Result of FASTA (ccds) for pF1KE3369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3369, 1089 aa
  1>>>pF1KE3369     1089 - 1089 aa - 1089 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9787+/-0.00192; mu= -22.0845+/- 0.107
 mean_var=615.8491+/-146.411, 0's: 0 Z-trim(103.4): 345  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.051682
 statistics sampled from 7126 (7403) to 7126 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.227), width:  16
 Scan time:  3.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4          (1089) 7141 549.9 1.1e-155
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5          (1106) 3019 242.6 3.6e-63
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4            ( 972)  822 78.7 6.8e-14
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4             ( 976)  822 78.8 6.8e-14
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13           (1338)  773 75.2 1.1e-12
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13          ( 993)  765 74.5 1.3e-12
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5           ( 972)  756 73.8 2.1e-12
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5           (1298)  754 73.8 2.8e-12
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5            (1363)  754 73.8 2.9e-12
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4             (1356)  750 73.5 3.6e-12


>>CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4               (1089 aa)
 initn: 7141 init1: 7141 opt: 7141  Z-score: 2908.6  bits: 549.9 E(32554): 1.1e-155
Smith-Waterman score: 7141; 100.0% identity (100.0% similar) in 1089 aa overlap (1-1089:1-1089)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 MSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 TFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 EVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 EMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 TEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 VDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 RSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIVII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIVII
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 SLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 SGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 LGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 VILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 LLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 RDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 VDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 SYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYII
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 PLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGSSSSTFIKREDETIEDIDMMDDIGIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGSSSSTFIKREDETIEDIDMMDDIGIDS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

                
pF1KE3 SDLVEDSFL
       :::::::::
CCDS34 SDLVEDSFL
                

>>CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5               (1106 aa)
 initn: 2551 init1: 996 opt: 3019  Z-score: 1247.5  bits: 242.6 E(32554): 3.6e-63
Smith-Waterman score: 3019; 45.7% identity (72.5% similar) in 1071 aa overlap (6-1057:8-1059)

                 10        20           30         40        50    
pF1KE3   MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILC---QLSLPSIL-PNENEKVVQLNSSFSLRCFGESE
              ::. . : ::  :::.:    :.:   .. :   : :....:.: : : : . 
CCDS43 MRLPGAMPALALKGELLL-LSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAP
               10         20        30        40        50         

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE3 VSWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEG
       : :.  ::.:  ...     . ..: : .:: ... ..  :: : : .: ..  :.. : 
CCDS43 VVWER-MSQEPPQEMA----KAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGLETD-ER
      60         70            80        90       100       110    

          120       130       140       150       160         170  
pF1KE3 RHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVV--PASY
       ...::.:::: :.:.:    . .... .     ::::.:::.  ::::...: :  :. :
CCDS43 KRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVALPVPY
           120       130       140       150       160       170   

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE3 DSRQGFNGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIV
       : ..::.: :    :::..:.  .. ..  . :: :...: ... ..:..:: ..::.:.
CCDS43 DHQRGFSGIFEDRSYICKTTIGDREVDSDAYYVYRLQVSS-INVSVNAVQTVVRQGENIT
           180       190       200       210        220       230  

            240       250       260         270       280       290
pF1KE3 VTCAVFNNEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEE--IKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYEC
       . : :..::::...:::: . .:. .  . .  . .:  ..   : .: : ..::: : :
CCDS43 LMCIVIGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMP-YHIRSILHIPSAELEDSGTYTC
            240       250       260        270       280       290 

              300       310       320       330       340       350
pF1KE3 AARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWL
        . ... . .. : ..:.: :.:....    . :. ..::. . . :  .::::: . :.
CCDS43 NVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWF
             300       310       320       330       340       350 

              360        370       380       390       400         
pF1KE3 KNNLTLIENLT-EITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFEL
       :.: :: .. . ::. ......: :: :.: :.:.:  ..::::. : .:::  . .:.:
CCDS43 KDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQL
             360       370       380       390       400       410 

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE3 LTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANN-
         .::  .:.: ..:  : : ::::: ..: : :.: :  :.:.:.:  :   :.:.:. 
CCDS43 QINVPVRVLELSESHPDS-GEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLLGNSS
             420        430       440       450       460       470

           470       480       490       500       510       520   
pF1KE3 -----VSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRS
            . . .:  . ...  : . . . .:.. ..:::  .: .: ...:. .:  .:  
CCDS43 EEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPF
              480       490       500       510       520       530

           530       540       550       560       570       580   
pF1KE3 ELTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYD
       ...: .:.:.:.:..:::::.:...:..::::::::.::::.: ::::::::::::::::
CCDS43 KVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYD
              540       550       560       570       580       590

           590       600       610       620       630       640   
pF1KE3 SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMS
       : ::.::: :::::.:::::::.:::.::.:::.:: .::::::::: ::::::::::::
CCDS43 STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMS
              600       610       620       630       640       650

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE3 ELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEK---
       :::::.:::::::.:::::::::.:::::::::: :::::.:::.:. .::.:: .:   
CCDS43 ELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRP
              660       670       680       690       700       710

              710       720       730       740       750       760
pF1KE3 PKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRS
       :. ::   .: :.     :.: :. :..: ::::.. ....:::::. :   ::.::. :
CCDS43 PSAELYSNAL-PVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESS
              720        730       740       750       760         

              770       780       790       800       810       820
pF1KE3 LYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLA
        :  : .    :  .   .  : .. :  :. .::..:.:::: ::::::::::::::::
CCDS43 NYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINE-SPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLA
     770       780       790        800       810       820        

