Result of FASTA (ccds) for pF1KB9655
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9655, 682 aa
  1>>>pF1KB9655 682 - 682 aa - 682 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0979+/-0.000957; mu= 7.8084+/- 0.058
 mean_var=158.8520+/-31.969, 0's: 0 Z-trim(111.3): 31  B-trim: 296 in 1/49
 Lambda= 0.101760
 statistics sampled from 12254 (12283) to 12254 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.377), width:  16
 Scan time:  4.140

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2          ( 682) 4706 703.0 3.5e-202
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3          ( 705) 1465 227.2 6.1e-59
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3           ( 686) 1268 198.3   3e-50
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3          ( 410) 1220 191.1 2.6e-48
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17        ( 535) 1127 177.6 4.2e-44
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16          ( 436)  677 111.4 2.8e-24
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12           ( 518)  673 110.9 4.8e-24
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12           ( 468)  664 109.5 1.1e-23
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17          ( 712)  663 109.5 1.7e-23
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 495)  651 107.7 4.3e-23
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12           ( 723)  653 108.0 4.8e-23
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6          ( 607)  650 107.6 5.6e-23
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17          ( 545)  648 107.2 6.3e-23
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17          ( 546)  648 107.2 6.3e-23
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11       ( 385)  628 104.2 3.6e-22
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15          (2856)  635 105.7 9.3e-22
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15          (3065)  635 105.8 9.9e-22
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 372)  616 102.4 1.2e-21
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 398)  616 102.5 1.3e-21
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1          ( 496)  608 101.3 3.4e-21
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1          ( 602)  608 101.4   4e-21
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX         ( 520)  600 100.2   8e-21
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7         ( 447)  583 97.6   4e-20
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6               ( 435)  512 87.2 5.4e-17
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6              ( 377)  500 85.4 1.6e-16
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1           ( 448)  489 83.8 5.7e-16
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12           ( 743)  404 71.5   5e-12


>>CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2               (682 aa)
 initn: 4706 init1: 4706 opt: 4706  Z-score: 3743.3  bits: 703.0 E(32554): 3.5e-202
Smith-Waterman score: 4706; 100.0% identity (100.0% similar) in 682 aa overlap (1-682:1-682)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MQLEHCLSPSIMLSKKFLNVSSSYPHSGGSELVLHDHPIISTTDNLERSSPLKKITRGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MQLEHCLSPSIMLSKKFLNVSSSYPHSGGSELVLHDHPIISTTDNLERSSPLKKITRGMT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 NQSDTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQSDTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 SAMFPYPGQHGPAHPAFSIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYPTAGYPYPQQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SAMFPYPGQHGPAHPAFSIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYPTAGYPYPQQY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 GHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 ISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 RQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 FPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 PGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 DPSGWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPSGWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 AEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSSDSGIYEQAKRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSSDSGIYEQAKRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLA
              610       620       630       640       650       660

              670       680  
pF1KB9 QRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
       ::::::::::::::::::::::
CCDS33 QRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
              670       680  

>>CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3               (705 aa)
 initn: 1677 init1: 1363 opt: 1465  Z-score: 1171.6  bits: 227.2 E(32554): 6.1e-59
Smith-Waterman score: 1902; 52.6% identity (71.6% similar) in 624 aa overlap (94-680:133-703)

            70        80        90       100       110        120  
pF1KB9 DTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQ-SAATAPSA
                                     :.:.:. ...:: : ::  :: :  .:: .
CCDS63 GRKGSPCGEEELPSAAAAAAAAAAAAAATARYSMDSLSSERYYL-QSPGPQGSELAAPCS
            110       120       130       140        150       160 

                130            140          150       160       170
pF1KB9 MFPYPGQ----HGPAHPA-----FSIGS---PSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYP
       .::: .     :::..::     .  ::   :. . :       . ..   . .:  :  
CCDS63 LFPYQAAAGAPHGPVYPAPNGARYPYGSMLPPGGFPAAVCPPGRAQFGPGAGAGSGAGGS
             170       180       190       200       210       220 

