Result of FASTA (ccds) for pF1KB4231
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4231, 1849 aa
  1>>>pF1KB4231     1849 - 1849 aa - 1849 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4868+/-0.000985; mu= 19.3048+/- 0.060
 mean_var=91.7658+/-17.792, 0's: 0 Z-trim(105.9): 36  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.133886
 statistics sampled from 8750 (8779) to 8750 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  2.840

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs109|chr8        (1849) 12156 2359.3       0
CCDS13411.1 ARFGEF2 gene_id:10564|Hs109|chr20      (1785) 6550 1276.5       0
CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17         ( 397)  655 137.5 9.7e-32
CCDS42392.3 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17         ( 398)  655 137.5 9.7e-32
CCDS86644.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17         ( 339)  646 135.8 2.8e-31
CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs109|chr7           ( 399)  635 133.7 1.4e-30
CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19         ( 399)  617 130.2 1.6e-29
CCDS86786.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19         ( 400)  617 130.2 1.6e-29
CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs109|chr22        ( 394)  603 127.5   1e-28
CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs109|chrX        ( 949)  537 114.9 1.5e-24
CCDS87048.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs109|chr3         ( 814)  536 114.7 1.5e-24
CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs109|chr3         ( 963)  536 114.7 1.7e-24
CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs109|chr3         (1114)  536 114.7   2e-24
CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs109|chrX        (1488)  537 115.0 2.2e-24
CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs109|chr12      ( 759)  510 109.7 4.6e-23
CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs109|chr12      (1182)  510 109.7 6.8e-23
CCDS7533.1 GBF1 gene_id:8729|Hs109|chr10           (1859)  505 108.9   2e-22
CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs109|chr8          ( 513)  332 75.2 7.3e-13
CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs109|chr8          (1047)  332 75.3 1.4e-12
CCDS3820.1 FBXO8 gene_id:26269|Hs109|chr4          ( 319)  324 73.6 1.4e-12
CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs109|chr2          (1056)  319 72.8 7.8e-12
CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs109|chr5           ( 771)  313 71.6 1.3e-11


