Result of FASTA (ccds) for pF1KE3393
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3393, 1188 aa
  1>>>pF1KE3393     1188 - 1188 aa - 1188 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5827+/-0.00125; mu= 3.4843+/- 0.076
 mean_var=270.2130+/-52.721, 0's: 0 Z-trim(109.8): 61  B-trim: 9 in 1/54
 Lambda= 0.078023
 statistics sampled from 11106 (11149) to 11106 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.342), width:  16
 Scan time:  5.070

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9733.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14         (1188) 7675 878.7       0
CCDS45114.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14        (1203) 7159 820.6       0
CCDS9732.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14         (1257) 7153 820.0       0
CCDS31061.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1        (1312) 2442 289.7 3.2e-77
CCDS31060.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1        (1226) 1937 232.8 3.9e-60


>>CCDS9733.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14              (1188 aa)
 initn: 7675 init1: 7675 opt: 7675  Z-score: 4684.0  bits: 878.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7675; 100.0% identity (100.0% similar) in 1188 aa overlap (1-1188:1-1188)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTDELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTDELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVAT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180        
pF1KE3 IDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
             1150      1160      1170      1180        

>>CCDS45114.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14             (1203 aa)
 initn: 7245 init1: 7153 opt: 7159  Z-score: 4370.0  bits: 820.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7629; 98.7% identity (98.8% similar) in 1203 aa overlap (1-1188:1-1203)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100                     1110      1120     
pF1KE3 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGT---------------DELDNMNSTERISFLQEKLQ
       :::::::::::::::::::::::::               .:::::::::::::::::::
CCDS45 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSNELDNMNSTERISFLQEKLQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

        1130      1140      1150      1160      1170      1180     
pF1KE3 EIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

          
pF1KE3 ECR
       :::
CCDS45 ECR
          

>>CCDS9732.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14              (1257 aa)
 initn: 7153 init1: 7153 opt: 7153  Z-score: 4366.1  bits: 820.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7282; 94.3% identity (94.3% similar) in 1220 aa overlap (1-1151:1-1220)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VVSATERTEWYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILNLPES
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKTEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNID
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHEPKVKEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDVNSI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 IDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKRDEE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTANSEGKSDSCSSDSETEDALEKNLINEELSLKDE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LEKNENLNDDKLDEENPKISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKEDEDAMPLIGPETLVCH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 EVDLDDLDEKDKTSIEDVAVESSESNSLVSIPPALPPVVQHNFSVASPLTLSQDESRSVK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFETNVASGTCSIIVQERESREKGQKRPSDGNS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100                                        
pF1KE3 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGT-----------------------------------
       :::::::::::::::::::::::::                                   
CCDS97 GLMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSSKCTPVKHLNVSKPQKLARS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

                                          1110      1120      1130 
pF1KE3 ----------------------------------DELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYY
                                         .:::::::::::::::::::::::::
CCDS97 PARISPHIKDGEKDKHREKHPNSSPRTYKWSFQLNELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYY
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

            1140      1150      1160      1170      1180        
pF1KE3 MSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
       ::::::::::::::::::::                                     
CCDS97 MSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
             1210      1220      1230      1240      1250       

>>CCDS31061.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1             (1312 aa)
 initn: 1999 init1: 846 opt: 2442  Z-score: 1500.0  bits: 289.7 E(32554): 3.2e-77
Smith-Waterman score: 2681; 43.7% identity (67.2% similar) in 1216 aa overlap (1-1136:1-1179)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
       ::: ::: :::::::::::::::::::::::.:::::::: ...:..:  ::::..::::
CCDS31 MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
       .::::::... ::..:::.:.:::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS31 KVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETL
               70        80        90       100       110       120

              130       140        150       160       170         
pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSS-LPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVV
       ::::::::::::::::.:::::::::. .:   .:.   :: .:::: :.  ::::::::
CCDS31 DQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIP---EEESSSSSSDEDEDDRKQIDELLGKVV
              130       140       150          160       170       

     180          190       200       210       220       230      
pF1KE3 SV--VSATERTE-WYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILN
        :  .:  ..   :.::::. :.:.:.:.::::. ::::: :.:: :. :::..:.   .
CCDS31 CVDYISLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVHEITSDT
       180       190       200       210       220       230       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE3 LPESELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAK
        :. .   : ....:  : :.:..: ::: ...:  .::::. :.   ::.:.::::: .
CCDS31 APKPDAVLKQAFEQALEFHKSRTIPANWKTELKE--DSSSSEAEE-EEEEEDDEKEKEDN
       240       250       260       270         280        290    

        300         310       320       330       340       350    
pF1KE3 KTEEEVPEEELDP--EERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQG
       ..:::   ::..:  :::.::::::::::::::::::: :::::..::::::::::.. :
CCDS31 SSEEE---EEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLG
             300       310       320       330       340       350 

