Result of FASTA (omim) for pF1KE4271
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4271, 1137 aa
  1>>>pF1KE4271 1137 - 1137 aa - 1137 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0227+/-0.000415; mu= 6.6084+/- 0.026
 mean_var=184.4756+/-37.177, 0's: 0 Z-trim(117.4): 16  B-trim: 218 in 1/54
 Lambda= 0.094429
 statistics sampled from 29394 (29410) to 29394 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.345), width:  16
 Scan time: 14.510

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002430 (OMIM: 600887,608089,617100) DNA mismatc (1137) 7323 1010.7       0
NP_001245210 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) D ( 868)  778 119.1 1.2e-25
XP_011531169 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) P ( 924)  778 119.1 1.3e-25
NP_000242 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA  ( 934)  778 119.1 1.3e-25
XP_005264389 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) P ( 974)  778 119.1 1.3e-25
NP_002431 (OMIM: 602105) mutS protein homolog 4 [H ( 936)  611 96.3 9.2e-19
NP_001268423 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1058)  599 94.7 3.2e-18
NP_001268422 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1058)  599 94.7 3.2e-18
NP_001268421 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1230)  599 94.7 3.6e-18
XP_011531101 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) P (1261)  599 94.7 3.7e-18
XP_011531100 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) P (1299)  599 94.8 3.8e-18
NP_000170 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) DNA  (1360)  599 94.8 3.9e-18
NP_002432 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 834)  587 93.0   8e-18
NP_751898 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 834)  587 93.0   8e-18
NP_079535 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 822)  575 91.4 2.5e-17
NP_751897 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 835)  575 91.4 2.5e-17


>>NP_002430 (OMIM: 600887,608089,617100) DNA mismatch re  (1137 aa)
 initn: 7323 init1: 7323 opt: 7323  Z-score: 5398.3  bits: 1010.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7323; 99.7% identity (100.0% similar) in 1137 aa overlap (1-1137:1-1137)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSRRKPASGGLAASSSAPARQAVLSRFFQSTGSLKSTSSSTGAADQVDPGAAAAAAAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSRRKPASGGLAASSSAPARQAVLSRFFQSTGSLKSTSSSTGAADQVDPGAAAAAAAAAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 AAPPAPPAPAFPPQLPPHVATEIDRRKKRPLENDGPVKKKVKKVQQKEGGSDLGMSGNSE
       ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AAPPAPPAPAFPPQLPPHIATEIDRRKKRPLENDGPVKKKVKKVQQKEGGSDLGMSGNSE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 PKKCLRTRNVSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLPKCTDFDDISLLHAKNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PKKCLRTRNVSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLPKCTDFDDISLLHAKNA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 VSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 QQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 GYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 TDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYAKDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYAKDT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 VDIKGSQIISGIVNLEKPVICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKMEFMTINGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VDIKGSQIISGIVNLEKPVICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKMEFMTINGT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 TLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKSEFQAIIPAVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKSEFQAIIPAVN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 SHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNEQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNEQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 GVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 HSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 AKQGDYCRPTVQEERKIVIKNGRHPVIDVLLGEQDQYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AKQGDYCRPTVQEERKIVIKNGRHPVIDVLLGEQDQYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 GKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_002 GKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTDTA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 EIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 YSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPG
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGAAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KE4 EILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
             1090      1100      1110      1120      1130       

>>NP_001245210 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA m  (868 aa)
 initn: 711 init1: 476 opt: 778  Z-score: 581.3  bits: 119.1 E(85289): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 871; 28.0% identity (61.0% similar) in 735 aa overlap (388-1094:95-786)

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
                                     .:.  :.    .. .  : :. . :.::. 
NP_001 FEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEAL
           70        80        90       100       110       120    

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE4 MSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYA
       . .. : : .::..   .: . . .  .. .:   : . .  .  :  .  .: ....  
NP_001 LIQIGPKECVLPGG---ETAGDMGKLRQI-IQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLK
          130          140       150        160       170       180

       480       490         500       510       520       530     
pF1KE4 KDTVDIKGSQIISGIV-NLEKPV-ICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKM---
             :: :. :... ..:. : . ::.:.::.:.      .::   :: :.       
NP_001 GK----KGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLE------LLSDDSNFGQFELTTFDF
                  190       200       210             220       230

             540       550        560       570       580       590
pF1KE4 -EFMTINGTTLRNLEILQNQT-DMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREI
        ..: .. ...: :...:... :   . ::  .:.. ::  :.: ...:. :::.   .:
NP_001 SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRI
              240       250       260       270       280       290

              600       610       620       630       640       650
pF1KE4 NARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKS
       . ::. :   ...        :. ::..::..:   .. ..  . :. . . . . .: .
NP_001 EERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPN
              300       310       320       330       340       350

              660       670       680       690         700        
pF1KE4 EFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNE--QAAKVGDKTELFK----
        .::.    ..: :. :: . .  . .: :   .. ....   .  .: ..  : :    
NP_001 VIQALEKHEGKH-QKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFD
              360        370       380       390       400         