>>CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs109|chr8             (1849 aa)
 initn: 12156 init1: 12156 opt: 12156  Z-score: 12679.0  bits: 2359.3 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 12156; 100.0% identity (100.0% similar) in 1849 aa overlap (1-1849:1-1849)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MYEGKKTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKAETEKQSPPHGEAKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MYEGKKTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKAETEKQSPPHGEAKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 GSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGNAPDST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGNAPDST
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 TPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQHHHLLQSPVSHHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQHHHLLQSPVSHHE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 PESPQLRYLPPQTVDHISQEHEGDLDLHTNDVDKSLQDDTEPENGSDISSAENEQTEADQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PESPQLRYLPPQTVDHISQEHEGDLDLHTNDVDKSLQDDTEPENGSDISSAENEQTEADQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 ATAAETLSKNEVLYDGENHDCEEKPQDIVQNIVEEMVNIVVGDMGEGTTINASADGNIGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ATAAETLSKNEVLYDGENHDCEEKPQDIVQNIVEEMVNIVVGDMGEGTTINASADGNIGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 IEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQESGNSSGPSPGAKFSHILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQESGNSSGPSPGAKFSHILQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 KDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSLQLLLSILQNAGPIFRTNEMFINA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSLQLLLSILQNAGPIFRTNEMFINA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 IKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQIEVFFKEIFLYILETSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQIEVFFKEIFLYILETSTS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 SFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRGSQELGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRGSQELGM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 SNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETIN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 RYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 QEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 LRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 PQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 VASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 SVGLQDCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFSIQLERDAYVQALARFTLLTVSSGITEMKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SVGLQDCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFSIQLERDAYVQALARFTLLTVSSGITEMKQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 KNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKPRYISGTVRGREGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKPRYISGTVRGREGSL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 TGTKDQAPDEFVGLGLVGGNVDWKQIASIQESIGETSSQSVVVAVDRIFTGSTRLDGNAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TGTKDQAPDEFVGLGLVGGNVDWKQIASIQESIGETSSQSVVVAVDRIFTGSTRLDGNAI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB4 VDFVRWLCAVSMDELLSTTHPRMFSLQKIVEISYYNMGRIRLQWSRIWEVIGDHFNKVGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VDFVRWLCAVSMDELLSTTHPRMFSLQKIVEISYYNMGRIRLQWSRIWEVIGDHFNKVGC
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB4 NPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKRNRSPTIRDMVVRCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKRNRSPTIRDMVVRCI
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB4 AQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQTTGHIVTLVFEKHFPATIDSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQTTGHIVTLVFEKHFPATIDSF
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB4 QDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEYTSDDMNVAPEDRVWVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEYTSDDMNVAPEDRVWVR
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB4 GWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKTYGHTYEKHWWQDLFRIVFRIFDNMKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKTYGHTYEKHWWQDLFRIVFRIFDNMKL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB4 PEQQTEKAEWMTTTCNHALYAICDVFTQYLEVLSDVLLDDIFAQLYWCVQQDNEQLARSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PEQQTEKAEWMTTTCNHALYAICDVFTQYLEVLSDVLLDDIFAQLYWCVQQDNEQLARSG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB4 TNCLENVVILNGEKFTLEIWDKTCNCTLDIFKTTIPHALLTWRPNSGETAPPPPSPVSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TNCLENVVILNGEKFTLEIWDKTCNCTLDIFKTTIPHALLTWRPNSGETAPPPPSPVSEK
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB4 PLDTISQKSVDIHDSIQPRSVDNRPQAPLVSASAVNEEVSKIKSTAKFPEQKLFAALLIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PLDTISQKSVDIHDSIQPRSVDNRPQAPLVSASAVNEEVSKIKSTAKFPEQKLFAALLIK
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CCDS13 AVSPKFVRLK-----------------HSQAQSKP----TTPEK-TDLTNGEHARSDSGK
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CCDS13 VSTENGDAPRERGSSLSGTD--DGAQEVVKDILEDVVTSAIKEAAEKHGLTEPERVLGEL
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            .:  : : :: :.:::              ::: :.:: :. :: ...: . .:.
CCDS13 ECQECAIPPGVD-ENSQTNGIA-------------DDRQSLSSADNLES-DAQGHQVAAR
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CCDS13 FSHVLQKDAFLVFRSLCKLSMKPLGEGPPDPKSHELRSKVVSLQLLLSVLQNAGPVFRTH
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CCDS13 EMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPDVFELSLAIFLTLLSNFKMHLKMQIEVFFKEIFLNI
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CCDS13 GHELGMTPLQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNHQTSLGQERLTDQEIGDGK
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CCDS13 GLD-MARRCSVTSMESTVSSG-----TQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPK
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CCDS13 KEFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIML
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CCDS13 GDHFNKVGCNPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKKNRSPT
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CCDS13 DNEQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPEVWDETCNCMLDIFKTTIPHVLLTWRPVGMEEDS
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pF1KB4 PPPSPVSEKPLDTISQKSVDIHDSIQPRSVDNRPQAPLVSASAVNEEVSKIKSTAKFPEQ
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CCDS13 ------SEKHLD------VDL-DRQSLSSIDKNPSE--RGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQ
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CCDS13 KLFASLLIKCVVQLELIQTIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDADIHIETEDQGMY
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       ....::.:::::::: ::: :.:::::: ::::.::.::::::::::::::::::::: :
CCDS13 KYMSSQHLFKLLDCLQESHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCL
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pF1KB4 RILFRMYMDESRVSAWEEVQQRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKI
       :::::::.::.: ..:::.:::::.::::::.::.:..:::::::::.::::.:::.:::
CCDS13 RILFRMYVDENRRDSWEEIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKI
          1670      1680      1690      1700      1710      1720   

            1800      1810      1820      1830      1840           
pF1KB4 SDNRFKAHASFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQ  
       .:..::::::.::: ::::::::::::::::::.::::::::..:  : :          
CCDS13 NDEKFKAHASMYYPYLCEIMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWIPEEPSQVPAALSP
          1730      1740      1750      1760      1770      1780   

CCDS13 VW
         

>>CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17              (397 aa)
 initn: 624 init1: 412 opt: 655  Z-score: 683.5  bits: 137.5 E(33420): 9.7e-32
Smith-Waterman score: 655; 43.9% identity (74.6% similar) in 244 aa overlap (645-886:9-248)

          620       630       640       650       660         670  
pF1KB4 CLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETINRYGS--LNSLESTS
                                     ::.    : .. :.: :  .  : ...  .
CCDS32                       MEEDDSYVPSDLTAEERQELENIRRRKQELLADIQRLK
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pF1KB4 SSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYLQEQGMLGTTPED
       .  :.  .... .  . :. . ....:..  .:   ::  ::.:::.: :. .: .: ::
CCDS32 DE-IAEVANEIENLGSTEERKNMQRNKQVA-MGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCED
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pF1KB4 IAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSALRMFLEGFRLPG
       :::::.. : :..: .:..::. :.:: .:..:.:. :.:.  ..:.:::.:: .:::::
CCDS32 IAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPG
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pF1KB4 EAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQY
       :::::::.:: :: :: .::.:  .: :.:: :::...::::.:.::.:.::.: : :..
CCDS32 EAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNG--VFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERF
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pF1KB4 IKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQNVASEKQRRLLYN
       : :::::::. ::::: :  .:. : .. ... :                          
CCDS32 IAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRV
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pF1KB4 LEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAFSVGLQDCDDTEV
                                                                   
