . : . : . : . : 465 CCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107206 CCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG 550 . : . : . : . : . : 515 AACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107256 AACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAAT 600 . : . : . : . : . : 565 GCCAGCTGTG GTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAA ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 107306 GCCAGCTGTGGTA...CAGGTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAA 650 . : . : . : . : . : 606 TGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107602 TGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGG 700 . : . : . : . : . : 656 GGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107652 GGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCA 750 . : . : . : . : . : 706 GCCACGGTGATG AAATCTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCT ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 107702 GCCACGGTGATGGTG...TAGAAATCTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCT 800 . : . : . : . : . : 747 GACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110718 GACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCT 850 . : . : . : . : . : 797 GGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110768 GGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTC 900 . : . : . : . : . : 847 TCCT TCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGAGAT ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110818 TCCTGTG...CAGTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGAGAT 950 . : . : . : . : . : 888 GCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112736 GCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTC 1000 . : . : . : . : . : 938 TGCGCTGGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112786 TGCGCTGGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTC 1050 . : . : . : . : . : 988 ACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112836 ACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTCT 1100 . : . : . : . : . : 1038 GCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112886 GCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGG 1150 . : . : . : . : . : 1088 CTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112936 CTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATG 1200 . : . : . : . : . : 1138 GACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCTG T ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>- 112986 GACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCTGGTG...CTG 1250 . : . : . : . : . : 1179 CTCCT TCTCGCCGGTGGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAG |-|||-| ||-|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 113621 C CCTGTGTC CCTACAGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAG 1300 . : . : . : . : . : 1228 AAGAAGGACGAAACACCTTTTGGG GTCTCGGTGGCTGTGGG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 113669 AAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTG...CAGGTCTCGGTGGCTGTGGG 1350 . : . : . : . : . : 1269 CCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113989 CCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCA 1400 . : . : . : . : . : 1319 ACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACC GCCCG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 114039 ACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGTG...TAGGCCCG 1450 . : . : . : . : . : 1360 GCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCATGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114591 GCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCATGAC 1500 . : . : . : . : . : 1410 ATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114641 ATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCC 1550 . : . : . : . : . : 1460 AAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 114691 AAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTG...CA 1600 . : . : . : . : . : 1502 GTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115145 GGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGG 1650 . : . : . : . : . : 1551 GGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115195 GGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGC 1700 . : . : . : . : . : 1601 CTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAG GCACTGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 115245 CTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAGGTG...CAGGCACTGAAG 1750 . : . : . : . : . : 1642 GAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115475 GAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCT 1800 . : . : . : . : . : 1692 CACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115525 CACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCG 1850 . : . : . : . : . : 1742 AGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115575 AGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTC 1900 . : . : . : . : . : 1792 AACCGCTTCCTCCG ATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCT ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 115625 AACCGCTTCCTCCGGTA...CAGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCT 1950 . : . : . : . : . : 1833 GGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118215 GGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGC 2000 . : . : . : . : . : 1883 TGGCTGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTG |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118265 TGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTG 2050 . : . : . : . : . : 1933 CATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118315 CATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGG 2100 . : . : . : . : . : 1983 ACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118365 ACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCA 2150 . : . : . : . : . : 2033 CCGACTATTACCGT GTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCATT ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 118415 CCGACTATTACCGTGTA...CAGGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCATT 2200 . : . : . : . : . : 2074 CGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119092 CGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAG 2250 . : . : . : . : . : 2124 CGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119142 CGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCA 2300 . : . : . : . : . : 2174 AGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAG GCAATCGAC ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 119192 AGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGTC...CAGGCAATCGAC 2350 . : . : . : . : . : 2215 TGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120532 TGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGA 2400 . : . : . : . : . : 2265 GGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120582 GGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCC 2450 . : . : . : . : . : 2315 ACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120632 ACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCT 2500 . : . : 2365 CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC |||||||||||||||||||||||| 120682 CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC