Result of FASTA (omim) for pF1KB5949
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5949, 509 aa
  1>>>pF1KB5949 509 - 509 aa - 509 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9634+/-0.000443; mu= 20.5135+/- 0.027
 mean_var=64.8398+/-13.008, 0's: 0 Z-trim(109.7): 34  B-trim: 791 in 1/50
 Lambda= 0.159277
 statistics sampled from 17856 (17890) to 17856 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.21), width:  16
 Scan time:  8.610

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_057383 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa protein ( 509) 3259 758.1 1.3e-218
NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa ( 639) 1094 260.7 9.2e-69
NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein ( 641) 1086 258.9 3.3e-68
NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein ( 641) 1086 258.9 3.3e-68
NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein ( 643) 1084 258.4 4.5e-68
NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein ( 641) 1078 257.0 1.2e-67
XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock  ( 646) 1072 255.7 3.1e-67
NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 646) 1072 255.7 3.1e-67
NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated  ( 654) 1062 253.4 1.5e-66
NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 493) 1018 243.2 1.4e-63
NP_004125 (OMIM: 182170,600548,616854) stress-70 p ( 679)  856 206.0 2.8e-52
XP_016875852 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 807)  670 163.3 2.4e-39
NP_001273432 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 814)  670 163.3 2.4e-39
XP_016875850 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 851)  670 163.4 2.5e-39
NP_006635 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 kD ( 858)  670 163.4 2.5e-39
NP_002145 (OMIM: 601113) heat shock 70 kDa protein ( 840)  655 159.9 2.7e-38
XP_016875851 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 809)  584 143.6 2.1e-33
XP_005266293 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 816)  584 143.6 2.1e-33
XP_011533189 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 853)  584 143.6 2.2e-33
NP_001273433 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 860)  584 143.6 2.2e-33
NP_001265134 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa prot ( 143)  481 119.4 7.1e-27
NP_008879 (OMIM: 601100) heat shock 70 kDa protein ( 471)  455 113.8 1.1e-24
NP_001273434 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 782)  301 78.5 7.7e-14
NP_001124463 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated p ( 999)  272 72.0 9.5e-12
NP_006380 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated prot ( 999)  272 72.0 9.5e-12
XP_016872586 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999)  272 72.0 9.5e-12
XP_016872585 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999)  272 72.0 9.5e-12
XP_005271451 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  272 72.0 9.5e-12
XP_005271449 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  272 72.0 9.5e-12
XP_016872584 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  272 72.0 9.5e-12
XP_005271450 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  272 72.0 9.5e-12
XP_016875853 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 736)  263 69.8 3.1e-11
XP_011533190 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 780)  263 69.8 3.3e-11


>>NP_057383 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa protein 14   (509 aa)
 initn: 3259 init1: 3259 opt: 3259  Z-score: 4045.6  bits: 758.1 E(85289): 1.3e-218
Smith-Waterman score: 3259; 100.0% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-509)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRIRNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRIRNI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 SNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVARLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVARLI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAALLAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAALLAY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 GIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 SEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVELLNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVELLNS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 IPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFPSGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 IPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFPSGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 PLPARRQHTLQAPGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDILAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 PLPARRQHTLQAPGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDILAVL
              430       440       450       460       470       480

              490       500         
pF1KB5 TMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
       :::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 TMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
              490       500         

>>NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa pro  (639 aa)
 initn: 982 init1: 492 opt: 1094  Z-score: 1355.5  bits: 260.7 E(85289): 9.2e-69
Smith-Waterman score: 1094; 35.6% identity (71.3% similar) in 505 aa overlap (3-505:7-506)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB5     MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSR
             :::. :: : .::.:.. :.. ..::: :.:.::. ::....:...: :::.. 
NP_068 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB5 IRNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDV
         : .::.. .:...::.  :  .:. . .    :. ..:: . ...   :::   ::..
NP_068 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB5 ARLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAA
       . ....:::: :.. ::. ....:::::  :...:..:  .:.  .:.::::.:.::.::
NP_068 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
              130       140       150       160       170       180

        180        190       200       210       220       230     
pF1KB5 LLAYGIGQDS-PTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETL
        .:::. . .   :..:.:.: ::: ....:.. ...::..: ::  : ..::  : . .
NP_068 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB5 AQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNV
       ...:: ::.:. :.:.  : ::. .: .. : ::..::.  .:.  .:::::: ::  ..
NP_068 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB5 SRARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAV
       .::::: : . ::   .: ..  : .  .   .:...:: :::.::::.:.:..:.: . 
NP_068 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
              310       320       330       340       350       360

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB5 ELLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVL
       :: .:: :::..  :::..:.:::: ..  :.: :... .    :  :.. .:.  .: :
NP_068 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTP---LSLGIETAGGV-MTPL
              370       380       390       400          410       

         420       430        440       450       460       470    
pF1KB5 FPSGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLR
       .  .: .:... .:. .   . ::: ...::.. .  .:... ...  :  .     :. 
NP_068 IKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGE-RAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVP
        420       430       440        450       460       470     

          480       490       500                                  
pF1KB5 DILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                         
       .: ... .  .: :.:: .:. ::: . :.:                             
NP_068 QIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEAN
         480       490       500       510       520       530     

NP_068 RDRVAAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEY
         540       550       560       570       580       590     

>>NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein 1A   (641 aa)
 initn: 994 init1: 489 opt: 1086  Z-score: 1345.5  bits: 258.9 E(85289): 3.3e-68
Smith-Waterman score: 1086; 35.2% identity (71.5% similar) in 505 aa overlap (2-505:5-503)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRI
           ::::. :: : .::.:.. :.. ..::: :.:.::. ::....:...: :::..  
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVA
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 RNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVA
        : .:::. .:...::. .:: .:. . .    ::. . : . ...   :::   ::...
NP_005 LNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEIS
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 RLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAAL
        ....:::: :.. ::  ....:::::  :...:..:  .:.  ::.::::.:.::.:: 
NP_005 SMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAA
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB5 LAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQ
       .:::. . .  :. :.:.: ::: ....:.. ...::..: .:  : ..::  : . :..
NP_005 IAYGLDR-TGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVN
               190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB5 YLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSR
       ... ::.:. :.:.  : ::. .: .. : ::..::.  .:.  .:::.:: ::  ...:
NP_005 HFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITR
     240       250       260       270       280       290         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 ARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVEL
       :::: ::: :: . .: ..  : .  .   .:. .:: :::.::::.:.:..:.: . .:
NP_005 ARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDL
     300       310       320       330       340       350         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 LNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFP
        .:: :::..  :::..:.::.: ..  :.: :... .    :  :.. .:.  .:.:. 
NP_005 NKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAP---LSLGLETAGGV-MTALIK
     360       370       380       390          400        410     

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pF1KB5 SGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDI
        .. .:... . . .   .  .: ...::.. .  .:... ...  :. .     :. .:
NP_005 RNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQI
         420       430       440        450       460       470    

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pF1KB5 LAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                           
        ... .  .: :.:: ::. ::: . :.:                               
NP_005 EVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRE
          480       490       500       510       520       530    

>>NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein 1B   (641 aa)
 initn: 994 init1: 489 opt: 1086  Z-score: 1345.5  bits: 258.9 E(85289): 3.3e-68
Smith-Waterman score: 1086; 35.2% identity (71.5% similar) in 505 aa overlap (2-505:5-503)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRI
           ::::. :: : .::.:.. :.. ..::: :.:.::. ::....:...: :::..  
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVA
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 RNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVA
        : .:::. .:...::. .:: .:. . .    ::. . : . ...   :::   ::...
NP_005 LNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEIS
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pF1KB5 RLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAAL
        ....:::: :.. ::  ....:::::  :...:..:  .:.  ::.::::.:.::.:: 
NP_005 SMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAA
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pF1KB5 LAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQ
       .:::. . .  :. :.:.: ::: ....:.. ...::..: .:  : ..::  : . :..
NP_005 IAYGLDR-TGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVN
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pF1KB5 YLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSR
       ... ::.:. :.:.  : ::. .: .. : ::..::.  .:.  .:::.:: ::  ...:
NP_005 HFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITR
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KB5 ARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVEL
       :::: ::: :: . .: ..  : .  .   .:. .:: :::.::::.:.:..:.: . .:
NP_005 ARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDL
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB5 LNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFP
        .:: :::..  :::..:.::.: ..  :.: :... .    :  :.. .:.  .:.:. 
NP_005 NKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAP---LSLGLETAGGV-MTALIK
     360       370       380       390          400        410     

       420       430        440       450       460       470      
pF1KB5 SGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDI
        .. .:... . . .   .  .: ...::.. .  .:... ...  :. .     :. .:
NP_005 RNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQI
         420       430       440        450       460       470    

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pF1KB5 LAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                           
        ... .  .: :.:: ::. ::: . :.:                               
NP_005 EVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRE
          480       490       500       510       520       530    

