seq1 = pF1KB5860.tfa, 1470 bp seq2 = pF1KB5860/gi568815597f_204425519.tfa (gi568815597f:204425519_204649679), 224161 bp >pF1KB5860 1470 >gi568815597f:204425519_204649679 (Chr1) 1-78 (100001-100078) 100% -> 79-153 (100842-100916) 100% -> 154-287 (105166-105299) 100% -> 288-343 (106673-106728) 100% -> 344-411 (111912-111979) 100% -> 412-511 (112691-112790) 100% -> 512-672 (117266-117426) 100% -> 673-822 (119017-119166) 100% -> 823-903 (121279-121359) 100% -> 904-1470 (123595-124161) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGACATCATTTTCCACCTCTGCTCAGTGTTCAACATCTGACAGTGCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGACATCATTTTCCACCTCTGCTCAGTGTTCAACATCTGACAGTGCTTG 50 . : . : . : . : . : 51 CAGGATCTCTCCTGGACAAATCAATCAG GTACGACCAAAAC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 100051 CAGGATCTCTCCTGGACAAATCAATCAGGTA...CAGGTACGACCAAAAC 100 . : . : . : . : . : 92 TGCCGCTTTTGAAGATTTTGCATGCAGCAGGTGCGCAAGGTGAAATGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100855 TGCCGCTTTTGAAGATTTTGCATGCAGCAGGTGCGCAAGGTGAAATGTTC 150 . : . : . : . : . : 142 ACTGTTAAAGAG GTCATGCACTATTTAGGTCAGTACATAAT ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 100905 ACTGTTAAAGAGGTA...CAGGTCATGCACTATTTAGGTCAGTACATAAT 200 . : . : . : . : . : 183 GGTGAAGCAACTTTATGATCAGCAGGAGCAGCATATGGTATATTGTGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105195 GGTGAAGCAACTTTATGATCAGCAGGAGCAGCATATGGTATATTGTGGTG 250 . : . : . : . : . : 233 GAGATCTTTTGGGAGAACTACTGGGACGTCAGAGCTTCTCCGTGAAAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105245 GAGATCTTTTGGGAGAACTACTGGGACGTCAGAGCTTCTCCGTGAAAGAC 300 . : . : . : . : . : 283 CCAAG CCCTCTCTATGATATGCTAAGAAAGAATCTTGTCAC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105295 CCAAGGTA...CAGCCCTCTCTATGATATGCTAAGAAAGAATCTTGTCAC 350 . : . : . : . : . : 324 TTTAGCCACTGCTACTACAG ATGCTGCTCAGACTCTCGCTC ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 106709 TTTAGCCACTGCTACTACAGGTA...CAGATGCTGCTCAGACTCTCGCTC 400 . : . : . : . : . : 365 TCGCACAGGATCACAGTATGGATATTCCAAGTCAAGACCAACTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 111933 TCGCACAGGATCACAGTATGGATATTCCAAGTCAAGACCAACTGAAGGTA 450 . : . : . : . : . : 412 CAAAGTGCAGAGGAAAGTTCCACTTCCAGAAAAAGAACTACAGA ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111983 ...CAGCAAAGTGCAGAGGAAAGTTCCACTTCCAGAAAAAGAACTACAGA 500 . : . : . : . : . : 456 AGACGATATCCCCACACTGCCTACCTCAGAGCATAAATGCATACATTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112735 AGACGATATCCCCACACTGCCTACCTCAGAGCATAAATGCATACATTCTA 550 . : . : . : . : . : 506 GAGAAG ATGAAGACTTAATTGAAAATTTAGCCCAAGATGAA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112785 GAGAAGGTA...TAGATGAAGACTTAATTGAAAATTTAGCCCAAGATGAA 600 . : . : . : . : . : 547 ACATCTAGGCTGGACCTTGGATTTGAGGAGTGGGATGTAGCTGGCCTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117301 ACATCTAGGCTGGACCTTGGATTTGAGGAGTGGGATGTAGCTGGCCTGCC 650 . : . : . : . : . : 597 TTGGTGGTTTTTAGGAAACTTGAGAAGCAACTATACACCTAGAAGTAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117351 TTGGTGGTTTTTAGGAAACTTGAGAAGCAACTATACACCTAGAAGTAATG 700 . : . : . : . : . : 647 GCTCAACTGATTTACAGACAAATCAG GATGTGGGTACTGCC ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 117401 GCTCAACTGATTTACAGACAAATCAGGTA...TAGGATGTGGGTACTGCC 750 . : . : . : . : . : 688 ATTGTTTCAGATACTACAGATGACTTGTGGTTTTTGAATGAGTCAGTATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119032 ATTGTTTCAGATACTACAGATGACTTGTGGTTTTTGAATGAGTCAGTATC 800 . : . : . : . : . : 738 AGAGCAGTTAGGTGTTGGAATAAAAGTTGAAGCTGCTGATACTGAACAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119082 AGAGCAGTTAGGTGTTGGAATAAAAGTTGAAGCTGCTGATACTGAACAAA 850 . : . : . : . : . : 788 CAAGTGAAGAAGTAGGGAAAGTAAGTGACAAAAAG GTGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 119132 CAAGTGAAGAAGTAGGGAAAGTAAGTGACAAAAAGGTA...CAGGTGATT 900 . : . : . : . : . : 829 GAAGTGGGAAAAAATGATGACCTGGAGGACTCTAAGTCCTTAAGTGATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121285 GAAGTGGGAAAAAATGATGACCTGGAGGACTCTAAGTCCTTAAGTGATGA 950 . : . : . : . : . : 879 TACCGATGTAGAGGTTACCTCTGAG GATGAGTGGCAGTGTA |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 121335 TACCGATGTAGAGGTTACCTCTGAGGTA...TAGGATGAGTGGCAGTGTA 1000 . : . : . : . : . : 920 CTGAATGCAAGAAATTTAACTCTCCAAGCAAGAGGTACTGTTTTCGTTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123611 CTGAATGCAAGAAATTTAACTCTCCAAGCAAGAGGTACTGTTTTCGTTGT 1050 . : . : . : . : . : 970 TGGGCCTTGAGGAAGGATTGGTATTCAGATTGTTCAAAGTTAACCCATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123661 TGGGCCTTGAGGAAGGATTGGTATTCAGATTGTTCAAAGTTAACCCATTC 1100 . : . : . : . : . : 1020 TCTCTCCACGTCTGATATCACTGCCATACCTGAAAAGGAAAATGAAGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123711 TCTCTCCACGTCTGATATCACTGCCATACCTGAAAAGGAAAATGAAGGAA 1150 . : . : . : . : . : 1070 ATGATGTCCCTGATTGTCGAAGAACCATTTCGGCTCCTGTCGTTAGACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123761 ATGATGTCCCTGATTGTCGAAGAACCATTTCGGCTCCTGTCGTTAGACCT 1200 . : . : . : . : . : 1120 AAAGATGCGTATATAAAGAAAGAAAACTCCAAACTTTTTGATCCCTGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123811 AAAGATGCGTATATAAAGAAAGAAAACTCCAAACTTTTTGATCCCTGCAA 1250 . : . : . : . : . : 1170 CTCAGTGGAATTCTTGGATTTGGCTCACAGTTCTGAAAGCCAAGAGACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123861 CTCAGTGGAATTCTTGGATTTGGCTCACAGTTCTGAAAGCCAAGAGACCA 1300 . : . : . : . : . : 1220 TCTCAAGCATGGGAGAACAGTTAGATAACCTTTCTGAACAGAGAACAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123911 TCTCAAGCATGGGAGAACAGTTAGATAACCTTTCTGAACAGAGAACAGAT 1350 . : . : . : . : . : 1270 ACAGAAAACATGGAGGATTGCCAGAATCTCTTGAAGCCATGTAGCTTATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123961 ACAGAAAACATGGAGGATTGCCAGAATCTCTTGAAGCCATGTAGCTTATG 1400 . : . : . : . : . : 1320 TGAGAAAAGACCACGAGACGGGAACATTATTCATGGAAGGACGGGCCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124011 TGAGAAAAGACCACGAGACGGGAACATTATTCATGGAAGGACGGGCCATC 1450 . : . : . : . : . : 1370 TTGTCACTTGTTTTCACTGTGCCAGAAGACTAAAGAAGGCTGGGGCTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124061 TTGTCACTTGTTTTCACTGTGCCAGAAGACTAAAGAAGGCTGGGGCTTCA 1500 . : . : . : . : . : 1420 TGCCCTATTTGCAAGAAAGAGATTCAGCTGGTTATTAAGGTTTTTATAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124111 TGCCCTATTTGCAAGAAAGAGATTCAGCTGGTTATTAAGGTTTTTATAGC 1550 1470 A | 124161 A