              180       190                 200          210       
pF1KB9 TAGYPYPQQYGHSYQGAPFY------QFSSTQPGL----VPG---KAQVYLCNRPLWLKF
       ..:   :  : .: ::::.:        ...  ::    :::   .:.::::::::::::
CCDS63 SGGGGGPGTYQYS-QGAPLYGPYPGAAAAGSCGGLGGLGVPGSGFRAHVYLCNRPLWLKF
             230        240       250       260       270       280

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB9 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKA
       ::::::::::::::::::::::::.::.::::::.::.:.::::::::::::::: ::::
CCDS63 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPNHWRFQGGKWVTCGKA
              290       300       310       320       330       340

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB9 DTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRL
       :.:.:::..:.::.:::::.::::::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::
CCDS63 DNNMQGNKMYVHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNTQMIVLQSLHKYQPRL
              350       360       370       380       390       400

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB9 HVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDT
       :.:::.:::.:: ..:...::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS63 HIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDS
              410       420       430       440       450       460

       400       410        420       430       440       450      
pF1KB9 IYTGCDMDRLTPSPNDSPRS-QIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPG
       .::. . :::::::.::::: :::::.::..  ::. . ::..  .::.. :        
CCDS63 MYTASENDRLTPSPTDSPRSHQIVPGGRYGVQ-SFFPEPFVNTLPQARYYNG--------
              470       480       490        500       510         

        460       470       480       490           500       510  
pF1KB9 TDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPAN----NRLDFAASAYDTATDFAGNAAT
        .:.::.:::::::::.:. . : ::::.:::..    :.::.  :.:..      ...:
CCDS63 -ERTVPQTNGLLSPQQSEEVANP-PQRWLVTPVQQPGTNKLDI--SSYESEY----TSST
              520       530        540       550             560   

            520       530       540            550       560       
pF1KB9 LLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPS-----GWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPN
       :: :   :.:.::::    :.. :::: ::.     :::.:.  :    : .. :: : .
CCDS63 LLPY---GIKSLPLQ----TSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQ---RKMAAGLP-WTS
              570           580       590       600           610  

       570       580       590       600       610       620       
pF1KB9 SAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSS
        .         .: .  : . :. :            : :.   ::::::: ::::.::.
CCDS63 RT---------SPTVFSEDQ-LSKE------------KVKEEIGSSWIETPPSIKSLDSN
                     620                    630       640       650

       630        640       650       660       670       680  
pF1KB9 DSGIYEQA-KRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
       :::.: .: ::::.::...  .:.:  .: : .  ..  :. .: ..:::.::.  
CCDS63 DSGVYTSACKRRRLSPSNSS-NENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKGMGGYYAFYTTP
              660       670        680       690       700     

>>CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3                (686 aa)
 initn: 1650 init1: 1219 opt: 1268  Z-score: 1015.5  bits: 198.3 E(32554): 3e-50
Smith-Waterman score: 1768; 50.4% identity (69.0% similar) in 623 aa overlap (94-680:133-684)

            70        80        90       100       110        120  
pF1KB9 DTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQ-SAATAPSA
                                     :.:.:. ...:: : ::  :: :  .:: .
CCDS26 GRKGSPCGEEELPSAAAAAAAAAAAAAATARYSMDSLSSERYYL-QSPGPQGSELAAPCS
            110       120       130       140        150       160 

                130            140          150       160       170
pF1KB9 MFPYPGQ----HGPAHPA-----FSIGS---PSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYP
       .::: .     :::..::     .  ::   :. . :       . ..   . .:  :  
CCDS26 LFPYQAAAGAPHGPVYPAPNGARYPYGSMLPPGGFPAAVCPPGRAQFGPGAGAGSGAGGS
             170       180       190       200       210       220 

              180       190                 200          210       
pF1KB9 TAGYPYPQQYGHSYQGAPFY------QFSSTQPGL----VPG---KAQVYLCNRPLWLKF
       ..:   :  : .: ::::.:        ...  ::    :::   .:.::::::::::::
CCDS26 SGGGGGPGTYQYS-QGAPLYGPYPGAAAAGSCGGLGGLGVPGSGFRAHVYLCNRPLWLKF
             230        240       250       260       270       280