            710       720         730       740            750     
pF1KE4 -DLSDF-PLIKKRKDEIQG-VIDEIR-MHLQEIRKILKNPSAQY-----VTVSGQEFMIE
        .::..  ...  . ..:. .:.  : . :.  ..:  . :::.     :: . .. . .
NP_001 PNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRN
     410       420       430       440       450       460         

         760       770       780       790       800       810     
pF1KE4 IKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFS
        :: ..  :  . ::  ..: .: ..  . ..:  . .. .. .:     : ...   . 
NP_001 NKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTS-LNEEY-TKNKTEYEEAQDAIV----KEIVNISSGYV
     470       480       490         500       510           520   

         820       830       840         850         860       870 
pF1KE4 EHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQE--ERKIVIKNGRHPVIDVLL
       : ...:  .   :: .: . :.:.:.. .   : ::.. :  . .:..: .::  ..:  
NP_001 EPMQTLNDV---LAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEV--
           530          540       550       560       570          

               880       890       900       910       920         
pF1KE4 GEQDQ--YVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATI
         ::.  ..::.. . .:..   :::::::::::.::.:...:..::::: .:: : : .
NP_001 --QDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEV
        580       590       600       610       620       630      

     930       940       950       960       970       980         
pF1KE4 GIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAI
       .::: :..:.::.:.  :: :::: :. .:: :.:.::..::.:.:::::::::.::...
NP_001 SIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGL
        640       650       660       670       680       690      

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KE4 AYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQV
       :.:  ::.   . .. .:.::.  .  :  :    :.: :.  :..:.            
NP_001 AWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALA-NQIPTVNNLHVTALTTEET-----------
        700       710       720        730       740               

    1050      1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KE4 PDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAK
          .:.:::. .:.  .:.:..::.::. : .... : .:. :::               
NP_001 ---LTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIME
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    1110      1120      1130                                       
pF1KE4 LWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH                                
                                                                   
NP_001 PAAKKCYLEREQGEKIIQEFLSKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEII
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>>XP_011531169 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) PREDI  (924 aa)
 initn: 747 init1: 476 opt: 778  Z-score: 580.9  bits: 119.1 E(85289): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 871; 28.0% identity (61.0% similar) in 735 aa overlap (388-1094:161-852)

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
                                     .:.  :.    .. .  : :. . :.::. 
XP_011 FEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEAL
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pF1KE4 MSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYA
       . .. : : .::..   .: . . .  .. .:   : . .  .  :  .  .: ....  
XP_011 LIQIGPKECVLPGG---ETAGDMGKLRQI-IQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLK
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pF1KE4 KDTVDIKGSQIISGIV-NLEKPV-ICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKM---
             :: :. :... ..:. : . ::.:.::.:.      .::   :: :.       
XP_011 GK----KGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLE------LLSDDSNFGQFELTTFDF
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pF1KE4 -EFMTINGTTLRNLEILQNQT-DMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREI
        ..: .. ...: :...:... :   . ::  .:.. ::  :.: ...:. :::.   .:
XP_011 SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRI
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pF1KE4 NARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKS
       . ::. :   ...        :. ::..::..:   .. ..  . :. . . . . .: .
XP_011 EERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPN
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pF1KE4 EFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNE--QAAKVGDKTELFK----
        .::.    ..: :. :: . .  . .: :   .. ....   .  .: ..  : :    
XP_011 VIQALEKHEGKH-QKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFD
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pF1KE4 -DLSDF-PLIKKRKDEIQG-VIDEIR-MHLQEIRKILKNPSAQY-----VTVSGQEFMIE
        .::..  ...  . ..:. .:.  : . :.  ..:  . :::.     :: . .. . .
XP_011 PNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRN
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pF1KE4 IKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFS
        :: ..  :  . ::  ..: .: ..  . ..:  . .. .. .:     : ...   . 
XP_011 NKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTS-LNEEY-TKNKTEYEEAQDAIV----KEIVNISSGYV
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pF1KE4 EHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQE--ERKIVIKNGRHPVIDVLL
       : ...:  .   :: .: . :.:.:.. .   : ::.. :  . .:..: .::  ..:  
XP_011 EPMQTLNDV---LAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEV--
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pF1KE4 GEQDQ--YVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATI
         ::.  ..::.. . .:..   :::::::::::.::.:...:..::::: .:: : : .
XP_011 --QDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEV
            650       660       670       680       690       700  

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pF1KE4 GIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAI
       .::: :..:.::.:.  :: :::: :. .:: :.:.::..::.:.:::::::::.::...
XP_011 SIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGL
            710       720       730       740       750       760  

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KE4 AYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQV
       :.:  ::.   . .. .:.::.  .  :  :    :.: :.  :..:.            
XP_011 AWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALA-NQIPTVNNLHVTALTTEET-----------
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    1050      1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KE4 PDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAK
          .:.:::. .:.  .:.:..::.::. : .... : .:. :::               
XP_011 ---LTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIME
                 820       830       840       850       860       

