Result of FASTA (ccds) for pF1KB5914
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5914, 530 aa
  1>>>pF1KB5914     530 - 530 aa - 530 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3474+/-0.000907; mu= 13.7411+/- 0.055
 mean_var=97.1809+/-19.640, 0's: 0 Z-trim(108.1): 128  B-trim: 46 in 1/49
 Lambda= 0.130102
 statistics sampled from 10017 (10147) to 10017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.304), width:  16
 Scan time:  1.710

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14           ( 530) 3612 688.6 4.9e-198
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 495) 3206 612.3 4.1e-175
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 481) 3202 611.6 6.7e-175
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 474) 3197 610.6 1.3e-174
CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14          ( 439) 2226 428.4 8.7e-120
CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6            ( 595) 1013 200.8 3.9e-51
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11         ( 423)  787 158.3 1.7e-38
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11         ( 422)  782 157.3 3.3e-38
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1          ( 470)  763 153.8 4.2e-37
CCDS87457.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6           ( 310)  676 137.3 2.5e-32
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs109|chr11            ( 933)  605 124.3 6.3e-28
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5          ( 742)  569 117.5 5.7e-26
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5           ( 777)  569 117.5 5.9e-26
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5          ( 778)  567 117.1 7.6e-26
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX              ( 388)  541 112.1 1.3e-24
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX              ( 920)  541 112.3 2.6e-24
CCDS86887.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2          ( 535)  500 104.5 3.4e-22
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2           ( 598)  500 104.5 3.7e-22
CCDS59229.1 PGR gene_id:5241|Hs109|chr11           ( 339)  466 98.0   2e-20
CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9           ( 626)  459 96.8 8.1e-20
CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9           ( 637)  459 96.8 8.2e-20
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs109|chr19         ( 404)  443 93.7 4.5e-19
CCDS58060.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1          ( 396)  414 88.2 1.9e-17
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1           ( 435)  395 84.7 2.5e-16
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1          ( 458)  395 84.7 2.6e-16
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs109|chr14          ( 508)  394 84.5 3.2e-16
CCDS44261.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1          ( 340)  384 82.6 8.4e-16
CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1           ( 348)  383 82.4 9.8e-16
CCDS41429.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1          ( 357)  382 82.2 1.1e-15
CCDS41430.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1          ( 352)  377 81.3 2.2e-15
CCDS44260.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1          ( 339)  374 80.7 3.1e-15
CCDS86200.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11        ( 342)  353 76.7 4.8e-14
CCDS44584.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11        ( 387)  353 76.8 5.3e-14
CCDS44585.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11        ( 402)  353 76.8 5.5e-14
CCDS7929.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11         ( 447)  353 76.8   6e-14
CCDS73285.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11        ( 453)  353 76.8   6e-14
CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17          ( 462)  342 74.8 2.6e-13
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6            ( 533)  340 74.4 3.7e-13
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6           ( 537)  340 74.4 3.8e-13
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs109|chr4           ( 984)  343 75.1 4.2e-13
CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17          ( 457)  334 73.3 7.2e-13
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12          ( 598)  334 73.3   9e-13
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12         ( 611)  334 73.3 9.1e-13
CCDS54811.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs109|chr4          ( 867)  336 73.8 9.4e-13
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12         ( 652)  334 73.3 9.6e-13
CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs109|chr6          ( 422)  330 72.5 1.1e-12
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs109|chr1           ( 340)  328 72.1 1.2e-12
CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12          ( 382)  328 72.1 1.4e-12
CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12          ( 443)  328 72.1 1.5e-12
CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12           ( 454)  328 72.1 1.6e-12


>>CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14                (530 aa)
 initn: 3612 init1: 3612 opt: 3612  Z-score: 3669.0  bits: 688.6 E(33420): 4.9e-198
Smith-Waterman score: 3612; 100.0% identity (100.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
              490       500       510       520       530

>>CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14               (495 aa)
 initn: 3197 init1: 3197 opt: 3206  Z-score: 3257.6  bits: 612.3 E(33420): 4.1e-175
Smith-Waterman score: 3206; 96.7% identity (98.8% similar) in 489 aa overlap (1-486:1-489)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460        470         
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHA-SNKGMEHL--L
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:. . :  .
CCDS32 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARAEKASQTLTSF
              430       440       450       460       470       480

       480       490       500       510       520       530
pF1KB5 NMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
       .:: ....:                                            
CCDS32 GMKMETLLPEATMEQ                                      
              490                                           