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB9 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKA
       ::::::::::::::::::::::::.::.::::::.::.:.::::::::::::::: ::::
CCDS26 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPNHWRFQGGKWVTCGKA
              290       300       310       320       330       340

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB9 DTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRL
       :.:.:::..:.::.:::::.::::::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::
CCDS26 DNNMQGNKMYVHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNTQMIVLQSLHKYQPRL
              350       360       370       380       390       400

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB9 HVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDT
       :.:::.:::.:: ..:...::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS26 HIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDS
              410       420       430       440       450       460

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB9 IYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGT
        .                  :::::.::..  ::. . ::..  .::.. :         
CCDS26 SH------------------QIVPGGRYGVQ-SFFPEPFVNTLPQARYYNG---------
                                470        480       490           

       460       470       480       490           500       510   
pF1KB9 DRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPAN----NRLDFAASAYDTATDFAGNAATL
       .:.::.:::::::::.:. . : ::::.:::..    :.::.  :.:..      ...::
CCDS26 ERTVPQTNGLLSPQQSEEVANP-PQRWLVTPVQQPGTNKLDI--SSYESEY----TSSTL
            500       510        520       530         540         

           520       530       540            550       560        
pF1KB9 LSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPS-----GWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPNS
       : :   :.:.::::    :.. :::: ::.     :::.:.  :    : .. :: : . 
CCDS26 LPY---GIKSLPLQ----TSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQ---RKMAAGLP-WTSR
            550           560       570       580          590     

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB9 AAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSSD
       .         .: .  : . :. :            : :.   ::::::: ::::.::.:
CCDS26 T---------SPTVFSEDQ-LSKE------------KVKEEIGSSWIETPPSIKSLDSND
                   600                    610       620       630  

      630        640       650       660       670       680  
pF1KB9 SGIYEQA-KRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
       ::.: .: ::::.::...  .:.:  .: : .  ..  :. .: ..:::.::.  
CCDS26 SGVYTSACKRRRLSPSNSS-NENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKGMGGYYAFYTTP
            640       650        660       670       680      

>>CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3               (410 aa)
 initn: 1418 init1: 1158 opt: 1220  Z-score: 980.7  bits: 191.1 E(32554): 2.6e-48
Smith-Waterman score: 1585; 56.4% identity (76.0% similar) in 459 aa overlap (233-680:1-408)

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB9 KAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPN
                                     :::::::::.::.::::::.::.:.:::::
CCDS63                               MFPFLSFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPN
                                             10        20        30

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB9 HWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNG
       :::::::::: :::::.:.:::..:.::.:::::.::::::::::::::::::::.::: 
CCDS63 HWRFQGGKWVTCGKADNNMQGNKMYVHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNT
               40        50        60        70        80        90

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB9 QMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKI
       ::.:::::::::::::.:::.:::.:: ..:...::::: ::::::::::::::::::::
CCDS63 QMIVLQSLHKYQPRLHIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKI
              100       110       120       130       140       150

            390       400       410        420       430       440 
pF1KB9 DHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRS-QIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYA
       ::::::::::::::..::. . :::::::.::::: :::::.::..  ::. . ::..  
CCDS63 DHNPFAKGFRDNYDSMYTASENDRLTPSPTDSPRSHQIVPGGRYGVQ-SFFPEPFVNTLP
              160       170       180       190        200         

             450       460       470       480       490           
pF1KB9 KARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPAN----NRLDFAA
       .::.. :         .:.::.:::::::::.:. . : ::::.:::..    :.::.  
CCDS63 QARYYNG---------ERTVPQTNGLLSPQQSEEVANP-PQRWLVTPVQQPGTNKLDI--
     210                220       230        240       250         

       500       510       520       530       540            550  
pF1KB9 SAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPS-----GWGARSPPQ
       :.:..      ...::: :   :.:.::::    :.. :::: ::.     :::.:.  :
CCDS63 SSYESEY----TSSTLLPY---GIKSLPLQ----TSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQ
       260           270          280           290       300      