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE3 GCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHE
       : :::.:::::::.:.:::::.:::::.:::: ::.:::::::::::::::.:. .   :
CCDS31 GFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALP-E
             360       370       380       390       400        410

          420       430       440       450       460              
pF1KE3 PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESERE-EIE----LKSPRG
         :... :. :.  :  .: ..:  . :.: : :.::    :.  : :::    .:   :
CCDS31 KVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNIIPREEKPIEDEIERKENIKPSLG
              420       430       440       450       460       470

     470       480       490       500        510       520        
pF1KE3 RRRIARDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTEN-KDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQK
        ..    ..::  . ..::  .  : .:.::  : :::   .... :  . ....  :. 
CCDS31 SKKNL--LESIPTHSDQEKEVNIKKPEDNENLDDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEEKAKSG
                480       490       500       510       520        

      530       540       550       560       570       580        
pF1KE3 EKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKT
       ..  .:.:: : .  ::::. .:.:: :.  :.. ::. : . :   : ::.:.:::::.
CCDS31 DET-NKEEDEDDEEAEEEEEEEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPP---GMKVQVRYGRGKN
      530        540       550       560       570          580    

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pF1KE3 QKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNK
       ::.::::::..... ::::::::: :::::::::.:::.:. : ::. :: :..:: :::
CCDS31 QKMYEASIKDSDVEGGEVLYLVHYCGWNVRYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNK
          590       600       610       620       630       640    

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pF1KE3 EDSEKD--EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNM--PYGLSKTANSEGK-----------
        :.:::  :: . .  : .: ..::.... : .:     :. . ::.             
CCDS31 LDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSIL
          650       660       670       680       690       700    

                 700          710       720              730       
pF1KE3 -----SDSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN-------LNDDKLDEENP
            :.: . ::: ::   : . .  ..: :  :.: .:.:        :...: ::: 
CCDS31 NGLQASESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRNDLISKEEQNSSSLLEENK
          710       720       730       740       750       760    

            740       750       760       770       780        790 
pF1KE3 K-----ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTEEVKKEA-EKSPK
             ::  . :  .: . . .:.:. ..  .:. :       .: ..:::.. .:: :
CCDS31 VHADLVISKPVSKSPERLR-KDIEVLSEDTDYEEDEVT------KKRKDVKKDTTDKSSK
          770       780        790       800             810       

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pF1KE3 GKGRRSKTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSSATEDEIDQCV
        . .:.: .  . :  .: .: :..:       .:.. :   ..:.. ::. ::: .  .
CCDS31 PQIKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEE------KAKNKESLCMENSSNSSSDEDEEETKA
       820       830       840             850       860       870 

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pF1KE3 KEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNFEQHFERENEG
       :    : :  :    .:..:  . .   . :...: .   .:.  . :.  .  .:..  
CCDS31 KMTPTK-KYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSD--ERLQNSRAKDRKDVW
              880       890       900       910         920        

              920       930       940          950       960       
pF1KE3 MPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAMPLIGPETLVCHEVDLD--
               .. ...: :.  :. :  .   :  :.   :...  .. :      :.:.  
CCDS31 SSIQGQWPKKTLKELFSDS-DTEAAASPPHPAPEEGVAEESLQTVAEEESCSPSVELEKP
      930       940        950       960       970       980       

            970           980         990                 1000     
pF1KE3 ---DLDEK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--PVV---------QHNFSV
          ..: :   .::  ..:  .:  :: :::... ::. :  :           : . .:
CCDS31 PPVNVDSKPIEEKTVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEGSRQQSSVTV
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

        1010      1020      1030      1040       1050      1060    
pF1KE3 ASPLTLSQDESRSVKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESA-NGFETNVASGTCSIIVQE
       . ::. .:.: ::.:::.: ::::::.: : :.   : .:.  ::...:.:.. .    :
CCDS31 SEPLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPAGFDASVSSSSSNQPEPE
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

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pF1KE3 R-ESREKGQKRPSDGNSG-LMAKKQKRTPKRTSAAAKNEKNGTDELDN--MNSTERISFL
       . :.   :::: .:...:   .:::::. : : .  :.. .::.  :.  ... : :.  
CCDS31 HPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNNKKKGKGTNSSDSEELSAGESIT--
      1110      1120      1130      1140      1150      1160       

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KE3 QEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSSSPPQ
         : : ...   ..::                                            
CCDS31 --KSQPVKSVSTGMKSHSTKSPARTQSPGKCGKNGDKDPDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSD
          1170      1180      1190      1200      1210      1220   