>>NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein 6 [  (643 aa)
 initn: 991 init1: 494 opt: 1084  Z-score: 1343.0  bits: 258.4 E(85289): 4.5e-68
Smith-Waterman score: 1084; 35.7% identity (71.0% similar) in 504 aa overlap (3-505:8-505)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB5      MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQS
              :.:. :: : .::.:...::. ..::: :.:.::. ::....:..:: :::..
NP_002 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB5 RIRNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPED
          :  :::. .:...::. .:  .:. . .    :. ..:: . ..    : :   ::.
NP_002 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE
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pF1KB5 VARLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSA
       .. ...:::::::.. ::. .. .:::::  :...:..:  .:.  ::.::::.:.::.:
NP_002 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA
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pF1KB5 ALLAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETL
       : .:::. . . .:. :.:.: ::: ....::. ...:...: .:  : ..::  : . :
NP_002 AAIAYGLDRRG-AGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
              190        200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB5 AQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNV
       ....  ::.:.  .:. :: ::. .: .. : ::..::.  .:.  .:::.:: ::  ..
NP_002 VNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSI
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KB5 SRARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAV
       .::::: ::: :: . .: ..  : .  .   .:. ::: :::.::::.:.:..:.: . 
NP_002 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGK
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB5 ELLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVL
       :: .:: :::..  :::..:..:.: .   :.: :... .    :  :.. .:.  .:.:
NP_002 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLLDVAP---LSLGLETAGGV-MTTL
     360       370       380       390       400          410      

         420       430        440       450       460       470    
pF1KB5 FPSGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLR
       .  .. .:... .:. .   .  .: ...::.. .  .:... ...  :. .     :. 
NP_002 IQRNATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGE-RAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVP
         420       430       440        450       460       470    

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pF1KB5 DILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                         
       .: ... .  .: : :: ::. ::: . :.:                             
NP_002 QIEVTFDIDANGILSVTATDRSTGKANKITITNDKGRLSKEEVERMVHEAEQYKAEDEAQ
          480       490       500       510       520       530    

NP_002 RDRVAAKNSLEAHVFHVKGSLQEESLRDKIPEEDRRKMQDKCREVLAWLEHNQLAEKEEY
          540       550       560       570       580       590    

>>NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein 1-l  (641 aa)
 initn: 992 init1: 491 opt: 1078  Z-score: 1335.6  bits: 257.0 E(85289): 1.2e-67
Smith-Waterman score: 1078; 35.1% identity (70.6% similar) in 504 aa overlap (3-505:8-505)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB5      MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQS
              :::. :: : .::.:.. :.. ..::: :.:.::. ::....:...: :::..
NP_005 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB5 RIRNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPED
          : .:::. .:...::. .:: .:  .      ::...:: .  ..   :.:   ::.
NP_005 VAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEE
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB5 VARLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSA
       .. ....:.::::.. ::  ....:::::  :...:..:  .:.  ::.::::.:.::.:
NP_005 ISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTA
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB5 ALLAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETL
       : .:::. . .  :. ..:.: ::: ....:.. ...::..: .:  : ..::  : . :
NP_005 AAIAYGLDKGGQ-GERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
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pF1KB5 AQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNV
       ..... ::.:. :.:.  : ::. .: .. : ::..::.  .::  .:::::: ::  ..
NP_005 VSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSI
     240       250       260       270       280       290         

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB5 SRARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAV
       .::::: ::. ::   .: ..  : .  .    :. .:: :::.::::.:.:..: : . 
NP_005 TRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGR
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB5 ELLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVL
       .: .:: :::..  :::..:.::.: ..  :.: :... .    :  :.. .:.  .:.:
NP_005 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLLDVAP---LSLGLETAGGV-MTAL
     360       370       380       390       400          410      

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pF1KB5 FPSGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLR
       .  .. .:... . . .   .  .: ...::.. .  .:... ...  :  .     :. 
NP_005 IKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGVP
         420       430       440        450       460       470    

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pF1KB5 DILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                         
       .: ... .  .: :.:: ::. ::: . :.:                             
NP_005 QIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKVNKITITNDKGRLSKEEIERMVLDAEKYKAEDEVQ
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NP_005 REKIAAKNALESYAFNMKSVVSDEGLKGKISESDKNKILDKCNELLSWLEVNQLAEKDEF
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>>XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock cogn  (646 aa)
 initn: 940 init1: 481 opt: 1072  Z-score: 1328.1  bits: 255.7 E(85289): 3.1e-67
Smith-Waterman score: 1072; 34.7% identity (71.1% similar) in 505 aa overlap (3-505:6-503)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRI
            :.:. :: : .::.:.. :.. ..::: :.:.::. ::....:...: :::..  
XP_011 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVA
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        : .:::. .:...::  .:  .:. . .   .:..  :. . ...   :::   ::.:.
XP_011 MNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVS
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pF1KB5 RLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAAL
        ....:::: :.. ::. ....:.:::  :...:..:  .:.  ::.::::.:.::.:: 
XP_011 SMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAA
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pF1KB5 LAYGIGQDSPTG-KSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLA
       .:::.  :. .: . :.:.: ::: ....:.. ...::..: ::  : ..::  : . ..
XP_011 IAYGL--DKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMV
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pF1KB5 QYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVS
       ... .::.:. :.:.  : ::. .: .. : ::..::.  .:.  .:::::: ::  ...
XP_011 NHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSIT
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pF1KB5 RARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVE
       ::::: : . ::   .. ..  : .  .  ..:. .:: :::.::::.:.:..:.: . :
XP_011 RARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKE
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pF1KB5 LLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLF
       : .:: :::..  :::..:.:: : ..  :.: :... .    :  :.. .:.  .:::.
XP_011 LNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTP---LSLGIETAGGV-MTVLI
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pF1KB5 PSGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRD
         .: .:... .:. .   .  .: ...::.. .  .:... ...  :  .     :. .
XP_011 KRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQ
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pF1KB5 ILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                          
       : ... .  .: :.:. .:. ::: . :.:                              
XP_011 IEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQR
           480       490       500       510       520       530   

