Result of FASTA (ccds) for pF1KE2635
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2635, 390 aa
  1>>>pF1KE2635     390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8809+/-0.00101; mu= 14.0201+/- 0.061
 mean_var=75.0261+/-14.989, 0's: 0 Z-trim(104.1): 125  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.148070
 statistics sampled from 7690 (7820) to 7690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.234), width:  16
 Scan time:  1.210

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS32785.1 ARHGAP28 gene_id:79822|Hs109|chr18     ( 570) 2535 551.3 8.5e-157
CCDS34535.1 ARHGAP18 gene_id:93663|Hs109|chr6      ( 663)  991 221.4 1.9e-57
CCDS34029.1 FAM13A gene_id:10144|Hs109|chr4        (1023)  310 76.1 1.7e-13
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2       ( 475)  303 74.4 2.5e-13
CCDS55201.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8          (1017)  290 71.8 3.3e-12
CCDS5990.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8           (1091)  290 71.8 3.5e-12
CCDS83253.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8          (1125)  290 71.8 3.6e-12
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 310)  282 69.9 3.8e-12
CCDS5989.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8           (1528)  290 71.9 4.7e-12
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 794)  284 70.5 6.4e-12
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 799)  284 70.5 6.4e-12
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 816)  284 70.5 6.6e-12
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 841)  284 70.5 6.7e-12
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10      ( 846)  284 70.5 6.8e-12
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 641)  282 70.0 7.1e-12
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 813)  282 70.0 8.8e-12
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 822)  282 70.0 8.9e-12
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17             ( 859)  282 70.0 9.2e-12
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22            (1227)  282 70.1 1.3e-11
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22            (1271)  282 70.1 1.3e-11
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17    ( 548)  276 68.7 1.5e-11
CCDS14142.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs109|chrX         ( 765)  277 69.0 1.7e-11
CCDS14141.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs109|chrX         ( 771)  277 69.0 1.8e-11
CCDS14140.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs109|chrX         ( 974)  277 69.0 2.2e-11
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17    ( 889)  276 68.8 2.3e-11
CCDS9350.1 STARD13 gene_id:90627|Hs109|chr13       ( 995)  274 68.4 3.4e-11
CCDS9349.1 STARD13 gene_id:90627|Hs109|chr13       (1105)  274 68.4 3.8e-11
CCDS9348.1 STARD13 gene_id:90627|Hs109|chr13       (1113)  274 68.4 3.8e-11
CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs109|chr2       ( 638)  265 66.4 8.8e-11


>>CCDS32785.1 ARHGAP28 gene_id:79822|Hs109|chr18          (570 aa)
 initn: 2535 init1: 2535 opt: 2535  Z-score: 2928.7  bits: 551.3 E(33420): 8.5e-157
Smith-Waterman score: 2535; 99.7% identity (99.7% similar) in 390 aa overlap (1-390:181-570)

                                             10        20        30
pF1KE2                               MKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IKKEDYVLTKFNVQKTRFGLTEAGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEK
              160       170       180       190       200       210

               40        50        60        70        80        90
pF1KE2 VKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKV
              220       230       240       250       260       270

              100       110       120       130       140       150
pF1KE2 KQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHV
              280       290       300       310       320       330

              160       170       180       190       200       210
pF1KE2 KVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSK
              340       350       360       370       380       390

              220       230       240       250       260       270
pF1KE2 HSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLR
              400       410       420       430       440       450

              280       290       300       310       320       330
pF1KE2 RKTLERETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLNNQTKAKDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKTLERETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLNNQTKAKDIL
              460       470       480       490       500       510

              340       350       360       370       380       390
pF1KE2 AKFQYENSHGSSECIKIQNQRLYEIGGNIGEHCLDPDAYILDVYRINPQAEWVIKPQPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS32 AKFQYENSHGSSECIKIQNQRLYEIGGNIGEHCLDPDAYILDVYRINPQAEWVIKPQQSS
              520       530       540       550       560       570

>>CCDS34535.1 ARHGAP18 gene_id:93663|Hs109|chr6           (663 aa)
 initn: 1114 init1: 484 opt: 991  Z-score: 1145.1  bits: 221.4 E(33420): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 1180; 46.3% identity (78.3% similar) in 391 aa overlap (1-388:284-662)