              830       840       850       860       870       880
pF1KE3 ARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWS
       :::::. .::.:::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::..::::::::::
CCDS43 ARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWS
      830       840       850       860       870       880        

              890       900       910       920       930       940
pF1KE3 YGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKR
       .::::::::.::::::: . ..  ::: :: :::::.: ::..:.:::: :::. . : :
CCDS43 FGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIR
      890       900       910       920       930       940        

              950       960       970       980       990      1000
pF1KE3 PSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKL
       : : .:  ..: ::   :::.:...  .::.:::::. : ..   . . :.  ..  :  
CCDS43 PPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPG-FHGL--RSPLDTS
      950       960       970       980       990         1000     

             1010      1020      1030       1040      1050         
pF1KE3 KDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGK-RNRHSSQTSEESAIETGSSSSTF
       .    ... ..  .:. :::::::  : ::  : :  ..  :  .:  . ..:.:. :  
CCDS43 SVLYTAVQPNE--GDNDYIIPLPD--PKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCD
        1010        1020        1030      1040      1050      1060 

    1060      1070      1080                        
pF1KE3 IKREDETIEDIDMMDDIGIDSSDLVEDSFL               
                                                    
CCDS43 SPLEPQDEPEPEPQLELQVEPEPELEQLPDSGCPAPRAEAEDSFL
            1070      1080      1090      1100      

>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4                 (972 aa)
 initn: 1503 init1: 788 opt: 822  Z-score: 362.9  bits: 78.7 E(32554): 6.8e-14
Smith-Waterman score: 1866; 36.5% identity (64.2% similar) in 987 aa overlap (26-984:35-955)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE3      MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEV
                                     : ::: :.... .:.... . : :   . :
CCDS47 RGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFV
           10        20        30        40        50        60    

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE3 SWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGR
       .: . . .: .        ::... ..:     .: :..:: :::  .:  ..       
CCDS47 KWTFEILDETN--------ENKQNEWIT----EKAEATNTGKYTCTNKHGLSNS------
           70                80            90       100            

         120       130       140       150        160        170   
pF1KE3 HIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPE-TPVTLHNSEGV-VPASY-
        ::..: ::   :    ..:  .  ..:..... :  :::: :  .:.. .:  .: .  
CCDS47 -IYVFVRDPAKLF----LVDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLR
         110           120       130       140       150       160 

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pF1KE3 ---DSRQGFNGTFTVGPYI-----CEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTV
          : . :.    .   :      : .  .::.  .  : . .  : . . . . . :. 
CCDS47 FIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV-VSVSKAS
             170       180       190       200       210        220

            230        240       250       260       270           
pF1KE3 Y--KSGETIVVTCAVFN-NEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIK---LVY----T
       :  . :: ..:::.. . .  :   :      . .. : :.: :  : .   . :    :
CCDS47 YLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWK-----RENSQTKLQE-KYNSWHHGDFNYERQAT
              230       240            250        260       270    

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE3 LTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKH
       ::.  : :.::: . : : ..   ..    .:. : .::::.: : ..    ::  :   
CCDS47 LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANV--TTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVD
          280       290       300         310       320       330  

          340        350       360       370       380       390   
pF1KE3 FVVEVRAYPPPR-ISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYT
       ..:: .:.: :.  .:.  : :. ..  .   . :. ..::: :.:.: : :  ..: ::
CCDS47 LIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKS-ENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYT
            340       350       360        370       380       390 

           400       410       420       430       440       450   
pF1KE3 IVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDI
       ....: :.  . .:.. ...   ::     .   ..:. ..:.: : : : :.:..:   
CCDS47 FLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILT----YDRLVNGM-LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGT
             400       410           420        430       440      

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE3 -KKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENR
        ..:    : ..:  .:... .      . .:.. .  .  ... .:.: : : .:  . 
CCDS47 EQRC----SASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSA
        450           460       470       480       490       500  

            520       530         540       550         560        
pF1KE3 ELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIV--IISLIVLVVIWK--QKPRYEIRWRVIESISPD
        ....        :. . .:. .:::  .. .::... .:  ::: ::..:.:.: :  .
CCDS47 YFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEI--N
            510       520       530       540       550         560

      570       580       590       600       610       620        
pF1KE3 GHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKM
       :..:.:.:: ::::: .:::::. : .:..::.::::::::.::::: .:. .: :::::
CCDS47 GNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKM
              570       580       590       600       610       620

      630       640       650       660       670       680        
pF1KE3 LKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHK
       :::.:. .:..:::::::....:: :.:::::::::: .::  .::::: ::::.:.:..
CCDS47 LKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRR
              630       640       650       660       670       680

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pF1KE3 NRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLER
       .::::.  . :   .     .:  . ::. :      .....::::: .  ..::     
CCDS47 KRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCS------DSTNEYMDMKPG--VSYV-----
              690       700       710             720              

      750       760       770       780       790       800        
pF1KE3 KEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEF
         :   .: .::.  : .::     .. .:   . .:.  .: : :::::.::::.:: :
CCDS47 --VPTKADKRRSV--RIGSY-----IERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAF
         730         740            750       760       770        

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE3 LASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIF
       ::::::.::::::::.::..:.:.::::::::::: .::::: ::.. ::::::::::::
CCDS47 LASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIF
      780       790       800       810       820       830        

      870       880       890       900       910       920        
pF1KE3 DNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEI
       . .::  ::::::::.:::.::::..::::: ::: ::. :: :.:: .:.:: .:.:.:
CCDS47 NCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDI
      840       850       860       870       880       890        