            560       570       580       590       600       610  
pF1KB9 YCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDS
           : .. :: : . ..         : .  : . :. :            : :.   :
CCDS63 R---KMAAGLP-WTSRTS---------PTVFSE-DQLSKE------------KVKEEIGS
           310        320                 330                   340

            620       630        640       650       660       670 
pF1KB9 SWIETPSSIKSIDSSDSGIYEQA-KRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKD
       :::::: ::::.::.:::.: .: ::::.::...  .:.:  .: : .  ..  :. .: 
CCDS63 SWIETPPSIKSLDSNDSGVYTSACKRRRLSPSNSS-NENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKG
              350       360       370        380       390         

             680  
pF1KB9 ISGYYGFYSHS
       ..:::.::.  
CCDS63 MGGYYAFYTTP
     400       410

>>CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17             (535 aa)
 initn: 1108 init1: 1025 opt: 1127  Z-score: 905.2  bits: 177.6 E(32554): 4.2e-44
Smith-Waterman score: 1151; 42.8% identity (61.9% similar) in 538 aa overlap (125-653:57-514)

          100       110       120       130        140             
pF1KB9 HSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAPSAMFPYPGQHG-PAHPAFSIGS---PSR-YMAHH
                                     ::::    :: :.  .:.   : :   :  
CCDS11 PGADPQHRYFYPEPGAQDADERRGGGSLGSPYPGGALVPAPPSRFLGAYAYPPRPQAAGF
         30        40        50        60        70        80      

     150       160        170       180       190        200       
pF1KB9 PVITNGAYNSLLSNSSPQGY-PTAGYPYPQQYGHSYQGAPFYQFSSTQPGL-VPGKAQVY
       :    :: .:.   .. .:: :  ::  :.  .  : : :  ...    :: : :: .: 
CCDS11 P----GAGESFPPPADAEGYQPGEGYAAPDPRAGLYPG-PREDYA-LPAGLEVSGKLRVA
             90       100       110       120         130       140

       210       220       230       240       250       260       
pF1KB9 LCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQ
       : :. :: ::..::::::::::::::::::::...::.::.:: .::::.:.: .:::.:
CCDS11 LNNHLLWSKFNQHQTEMIITKQGRRMFPFLSFTVAGLEPTSHYRMFVDVVLVDQHHWRYQ
              150       160       170       180       190       200

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB9 GGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVL
       .:::: ::::. .. :::.:.:::::::::::::::.::::::::::::::::  ::.::
CCDS11 SGKWVQCGKAEGSMPGNRLYVHPDSPNTGAHWMRQEVSFGKLKLTNNKGASNNVTQMIVL
              210       220       230       240       250       260

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB9 QSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPF
       :::::::::::.::::.   : . . . .. ::: ::::::::::::..:::::::.:::
CCDS11 QSLHKYQPRLHIVEVNDGEPEAACNASNTHIFTFQETQFIAVTAYQNAEITQLKIDNNPF
              270       280       290       300       310       320

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB9 AKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHP
       :::::.:....::. : .   :::  .:  :.. : .:.    .: .:.    . .::.:
CCDS11 AKGFRENFESMYTSVDTS--IPSP-PGPNCQFLGGDHYS---PLLPNQYP---VPSRFYP
              330         340        350          360          370 

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB9 GAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFA
            :: . :         . ::            :. .: ..       .:..     
CCDS11 DL---PGQAKD---------VVPQA----------YWLGAPRDH-------SYEAE----
                         380                 390                   

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB9 GNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPSGWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPN
               . :...:   : .:   :  ..::    :  . .:       .:     :: 
CCDS11 --------FRAVSMKPAFLPSA--PGPTMSYY---RGQEVLAPG------AG-----WPV
              400       410         420                430         

       570       580       590       600       610        620      
pF1KB9 SAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDS-SWIETPSSIKSIDS
       .     .:. :. .  .  . :  :  :  ::..:   :.: .    : :  . :.  .:
CCDS11 APQYPPKMGPASWF--RPMRTLPME--P-GPGGSEGRGPEDQGPPLVWTEI-APIRP-ES
          440         450          460       470       480         