                                             10        20        30
pF1KE2                               MKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEK
                                     :::. ::.::::::..:..::.::..:. :
CCDS34 SKGDDATLPSFRLPKDKTGTTRIGDLAPQDMKKVCHLALIELTALYDVLGIELKQQKAVK
           260       270       280       290       300       310   

               40        50        60        70        80        90
pF1KE2 VKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKV
       .: .:.:.: ::::.::. :..: ::...::..::.. ..:: :::.::..:. : . ..
CCDS34 IKTKDSGLFCVPLTALLEQDQRKVPGMRIPLIFQKLISRIEERGLETEGLLRIPGAAIRI
           320       330       340       350       360       370   

              100       110       120       130       140       150
pF1KE2 KQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHV
       :.  .::.:::    :.:... ...:: .:: :.::::  :. :::. :: .. .  :  
CCDS34 KNLCQELEAKFYEGTFNWESVKQHDAASLLKLFIRELPQPLLSVEYLKAFQAV-QNLPTK
           380       390       400       410       420        430  

              160       170       180       190       200          
pF1KE2 KVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRS-
       : :.:::.:.:. :::::::. .::. :...:: :. ::.:.. :.. :::::::. .. 
CCDS34 KQQLQALNLLVILLPDANRDTLKALLEFLQRVIDNKEKNKMTVMNVAMVMAPNLFMCHAL
            440       450       460       470       480       490  

       210       220       230       240       250       260       
pF1KE2 --KHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRK
         : :. .:...:  .:. ..:..::::.:: .:.:...:::..:  .   ::.  ...:
CCDS34 GLKSSEQREFVMAAGTANTMHLLIKYQKLLWTIPKFIVNQVRKQNTENH--KKDKRAMKK
            500       510       520       530       540         550

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE2 LLRRKTLERETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLNNQTKAK
       ::.. . .::          .:. ..   .:::.:::::.:: ::::::::::... ::.
CCDS34 LLKKMAYDREK--------YEKQDKSTNDADVPQGVIRVQAPHLSKVSMAIQLTEELKAS
              560               570       580       590       600  

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE2 DILAKFQYENSHGSSECIKIQNQRLYEIGGNIGEHCLDPDAYILDVYRINPQAEWVIKPQ
       :.::.:  ..: : .. .:  .  ::::::::::.::: :.:. :.:..::.:::::: .
CCDS34 DVLARFLSQES-GVAQTLKKGEVFLYEIGGNIGERCLDDDTYMKDLYQLNPNAEWVIKSK
            610        620       630       640       650       660 

       390
pF1KE2 PSS
       :  
CCDS34 PL 
          

>>CCDS34029.1 FAM13A gene_id:10144|Hs109|chr4             (1023 aa)
 initn: 231 init1: 114 opt: 310  Z-score: 356.0  bits: 76.1 E(33420): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 316; 29.6% identity (56.1% similar) in 287 aa overlap (38-321:40-309)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE2 SLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFF
                                     .::: :  :   .:.      .: :. .. 
CCDS34 QSKAAVRLKEDMKKIVAVPLNEQKDFTYQKLFGVSLQEL---ERQGLTENGIPAVVWNIV
      10        20        30        40           50        60      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE2 EKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFREL
       : . . :: .::.::..: .  :.: : ....   ..  :   .:   :: .:: :.:::
CCDS34 EYLTQHGLTQEGLFRVNGNVKVVEQLRLKFESGVPVELGKDGDVC--SAASLLKLFLREL
         70        80        90       100       110         120    

       130       140       150       160       170       180       
pF1KE2 PTSLFPVEYIPAFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANES
       : ::.     : ::.:.. : .  :: ..:. ..  :::..    . :  :..::  .. 
CCDS34 PDSLITSALQPRFIQLFQDGRN-DVQESSLRDLIKELPDTHYCLLKYLCQFLTKVAKHHV
          130       140        150       160       170       180   

       190       200       210       220       230       240       
pF1KE2 KNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQ
       .:::.. :..::..:: :        ..:  : :   .:.  .:.  . :..:      .
CCDS34 QNRMNVHNLATVFGPNCFHVPPGLEGMKEQDLCN---KIMAKILENYNTLFEVEYTENDH
           190       200       210          220       230       240

       250       260         270       280       290       300     
pF1KE2 VRRMNEATMLLKKQLPSVRKL--LRRKTLERETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIR
       .:  : : ... :..    .:  :  . :::.  .:  .  . :: :        :: :.
CCDS34 LRCENLARLIIVKEVYYKNSLPILLTRGLERDMPKPPPKTKIPKSRS--------EGSIQ
              250       260       270       280               290  