    1110      1120      1130                                    
pF1KE4 LWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH                             
                                                                
XP_011 PAAKKCYLERENLRVTEPKDQCLILLTWKRKLRGGKRSACSRPERQNQGSATPSASA
       870       880       890       900       910       920    

>>NP_000242 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA mism  (934 aa)
 initn: 747 init1: 476 opt: 778  Z-score: 580.8  bits: 119.1 E(85289): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 871; 28.0% identity (61.0% similar) in 735 aa overlap (388-1094:161-852)

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
                                     .:.  :.    .. .  : :. . :.::. 
NP_000 FEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEAL
              140       150       160       170       180       190

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pF1KE4 MSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYA
       . .. : : .::..   .: . . .  .. .:   : . .  .  :  .  .: ....  
NP_000 LIQIGPKECVLPGG---ETAGDMGKLRQI-IQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLK
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pF1KE4 KDTVDIKGSQIISGIV-NLEKPV-ICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKM---
             :: :. :... ..:. : . ::.:.::.:.      .::   :: :.       
NP_000 GK----KGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLE------LLSDDSNFGQFELTTFDF
            250       260       270             280       290      

             540       550        560       570       580       590
pF1KE4 -EFMTINGTTLRNLEILQNQT-DMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREI
        ..: .. ...: :...:... :   . ::  .:.. ::  :.: ...:. :::.   .:
NP_000 SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRI
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pF1KE4 NARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKS
       . ::. :   ...        :. ::..::..:   .. ..  . :. . . . . .: .
NP_000 EERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPN
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pF1KE4 EFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNE--QAAKVGDKTELFK----
        .::.    ..: :. :: . .  . .: :   .. ....   .  .: ..  : :    
NP_000 VIQALEKHEGKH-QKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFD
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pF1KE4 -DLSDF-PLIKKRKDEIQG-VIDEIR-MHLQEIRKILKNPSAQY-----VTVSGQEFMIE
        .::..  ...  . ..:. .:.  : . :.  ..:  . :::.     :: . .. . .
NP_000 PNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRN
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pF1KE4 IKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFS
        :: ..  :  . ::  ..: .: ..  . ..:  . .. .. .:     : ...   . 
NP_000 NKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTS-LNEEY-TKNKTEYEEAQDAIV----KEIVNISSGYV
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pF1KE4 EHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQE--ERKIVIKNGRHPVIDVLL
       : ...:  .   :: .: . :.:.:.. .   : ::.. :  . .:..: .::  ..:  
NP_000 EPMQTLNDV---LAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEV--
     590          600       610       620       630       640      

               880       890       900       910       920         
pF1KE4 GEQDQ--YVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATI
         ::.  ..::.. . .:..   :::::::::::.::.:...:..::::: .:: : : .
NP_000 --QDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEV
            650       660       670       680       690       700  

     930       940       950       960       970       980         
pF1KE4 GIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAI
       .::: :..:.::.:.  :: :::: :. .:: :.:.::..::.:.:::::::::.::...
NP_000 SIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGL
            710       720       730       740       750       760  

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KE4 AYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQV
       :.:  ::.   . .. .:.::.  .  :  :    :.: :.  :..:.            
NP_000 AWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALA-NQIPTVNNLHVTALTTEET-----------
            770       780       790        800       810           

    1050      1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KE4 PDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAK
          .:.:::. .:.  .:.:..::.::. : .... : .:. :::               
NP_000 ---LTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIME
                 820       830       840       850       860       

    1110      1120      1130                                       
pF1KE4 LWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH                                
                                                                   
NP_000 PAAKKCYLEREQGEKIIQEFLSKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEII
       870       880       890       900       910       920       

>>XP_005264389 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) PREDI  (974 aa)
 initn: 747 init1: 476 opt: 778  Z-score: 580.5  bits: 119.1 E(85289): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 871; 28.0% identity (61.0% similar) in 735 aa overlap (388-1094:161-852)

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
                                     .:.  :.    .. .  : :. . :.::. 
XP_005 FEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEAL
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pF1KE4 MSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYA
       . .. : : .::..   .: . . .  .. .:   : . .  .  :  .  .: ....  
XP_005 LIQIGPKECVLPGG---ETAGDMGKLRQI-IQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLK
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pF1KE4 KDTVDIKGSQIISGIV-NLEKPV-ICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKM---
             :: :. :... ..:. : . ::.:.::.:.      .::   :: :.       
XP_005 GK----KGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLE------LLSDDSNFGQFELTTFDF
            250       260       270             280       290      