        630        640       650       660       670       680  
pF1KB9 SDSGIYE-QAKRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
       ::::. : ..::::.::  .  ..::::                             
CCDS11 SDSGLGEGDSKRRRVSPYPSS-GDSSSPAGAPSPFDKEAEGQFYNYFPN        
       490       500        510       520       530             

>>CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16               (436 aa)
 initn: 704 init1: 245 opt: 677  Z-score: 549.5  bits: 111.4 E(32554): 2.8e-24
Smith-Waterman score: 683; 34.0% identity (56.5% similar) in 444 aa overlap (120-542:4-406)

      90       100       110       120          130       140      
pF1KB9 VSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAPSAMFPYPG---QHGPAHPAFSIGSPSRYM
                                     :  ..:  :   . :::.:. . . :    
CCDS10                            MYHPRELYPSLGAGYRLGPAQPGADSSFPPALA
                                          10        20        30   

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB9 A--HHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYPTAGYPYPQQYGHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKA
          ..: . .   . .::.        :..: :       .:.     .      .:: .
CCDS10 EGYRYPELDTPKLDCFLSGMEAAPRTLAAHP-PLPLLPPAMGTEPAPSAPEALHSLPG-V
            40        50        60         70        80        90  

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB9 QVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHW
       .. : :: :: .:    ::::::: ::::::    ...:::: :.: ...::: .:  ..
CCDS10 SLSLENRELWKEFSSVGTEMIITKAGRRMFPACRVSVTGLDPEARYLFLLDVIPVDGARY
             100       110       120       130       140       150 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB9 RFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQM
       :.:: .: : :::.  .  .:::.::::: :::::::: .:: ..::::.  . . .:..
CCDS10 RWQGRRWEPSGKAEPRLP-DRVYIHPDSPATGAHWMRQPVSFHRVKLTNS--TLDPHGHL
             160        170       180       190       200          

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB9 VVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDH
       . :.:.::::::.:.:.. .  ..   . : . .: :::: ::.:::::: .::::::  
CCDS10 I-LHSMHKYQPRIHLVRAAQLCSQ---HWGGMASFRFPETTFISVTAYQNPQITQLKIAA
       210       220       230          240       250       260    

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB9 NPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKAR
       ::::::::.:      .:  .:      :.  .. . : . : . ..             
CCDS10 NPFAKGFRENG----RNCKRER------DARVKRKLRGPEPAATEAY-------------
          270           280             290       300              

          450       460       470           480              490   
pF1KB9 FHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPG----APSP-------QRWFVTPAN---
          :.:  ::   : ..       .:.::  ::    ::.:       . ... ::    
CCDS10 ---GSGDTPGGPCDSTLGGDIRESDPEQAPAPGEATAAPAPLCGGPSAEAYLLHPAAFHG
                310       320       330       340       350        

                500       510       520       530       540        
pF1KB9 --NRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPSGWGAR
         ..:   . ..  : : .: .:    :.:: .. :: ...: .: : .  : :      
CCDS10 APSHLPTRSPSFPEAPD-SGRSAP---YSAAFLE-LP-HGSGGSGYPAAPPAVPFAPHFL
      360       370        380           390        400       410  

      550       560       570       580       590       600        
pF1KB9 SPPQYCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKD
                                                                   
CCDS10 QGGPFPLPYTAPGGYLDVGSKPMY                                    
            420       430                                          

>>CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12                (518 aa)
 initn: 656 init1: 259 opt: 673  Z-score: 545.2  bits: 110.9 E(32554): 4.8e-24
Smith-Waterman score: 685; 39.3% identity (63.8% similar) in 351 aa overlap (146-490:10-309)

         120       130       140       150       160          170  
pF1KB9 AATAPSAMFPYPGQHGPAHPAFSIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQ---GYPTA
                                     .:: :.  ..  ..:  .:.:.   : :. 
CCDS91                      MADADEGFGLAHTPLEPDA--KDLPCDSKPESALGAPSK
                                    10          20        30       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 GYPYPQQYGHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRR
       .   ::        : :     :: :.  :  .:.: .: ::::::.  ::::::: :::
CCDS91 SPSSPQ--------AAF-----TQQGM-EG-IKVFLHERELWLKFHEVGTEMIITKAGRR
        40                     50          60        70        80  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 MFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDS
       :::  . ...::.: ..: ...:.. :: ....:  .::   :::.  . : :.:.::::
CCDS91 MFPSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHRYKFADNKWSVTGKAEPAMPG-RLYVHPDS
             90       100       110       120       130        140 