         310        320       330       340       350       360    
pF1KE2 VHAPLLSKVSMAI-QLNNQTKAKDILAKFQYENSHGSSECIKIQNQRLYEIGGNIGEHCL
       .:  :  ..: .: ::.                                           
CCDS34 AHRVLQPELSDGIPQLSLRLSYRKACLEDMNSAEGAISAKLVPSSQEDERPLSPFYLSAH
            300       310       320       330       340       350  

>>CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2            (475 aa)
 initn: 261 init1: 148 opt: 303  Z-score: 353.1  bits: 74.4 E(33420): 2.5e-13
Smith-Waterman score: 303; 29.2% identity (63.9% similar) in 216 aa overlap (27-237:266-470)

                   10        20        30          40        50    
pF1KE2     MKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEKVKG--RDNGIFGVPLTVLLDGDRKKD
                                     :: . ::  .:. :::  :  . . . .  
CCDS21 FRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQ-IFGSHLHKVCERENST-
         240       250       260       270        280       290    

           60        70        80        90         100       110  
pF1KE2 PGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYRE--ELDAKFNADKFKWDKMC
           ::  ... .: ::. ::. .::.:.::  : ... :   . . :.: :  .:. . 
CCDS21 ----VPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIH
               300       310       320       330       340         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE2 HREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAA
          .:  :: ::::::  :::  ..  :.  ...  . .....:.. .:. ::  :::. 
CCDS21 VVTGA--LKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDN-NTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTM
     350         360       370       380        390       400      

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pF1KE2 QALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYE-ELLLANTAAHIIRLML
       ..:.  ..:..:. ::: ::  ... :..:.:. .... ...  ...  :  :..  .. 
CCDS21 KVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAEL--MLS
        410       420       430       440       450       460      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 KYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLRRKTLERETASPKTSKVLQKSP
       .:.::.                                                      
CCDS21 EYSKIFGSEED                                                 
          470                                                      

>>CCDS55201.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8               (1017 aa)
 initn: 254 init1: 137 opt: 290  Z-score: 332.9  bits: 71.8 E(33420): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 292; 28.6% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (1-205:517-723)

                                             10              20    
pF1KE2                               MKKIRHLSLIELTAFFDAF------GIQ--
                                     :. ... ::..:::... .      :..  
CCDS55 HRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWA
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pF1KE2 ----LKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESE
           .:: :.   :  : ..:::::::  . .:  .:   .:  .:. .. ...  :.. 
CCDS55 VPKFMKRIKVPDYK--DRSVFGVPLTV--NVQRTGQP---LPQSIQQAMRYLRNHCLDQV
        550       560         570            580       590         

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pF1KE2 GIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIP
       :.:: ::  ....  :.  .. .  :  ... .   ..: ::: .::.::  :.  .   
CCDS55 GLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAI--DCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSE
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      140       150       160       170       180       190        
pF1KE2 AFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNIST
       .:.....  :. . ..::..  .: ::: ::.. :.:. :.. : :  ..:.:.  :...
CCDS55 TFLQIYQYVPKDQ-RLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAV
       660       670        680       690       700       710      

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE2 VMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLL
        .::.::                                                     
CCDS55 CLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVP
        720       730       740       750       760       770      

>>CCDS5990.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8                (1091 aa)
 initn: 254 init1: 137 opt: 290  Z-score: 332.5  bits: 71.8 E(33420): 3.5e-12
Smith-Waterman score: 292; 28.6% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (1-205:591-797)

                                             10              20    
pF1KE2                               MKKIRHLSLIELTAFFDAF------GIQ--
                                     :. ... ::..:::... .      :..  
CCDS59 HRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWA
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pF1KE2 ----LKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESE
           .:: :.   :  : ..:::::::  . .:  .:   .:  .:. .. ...  :.. 
CCDS59 VPKFMKRIKVPDYK--DRSVFGVPLTV--NVQRTGQP---LPQSIQQAMRYLRNHCLDQV
              630         640         650          660       670   