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pF1KE3 MVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVAR-MRVDSDNA
       :  ::...: :::.: .. ...:. .  . .. : ..     . ..:.: . .:..:   
CCDS47 MKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGS
      900       910       920       930       940       950        

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KE3 YIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEE
                                                                   
CCDS47 TASSSQPLLVHDDV                                              
      960       970                                                

>>CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4                  (976 aa)
 initn: 1503 init1: 788 opt: 822  Z-score: 362.9  bits: 78.8 E(32554): 6.8e-14
Smith-Waterman score: 1857; 36.4% identity (64.2% similar) in 991 aa overlap (26-984:35-959)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE3      MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEV
                                     : ::: :.... .:.... . : :   . :
CCDS34 RGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFV
           10        20        30        40        50        60    

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE3 SWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGR
       .: . . .: .        ::... ..:     .: :..:: :::  .:  ..       
CCDS34 KWTFEILDETN--------ENKQNEWIT----EKAEATNTGKYTCTNKHGLSNS------
           70                80            90       100            

         120       130       140       150        160        170   
pF1KE3 HIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPE-TPVTLHNSEGV-VPASY-
        ::..: ::   :    ..:  .  ..:..... :  :::: :  .:.. .:  .: .  
CCDS34 -IYVFVRDPAKLF----LVDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLR
         110           120       130       140       150       160 

               180            190       200       210       220    
pF1KE3 ---DSRQGFNGTFTVGPYI-----CEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTV
          : . :.    .   :      : .  .::.  .  : . .  : . . . . . :. 
CCDS34 FIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV-VSVSKAS
             170       180       190       200       210        220

            230        240       250       260       270           
pF1KE3 Y--KSGETIVVTCAVFN-NEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIK---LVY----T
       :  . :: ..:::.. . .  :   :      . .. : :.: :  : .   . :    :
CCDS34 YLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWK-----RENSQTKLQE-KYNSWHHGDFNYERQAT
              230       240            250        260       270    

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE3 LTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKH
       ::.  : :.::: . : : ..   ..    .:. : .::::.: : ..    ::  :   
CCDS34 LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANV--TTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVD
          280       290       300         310       320       330  

          340        350       360       370       380       390   
pF1KE3 FVVEVRAYPPPR-ISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYT
       ..:: .:.: :.  .:.  : :. ..  .   . :. ..::: :.:.: : :  ..: ::
CCDS34 LIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKS-ENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYT
            340       350       360        370       380       390 

           400       410       420       430       440       450   
pF1KE3 IVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDI
       ....: :.  . .:.. ...   ::     .   ..:. ..:.: : : : :.:..:   
CCDS34 FLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILT----YDRLVNGM-LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGT
             400       410           420        430       440      

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE3 -KKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENR
        ..:    : ..:  .:... .      . .:.. .  .  ... .:.: : : .:  . 
CCDS34 EQRC----SASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSA
        450           460       470       480       490       500  

            520           530         540       550         560    
pF1KE3 ELKLVAPTLRSEL----TVAAAVLVLLVIV--IISLIVLVVIWK--QKPRYEIRWRVIES
        ....     .:     :. . .:. .:::  .. .::... .:  ::: ::..:.:.: 
CCDS34 YFNFAFKGNNKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEE
            510       520       530       540       550       560  

          570       580       590       600       610       620    
pF1KE3 ISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKV
       :  .:..:.:.:: ::::: .:::::. : .:..::.::::::::.::::: .:. .: :
CCDS34 I--NGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTV
              570       580       590       600       610       620

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pF1KE3 AVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVN
       :::::::.:. .:..:::::::....:: :.:::::::::: .::  .::::: ::::.:
CCDS34 AVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLN
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pF1KE3 YLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVP
       .:...::::.  . :   .     .:  . ::. :      .....::::: .  ..:: 
CCDS34 FLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCS------DSTNEYMDMKPG--VSYV-
              690       700       710             720         730  

          750       760       770       780       790       800    
pF1KE3 MLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVAR
             :   .: .::.  : .::     .. .:   . .:.  .: : :::::.::::.
CCDS34 ------VPTKADKRRSV--RIGSY-----IERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAK
                   740              750       760       770        

          810       820       830       840       850       860    
pF1KE3 GMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAP
       :: :::::::.::::::::.::..:.:.::::::::::: .::::: ::.. ::::::::
CCDS34 GMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAP
      780       790       800       810       820       830        

          870       880       890       900       910       920    
pF1KE3 ESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSE
       ::::. .::  ::::::::.:::.::::..::::: ::: ::. :: :.:: .:.:: .:
CCDS34 ESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAE
      840       850       860       870       880       890        

          930       940       950       960       970        980   
pF1KE3 VYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVAR-MRVD
       .:.::  ::...: :::.: .. ...:. .  . .. : ..     . ..:.: . .:..
CCDS34 MYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRIN
      900       910       920       930       940       950        

           990      1000      1010      1020      1030      1040   
pF1KE3 SDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQ
       :                                                           
CCDS34 SVGSTASSSQPLLVHDDV                                          
      960       970                                                

>>CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13                (1338 aa)
 initn: 1325 init1: 764 opt: 773  Z-score: 341.4  bits: 75.2 E(32554): 1.1e-12
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                           10        20        30        40        
pF1KE3             MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLR
                                     ..:  :.: :  .     ... :: . .  
CCDS93 TYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTP
       200       210       220       230       240       250       

       50        60        70          80        90       100      
pF1KE3 CFGESEVSWQYPMSEEESSDVEIRNEENNS--GLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQ
          . ...:.::  ... ..:. : ...::  ..: .:: ... .    :::::      
CCDS93 LNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGP
       260       270       280       290       300       310       

