Result of SIM4 for pF1KB4576

seq1 = pF1KB4576.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KB4576/gi568815587r_44834887.tfa (gi568815587r:44834887_45038335), 203449 bp

>pF1KB4576 567
>gi568815587r:44834887_45038335 (Chr11)

(complement)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-188  (100723-100781)   100% ->
189-237  (100984-101032)   100% ->
238-334  (101437-101533)   100% ->
335-436  (102674-102775)   100% ->
437-567  (103319-103449)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCAAGCAGCCCCCGCCTCTGATGAAGAAGCACAGCCAGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCAAGCAGCCCCCGCCTCTGATGAAGAAGCACAGCCAGACGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCGTGAGCCGCCTGAAGACCCGCAAGATCCTCGGCGTGGGCGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCGTGAGCCGCCTGAAGACCCGCAAGATCCTCGGCGTGGGCGGGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGACGACGGGGAGGTGCATCGCTCCAAG         ATCAGCCAGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 ATGACGACGGGGAGGTGCATCGCTCCAAGGTG...CAGATCAGCCAGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTAGGCAATGAAATCAAGTTTACCATTCGGGAGCCTTTGGGGCTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100735 TTAGGCAATGAAATCAAGTTTACCATTCGGGAGCCTTTGGGGCTCAGGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       GGTCTGGCAGTTCGTCTCTGCTGTGCTCTTCTCCGGCATTGCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100785 ...CAGGGTCTGGCAGTTCGTCTCTGCTGTGCTCTTCTCCGGCATTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATG         GCGCTTGCCTTCCCTGACCAGCTCTATGATGCGGTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101028 TCATGGTG...CAGGCGCTTGCCTTCCCTGACCAGCTCTATGATGCGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGATGGAGCCCAGGTGACCAGCAAGACCCCCATCCGCCTCTACGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101473 TTTGATGGAGCCCAGGTGACCAGCAAGACCCCCATCCGCCTCTACGGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCCCTCCTCA         GCATCTCCCTGATCATGTGGAACGCTCTCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101523 TGCCCTCCTCAGTG...CAGGCATCTCCCTGATCATGTGGAACGCTCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACACGGCTGAGAAGGTCATCATTCGATGGACCCTGCTCACCGAAGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102704 ACACGGCTGAGAAGGTCATCATTCGATGGACCCTGCTCACCGAAGCTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TATTTCGGGGTCCAGTTCTTGG         TGGTCACTGCCACGCTAGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102754 TATTTCGGGGTCCAGTTCTTGGGTG...CAGTGGTCACTGCCACGCTAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGAGACGGGCCTCATGTCCCTGGGGATCCTGCTGCTCCTGGTCAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103338 TGAGACGGGCCTCATGTCCCTGGGGATCCTGCTGCTCCTGGTCAGCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCCTTTTTGTCGTCATCAGCATTTACTACTATTACCAAGTCGGCCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103388 TCCTTTTTGTCGTCATCAGCATTTACTACTATTACCAAGTCGGCCGAAGA

    600     .    :
    556 CCCAAGAAGGCC
        ||||||||||||
 103438 CCCAAGAAGGCC

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