CCDS32 KTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQV
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>>CCDS42392.3 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17              (398 aa)
 initn: 624 init1: 412 opt: 655  Z-score: 683.5  bits: 137.5 E(33420): 9.7e-32
Smith-Waterman score: 655; 43.9% identity (74.6% similar) in 244 aa overlap (645-886:9-248)

          620       630       640       650       660         670  
pF1KB4 CLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETINRYGS--LNSLESTS
                                     ::.    : .. :.: :  .  : ...  .
CCDS42                       MEEDDSYVPSDLTAEERQELENIRRRKQELLADIQRLK
                                     10        20        30        

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pF1KB4 SSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYLQEQGMLGTTPED
       .  :.  .... .  . :. . ....:..  .:   ::  ::.:::.: :. .: .: ::
CCDS42 DE-IAEVANEIENLGSTEERKNMQRNKQVA-MGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCED
       40         50        60         70        80        90      

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pF1KB4 IAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSALRMFLEGFRLPG
       :::::.. : :..: .:..::. :.:: .:..:.:. :.:.  ..:.:::.:: .:::::
CCDS42 IAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPG
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pF1KB4 EAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQY
       :::::::.:: :: :: .::.:  .: :.:: :::...::::.:.::.:.::.: : :..
CCDS42 EAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNG--VFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERF
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pF1KB4 IKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQNVASEKQRRLLYN
       : :::::::. ::::: :  .:. : .. ... :                          
CCDS42 IAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGR
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pF1KB4 LEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAFSVGLQDCDDTEV
                                                                   
CCDS42 VKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQ
          280       290       300       310       320       330    

>>CCDS86644.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17              (339 aa)
 initn: 624 init1: 412 opt: 646  Z-score: 675.2  bits: 135.8 E(33420): 2.8e-31
Smith-Waterman score: 646; 51.6% identity (80.0% similar) in 190 aa overlap (697-886:2-189)

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pF1KB4 SLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYLQEQGML
                                     :... . .:   ::  ::.:::.: :. .:
CCDS86                              MQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLL
                                            10        20        30 

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pF1KB4 GTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSALRMFLE
        .: :::::::.. : :..: .:..::. :.:: .:..:.:. :.:.  ..:.:::.:: 
CCDS86 KNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLW
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pF1KB4 GFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNK
       .::::::::::::.:: :: :: .::.:  .: :.:: :::...::::.:.::.:.::.:
CCDS86 SFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNG--VFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDK
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pF1KB4 MTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQNVASEKQ
        : :..: :::::::. ::::: :  .:. : .. ... :                    
CCDS86 PTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLL
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pF1KB4 RRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAFSVGLQD
                                                                   
CCDS86 KLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYI
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>>CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs109|chr7                (399 aa)
 initn: 606 init1: 413 opt: 635  Z-score: 662.6  bits: 133.7 E(33420): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 635; 48.5% identity (76.2% similar) in 206 aa overlap (683-886:49-252)

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pF1KB4 IKHPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLK--QQKEIIEQGIDLFN
                                     :.  ::  . :  :  :... : .:   ::
CCDS53 EEREELLDIRRRKKELIDDIERLKYEIAEVMTEIDNLTSVEESKTTQRNKQIAMGRKKFN
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pF1KB4 KKPKRGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQH
         ::.:::.: :. .: ..:::.::::.. : :..: .:..::. :.:: .:. :.:. :
CCDS53 MDPKKGIQFLIENDLLQSSPEDVAQFLYKGEGLNKTVIGDYLGERDEFNIKVLQAFVELH
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pF1KB4 DFSGKDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYS
       .:.  ..:.:::.:: .::::::::::::.:: ::.::  :: :  .: :.:: :::...
CCDS53 EFADLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFASRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFA
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pF1KB4 IIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKEL
       ::::.:.::. .:..: : :..: ::::::.. ::::: :  .:. : .. ... :    
CCDS53 IIMLNTSLHNHNVRDKPTAERFIAMNRGINEGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGN
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pF1KB4 TIPTKSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFK
                                                                   
CCDS53 DLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIR
        260       270       280       290       300       310      

>>CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19              (399 aa)
 initn: 591 init1: 396 opt: 617  Z-score: 643.8  bits: 130.2 E(33420): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 617; 45.1% identity (77.2% similar) in 206 aa overlap (681-886:45-247)

              660       670       680       690       700       710
pF1KB4 SEIKHPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFN
                                     ... : .  :  ..:......  .:   ::
CCDS12 ERMELENIRRRKQELLVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMA-MGRKKFN
           20        30        40        50        60         70   