             540       550        560       570       580       590
pF1KE4 -EFMTINGTTLRNLEILQNQT-DMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREI
        ..: .. ...: :...:... :   . ::  .:.. ::  :.: ...:. :::.   .:
XP_005 SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRI
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pF1KE4 NARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKS
       . ::. :   ...        :. ::..::..:   .. ..  . :. . . . . .: .
XP_005 EERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPN
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pF1KE4 EFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNE--QAAKVGDKTELFK----
        .::.    ..: :. :: . .  . .: :   .. ....   .  .: ..  : :    
XP_005 VIQALEKHEGKH-QKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFD
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            710       720         730       740            750     
pF1KE4 -DLSDF-PLIKKRKDEIQG-VIDEIR-MHLQEIRKILKNPSAQY-----VTVSGQEFMIE
        .::..  ...  . ..:. .:.  : . :.  ..:  . :::.     :: . .. . .
XP_005 PNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRN
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         760       770       780       790       800       810     
pF1KE4 IKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFS
        :: ..  :  . ::  ..: .: ..  . ..:  . .. .. .:     : ...   . 
XP_005 NKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTS-LNEEY-TKNKTEYEEAQDAIV----KEIVNISSGYV
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         820       830       840         850         860       870 
pF1KE4 EHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQE--ERKIVIKNGRHPVIDVLL
       : ...:  .   :: .: . :.:.:.. .   : ::.. :  . .:..: .::  ..:  
XP_005 EPMQTLNDV---LAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEV--
     590          600       610       620       630       640      

               880       890       900       910       920         
pF1KE4 GEQDQ--YVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATI
         ::.  ..::.. . .:..   :::::::::::.::.:...:..::::: .:: : : .
XP_005 --QDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEV
            650       660       670       680       690       700  

     930       940       950       960       970       980         
pF1KE4 GIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAI
       .::: :..:.::.:.  :: :::: :. .:: :.:.::..::.:.:::::::::.::...
XP_005 SIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGL
            710       720       730       740       750       760  

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KE4 AYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQV
       :.:  ::.   . .. .:.::.  .  :  :    :.: :.  :..:.            
XP_005 AWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALA-NQIPTVNNLHVTALTTEET-----------
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pF1KE4 PDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAK
          .:.:::. .:.  .:.:..::.::. : .... : .:. :::               
XP_005 ---LTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIME
                 820       830       840       850       860       

    1110      1120      1130                                       
pF1KE4 LWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH                                
                                                                   
XP_005 PAAKKCYLERENLRVTEPKDQCLILLTWKRKLRGGKRSACSRPERQNQGSGGDFKRKSLV
       870       880       890       900       910       920       

>>NP_002431 (OMIM: 602105) mutS protein homolog 4 [Homo   (936 aa)
 initn: 619 init1: 384 opt: 611  Z-score: 457.8  bits: 96.3 E(85289): 9.2e-19
Smith-Waterman score: 869; 26.5% identity (63.9% similar) in 739 aa overlap (388-1093:171-868)

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
                                     ::.....  . ......: :... ... :.
NP_002 YSASSSSAISAHSPSVIVAVVEGRGLARGEIGMASIDLKNPQIILSQFADNTTYAKVITK
              150       160       170       180       190       200

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pF1KE4 MSSLQPVELLLPS---ALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTE
       .. :.:.:... .   :....:. .    : .. .   .    ..  ::. ..... . .
NP_002 LKILSPLEIIMSNTACAVGNSTKLF----TLITENFKNVNFTTIQRKYFNETKGLEYIEQ
              210       220           230       240       250      

          480       490       500         510       520        530 
pF1KE4 FYAKDTVDIKGSQIISGIVNLEKPVIC--SLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQ-LSSK
       .   .   .        ......   :  ..::..::. :: ... .  :...:  ....
NP_002 LCIAEFSTV--------LMEVQSKYYCLAAVAALLKYV-EF-IQNSVYAPKSLKICFQGS
        260               270       280         290       300      

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE4 MEFMTINGTTLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREIN
        .   :.... .:::.: :. :.... .:. ::..:::  : :.:.. . .::. .. ::
NP_002 EQTAMIDSSSAQNLELLINNQDYRNNHTLFGVLNYTKTPGGSRRLRSNILEPLVDIETIN
        310       320       330       340       350       360      

             600       610       620       630         640         
pF1KE4 ARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYH--KKCSTQEFFLIVKTLYHLK
        ::: :.:.:..:   :: ... . .. : :. :  . .  :. ...     . .: .::
NP_002 MRLDCVQELLQDEELFFG-LQSVISRFLDTEQLLSVLVQIPKQDTVNAAESKITNLIYLK
        370       380        390       400       410       420     

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pF1KE4 SEFQAIIP--AVNSHIQSDLLRT-----------VILE-IPELLSPVEHYLK-ILNEQAA
         .. . :   . .. .. :::.           .::: :  ...   .:.:  :: .. 
NP_002 HTLELVDPLKIAMKNCNTPLLRAYYGSLEDKRFGIILEKIKTVINDDARYMKGCLNMRTQ
         430       440       450       460       470       480     