>>CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14               (481 aa)
 initn: 3197 init1: 3197 opt: 3202  Z-score: 3253.7  bits: 611.6 E(33420): 6.7e-175
Smith-Waterman score: 3202; 97.9% identity (99.2% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-479)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
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pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
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pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
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pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
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pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   : ......:
CCDS55 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHAR-WGEKQFIHLK
              430       440       450       460        470         

              490       500       510       520       530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
                                                         
CCDS55 LS                                                
     480                                                 

>>CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14               (474 aa)
 initn: 3197 init1: 3197 opt: 3197  Z-score: 3248.7  bits: 610.6 E(33420): 1.3e-174
Smith-Waterman score: 3197; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:1-468)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
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pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
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pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS61 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARSCVYK      
              430       440       450       460       470          

              490       500       510       520       530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ

>>CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14               (439 aa)
 initn: 2253 init1: 2226 opt: 2226  Z-score: 2264.2  bits: 428.4 E(33420): 8.7e-120
Smith-Waterman score: 2812; 82.8% identity (82.8% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-439)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
       ::::::::::::::::::                                          
CCDS61 LADKELVHMISWAKKIPG------------------------------------------
              310                                                  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
                                                        :::::::::::
CCDS61 -------------------------------------------------MYPLVTATQDA
                                                       320         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
     330       340       350       360       370       380         

              490       500       510       520       530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
     390       400       410       420       430         

>>CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6                 (595 aa)
 initn: 1276 init1: 641 opt: 1013  Z-score: 1031.8  bits: 200.8 E(33420): 3.9e-51
Smith-Waterman score: 1593; 48.2% identity (72.0% similar) in 558 aa overlap (17-529:27-578)

                         10        20          30          40      
pF1KB5           MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSSY--VDSHHEYPAM
                                 :  :  .:::.  : .:. ::   : .. :  :.
CCDS52 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
               10        20        30        40        50        60

         50        60        70                          80        
pF1KB5 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
        : . :. : .. .. :.:  ::: .                  . :: .:   : .:::
CCDS52 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
               70         80        90       100       110         

       90        100         110       120       130       140     
pF1KB5 LVV-HRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
       ..  : :    : : . : .   ::       : : .. .:. . .: :: ..  ::   
CCDS52 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
     120       130       140       150         160        170      

              150       160       170       180       190       200
pF1KB5 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
          .....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS52 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
        180       190       200       210       220       230      

              210       220       230            240        250    
pF1KB5 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
       ::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :.     ..  ::  . ..   .: 
CCDS52 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
        240       250       260       270       280       290      

               260       270       280         290       300       
pF1KB5 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
       .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .: :.  :. ::.:::::  ::.:::.:::
CCDS52 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
        300       310       320        330       340       350     

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB5 HMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEG
       :::.:::..::::.:.: :::.:::  :.:.::.::.:::..:::::.:::.:.:::..:
CCDS52 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
         360       370       380       390       400       410     

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB5 KCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLA
       :::::..:::::::::.:::: ..:: .:..:.:..:::::..: ....:  .   .   
CCDS52 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
         420       430       440       450       460       470     

        430       440       450       460       470       480      
pF1KB5 H-LLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMKCKNVVP
       : .:. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.:: :::::::: .::::::::
CCDS52 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVP
         480       490       500       510       520       530     

        490       500       510        520       530               
pF1KB5 VYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSK-SKEGSQNPQSQ               
       .::::::::.:: :..  .:  :.    ...:. .  :: . .:                
CCDS52 LYDLLLEMLDAHRLHA-PTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPAT
         540       550        560       570       580       590    

CCDS52 V
        

>>CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11              (423 aa)
 initn: 597 init1: 560 opt: 787  Z-score: 804.8  bits: 158.3 E(33420): 1.7e-38
Smith-Waterman score: 787; 40.3% identity (64.4% similar) in 357 aa overlap (148-497:78-420)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
                                     .: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS41 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
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pF1KB5 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
       ::  .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .:  : :   ..:   
CCDS41 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
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        240            250       260       270       280        290
pF1KB5 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
       . :       ::    .::  ::     ..:     ::  :: .:: ..  .  :..:  
CCDS41 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PRKTAAPVNA-----LVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
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pF1KB5 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
       .   . .:  : :.:.:  :::::.::::  ::: ::. .:.: :::::..:.  ::.  
CCDS41 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
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pF1KB5 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
         .: :: ::::: .::  . :. :.   ::  . :.. :.:...::. .::. : ::. 
CCDS41 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
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pF1KB5 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASN
         .    .::.. ..: . :. .   : .  ...: ..  .  : . ::. :  .:....
CCDS41 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
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pF1KB5 KGMEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
       : . :. ..: .. ::.. :.::::.:                                 
CCDS41 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD                              
           400       410       420                                 