              720       730       740       750       760       770
pF1KB4 KKPKRGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQH
         ::.:::.: :. .: .:::.::.::.. : :..: .:..::. ...:  :..:.:: :
CCDS12 MDPKKGIQFLVENELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAVLHAFVDLH
            80        90       100       110       120       130   

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pF1KB4 DFSGKDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYS
       .:.  ..:.:::.:: .::::::::::::.:: :: ::  :: :  .: :.:: :::...
CCDS12 EFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFA
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pF1KB4 IIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKEL
       .:::.:.::.:.:..:   :... ::::::.. ::::: :  .:. : .. ... :    
CCDS12 VIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGN
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KB4 TIPTKSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFK
                                                                   
CCDS12 DLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIR
             260       270       280       290       300       310 

>>CCDS86786.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19              (400 aa)
 initn: 591 init1: 396 opt: 617  Z-score: 643.8  bits: 130.2 E(33420): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 617; 45.1% identity (77.2% similar) in 206 aa overlap (681-886:45-247)

              660       670       680       690       700       710
pF1KB4 SEIKHPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFN
                                     ... : .  :  ..:......  .:   ::
CCDS86 ERMELENIRRRKQELLVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMA-MGRKKFN
           20        30        40        50        60         70   

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pF1KB4 KKPKRGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQH
         ::.:::.: :. .: .:::.::.::.. : :..: .:..::. ...:  :..:.:: :
CCDS86 MDPKKGIQFLVENELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAVLHAFVDLH
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pF1KB4 DFSGKDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYS
       .:.  ..:.:::.:: .::::::::::::.:: :: ::  :: :  .: :.:: :::...
CCDS86 EFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFA
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pF1KB4 IIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKEL
       .:::.:.::.:.:..:   :... ::::::.. ::::: :  .:. : .. ... :    
CCDS86 VIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGN
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pF1KB4 TIPTKSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFK
                                                                   
CCDS86 DLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSI
             260       270       280       290       300       310 

>>CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs109|chr22             (394 aa)
 initn: 571 init1: 373 opt: 603  Z-score: 629.3  bits: 127.5 E(33420): 1e-28
Smith-Waterman score: 603; 40.2% identity (73.1% similar) in 249 aa overlap (640-886:3-247)

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pF1KB4 KKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETI--NRYGSLNS
                                     : . .:.:   .: .. . :  .:   :..
CCDS13                             MDLCHPEPAELSSGETEELQRIKWHRKQLLED
                                           10        20        30  

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pF1KB4 LESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYLQEQGMLG
       ... ..  :..  .:..  .. :. .. ...::.   :   ::  : .::::. :. .: 
CCDS13 IQKLKDE-IADVFAQIDCFESAEESRMAQKEKELC-IGRKKFNMDPAKGIQYFIEHKLLT
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pF1KB4 TTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSALRMFLEG
          .:::.::.. : :..: .: .::. : .: .:. :.:: :.:.. ..:.:::.:: .
CCDS13 PDVQDIARFLYKGEGLNKTAIGTYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWS
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pF1KB4 FRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNKM
       ::::::::::::.:: ::.::  :: :  .: :.:: :::..:::::.:.::.:.:... 
CCDS13 FRLPGEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRP
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pF1KB4 TKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQNVASEKQR
         :....::::::...::::. :  ... : .. .:. :                     
CCDS13 PFERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLK
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pF1KB4 RLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAFSVGLQDC
                                                                   
CCDS13 LGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPS
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>>CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs109|chrX             (949 aa)
 initn: 515 init1: 183 opt: 537  Z-score: 554.4  bits: 114.9 E(33420): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 537; 36.7% identity (67.8% similar) in 267 aa overlap (657-910:502-768)

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pF1KB4 SKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETIN-RYGSL--NSLESTSSSGI--GSYST
                                     ::::   ::   .::.   ..:.   .:. 
CCDS35 GGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQR
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pF1KB4 QMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEE
       .   . .   :.    :..  . :..::::::..::::: :.:.:. ::  .:.:. ...
CCDS35 ETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERK
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pF1KB4 RLDSTQVGEFLGDNDK-FNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRL
        :.  ..:::::. .: ::..:.   ::. :::. :. .::: :   .:. :::::..::
CCDS35 GLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQGEAQKVERL
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pF1KB4 MEKFAARYLECNQGQT-LFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKN--KMTKEQYIKMNR
       .: :. ::  :: . .  : . :: ..::..::.:.::..::.::   ::  ...::  :
CCDS35 IEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDDFIKNLR
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pF1KB4 GINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKS----SKQNVASEKQRRLLYNL
       :.....:.:.. : .::..: :...  .. .   . .      .:. : :  .:::.   
CCDS35 GVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGKKPVLSLPHRRLVCCC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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