        110       120       130         140       150       160    
pF1KE3 TEENELEGRHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVI--VEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNS
       . ..   . :::      : ::. .      :.  :    :  .  ..    .: ..  .
CCDS93 SFKSVNTSVHIY------DKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVKAFPSPEVVWLK
       320             330       340       350       360       370 

          170                      180       190       200         
pF1KE3 EGVVPASYDS----RQGFN-----------GTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNV----
       .:. ::.  :     .:..           :..:.   : ...:  .   :.  ::    
CCDS93 DGL-PATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTATLIVNVKPQI
              380       390       400       410       420       430

         210       220       230       240        250              
pF1KE3 YALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNNEVVDLQWTY-P-----GEVKGKGIT
       :   ..:  :       ..:  :   ..::....     ..: . :     .:..    .
CCDS93 YEKAVSSFPD------PALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARCDFCS
              440             450       460       470       480    

     260                             270       280       290       
pF1KE3 MLEEI-----------KVPSI-----------KLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATR
         ::            .. ::           :.. ::.: .. .  :: : : : . . 
CCDS93 NNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRI--SGIYICIASNKVG
          490       500       510       520         530       540  

       300       310        320       330        340       350     
pF1KE3 EVKEMKKVTISVHEKGF-IEIKPTFSQLEAVNLH-EVKHFVVEVRAYPPPRISWLK----
        : .  .  :.   .:: ....   .. : ..:   :..:. .        ..:.     
CCDS93 TVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYR-------DVTWILLRTV
            550       560       570       580              590     

             360       370       380       390           400       
pF1KE3 NNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQN----EDAVKSYTF
       :: :.  ....    . : . :    .: .. .. .::: :.  :.:    :. ...  .
CCDS93 NNRTMHYSISKQKMAITKEHSITL--NLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEI
         600       610         620       630       640       650   

       410       420        430       440       450       460      
pF1KE3 ELLTQVPSSILDLVDDHHGS-TGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILA
        .  :    .:  ..::  . ... :. : :.:.: :.: :.  :. .: ..: .  ::.
CCDS93 TIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWF--KNNHKIQQEPG-IILG
           660       670       680       690         700        710

        470       480       490       500         510       520    
pF1KE3 NNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGA--ENRELKLVAPTLRSE
        . :... :           :::    :.  . .: : :  :.   .  : . . . .:.
CCDS93 PGSSTLFIE-----------RVT---EEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSN
                         720          730       740       750      

          530       540       550        560       570         580 
pF1KE3 LTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQK-PRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPM--QLP
       : . . . . .. ... :.. . : :.:    ::.   . ::  :  : . .: .  .::
CCDS93 LELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSSEIKTDYL-SIIMDPDE-VPLDEQCERLP
        760       770       780       790        800        810    

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pF1KE3 YD-SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQA
       :: :.::: :. : ::. :: :::::::...:.:...:     :::::::  : .:: .:
CCDS93 YDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKA
          820       830       840       850       860       870    

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pF1KE3 LMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSG-PIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPE
       ::.::::.::.: :::.:::::::::.: :...:.::: ::.: :::...:: :.     
CCDS93 LMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFF-----
          880       890       900       910       920              

     700       710       720       730       740       750         
pF1KE3 KPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQR
                 ::  : .      : .: . . :.          : ::. .  . ...  
CCDS93 ----------LNK-DAA------LHMEPKKEKME----------PGLEQGKKPRLDSVTS
               930              940                 950       960  

     760       770        780       790       800       810        
pF1KE3 SLYDRPASYKK-KSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRD
       :     ..... ::. : : ..  .   .: .:. ::.:...:::::::::.:..:.:::
CCDS93 SESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRD
            970       980       990      1000      1010      1020  

      820       830       840       850       860       870        
pF1KE3 LAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDV
       :::::.::.....::::::::::::... .:: ::.: ::.::::::::::..:.: :::
CCDS93 LAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDV
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

      880       890       900       910       920       930        
pF1KE3 WSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPE
       ::::.::::::::::.::::...:  : .... :.::  :...: :.:.::. ::. .:.
CCDS93 WSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPK
           1090      1100      1110      1120      1130      1140  

      940       950       960       970       980       990        
pF1KE3 KRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEED
       .:: : .: : . .:: .. ..                                      
CCDS93 ERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISAPK
           1150      1160      1170      1180      1190      1200  

>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13               (993 aa)
 initn: 1327 init1: 740 opt: 765  Z-score: 339.8  bits: 74.5 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 1465; 33.6% identity (60.5% similar) in 917 aa overlap (61-965:133-958)

               40        50        60          70        80        
pF1KE3 LPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYPMSEEESSD--VEIRNEENNSGLFVTVLEVS
                                     :.: ....  . :..: .:  .. ::    
CCDS31 CLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFIQSEATNYTILFTV----
            110       120       130       140       150            

       90       100       110       120       130       140        
pF1KE3 SASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAII
         :  .: :::    . .  ::.     :   ::.: : .:              ::   
CCDS31 --SIRNTLLYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVEWVLC------------DSQGE
        160       170       180       190                   200    

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE3 PCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYAL
        :.    :.:..... : :.          .  : .    :  .  :..   . :..  :
CCDS31 SCK---EESPAVVKKEEKVL----------HELFGTDIRCCARNELGRECTRL-FTI-DL
             210       220                 230       240           

      210       220       230        240       250         260     
pF1KE3 KATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTC-AVFNNEVVDLQWTYPGEV--KGKGITM-LEEI
       . : .  : .  ::.    :: . . : ::  :.   : :   ...  .:. . :     
CCDS31 NQTPQTTLPQLFLKV----GEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEMSTYST
     250       260           270       280       290       300     