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pF1KE2 GIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIP
       :.:: ::  ....  :.  .. .  :  ... .   ..: ::: .::.::  :.  .   
CCDS59 GLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAI--DCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSE
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pF1KE2 AFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNIST
       .:.....  :. . ..::..  .: ::: ::.. :.:. :.. : :  ..:.:.  :...
CCDS59 TFLQIYQYVPKDQ-RLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAV
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      200       210       220       230       240       250        
pF1KE2 VMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLL
        .::.::                                                     
CCDS59 CLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVP
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>>CCDS83253.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8               (1125 aa)
 initn: 254 init1: 137 opt: 290  Z-score: 332.2  bits: 71.8 E(33420): 3.6e-12
Smith-Waterman score: 292; 28.6% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (1-205:625-831)

                                             10              20    
pF1KE2                               MKKIRHLSLIELTAFFDAF------GIQ--
                                     :. ... ::..:::... .      :..  
CCDS83 HRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWA
          600       610       620       630       640       650    

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pF1KE2 ----LKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESE
           .:: :.   :  : ..:::::::  . .:  .:   .:  .:. .. ...  :.. 
CCDS83 VPKFMKRIKVPDYK--DRSVFGVPLTV--NVQRTGQP---LPQSIQQAMRYLRNHCLDQV
          660         670         680          690       700       

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pF1KE2 GIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIP
       :.:: ::  ....  :.  .. .  :  ... .   ..: ::: .::.::  :.  .   
CCDS83 GLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAI--DCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSE
       710       720       730         740       750       760     

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pF1KE2 AFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNIST
       .:.....  :. . ..::..  .: ::: ::.. :.:. :.. : :  ..:.:.  :...
CCDS83 TFLQIYQYVPKDQ-RLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAV
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      200       210       220       230       240       250        
pF1KE2 VMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLL
        .::.::                                                     
CCDS83 CLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVP
          830       840       850       860       870       880    

>>CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17                  (310 aa)
 initn: 234 init1: 159 opt: 282  Z-score: 331.8  bits: 69.9 E(33420): 3.8e-12
Smith-Waterman score: 292; 28.6% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (10-250:71-301)

                                    10        20        30         
pF1KE2                      MKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEKVKGRDNGIF
                                     .:..  : .  ..:::. ..:    ..:.:
CCDS58 RNKLLRNKLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKK----QTGVF
               50        60        70        80        90          

      40        50        60        70        80        90         
pF1KE2 GVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYREELDA
       :: ..:.   .:.:     :: ....  :.::. :.:  ::.:.:: .. ..  .  .::
CCDS58 GVKISVVTKRERSK-----VPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDA
        100       110            120       130       140       150 

     100        110       120       130       140        150       
pF1KE2 KFNADKFKW-DKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFI-SLMERGPHVKVQFQAL
       . : : .   . :     :  :: .:::::  :.  .  :::. ..    : .: . . .
CCDS58 N-NKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCM-M
              160       170       180       190       200          

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE2 HLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEEL
       ::.  .::: :  .   :.  ...:  .:  :.::: :..::..:.:.     .:  .  
CCDS58 HLL-RSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESKAHLT
     210        220       230       240       250       260        

       220       230       240         250       260       270     
pF1KE2 LLANTAAHIIRLMLKYQKILWKV--PSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLRRKTLE
         :.  .: .  : . : .:. .  : . .....:                         
CCDS58 SAADIWSHDV--MAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV                
      270         280       290       300       310                

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE2 RETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLNNQTKAKDILAKFQY

>>CCDS5989.1 DLC1 gene_id:10395|Hs109|chr8                (1528 aa)
 initn: 254 init1: 137 opt: 290  Z-score: 330.2  bits: 71.9 E(33420): 4.7e-12
Smith-Waterman score: 292; 28.6% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (1-205:1028-1234)

                                             10              20    
pF1KE2                               MKKIRHLSLIELTAFFDAF------GIQ--
                                     :. ... ::..:::... .      :..  
CCDS59 HRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWA
      1000      1010      1020      1030      1040      1050       

                 30        40        50        60        70        
pF1KE2 ----LKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESE
           .:: :.   :  : ..:::::::  . .:  .:   .:  .:. .. ...  :.. 
CCDS59 VPKFMKRIKVPDYK--DRSVFGVPLTV--NVQRTGQP---LPQSIQQAMRYLRNHCLDQV
      1060      1070        1080        1090         1100      1110

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE2 GIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIP
       :.:: ::  ....  :.  .. .  :  ... .   ..: ::: .::.::  :.  .   
CCDS59 GLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAI--DCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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