FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2456, 1709 aa 1>>>pF1KE2456 1709 - 1709 aa - 1709 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4246+/-0.00125; mu= 1.4900+/- 0.076 mean_var=286.1589+/-57.259, 0's: 0 Z-trim(110.5): 100 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.075818 statistics sampled from 11571 (11662) to 11571 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16 Scan time: 4.780 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 11447 1267.2 0 CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 4996 561.6 8.7e-159 CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 1450 173.6 3.2e-42 CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 1420 170.5 5.1e-41 CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 1420 170.5 5.2e-41 CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 1420 170.5 5.3e-41 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:.:::. CCDS10 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSG--SQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSE 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 GSSSQSGSSDSDSGSESGSQSESESDTSRENKVQAKPPKVDGAEFWKSSPSILAVQRSAI .: ::: :.:.: .::.:. ..:. .. : .: ..:. :.. .:.:: CCDS10 SSESQS-ESESES---AGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRS-- 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSG ....: : . .:..::. .: . . . .:. .:.: :.. : . ...: CCDS10 ---------NRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 SDSESEEEREKSSCDETESDYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDD ...::: :..: . . :. : :. : : :. : :..:.: :::.:::: CCDS10 TSAESEPEQKKVKARRPV----PRRTV----PKPRVK-KQPKTQRGKRKKQ-DSSDEDDD 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 EEDYDNDKRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCR : . ::..::.:. :::::::....::::::.:. :: : . .... ::::. .: : CCDS10 --DDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDE-QQDNSETIEKVLDSR 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 IGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQ .:.::::::.::.::.::.:::.. :. .:. :::::::::::::.::.:::.::.:.:: CCDS10 LGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEKDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQ 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 pF1KE2 NVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIA----- .:.:.:::.:.:::..: :.:: ..:::::::.::::::...:.::::::::.:: CCDS10 KVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSK 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ----------HSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQS :: . . .. :.: :::.::::::::::: :::.:::: ::: . :::.: CCDS10 STLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNS 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 KTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILAD :: : ..::.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:::::::::::.:: :::: CCDS10 KTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGG-ENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILAD 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 EMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDIN ::::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :: ..:.:::.::. CCDS10 EMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLM 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 SRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLL ::: :: .:: : :::::::: :.::::::::::. ::..::::.::::::::::::::: CCDS10 SRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLL 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::: :: :: CCDS10 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSL 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 HKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTS :: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::..:::: CCDS10 HKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTS 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 GFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNR :::::.::::::::::::::::..:: : :: : ::::::::::::::: :::::::: CCDS10 GFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNR 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 VLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRA :::::::::::::::::: ...::::::::::::.::::::::::.::::::::::::: CCDS10 VLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRA 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.::: CCDS10 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERA 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 KKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQE ::::::::::::::::::.:.:...:. :.:.:::::::.::::::::.:::: ::::.: CCDS10 KKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESE 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 PQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEI ::::::::::. :::.::: . .. ::::::::::::..: ::. ::: :: :.:.:: CCDS10 PQEMDIDEILRLAETRENEVST-SATDELLSQFKVANFATM-EDEEELE-ERPHKDWDEI 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 IPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEG---RRSRSRRYSGSDSDS- :::.::...:::::::::::::::::.:. .:. . : :.. . ...: :.:.:.. CCDS10 IPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETE 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 -ISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKS .. :.::.:::::.. .. ..::.:::::::::.::::: :::::. ::::::::::: CCDS10 DSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKS 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 ETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERT---GGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHE .::.:::::.::.:..:... ... : :: .:::..:::::::.: .:.:: CCDS10 VADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 EELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKM ::. :::::: ::::.:.: . :..::::::..:: :::: ::.::::.:::.::.:: CCDS10 EEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKT 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 DPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAGSSK--RRKARA ::.:.:: :::: . :::::.::::::::::.::: . : :: :..:. .: .:: :. CCDS10 DPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRV 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1340 1350 1360 pF1KE2 KKNKAMKSIKVKE-----------------EIKSDS---SPLP----------------S ::.. . .: .. :.:.:. ::. : CCDS10 KKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMS 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 EKSDEDDDKLSESKSDGRERSK--------KSSVSDAPVHITASGEPVPISE-ESEELDQ ..:.. :: ....: .:. : ::. :..::::::..:::::.: :...::: CCDS10 SRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQ 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 KTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQI .::::::::::::: ::::::.:.:::. .:::::::.::.::::.:.:::: :.. :.: CCDS10 ETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHI 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE2 KQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKR----QESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDV : ::.:::::::::::::::::::::: : ::: .:.....: ... .: . CCDS10 KLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDVTGGKKPFRPEASGS 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE2 ER----LKENTNHDDSSRDSYSSDRHLTQYHDHHKD-------RHQGDSYKKSDSRKRPY : . .:.:. . . : :.: : .: :: ... . . .:.: . CCDS10 SRDSLISQSHTSHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHPRDNYNHPNKRHFSNADRGDWQRERKF 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE2 SSFSNGKDHRDWD---HYKQDSRYYSDRE--KHRKLDDHRSRDHRSNLEGSLKDRSHSDH . ...:... : :.. ....:.:.. .:..: ::: ..: : . . : .... CCDS10 N-YGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDAHRSGSYRPN--NMSRKRPYDQY 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 RSHSDHRLHSDHRSSSEYTHHKSSR----DYRYHSDWQMDHRASSSGPRSPLDQRSYGSR : ::: : :. . :: :.: ..: .. :.: : CCDS10 SSDRDHRGHRDYY---DRHHHDSKRRRSDEFRPQNYHQQDFRRMSDHRPAMGYHGQGPSD 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1690 1700 pF1KE2 SPFEHSVEHKSTPEHTWSSRKT CCDS10 HYRSFHTDKLGEYKQPLPPLHPAVSDPRSPPSQKSPHDSKSPLDHRSPLERSLEQKNNPD 1770 1780 1790 1800 1810 1820 >>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058 aa) initn: 1249 init1: 641 opt: 1450 Z-score: 871.4 bits: 173.6 E(32554): 3.2e-42 Smith-Waterman score: 1531; 31.0% identity (59.3% similar) in 1134 aa overlap (287-1364:14-1052) 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 EVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEI :. ::.:: ..: : . : ..: : CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIE---DEQPGPSTSQEEGAA 10 20 30 40 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 QYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNC . . : ::. :... :...... : . . :. . : :: CCDS76 A--------AATEATAATEKGEKKKE----KNVSSFQLK--LAAKAPKSEKEMDPEY--- 50 60 70 80 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 QQELTDDLHKQYQIVER---IIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQ-GLPYSECSWEDGALISKK .... : :..... . ..:: : :: : . . : : . . : .::: CCDS76 EEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLIS-- 90 100 110 120 130 140 440 450 460 470 480 pF1KE2 FQACIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRF----VALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNG .: : .: .: ..:.. . . .. .:::. .: :::::. : CCDS76 ----AGDYRHR---RTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYV---KGGPLRDYQIRG 150 160 170 180 190 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 LNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQRE :::: . .: . :::::::::::.:::..:.:: : ... :: ...:: ::: .:. : CCDS76 LNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNE 200 210 220 230 240 250 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 IQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNW .. :. .. .. ..:: ..: . : . ... .:.::...:.:. . ..: CCDS76 FKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGE-----WDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHW 260 270 280 290 300 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 AFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSW .. .:::::.::. : : . . .:::..:::.:::::::.:.:::.::.:..:. :.: CCDS76 RYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSA 310 320 330 340 350 360 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 EDFEE----EHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQ .::. .. : . :: :.::::::.: ::::::: : : . . .: .:.. CCDS76 DDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQRE 370 380 390 400 410 420 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 YYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLI .: :: .. .:....: . .:::.:.:.::::: ::. . . :. .: :.. CCDS76 WYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDE---HIV 430 440 450 460 470 480 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 RSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRK .:::...::::: .:.:.:.::::::::.:.:::: .: .: . . ::::. : :. 