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE3 KVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQL
       .   :...... :  .. .:.: : :.. .     .  ... ... :::::.   .  . 
CCDS31 NRTMIRILFAF-VSSVARNDTGYYTCSSSK-----HPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDY
         310        320       330            340       350         

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE3 EAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRA
       : .. .:   : :. .:::  : .:         .... .   :.       :  :.   
CCDS31 E-IDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCTW---------TFSRKSFPCEQKGLDNGYSISKFCNH
     360        370       380                390       400         

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE3 KEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPD
       :..  :.: . :.:.::  .  : :  .   ..:  ..  ..:       : ..: :::.
CCDS31 KHQP-GEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQAS-------CFSDGYPLPS
     410        420       430       440       450              460 

          450        460       470       480       490       500   
pF1KE3 IEWMICKDIK-KCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLA
         :  :.: . .:..: .  .  :  .:   .. ..  :.  . ...... . . :.: :
CCDS31 WTWKKCSDKSPNCTEEITEGVW-NRKAN--RKVFGQWVSS--STLNMSEAIKGFLVKCCA
             470       480          490         500       510      

           510       520           530       540       550         
pF1KE3 KNLLGAENRELKLVAPT----LRSELTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRW
        : ::.  . . : .:     ......  :.. : :.....  ...   .:.. ::: . 
CCDS31 YNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQL
        520       530       540       550       560       570      

     560       570       580       590       600       610         
pF1KE3 RVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQ
       ....  . . .::.:::  .  :: .:::::..: .:.::::::::::...::::.:.. 
CCDS31 QMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTG
        580       590       600       610       620       630      

     620       630       640       650       660       670         
pF1KE3 PVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFY
         ..:::::::  : :::..:::::::.::.:: : :::::::::: :::::.: ::: :
CCDS31 VSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCY
        640       650       660       670       680       690      

     680       690       700       710       720       730         
pF1KE3 GDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADT
       :::.:::...:..:   :                    :... .  :.: ...   :.  
CCDS31 GDLLNYLRSKREKF---H--------------------RTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHP
        700       710                              720       730   

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pF1KE3 TQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEV-KNLLSDDNSEGLTLLDLLSF
       .. .:  .. ..   ::   .:.    :..... .. :  : :  ... . ::. ::: :
CCDS31 NSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGN--SFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCF
           740       750         760       770       780       790 

      800       810       820       830       840       850        
pF1KE3 TYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLP
       .::::.:::::  :.::::::::::::...::.::::::::::::: ::::: .:.. ::
CCDS31 AYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLP
             800       810       820       830       840       850 

      860       870       880       890       900       910        
pF1KE3 VKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKP
       ::::::::.:...::  ::::::::::::::::: .::::. ::..::. :..:..: .:
CCDS31 VKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQP
             860       870       880       890       900       910 

      920       930       940       950       960       970        
pF1KE3 DHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVA
        .:: :.: :: .::  . .::::: .:. ..   :    .  :...             
CCDS31 FYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQN
             920       930       940       950       960       970 

      980       990      1000      1010      1020      1030        
pF1KE3 RMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRN
                                                                   
CCDS31 RRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS                                      
             980       990                                         

>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5                (972 aa)
 initn: 1359 init1: 743 opt: 756  Z-score: 336.3  bits: 73.8 E(32554): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 1726; 34.1% identity (63.9% similar) in 969 aa overlap (27-965:20-926)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYP
                                 .: : :.  : ::. ... .::: :.. : :. :
CCDS43        MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGP
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110          
pF1KE3 MSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRH--IY
        : . .    . .. ..:     .: ...:.  .:: : :      :: ..  :    :.
CCDS43 PSPHWT----LYSDGSSS-----ILSTNNATFQNTGTYRC------TEPGDPLGGSAAIH
                60             70        80              90        

      120       130       140       150         160            170 
pF1KE3 IYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDP--ETPVTLHNSEGV-----VPAS
       .:: ::     : ..    :.: .:..:..::  :::  :. :.:   .:      .  :
CCDS43 LYVKDPA---RPWNVLAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYS
      100          110       120       130       140       150     

                180        190       200       210        220      
pF1KE3 YDSRQGFN---GTFTVGP-YICEATVKGKKFQTIPFNVYALKAT-SELDLEMEALKTVYK
       ..  .::.   . :  .  : : : . :.: ..: . . . :.  .   : .   . :  
CCDS43 FSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRI
         160       170       180       190       200       210     

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE3 SGETIVVTCAVFNNEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSG
        ::.  ..:.. . .: ...     .    .: .  ...    . : ::.. ..  . .:
CCDS43 RGEAAQIVCSASSVDV-NFDVFLQHNNTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAG
         220       230        240       250       260       270    

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE3 DYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPR
       .: :.: ..  . :.  .. . : :.......   . .. :.. :  .. : :.:::  .
CCDS43 NYSCVASNV--QGKHSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQ
          280         290       300       310       320       330  

         350        360       370       380       390       400    
pF1KE3 -ISWLK-NNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKS
        ..:   . ..  .   .... . : .  :.   :.: : :  ..:.:...:.:  . ..
CCDS43 GFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTK-DTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRA
            340       350        360       370       380       390 

          410       420       430       440       450        460   
pF1KE3 YTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKD-IKKCNNETSWT
        ::::  . :  . ...    ...:  :. :.: : : :.. :. :.    .:..     
CCDS43 LTFELTLRYPPEV-SVIWTFINGSG--TLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQ
             400        410         420       430       440        