>>CCDS31060.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1             (1226 aa)
 initn: 2010 init1: 846 opt: 1937  Z-score: 1193.1  bits: 232.8 E(32554): 3.9e-60
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pF1KE3 MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
       ::: ::: :::::::::::::::::::::::.:::::::: ...:..:  ::::..::::
CCDS31 MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPL
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE3 RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
       .::::::... ::..:::.:.:::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS31 KVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE3 DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSS-LPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVV
       ::::::::::::::::.:::::::::. .:   .:.   :: .:::: :.  ::::::::
CCDS31 DQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIP---EEESSSSSSDEDEDDRKQIDELLGKVV
              130       140       150          160       170       

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pF1KE3 SV--VSATERTE-WYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILN
        :  .:  ..   :.::::. :.:.:.:.::::. ::::: :.:: :. :::..:.   .
CCDS31 CVDYISLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVHEITSDT
       180       190       200       210       220       230       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE3 LPESELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAK
        :. .   : ....:  : :.:..: ::: ...:  .::::. :.   ::.:.::::: .
CCDS31 APKPDAVLKQAFEQALEFHKSRTIPANWKTELKE--DSSSSEAEE-EEEEEDDEKEKEDN
       240       250       260       270         280        290    

        300         310       320       330       340       350    
pF1KE3 KTEEEVPEEELDP--EERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQG
       ..:::   ::..:  :::.::::::::::::::::::: :::::..::::::::::.. :
CCDS31 SSEEE---EEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLG
             300       310       320       330       340       350 

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pF1KE3 GCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHE
       : :::.:::::::.:.:::::.:::::.:::: ::.:::::::::::::::.:. .   :
CCDS31 GFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQ-MALPE
             360       370       380       390       400        410

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE3 PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIA
         :... :. :.  :  .: ..:  . :.: : :.::                     : 
CCDS31 KVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNI---------------------IP
              420       430       440                              

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pF1KE3 RDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTENKDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKK
       :. . :. :::..   ...: .   .:.. ..  :             .. ..:: .:::
CCDS31 REEKPIEDEIERK---ENIKPSLGSKKNLLESIPT-------------HSDQEKEVNIKK
     450       460          470       480                    490   

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pF1KE3 QEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEA
        ::... .:.... ..  :  . : ..: :               :.: :          
CCDS31 PEDNENLDDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEE---------------KAKSG----------
           500       510       520                                 

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pF1KE3 SIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKD
                               ::::.:::.:. : ::. :: :..:: ::: :.:::
CCDS31 ------------------------YDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKD
                              530       540       550       560    

            660        670       680                         690   
pF1KE3 --EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNMPYGL-------SKTA-----------NSEGKS
         :: . .  : .: ..::.... : .:   :       : ::           :.   :
CCDS31 KDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQAS
          570       580       590       600       610       620    

           700          710       720              730             
pF1KE3 DSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN-------LNDDKLDEENPK-----
       .: . ::: ::   : . .  ..: :  :.: .:.:        :...: :::       
CCDS31 ESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHADLV
          630       640       650       660       670       680    

      740       750       760       770       780        790       
pF1KE3 ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEKTEEVKKEA-EKSPKGKGRRS
       ::  . :  .: . . .:.:. ..  .:. :       .: ..:::.. .:: : . .:.
CCDS31 ISKPVSKSPERLR-KDIEVLSEDTDYEEDEVT------KKRKDVKKDTTDKSSKPQIKRG
          690        700       710             720       730       

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pF1KE3 KTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSSLDNKNFSSATEDEIDQCVKEKKLK
       : .  . :  .: .: :..:       .:.. :   ..:.. ::. ::: .  .:    :
CCDS31 KRRYCNTEECLKTGSPGKKEE------KAKNKESLCMENSSNSSSDEDEEETKAKMTPTK
       740       750             760       770       780       790 

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pF1KE3 RKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGSEGMKNLNFEQHFERENEGMPSLIA
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CCDS31 -KYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSD--ERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQ
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pF1KE3 ESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAMPLIGPETLVCHEVDLD-----DLD
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CCDS31 WPKKTLKELFSDS-DTEAAASPPHPAPEEGVAEESLQTVAEEESCSPSVELEKPPPVNVD
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pF1KE3 EK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--PVV---------QHNFSVASPLTL
        :   .::  ..:  .:  :: :::... ::. :  :           : . .:. ::. 
CCDS31 SKPIEEKTVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEGSRQQSSVTVSEPLAP
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CCDS31 NQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPAGFDASVSSSSSNQPEPEHPEKAC
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        :::: .:...:   .:::::.                                      
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pF1KE3 -----------PKRTSAAAKNEKNGT----------------------DELDNMNSTERI
                  : ::.. .:  :::                       ..:.::.:.:::
CCDS31 STGMKSHSTKSPARTQSPGKCGKNGDKDPDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERI
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       ..::::::::::.:.:::::::.:::::::::::.::        :.:.:... ::::::
CCDS31 TILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERE--------SAATSSSSSSPSSSS
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           :.                     
CCDS31 ITAAVMLTLAEPSMSSASQNGMSVECR
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