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CCDS76 IEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEP-PKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP 710 720 730 740 750 760 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 -RQKELEEIYMLP-RMRNCAKQISFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKK-RGRPR .: ..... ..: :. . .. . . . : . .... .. :: : CCDS76 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP 770 780 790 800 810 820 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 TIPREN-------IKGFSDAEIR---RFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLR :.:. .::.. : .:::. .:.: . .: :::..: :: .. CCDS76 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYG--RDDIDNIAREVE--GKSPEEVM 830 840 850 860 870 880 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 RLGELVHNGC--IKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPL . . . . : .. .. . :: .:. . ::: .. : . . :. CCDS76 EYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQR------RIS---IKKALDAKIARYKAPF 890 900 910 920 930 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 HKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSL :. : :: .:. .. .:.: :. ....:. .. . .: CCDS76 HQL-------RIQYGT---SKGKNYT----EEEDRFLICMLHKMGFDRENVYE---ELRQ 940 950 960 970 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 THKILP----DDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAGSSKRRKARAKKNK . : : :. : ..: : . ::.:. .. . : .:..:. ::.. 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CCDS32 ---PG-----LGSKAGS---MSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEA 1270 1280 1290 1300 1310 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 ILKRAETHEN--EPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQR : . . ... : . .: ::.::::.. .:: :: : ::. . :: . : CCDS32 IARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIE-EIEREIIKQEENVDPDYW 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 RRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFNGS--EGRRSRSRRYSGS-----DSDSIS ..: ... ... :.. : . . ::...: . : . ..:. :: : : CCDS32 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERP 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 EGKRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIRRF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVD ::.: .:: . . .: . .. :. : .. : : . . : .:: .. CCDS32 EGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQ 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 KSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEE ::: CCDS32 WLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLV 1500 1510 1520 1530 1540 1550 >>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa) initn: 1466 init1: 609 opt: 1397 Z-score: 840.1 bits: 167.8 E(32554): 1.8e-40 Smith-Waterman score: 1462; 37.1% identity (65.4% similar) in 723 aa overlap (356-1054:55-738) 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 SHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASP---EDVEYYN--CQQEL : : .. . .::: .... . .... CCDS37 ASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKM 30 40 50 60 70 80 390 400 410 420 430 pF1KE2 TDDLHKQYQIVER---IIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQ-GLPYSECSWEDGALISKKFQAC : .... . . ..:: : .: : : . : : . . : :.: CCDS37 QTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKD-EKQNLLS------ 90 100 110 120 130 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 IDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVAL----KKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWL . .: : .: .: ..: . . . . . .:::. . : .:::::. ::::: CCDS37 VGDYRHR---RTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYV--KWG-KLRDYQVRGLNWL 140 150 160 170 180 190 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 AHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTW . .: . :::::::::::.::::.:.:. : ... :: ...:: ::: .:. :.. : CCDS37 ISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRW 200 210 220 230 240 250 560 570 580 590 600 pF1KE2 ASQMNAVVYLGDINSR-----NMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLN . . .: .:: ..: ... :: .. .:.::.:.:.:. . .: CCDS37 VPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEW----------DVCVTSYEMLIKEKSVFKKFN 260 270 280 290 300 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 WAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSS : .. .:::::.::. : : . . .::...:::.:::::::.:.::::::.:..:. :.: CCDS37 WRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNS 310 320 330 340 350 360 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 WEDFEEEHGKGREYG----YASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQK .::. . : :: :.::::::.: ::::::: : : . . .: .:. CCDS37 ADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQR 370 380 390 400 410 420 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 QYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHL ..: :: .. :....: . .:::.:.:.::::: ::. . . :. . .:: CCDS37 EWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTD---MHL 430 440 450 460 470 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 IRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELR . .:::...::::: .:.:.:.::::::::.:.:::: .: .:.. . ::::. . : CCDS37 VTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDER 480 490 500 510 520 530 