           470       480       490       500       510       520   
pF1KE3 ILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRS
       .  .   ..... .   . ::.. .:   .:.. . .: :.: .:. .  .  ..   ..
CCDS43 VWDDPYPEVLSQ-EPFHKVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHT
      450       460        470       480       490       500       

                  530       540       550       560       570      
pF1KE3 E-------LTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVD
       .         :..: . ....... :..:.  .::::.:..::..:::   .:. : ..:
CCDS43 HPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESY--EGNSYTFID
       510       520       530       540       550         560     

        580       590       600       610       620       630      
pF1KE3 PMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSS
       : ::::. .:::::..: .:..::.::::::::.::.::.. . :.:::::::: ::...
CCDS43 PTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHAD
         570       580       590       600       610       620     

        640       650       660       670       680       690      
pF1KE3 EKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSH
       ::.:::::::::.::: : ::::::::::..::. .::::: ::::.:.:... ...:. 
CCDS43 EKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLG-
         630       640       650       660       670       680     

        700       710       720       730       740       750      
pF1KE3 HPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSD
           :.       :.:...          :.. :: ...          ::.: : . : 
CCDS43 ----PS-------LSPGQDP---------EGGVDYKNIH----------LEKKYVRRDSG
                     690                700                 710    

        760            770       780       790       800       810 
pF1KE3 IQRSLYD-----RPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLAS
       .. .  :     ::.:    :  ::  .. :. .... : : ::: :. :::.:: ::::
CCDS43 FSSQGVDTYVEMRPVS---TSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLAS
          720       730          740       750       760       770 

             820       830       840       850       860       870 
pF1KE3 KNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNL
       :::.:::.:::::::..:...:: :::::::::.::::. ::.. ::::::::::::: .
CCDS43 KNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCV
             780       790       800       810       820       830 

             880       890       900       910       920       930 
pF1KE3 YTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVK
       ::. ::::::::::::::::: .::::..:.: ::. .:.::.::.:  : ...: ::  
CCDS43 YTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQA
             840       850       860       870       880       890 

             940        950       960       970       980       990
pF1KE3 CWNSEPEKRPSFYHL-SEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIG
       ::  :: .::.: .. : . :.    . ...: ..                         
CCDS43 CWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHL
             900       910       920       930       940       950 

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KE3 VTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAI
                                                                   
CCDS43 TCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC                                       
             960       970                                         

>>CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5                (1298 aa)
 initn: 1340 init1: 742 opt: 754  Z-score: 333.9  bits: 73.8 E(32554): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 1231; 32.5% identity (59.9% similar) in 841 aa overlap (158-965:421-1184)

       130       140       150       160       170         180     
pF1KE3 FVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYD--SRQGFNGTFTVG
                                     :  .:..:.  :. :.  :::... :    
CCDS43 EASTGTYTLALWNSAAGLRRNISLELVVNVPPQIHEKEASSPSIYSRHSRQALTCTAYGV
              400       410       420       430       440       450

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE3 PYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNNEVVDL
       :     ... .     : ...: ..  .   ... :    .. .....  ::   : .: 
CCDS43 PL--PLSIQWHWRPWTPCKMFAQRSLRRR--QQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDT
                460       470         480       490       500      

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE3 QWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKV
        ::    :.::.            : :  :.. .:.:  :. :.:.. . . . ...   
CCDS43 -WTE--FVEGKN------------KTVSKLVIQNANV--SAMYKCVVSNKVGQDERLIYF
           510                   520         530       540         

         310        320       330       340       350       360    
pF1KE3 TISVHEKGF-IEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL----
        ...   :: :: ::.   ::.  .     .  .. .:   .. : . ::. ...     
CCDS43 YVTTIPDGFTIESKPSEELLEGQPVL----LSCQADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNP
     550       560       570           580       590       600     

                          370         380       390       400      
pF1KE3 ------------TEITTDVEKIQE-IRYRS-KLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAV----
                   : .....:..    :. . .:.. :.  :  :::.  .:.. .     
CCDS43 LLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHC
         610       620       630       640       650       660     

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE3 -KSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETS
        :.:      ..:    .:.:   . . .  ..: . :.  :.: :.  :: ..  .: :
CCDS43 HKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY--KD-ERLLEEKS
         670       680       690       700       710          720  

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE3 WTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTL
        . ::.  ::    :. : :    ::             : . :  :  :   ....   
CCDS43 GVDLAD--SNQKLSIQ-RVREEDAGRYL-----------CSVCNAKGCVNSSASVAVEGS
              730        740                  750       760        

             530        540         550        560       570       
pF1KE3 RSELTVAAAVLVLL-VIVIISLIVLVVIW--KQKPRY-EIRWRVIESISPDGHEYIYVDP
       ... ..  ..::   ::...  ..:..:.   ..: . .:.   .  :   :.  .  . 
CCDS43 EDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQC
      770       780       790       800       810       820        

       580        590       600       610       620       630      
pF1KE3 MQLPYD-SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSS
         : :: :.:::::. : :::::: ::::::::..:.:. ...    :::::::  : .:
CCDS43 EYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATAS
      830       840       850       860       870       880        

        640       650       660        670       680       690     
pF1KE3 EKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTK-SGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLS
       :..::::::::. :.: :::.::::::::: .::...:.:.: ::.: :.:. .::.:  
CCDS43 EHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAF--
      890       900       910       920       930       940        

         700       710       720       730       740       750     
pF1KE3 HHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYS
                      .:  :.       : :. : .  : .      .  :.:.. .. .
CCDS43 ---------------SPCAEK-------SPEQRGRFRAMVE------LARLDRRRPGSSD
                       950              960             970        