          700       710       720       730       740       750    
pF1KE4 KVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMI
       :      . .....:  : .:      ..:.:   .... .  . :     . :.. :.:
NP_002 KC---YAVRSNINEFLDIARR--TYTEIVDDIAGMISQLGEKYSLPLRTSFS-SARGFFI
            490       500         510       520       530          

          760           770       780        790           800     
pF1KE4 EIKNSAVSC----IPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVE-NYRHLNQLRE----QLVLDCSA
       .. .. ..     .:....:....:    : :  ... : :  ..:::      .. :. 
NP_002 QMTTDCIALPSDQLPSEFIKISKVKNSYSFTSADLIKMNERCQESLREIYHMTYMIVCK-
     540       550       560       570       580       590         

         810       820       830       840       850       860     
pF1KE4 EWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGDYCRPTVQEERKIVIKNGRHP
           .: .. :: : : :    .. .: ..:.:..   .:: ::   .   ..::.: ::
NP_002 ----LLSEIYEHIHCLYKLSDTVSMLDMLLSFAHACTLSDYVRPEFTD--TLAIKQGWHP
          600       610       620       630       640         650  

         870       880       890       900       910       920     
pF1KE4 VIDVLLGEQDQYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAE
       ... . .:.   . ::: ..: :.  .:::::::.:::.:.::.::  ::::::::::::
NP_002 ILEKISAEKP--IANNTYVTEGSN-FLIITGPNMSGKSTYLKQIALCQIMAQIGSYVPAE
            660         670        680       690       700         

         930       940       950       960       970       980     
pF1KE4 EATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHD
        ... :.  ::::... :.:  . ::::.:. . : :...:...::...:::::::.:..
NP_002 YSSFRIAKQIFTRISTDDDIETNSSTFMKEMKEIAYILHNANDKSLILIDELGRGTNTEE
     710       720       730       740       750       760         

         990      1000      1010      1020      1030      1040     
pF1KE4 GIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGT
       ::.: ::. ::.. ..:..:::.::.  .:...  : . : :.:  : :.. ..      
NP_002 GIGICYAVCEYLL-SLKAFTLFATHFLELCHIDALYPN-VENMH--FEVQHVKN------
     770       780        790       800        810                 

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pF1KE4 AEQVPDFVTFLYQITRGIAA-RSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRL
       . .  . . . :....:..  ..:::..:.....:  :.  : . . ..           
NP_002 TSRNKEAILYTYKLSKGLTEEKNYGLKAAEVSSLPPSIVLDAKEITTQITRQILQNQRST
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pF1KE4 KYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH                        
                                                                
NP_002 PEMERQRAVYHLATRLVQTARNSQLDPDSLRIYLSNLKKKYKEDFPRTEQVPEKTEE
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>>NP_001268423 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) DNA m  (1058 aa)
 initn: 814 init1: 425 opt: 599  Z-score: 448.2  bits: 94.7 E(85289): 3.2e-18
Smith-Waterman score: 1047; 27.8% identity (61.1% similar) in 960 aa overlap (230-1101:105-1029)