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 KQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQ ..... .: .: : :.:::::::::::::.::.:...::::::: ::::. ::::::: CCDS37 QDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQ 540 550 560 570 580 590 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 KKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKE : : ..:..: ..::: :.:::. :. :: .:::. :. : .. . ..:. CCDS37 TKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQ----GRLV------DQNLNKIGKD 600 610 620 630 640 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 ELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRA--ETHENEPGPLTVGDELLSQFKV :. ... :: ..: ..:.: . ::: ::.:. .: : . .:. : .: . CCDS37 EMLQMIRHGATHVFA---SKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTM 650 660 670 680 690 700 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 ANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQIS . :.. . . : :... . : : .:.: CCDS37 DTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRP 710 720 730 740 750 760 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 FNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKF CCDS37 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAES 770 780 790 800 810 820 >>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905 aa) initn: 1602 init1: 686 opt: 1398 Z-score: 837.0 bits: 168.1 E(32554): 2.7e-40 Smith-Waterman score: 1989; 31.7% identity (58.2% similar) in 1509 aa overlap (116-1518:317-1755) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 FWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSS-EVKRKKH :: :: : :.:.:..: . .. .. .::. CCDS76 LKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKK 290 300 310 320 330 340 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 KDEDWQMSGSGSPSQSGSDSE-SEEEREKSSCDETESDYEPK--NKVKSRKPQNRSKSKN : :. . .: .. . : .. : :: :. . . :... . . CCDS76 KGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPH 350 360 370 380 390 400 210 220 230 240 250 pF1KE2 GKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDND--KRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDS-DDLLEV .: : . . :.:: .. :. .: ....... : : . :. . .. CCDS76 CEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHI 410 420 430 440 450 460 260 270 280 290 300 pF1KE2 CGEDVPQPEEEEFETIERFMDC-----RIGR----KGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEK . : :: . : . : .. . : . . : :.:::. : CCDS76 HCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPK 470 480 490 500 510 520 310 320 330 340 350 pF1KE2 NKE--PGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLK---QQNVRGMKKLDNYKKK-------DQ : : : :...::.: :. : .: .: :. : :.... ... . :. CCDS76 PLEGRP-ERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDE 530 540 550 560 570 580 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLP : .: :: .:. .:. .. .. ......::. :: .:. :. : ::. :: CCDS76 EKSRKRKNKDPKFAEME--ERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKK--GHVHYLIKWRDLP 590 600 610 620 630 640 420 430 440 450 460 pF1KE2 YSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQ----SKTTPFKDCKVLK----QRPR------- :.. :::. . . .. . :... . . : : : .: .:: CCDS76 YDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDP 650 660 670 680 690 700 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 FVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNY : ..:: :. . : :. ::..::::: :: .:.. :::::::::::.:: :: CCDS76 TVKYERQPEYLDA-TGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYS 710 720 730 740 750 760 530 540 550 560 570 pF1KE2 LFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH--- :..: . ::::. .::::. .:.::.. :: .: .:.:.:: .:: .:: .:.. . CCDS76 LYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNA 770 780 790 800 810 820 580 590 600 610 620 pF1KE2 -----QTKRLK------FNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYK ...:.: :..:::.::.. : :.::...:: . :::::::::..: ... CCDS76 IRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFR 830 840 850 860 870 880 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 TLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGK-GREYGYASLH .: .. .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.: . : : :: . ..: .:: CCDS76 VLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLH 890 900 910 920 930 940 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 KELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSG : : .:::.: :: :..:.:.: :.:.:.: .::.:::.:::::..::. . :. . CCDS76 DMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVS 950 960 970 980 990 1000 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 FLNIMMELKKCCNHCYL--IKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGN .::..:.::::::: :: . . .. : . . :::.::::.::.:.: :.: :. CCDS76 LLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGH 1010 1020 1030 1040 1050 1060 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 RVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTR ::::::::..:::.: ..:... . ..:.::.: :..:..:.:.::: :...:::::::: CCDS76 RVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 AGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILER :::::::::.::::.:.::::::.::.:: .:::::::.:.: :::.::..:::: : . CCDS76 AGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQV 1130 1140 1150 1160 1170 1180 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 AKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEP----- :::::.: :::. : .:: :: ..:.::. :::::.:::::. CCDS76 AKKKMMLTHLVV-RPGLGSKT----GS-------MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGG 1190 1200 1210 1220 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 ----EGEEQEPQEMD---IDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDED-DI :::.. ..: :...: : . :.: : .: ::.::::.. .:. CCDS76 GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQD-ETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGE 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE2 ELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFN-GSEGRRS : : ::. . :: . : ..: ... ... :.. : . . ::...: ::. :. CCDS76 EEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRD 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 RSRRYSGSDSD-SIS--EG-----------KRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIR . : ..:: :.. :: .::...: . . .: . .. :. CCDS76 WQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVL 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 RF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTG : .. : : . . : .:: .. ::: .: : .: : : CCDS76 GFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSE-------KEFKAYVSLFMRHL 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 GRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDI . : . :: .:: .. : .: : . . : ::. . : . CCDS76 CEPGADGAETF-ADGVPREG-LSRQHVLTRIGVMSLI------RKKV-----QEFEHVNG 1470 1480 1490 1500 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 DWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKI-LPDDP-DKKPQAKQLQTRADYL :. . ... : ::. : . : :. : : .:.. :. CCDS76 RWSMPELAEVE-----------ENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDG 1510 1520 1530 1540 1550 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 IKLLSRDLAKKEALSGAGSSKRRKARAKKNKAMKSIKVKEEIKSDSSPLPSEKSDEDDDK ::. .: ..:.. : .: .:: . :. ..: :. .:.: CCDS76 IKIEENSLKEEESIEG-------------EKEVKSTAPETAIECTQAPAPA----SEDEK 1560 1570 1580 1590 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE2 LSESKSDGRERSKKSSV---SDAPVHITASGEP-VPISEESEELDQKTFSIC----KERM . .:.:. .:. : .. :.. .: : ::. .: . . :.. CCDS76 VVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 RPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQ-CLIKIGDH-ITECLKEYTNPEQIKQWRKNLW . : .. : . : :....: .. .: ...:.: .:: . . : :. :. . CCDS76 EEKKEVMLQNGETPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTY 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 IFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKRQESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDVERLKENTNHDDS . . . : : . .:. . :. : :. . . :: CCDS76 EIWHR--RHDYWLLAGIINHGYARWQDIQ-NDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLA 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 SRDSYSSDRHLTQYHDHHKDRHQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYS CCDS76 RRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGN 1780 1790 1800 1810 1820 1830 >>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912 aa) initn: 1602 init1: 686 opt: 1398 Z-score: 837.0 bits: 168.1 E(32554): 2.7e-40 Smith-Waterman score: 1989; 31.7% identity (58.2% similar) in 1509 aa overlap (116-1518:324-1762) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 FWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSS-EVKRKKH :: :: : :.:.:..: . .. .. .::. CCDS85 LKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKK 300 310 320 330 340 350 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 KDEDWQMSGSGSPSQSGSDSE-SEEEREKSSCDETESDYEPK--NKVKSRKPQNRSKSKN : :. . .: .. . : .. : :: :. . . :... . . CCDS85 KGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPH 360 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 pF1KE2 GKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDND--KRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDS-DDLLEV .: : . . :.:: .. :. .: ....... : : . :. . .. CCDS85 CEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHI 420 430 440 450 460 470 260 270 280 290 300 pF1KE2 CGEDVPQPEEEEFETIERFMDC-----RIGR----KGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEK . : :: . : . : .. . : . . : :.:::. : CCDS85 HCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPK 480 490 500 510 520 530 310 320 330 340 350 pF1KE2 NKE--PGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLK---QQNVRGMKKLDNYKKK-------DQ : : : :...::.: :. : .: .: :. : :.... ... . :. CCDS85 PLEGRP-ERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDE 540 550 560 570 580 590 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLP : .: :: .:. .:. .. .. ......::. :: .:. :. : ::. :: CCDS85 EKSRKRKNKDPKFAEME--ERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKK--GHVHYLIKWRDLP 600 610 620 630 640 420 430 440 450 460 pF1KE2 YSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQ----SKTTPFKDCKVLK----QRPR------- :.. :::. . . .. . :... . . : : : .: .:: CCDS85 YDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDP 650 660 670 680 690 700 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 FVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNY : ..:: :. . : :. ::..::::: :: .:.. :::::::::::.:: :: CCDS85 TVKYERQPEYLDA-TGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYS 710 720 730 740 750 760 530 540 550 560 570 pF1KE2 LFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH--- :..: . ::::. .::::. .:.::.. :: .: .:.:.:: .:: .:: .:.. . 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