>>CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11              (422 aa)
 initn: 628 init1: 368 opt: 782  Z-score: 799.7  bits: 157.3 E(33420): 3.3e-38
Smith-Waterman score: 782; 40.3% identity (64.7% similar) in 357 aa overlap (148-497:78-419)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
                                     .: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS60 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
        50        60        70        80        90       100       

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pF1KB5 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
       ::  .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .:  : :   ..:   
CCDS60 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
       110       120       130       140       150       160       

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pF1KB5 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
       . :       ::    .::  :: .   ..:     ::  :: .:: ..  .  :..:  
CCDS60 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PR-KTAPVNA-----LVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
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pF1KB5 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
       .   . .:  : :.:.:  :::::.::::  ::: ::. .:.: :::::..:.  ::.  
CCDS60 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
     220       230       240       250       260       270         

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pF1KB5 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
         .: :: ::::: .::  . :. :.   ::  . :.. :.:...::. .::. : ::. 
CCDS60 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
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pF1KB5 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASN
         .    .::.. ..: . :. .   : .  ...: ..  .  : . ::. :  .:....
CCDS60 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
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pF1KB5 KGMEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
       : . :. ..: .. ::.. :.::::.:                                 
CCDS60 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD                              
            400       410       420                                

>>CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1               (470 aa)
 initn: 785 init1: 377 opt: 763  Z-score: 779.7  bits: 153.8 E(33420): 4.2e-37
Smith-Waterman score: 855; 39.8% identity (70.9% similar) in 357 aa overlap (148-499:132-470)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
                                     .: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS58 VRKLYDDCSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKRLCLVCGDIASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
             110       120       130       140       150       160 

       180       190       200       210       220         230     
pF1KB5 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSR--RERCGYRLVRRQRSA
       ::. .: :::::.: : : :::::::::. :: .:::.: : :  : : : .  .:. .:
CCDS58 QGNIEYSCPATNECEITKRRRKSCQACRFMKCLKVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRIDA
             170       180       190       200       210       220 

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pF1KB5 DEQLHCAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFTEASM
       ... .   .  .     :  . :: .  . ...:  :: ::: ..  .  :..: .. . 
CCDS58 ENSPYLNPQLVQ-----PAKKPLLWSDPADNKIVSHLLVAEPEKIYAMPDPTVPDSDIKA
             230            240       250       260       270      

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pF1KB5 MMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKL
       . .:  :::.::: .:.:::.::::  ::: ::. ::.: :::.:..:...::..   .:
CCDS58 LTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSTLSLADQMSLLQSAWMEILILGVVYRSLSFEDEL
        280       290       300       310       320       330      

          360       370       380       390       400        410   
pF1KB5 IFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNS-SMYPL
       ..: : ..:.:..: . :.:.. . .:  ..... .::...:.. .::. : :: ::.  
CCDS58 VYADDYIMDEDQSK-LAGLLDLNNAILQLVKKYKSMKLEKEEFVTLKAIALANSDSMH--
        340       350        360       370       380       390     

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pF1KB5 VTATQDADSSRKLAHLLN-AVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKG
           .:... .::  .:. :. :       ..: . ...  : ...:: :  .:..:.:.
CCDS58 ---IEDVEAVQKLQDVLHEALQDY------EAG-QHMEDPRRAGKMLMTLPLLRQTSTKA
              400       410              420       430       440   

            480       490       500       510       520       530
pF1KB5 MEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
       ..:. :.: .. ::.. :.::::.:.:                               
CCDS58 VQHFYNIKLEGKVPMHKLFLEMLEAKV                               
           450       460       470                               

>>CCDS87457.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6                (310 aa)
 initn: 1207 init1: 615 opt: 676  Z-score: 694.2  bits: 137.3 E(33420): 2.5e-32
Smith-Waterman score: 1209; 61.0% identity (85.1% similar) in 282 aa overlap (142-410:5-285)

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB5 SLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKA
                                     : .....::::.::::::::::::::::::
CCDS87                           MAMESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKA
                                         10        20        30    

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB5 FFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRR
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: : :..: : :....
CCDS87 FFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKH
           40        50        60        70        80        90    

                  240        250            260       270       280
pF1KB5 QRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPRV-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHV
       .:. :.     ..  ::  . ..   .: .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .
CCDS87 KRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLMIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-I
          100       110       120       130       140       150    

                290       300       310       320       330        
pF1KB5 LISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEV
       : :.  :. ::.:::::  ::.:::.::::::.:::..::::.:.: :::.:::  :.:.
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