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE4 LSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMKQQHKDAVLCVECGYKYRFF
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NP_001 KRRDEHRRRPDHPDFDASTLYVPEDFLNSCTPGMRKWWQIKSQNFDLVICYKVGKFYELY
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pF1KE4 GEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIG
         :: :.. ::..   .  :.  ...:   .  .   :: :::::. :.::::  .    
NP_001 HMDALIGVSELGLV-FMKGNWAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGYKVARVEQTETPEMM---
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pF1KE4 DNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLI-KLDDAVNVDEI-MTDTSTSYLLCISENKEN
       . :     ::.. .   . .. ...  .: :  .. .: :   ... ..::: ..:..:.
NP_001 EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDPSENYSKYLLSLKEKEED
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pF1KE4 VRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSSLQPVELLLPSA-LSEQT
          . ..    :.  :. . :.  . .:.:.   :...: ..   ::..:. .. ::..:
NP_001 SSGHTRA---YGVCFVDTSLGKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAHYPPVQVLFEKGNLSKET
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pF1KE4 EALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTE---FYAK--DTVDIKGSQIISG
       ..... . : :.:.  :      . ... :...... :   :  :  : . .   :...:
NP_001 KTILKSSLSCSLQEGLIP----GSQFWDASKTLRTLLEEEYFREKLSDGIGVMLPQVLKG
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pF1KE4 I------VNL---EKP--VICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQ-------------
       .      ..:   ::   .. .:.. . :::.  ... : .  ::..             
NP_001 MTSESDSIGLTPGEKSELALSALGGCVFYLKKCLIDQELLSMANFEEYIPLDSDTVSTTR
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pF1KE4 ----LSSKMEFMTINGTTLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQP
           ... .. :.....:: ::::. : :. .:.:.::  .:  .: ::.: ::.:.  :
NP_001 SGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGTLLERVDTCHTPFGKRLLKQWLCAP
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pF1KE4 LLKLREINARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYH--KKCSTQEF---
       : .   :: ::::. ...   ... ... . :.::::.:: : .:..  .  ..:.    
NP_001 LCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVELLKKLPDLERLLSKIHNVGSPLKSQNHPDS
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pF1KE4 --FLIVKTLYHLKS--EFQA-------------IIPAVNSHIQSDLLRTVI-LE------
         ..  .: :  :.  .: .             :.  : . ..: .:. :: :.      
NP_001 RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKVMCKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEG
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pF1KE4 -IPELLSPVEHYLKILN-EQAAKVGDKTEL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHL
        .:.:   ....   .. :.: :.:  :    : .  :  :   :..: :....    .:
NP_001 RFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLITPKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YL
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pF1KE4 QEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEI-KNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENY
       .. :. .   .  :  .. .....:: .: ..  .: ..   .. :. .:. .  : .. 
NP_001 EKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPENFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKL
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pF1KE4 RHL---NQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD-
        .:   .. :.  . ::  .   .. .:...:..  .::. .:..: .. ::. .. :: 
NP_001 ANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNFDKNYKDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDG
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pF1KE4 -YCRPTV--QEERK--IVIKNGRHPVID-VLLGEQDQYVPNNTDLSEDSER-------VM
        .:::..   :.    . .:..::: :  ...:  :...::.  .. . :.        .
NP_001 PMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCITKTFFG--DDFIPNDILIGCEEEEQENGKAYCV
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pF1KE4 IITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTF
       ..:::::::::. ..:..:...:::.: :::::   .  .: .:::.::.: :..:.:::
NP_001 LVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQMGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTF
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pF1KE4 MEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYP
       . ::..:: :. .::..:::..:::::::.: :: ::: :... . . .:  ::: ::: 
NP_001 FVELSETASILMHATAHSLVLVDELGRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYH
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            1020      1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KE4 PVCE-LEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLN
        . :   .: . ..:  ::. .: :.: . ::.      . .::::.. .:   .:::.:
NP_001 SLVEDYSQNVAVRLG--HMACMV-ENECE-DPSQ-----ETITFLYKFIKGACPKSYGFN
      950       960          970             980       990         

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pF1KE4 VAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEET
       .:.::..: :...:. .:..:.: . .. :                              
NP_001 AARLANLPEEVIQKGHRKAREFEKMNQSLRLFREVCLASERSTVDAEAVHKLLTLIKEL 
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>>NP_001268422 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) DNA m  (1058 aa)
 initn: 814 init1: 425 opt: 599  Z-score: 448.2  bits: 94.7 E(85289): 3.2e-18
Smith-Waterman score: 1047; 27.8% identity (61.1% similar) in 960 aa overlap (230-1101:105-1029)

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE4 LSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMKQQHKDAVLCVECGYKYRFF
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NP_001 KRRDEHRRRPDHPDFDASTLYVPEDFLNSCTPGMRKWWQIKSQNFDLVICYKVGKFYELY
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pF1KE4 GEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIG
         :: :.. ::..   .  :.  ...:   .  .   :: :::::. :.::::  .    
NP_001 HMDALIGVSELGLV-FMKGNWAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGYKVARVEQTETPEMM---
          140        150       160       170       180       190   

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pF1KE4 DNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLI-KLDDAVNVDEI-MTDTSTSYLLCISENKEN
       . :     ::.. .   . .. ...  .: :  .. .: :   ... ..::: ..:..:.
NP_001 EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDPSENYSKYLLSLKEKEED
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pF1KE4 VRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSSLQPVELLLPSA-LSEQT
          . ..    :.  :. . :.  . .:.:.   :...: ..   ::..:. .. ::..:
NP_001 SSGHTRA---YGVCFVDTSLGKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAHYPPVQVLFEKGNLSKET
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pF1KE4 EALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTE---FYAK--DTVDIKGSQIISG
       ..... . : :.:.  :      . ... :...... :   :  :  : . .   :...:
NP_001 KTILKSSLSCSLQEGLIP----GSQFWDASKTLRTLLEEEYFREKLSDGIGVMLPQVLKG
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pF1KE4 I------VNL---EKP--VICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQ-------------
       .      ..:   ::   .. .:.. . :::.  ... : .  ::..             
NP_001 MTSESDSIGLTPGEKSELALSALGGCVFYLKKCLIDQELLSMANFEEYIPLDSDTVSTTR
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pF1KE4 ----LSSKMEFMTINGTTLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQP
           ... .. :.....:: ::::. : :. .:.:.::  .:  .: ::.: ::.:.  :
NP_001 SGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGTLLERVDTCHTPFGKRLLKQWLCAP
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KE4 LLKLREINARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYH--KKCSTQEF---
       : .   :: ::::. ...   ... ... . :.::::.:: : .:..  .  ..:.    
NP_001 LCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVELLKKLPDLERLLSKIHNVGSPLKSQNHPDS
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pF1KE4 --FLIVKTLYHLKS--EFQA-------------IIPAVNSHIQSDLLRTVI-LE------
         ..  .: :  :.  .: .             :.  : . ..: .:. :: :.      
NP_001 RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKVMCKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEG
      540       550       560       570       580       590        

