seq1 = pF1KE6646.tfa, 678 bp seq2 = pF1KE6646/gi568815597r_71307449.tfa (gi568815597r:71307449_71876299), 568851 bp >pF1KE6646 678 >gi568815597r:71307449_71876299 (Chr1) (complement) 24-151 (100001-100128) 100% == 275-404 (265148-265274) 96% -> 405-563 (283332-283487) 96% -> 564-678 (468737-468851) 100% 0 . : . : . : . : . : 24 AGTTCCTCCTAAGATATATGACATCTCAAATGATATGACCGTCAATGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 AGTTCCTCCTAAGATATATGACATCTCAAATGATATGACCGTCAATGAAG 50 . : . : . : . : . : 74 GAACCAACGTCACTCTTACTTGTTTGGCCACTGGGAAACCAGAGCCTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GAACCAACGTCACTCTTACTTGTTTGGCCACTGGGAAACCAGAGCCTTCC 100 . : . : . 124 ATTTCTTGGCGACACATCTCCCCATCAG |||||||||||||||||||||||||||| 100101 ATTTCTTGGCGACACATCTCCCCATCAG 0 . : . : . : . : . : 275 TTGTCAACTTTGCTCCTACTATTCAGGAAATTAAATCTGGCACCGTGACC |||-|| -||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265148 TTG CAG TT GCTCCTACTATTCAGGAAATTAAATCTGGCACCGTGACC 50 . : . : . : . : . : 325 CCCGGACGCAGTGGCCTGATAAGATGTGAAGGTGCAGGTGTGCCGCCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265195 CCCGGACGCAGTGGCCTGATAAGATGTGAAGGTGCAGGTGTGCCGCCTCC 100 . : . : . : . : . : 375 AGCCTTTGAATGGTACAAAGGAGAGAAGAA GCTCTTCAATG ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 265245 AGCCTTTGAATGGTACAAAGGAGAGAAGAAGTG...TAGGCTCTTCAATG 150 . : . : . : . : . : 416 GCCAACAAGGAATTATTATTCAAAATTTTAGCACAAGATCCATTCTCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 283343 GCCAACAAGGAATTATTATTCAAAATTTTAGCACAAGATCCATTCTCACT 200 . : . : . : . : . : 466 GTTACCAACGTGACACAGGAGCACTTCGGCAATTATACTTGTGTGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 283393 GTTACCAACGTGACACAGGAGCACTTCGGCAATTATACCTGTGTGGCTGC 250 . : . : . : . : . : 516 CAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCCTCCAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |--||->> 283443 CAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCGT AA GT 300 . : . : . : . : . : 564 TACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCTGATGTTCTTTTC >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 283490 A...AAGTACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCTGATGTTCTTTTC 350 . : . : . : . : . : 607 TCCTGCTGGTACCTTGTGTTGACACTGTCCTCTTTCACCAGCATATTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 468780 TCCTGCTGGTACCTTGTGTTGACACTGTCCTCTTTCACCAGCATATTCTA 400 . : . : 657 CCTGAAGAATGCCATTCTACAA |||||||||||||||||||||| 468830 CCTGAAGAATGCCATTCTACAA