>>NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro  (646 aa)
 initn: 940 init1: 481 opt: 1072  Z-score: 1328.1  bits: 255.7 E(85289): 3.1e-67
Smith-Waterman score: 1072; 34.7% identity (71.1% similar) in 505 aa overlap (3-505:6-503)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRI
            :.:. :: : .::.:.. :.. ..::: :.:.::. ::....:...: :::..  
NP_006 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVA
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pF1KB5 RNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVA
        : .:::. .:...::  .:  .:. . .   .:..  :. . ...   :::   ::.:.
NP_006 MNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVS
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pF1KB5 RLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAAL
        ....:::: :.. ::. ....:.:::  :...:..:  .:.  ::.::::.:.::.:: 
NP_006 SMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAA
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pF1KB5 LAYGIGQDSPTG-KSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLA
       .:::.  :. .: . :.:.: ::: ....:.. ...::..: ::  : ..::  : . ..
NP_006 IAYGL--DKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMV
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pF1KB5 QYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVS
       ... .::.:. :.:.  : ::. .: .. : ::..::.  .:.  .:::::: ::  ...
NP_006 NHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSIT
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pF1KB5 RARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVE
       ::::: : . ::   .. ..  : .  .  ..:. .:: :::.::::.:.:..:.: . :
NP_006 RARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKE
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pF1KB5 LLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLF
       : .:: :::..  :::..:.:: : ..  :.: :... .    :  :.. .:.  .:::.
NP_006 LNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTP---LSLGIETAGGV-MTVLI
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pF1KB5 PSGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRD
         .: .:... .:. .   .  .: ...::.. .  .:... ...  :  .     :. .
NP_006 KRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQ
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pF1KB5 ILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS                          
       : ... .  .: :.:. .:. ::: . :.:                              
NP_006 IEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQR
           480       490       500       510       520       530   

>>NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated prot  (654 aa)
 initn: 741 init1: 519 opt: 1062  Z-score: 1315.6  bits: 253.4 E(85289): 1.5e-66
Smith-Waterman score: 1062; 34.8% identity (70.9% similar) in 506 aa overlap (4-505:31-526)

                                          10        20        30   
pF1KB5                            MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDR
                                     .:. :: : .::.:.:.::. ..::: :.:
NP_005 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
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pF1KB5 VTPAVVAYS-ENEEIVGLAAKQSRIRNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVI
       .::. ::.. :.:...: :::..   :  :::. .:...::. .::..:. :      :.
NP_005 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
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pF1KB5 EKNGKLRYEIDTGE-ETKFVNPEDVARLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQ
       ::. :   ..: :  .::   ::... ....::::::.. ::. .. .:.:::  :.. :
NP_005 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
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pF1KB5 KNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAALLAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVN
       ..:  .:.  ::.::.:.:.::.:: .:::.  :.  :..::::: ::: ....:.. ..
NP_005 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGL--DKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTID
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pF1KB5 SGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHS
       .:...:..:: : ..::  : . . ... . ....  .::: . ::..::   .: ::..
NP_005 NGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRA
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pF1KB5 LSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINK
       ::.  .:   ..:.:::.::. ...::.:: :   :: . .. .. .:... .  .::..
NP_005 LSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDE
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KB5 VVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVELLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLM
       .:: :::.::::.:::.:..: . :   .: :::..  :::..::.: : ..  . : ..
NP_005 IVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQD--TGDLVL
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pF1KB5 IE-CSARDILVKGVDESGASRFTVLFPSGTPLPARRQHTLQ-APGSISSVCLELYESDGK
       .. :     :. :..  :.  .: :.: .: .:..... .. :  .  .: ...::.. .
NP_005 LDVCP----LTLGIETVGGV-MTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGE-R
        420           430        440       450       460        470

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pF1KB5 NSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
         .:..  ..   :  .     :. .: ... .  .: :.::  :. ::. . :.:    
NP_005 PLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQ
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NP_005 NRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSED
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NP_694 NHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSIT
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NP_694 RARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKE
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NP_694 LNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTP---LSLGIETAGGV-MTVLI
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NP_694 GGAPPSGGASSGPTIEEVD               
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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