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pF1KE4 -IPELLSPVEHYLKILN-EQAAKVGDKTEL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHL
        .:.:   ....   .. :.: :.:  :    : .  :  :   :..: :....    .:
NP_001 RFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLITPKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YL
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pF1KE4 QEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEI-KNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENY
       .. :. .   .  :  .. .....:: .: ..  .: ..   .. :. .:. .  : .. 
NP_001 EKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPENFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKL
           660       670       680       690       700       710   

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pF1KE4 RHL---NQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD-
        .:   .. :.  . ::  .   .. .:...:..  .::. .:..: .. ::. .. :: 
NP_001 ANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNFDKNYKDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDG
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pF1KE4 -YCRPTV--QEERK--IVIKNGRHPVID-VLLGEQDQYVPNNTDLSEDSER-------VM
        .:::..   :.    . .:..::: :  ...:  :...::.  .. . :.        .
NP_001 PMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCITKTFFG--DDFIPNDILIGCEEEEQENGKAYCV
              780       790       800         810       820        

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pF1KE4 IITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTF
       ..:::::::::. ..:..:...:::.: :::::   .  .: .:::.::.: :..:.:::
NP_001 LVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQMGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTF
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pF1KE4 MEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYP
       . ::..:: :. .::..:::..:::::::.: :: ::: :... . . .:  ::: ::: 
NP_001 FVELSETASILMHATAHSLVLVDELGRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYH
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pF1KE4 PVCE-LEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLN
        . :   .: . ..:  ::. .: :.: . ::.      . .::::.. .:   .:::.:
NP_001 SLVEDYSQNVAVRLG--HMACMV-ENECE-DPSQ-----ETITFLYKFIKGACPKSYGFN
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pF1KE4 VAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEET
       .:.::..: :...:. .:..:.: . .. :                              
NP_001 AARLANLPEEVIQKGHRKAREFEKMNQSLRLFREVCLASERSTVDAEAVHKLLTLIKEL 
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>>NP_001268421 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) DNA m  (1230 aa)
 initn: 814 init1: 425 opt: 599  Z-score: 447.2  bits: 94.7 E(85289): 3.6e-18
Smith-Waterman score: 1051; 26.8% identity (58.8% similar) in 1121 aa overlap (85-1101:118-1201)

           60        70        80        90        100       110   
pF1KE4 AAAAAAAAPPAPPAPAFPPQLPPHVATEIDRRKKRPLEND-GPVKKKVKKVQQKEGGSDL
                                     ::     :.: :    . :   ..::.:: 
NP_001 KSEEDNEIESEEEVQPKTQGSRRSSRQIKKRRVISDSESDIGGSDVEFKPDTKEEGSSDE
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pF1KE4 GMSG--NSE------PKKCLRTRN-VSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLP
         ::  .::      : :  : :. .  .  .::.    .  :..  :. :.. .     
NP_001 ISSGVGDSESEGLNSPVKVARKRKRMVTGNGSLKRKSSRKETPSATKQATSISSETKNTL
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pF1KE4 KCTDFDDISLLHAKNAVSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNT-----SHENLQKTASK
       .  .  . :  .:. . ...::.:       ::  :..    .      .: ... ..  
NP_001 RAFSAPQNSESQAHVSGGGDDSSRPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLY
       210       220       230       240       250       260       