         760       770       780        790       800       810    
pF1KE3 DIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNL-LSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNC
        .  . ...  .  ...  :.:...: ::      ::. ::. ...:::::::::::..:
CCDS43 RVLFARFSKTEGGARRASPDQEAEDLWLSP-----LTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKC
      980       990      1000           1010      1020      1030   

          820       830       840       850       860       870    
pF1KE3 VHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTT
       .::::::::.::... .::::::::::::..: .:: :::. ::.::::::::::..:::
CCDS43 IHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTT
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

          880       890       900       910       920       930    
pF1KE3 LSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWN
        :::::.:.:::::::::..::::....  : .....: ::  :. ::  . .::..::.
CCDS43 QSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWS
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

          940       950       960       970       980       990    
pF1KE3 SEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYK
       ..:. ::.: .: ::. .:: :.  .  :..                             
CCDS43 GDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQAD
          1160      1170      1180      1190      1200      1210   

         1000      1010      1020      1030      1040      1050    
pF1KE3 NEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGS
                                                                   
CCDS43 AEDSPPSLQRHSLAARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQT
          1220      1230      1240      1250      1260      1270   

>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5                 (1363 aa)
 initn: 1340 init1: 742 opt: 754  Z-score: 333.6  bits: 73.8 E(32554): 2.9e-12
Smith-Waterman score: 1231; 32.5% identity (59.9% similar) in 841 aa overlap (158-965:421-1184)

       130       140       150       160       170         180     
pF1KE3 FVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYD--SRQGFNGTFTVG
                                     :  .:..:.  :. :.  :::... :    
CCDS44 EASTGTYTLALWNSAAGLRRNISLELVVNVPPQIHEKEASSPSIYSRHSRQALTCTAYGV
              400       410       420       430       440       450

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE3 PYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNNEVVDL
       :     ... .     : ...: ..  .   ... :    .. .....  ::   : .: 
CCDS44 PL--PLSIQWHWRPWTPCKMFAQRSLRRR--QQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDT
                460       470         480       490       500      

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE3 QWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKV
        ::    :.::.            : :  :.. .:.:  :. :.:.. . . . ...   
CCDS44 -WTE--FVEGKN------------KTVSKLVIQNANV--SAMYKCVVSNKVGQDERLIYF
           510                   520         530       540         

         310        320       330       340       350       360    
pF1KE3 TISVHEKGF-IEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL----
        ...   :: :: ::.   ::.  .     .  .. .:   .. : . ::. ...     
CCDS44 YVTTIPDGFTIESKPSEELLEGQPVL----LSCQADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNP
     550       560       570           580       590       600     

                          370         380       390       400      
pF1KE3 ------------TEITTDVEKIQE-IRYRS-KLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAV----
                   : .....:..    :. . .:.. :.  :  :::.  .:.. .     
CCDS44 LLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHC
         610       620       630       640       650       660     

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE3 -KSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETS
        :.:      ..:    .:.:   . . .  ..: . :.  :.: :.  :: ..  .: :
CCDS44 HKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY--KD-ERLLEEKS
         670       680       690       700       710          720  

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE3 WTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTL
        . ::.  ::    :. : :    ::             : . :  :  :   ....   
CCDS44 GVDLAD--SNQKLSIQ-RVREEDAGRYL-----------CSVCNAKGCVNSSASVAVEGS
              730        740                  750       760        

             530        540         550        560       570       
pF1KE3 RSELTVAAAVLVLL-VIVIISLIVLVVIW--KQKPRY-EIRWRVIESISPDGHEYIYVDP
       ... ..  ..::   ::...  ..:..:.   ..: . .:.   .  :   :.  .  . 
CCDS44 EDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQC
      770       780       790       800       810       820        

       580        590       600       610       620       630      
pF1KE3 MQLPYD-SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSS
         : :: :.:::::. : :::::: ::::::::..:.:. ...    :::::::  : .:
CCDS44 EYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATAS
      830       840       850       860       870       880        

        640       650       660        670       680       690     
pF1KE3 EKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTK-SGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLS
       :..::::::::. :.: :::.::::::::: .::...:.:.: ::.: :.:. .::.:  
CCDS44 EHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAF--
      890       900       910       920       930       940        

         700       710       720       730       740       750     
pF1KE3 HHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYS
                      .:  :.       : :. : .  : .      .  :.:.. .. .
CCDS44 ---------------SPCAEK-------SPEQRGRFRAMVE------LARLDRRRPGSSD
                       950              960             970        

         760       770       780        790       800       810    
pF1KE3 DIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNL-LSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNC
        .  . ...  .  ...  :.:...: ::      ::. ::. ...:::::::::::..:
CCDS44 RVLFARFSKTEGGARRASPDQEAEDLWLSP-----LTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKC
      980       990      1000           1010      1020      1030   

          820       830       840       850       860       870    
pF1KE3 VHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTT
       .::::::::.::... .::::::::::::..: .:: :::. ::.::::::::::..:::
CCDS44 IHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTT
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

          880       890       900       910       920       930    
pF1KE3 LSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWN
        :::::.:.:::::::::..::::....  : .....: ::  :. ::  . .::..::.
CCDS44 QSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWS
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

          940       950       960       970       980       990    
pF1KE3 SEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYK
       ..:. ::.: .: ::. .:: :.  .  :..                             
CCDS44 GDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQAD
          1160      1170      1180      1190      1200      1210   

         1000      1010      1020      1030      1040      1050    
pF1KE3 NEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGS
                                                                   
CCDS44 AEDSPPSLQRHSLAARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQT
          1220      1230      1240      1250      1260      1270   

>>CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4                  (1356 aa)
 initn: 1217 init1: 746 opt: 750  Z-score: 332.0  bits: 73.5 E(32554): 3.6e-12
Smith-Waterman score: 1287; 31.5% identity (57.5% similar) in 999 aa overlap (47-960:244-1170)

         20        30        40        50              60        70
pF1KE3 GLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVS------WQYPMSEEESSDVE
                                     : : ...:..      :.:: :... . . 
CCDS34 YIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLV
           220       230       240       250       260       270   

               80            90       100        110       120     
pF1KE3 IRNEENNSGL----FVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNH-TQTEENELEGRHIYIYVPD-P
        :. ...::     :...: ..... .  :::::  .   .:..:       .. : . :
CCDS34 NRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRSDQGLYTCAASSGLMTKKNST-----FVRVHEKP
           280       290       300       310       320             

          130       140       150       160        170             
pF1KE3 DVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGV-VPASYDSRQGF-----
        :::   :: . :: .   . . :: .      :     ..:. . ...  . :      
CCDS34 FVAF-GSGM-ESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIM
      330         340       350       360       370       380      

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE3 ------NGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIV
             .:..::   . .   : :. ... . ::.    .: .: .  . . :. : : .
CCDS34 EVSERDTGNYTV--ILTNPISKEKQSHVVSLVVYVPPQIGEKSL-ISPVDS-YQYGTTQT
        390         400       410       420        430        440  

                              240          250              260    
pF1KE3 VTCAVFN------------------NE---VVDLQWTYPGE-------VKGKGITMLEEI
       .::.:.                   ::   .:..   :: :        .: .   ... 
CCDS34 LTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKN
            450       460       470       480       490       500  

              270       280       290       300       310          
pF1KE3 KVPSI----KLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVH-EKG-FIEIK
       .   :    : : ::..  :.:  :. :.:   .:. .: . ..: :: :  .:  : ..
CCDS34 QFALIEGKNKTVSTLVIQAANV--SALYKC---EAVNKVGRGERV-ISFHVTRGPEITLQ
            510       520         530          540        550      

      320       330       340       350        360       370       
pF1KE3 PTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLK-NNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRS
       :   ... .. . :. . .  :.     ..: : .   :  .. :. : : :  .  .. 
CCDS34 P---DMQPTEQESVSLWCTADRS-TFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKL
           560       570        580       590       600       610  

                    380       390       400           410       420
pF1KE3 K-------------LKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYT----FELLTQVPSSILDL
       .             ..:  :. .:.: :. .::.. . : .     . .: .:  .:   
CCDS34 NATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLTVLERVAPTITGN
            620       630       640       650       660       670  

              430        440       450       460       470         
pF1KE3 VDDHHGSTGGQT-VRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSR
       ....  : : .  : ::: :.: :.: :.  :: ..   : :  .: ..  :.  .   :
CCDS34 LENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWF--KD-NETLVEDSGIVLKDGNRNLTIR---R
            680       690       700          710       720         

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE3 DRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRSELTVAAAVLV-LLVIV
        :.  ::  :           : : ..::  . :  ..    . . ..   .::   ::.
CCDS34 VRKEDEGLYT-----------CQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIA
        730                  740       750       760       770     

      540       550          560       570         580        590  
pF1KE3 IISLIVLVVIWKQKPRY---EIRWRVIESISPDGHEYIYVDPM--QLPYD-SRWEFPRDG
       ..  ..::.: .   :    :..   . ::  :  : . .:    .:::: :.:::::: 
CCDS34 MFFWLLLVIILRTVKRANGGELKTGYL-SIVMDPDE-LPLDEHCERLPYDASKWEFPRDR
         780       790       800        810        820       830   

            600       610       620       630       640       650  
pF1KE3 LVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLG
       : ::. :: ::::.:.:. :.:....     :::::::  :  ::..::::::::. :.:
CCDS34 LKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIG
           840       850       860       870       880       890   

            660        670       680       690       700       710 
pF1KE3 PHLNIVNLLGACTK-SGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLN
        :::.::::::::: .::...:.:.: .:.: .::...:. :.   : : :         
CCDS34 HHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFV---PYKTK---------
           900       910       920       930          940          

             720       730       740       750       760       770 
pF1KE3 PADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKK
           ..:      :... ::.          .:.  ...... .. : :     .  ..:
CCDS34 ----GAR------FRQGKDYVGA--------IPVDLKRRLDSITSSQSS--ASSGFVEEK
                       950               960       970         980 

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE3 SMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKI
       :. : : ..   :  .. :::  :. ...:::.:::::::..:.::::::::.::.. ..
CCDS34 SLSDVEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNV
             990      1000      1010      1020      1030      1040 

             840       850       860       870       880       890 
pF1KE3 VKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSL
       ::::::::::::..: .:: ::.. ::.::::::.::: .::  :::::.:.::::::::
CCDS34 VKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSL
            1050      1060      1070      1080      1090      1100 

             900       910       920       930       940       950 
pF1KE3 GGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVE
       :..::::. .:  :  ..: : ::  ::..: :.:. :. ::..:: .::.: .: : . 
CCDS34 GASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLG
            1110      1120      1130      1140      1150      1160 

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pF1KE3 NLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQR
       ::: .. ..                                                   
CCDS34 NLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVSCMEEEEVCDPKFHYDNTAGIS
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 




1089 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Fri Nov 11 17:00:13 2016 done: Fri Nov 11 17:00:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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