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pF1KE4 SANKRSKSIYTPLELQYIEMKQQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHN
         .   .:  ::   .. ..:.:. : :.: . :  :...  :: :.. ::..   .  :
NP_001 VPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQNFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGN
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pF1KE4 FMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTL
       .  ...:   .  .   :: :::::. :.::::  .    . :     ::.. .   . .
NP_001 WAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGYKVARVEQTETPEMM---EAR----CRKMAHISKYDRV
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     340        350        360       370       380       390       
pF1KE4 IGEDVNPLI-KLDDAVNVDEI-MTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPAT
       . ...  .: :  .. .: :   ... ..::: ..:..:.   . ..    :.  :. . 
NP_001 VRREICRIITKGTQTYSVLEGDPSENYSKYLLSLKEKEEDSSGHTRA---YGVCFVDTSL
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pF1KE4 GEVVFDSFQDSASRSELETRMSSLQPVELLLPSA-LSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVE
       :.  . .:.:.   :...: ..   ::..:. .. ::..:..... . : :.:.  :   
NP_001 GKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAHYPPVQVLFEKGNLSKETKTILKSSLSCSLQEGLI---
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pF1KE4 RMDNIYFEYSHAFQAVTE---FYAK--DTVDIKGSQIISGI------VNL---EKP--VI
          . ... :...... :   :  :  : . .   :...:.      ..:   ::   ..
NP_001 -PGSQFWDASKTLRTLLEEEYFREKLSDGIGVMLPQVLKGMTSESDSIGLTPGEKSELAL
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pF1KE4 CSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQ-----------------LSSKMEFMTINGTTLR
        .:.. . :::.  ... : .  ::..                 ... .. :.....:: 
NP_001 SALGGCVFYLKKCLIDQELLSMANFEEYIPLDSDTVSTTRSGAIFTKAYQRMVLDAVTLN
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pF1KE4 NLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEVLHS
       ::::. : :. .:.:.::  .:  .: ::.: ::.:.  :: .   :: ::::. ...  
NP_001 NLEIFLNGTNGSTEGTLLERVDTCHTPFGKRLLKQWLCAPLCNHYAINDRLDAIEDLMVV
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pF1KE4 ESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYH--KKCSTQEF-----FLIVKTLYHLKS--EFQA
        ... ... . :.::::.:: : .:..  .  ..:.      ..  .: :  :.  .: .
NP_001 PDKI-SEVVELLKKLPDLERLLSKIHNVGSPLKSQNHPDSRAIMYEETTYSKKKIIDFLS
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pF1KE4 -------------IIPAVNSHIQSDLLRTVIL--------EIPELLSPVEHYLKILN-EQ
                    :.  : . ..: .:. ::         ..:.:   ....   .. :.
NP_001 ALEGFKVMCKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEK
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pF1KE4 AAKVGDKTEL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQ
       : :.:  :    : .  :  :   :..: :....    .:.. :. .   .  :  .. .
NP_001 ARKTGLITPKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YLEKQRNRIGCRTIVYWGIGRN
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pF1KE4 EFMIEI-KNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHL---NQLREQLVLDCSAE
       ....:: .: ..  .: ..   .. :. .:. .  : ..  .:   .. :.  . ::  .
NP_001 RYQLEIPENFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKLANLINAEERRDVSLKDCMRR
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pF1KE4 WLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTV--QEERK--IVIK
          .. .:...:..  .::. .:..: .. ::. .. ::  .:::..   :.    . .:
NP_001 ---LFYNFDKNYKDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFLELK
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pF1KE4 NGRHPVID-VLLGEQDQYVPNNTDLSEDSER-------VMIITGPNMGGKSSYIKQVALI
       ..::: :  ...:  :...::.  .. . :.        ...:::::::::. ..:..:.
NP_001 GSRHPCITKTFFG--DDFIPNDILIGCEEEEQENGKAYCVLVTGPNMGGKSTLMRQAGLL
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pF1KE4 TIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLV
       ..:::.: :::::   .  .: .:::.::.: :..:.:::. ::..:: :. .::..:::
NP_001 AVMAQMGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLV
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pF1KE4 ILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNY--HM
       ..:::::::.: :: ::: :... . . .:  ::: :::  . :   .::..:.    ::
NP_001 LVDELGRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYHSLVE---DYSQNVAVRLGHM
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pF1KE4 GFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKS
       . .: :.: . ::.      . .::::.. .:   .:::.:.:.::..: :...:. .:.
NP_001 ACMV-ENECE-DPSQ-----ETITFLYKFIKGACPKSYGFNAARLANLPEEVIQKGHRKA
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pF1KE4 KELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
       .:.: . .. :                                    
NP_001 REFEKMNQSLRLFREVCLASERSTVDAEAVHKLLTLIKEL       
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>>XP_011531101 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) PREDI  (1261 aa)
 initn: 814 init1: 425 opt: 599  Z-score: 447.0  bits: 94.7 E(85289): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 1051; 26.8% identity (58.8% similar) in 1121 aa overlap (85-1101:149-1232)

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pF1KE4 AAAAAAAAPPAPPAPAFPPQLPPHVATEIDRRKKRPLEND-GPVKKKVKKVQQKEGGSDL
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XP_011 KSEEDNEIESEEEVQPKTQGSRRSSRQIKKRRVISDSESDIGGSDVEFKPDTKEEGSSDE
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pF1KE4 GMSG--NSE------PKKCLRTRN-VSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLP
         ::  .::      : :  : :. .  .  .::.    .  :..  :. :.. .     
XP_011 ISSGVGDSESEGLNSPVKVARKRKRMVTGNGSLKRKSSRKETPSATKQATSISSETKNTL
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pF1KE4 KCTDFDDISLLHAKNAVSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNT-----SHENLQKTASK
       .  .  . :  .:. . ...::.:       ::  :..    .      .: ... ..  
XP_011 RAFSAPQNSESQAHVSGGGDDSSRPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLY
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pF1KE4 SANKRSKSIYTPLELQYIEMKQQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHN
         .   .:  ::   .. ..:.:. : :.: . :  :...  :: :.. ::..   .  :
XP_011 VPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQNFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGN
      300        310       320       330       340       350       

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pF1KE4 FMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTL
       .  ...:   .  .   :: :::::. :.::::  .    . :     ::.. .   . .
XP_011 WAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGYKVARVEQTETPEMM---EAR----CRKMAHISKYDRV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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