            300       310       320       330       340            
pF1KB9 PNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNED---GTED
       : :::::::: .:: :::::::.   .  :. ..:.:.::::::::.:...:.   :...
CCDS91 PATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNH--LDPFGH-IILNSMHKYQPRLHIVKADENNGFGSKN
             150       160         170        180       190        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB9 TSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTP
       :.      : .:::: :::::.:::  ::::::..:::::::: . :      .. :.  
CCDS91 TA----FCTHVFPETAFIAVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDM-----ELHRM--
      200           210       220       230       240              

     410       420       430       440       450       460         
pF1KB9 SPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLS
       :  .: .  .::  :     : .... .::..           :  . .:..  ...: :
CCDS91 SRMQSKEYPVVP--R-----STVRQKVASNHS-----------PFSSESRALSTSSNLGS
       250         260            270                  280         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB9 PQQAEDPGAPSPQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAA
         : :. :. .:.. .. : :                                       
CCDS91 QYQCEN-GVSGPSQDLLPPPNPYPLPQEHSQIYHCTKRKEEECSTTDHPYKKPYMETSPS
     290        300       310       320       330       340        

>>CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12                (468 aa)
 initn: 656 init1: 259 opt: 664  Z-score: 538.7  bits: 109.5 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 674; 41.9% identity (67.5% similar) in 289 aa overlap (205-490:5-259)

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB9 PYPQQYGHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMF
                                     .:.: .: ::::::.  ::::::: :::::
CCDS91                           MEGIKVFLHERELWLKFHEVGTEMIITKAGRRMF
                                         10        20        30    

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB9 PFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPN
       :  . ...::.: ..: ...:.. :: ....:  .::   :::.  . : :.:.::::: 
CCDS91 PSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHRYKFADNKWSVTGKAEPAMPG-RLYVHPDSPA
           40        50        60        70        80         90   

          300       310       320       330       340          350 
pF1KB9 TGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNED---GTEDTS
       :::::::: .:: :::::::.   .  :. ..:.:.::::::::.:...:.   :...:.
CCDS91 TGAHWMRQLVSFQKLKLTNNH--LDPFGH-IILNSMHKYQPRLHIVKADENNGFGSKNTA
           100       110         120        130       140       150

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB9 QPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSP
             : .:::: :::::.:::  ::::::..:::::::: . :      .. :.  : 
CCDS91 ----FCTHVFPETAFIAVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDM-----ELHRM--SR
                  160       170       180       190                

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB9 NDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQ
        .: .  .::        : .... .::..           :  . .:..  ...: :  
CCDS91 MQSKEYPVVPR-------STVRQKVASNHS-----------PFSSESRALSTSSNLGSQY
     200       210              220                  230       240 

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 QAEDPGAPSPQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGC
       : :. :. .:.. .. : :                                         
CCDS91 QCEN-GVSGPSQDLLPPPNPYPLPQEHSQIYHCTKRKEEECSTTDHPYKKPYMETSPSEE
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17               (712 aa)
 initn: 718 init1: 245 opt: 663  Z-score: 535.2  bits: 109.5 E(32554): 1.7e-23
Smith-Waterman score: 663; 40.2% identity (67.0% similar) in 291 aa overlap (107-393:6-287)

         80        90       100       110       120        130     
pF1KB9 DVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAPS-AMFPYPGQHGPAHP
                                     :. :..      ::  : ::. .  . :.:
CCDS11                          MREPALAASAMAYHPFHAPRPADFPMSAFLAAAQP
                                        10        20        30     

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB9 AF--SIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYPTAGYPYPQQYGHSYQGAPFYQFS
       .:  ... :   .:. :.   :  ..  . ..  .   ::  . .  :    .: . ...
CCDS11 SFFPALALPPGALAK-PLPDPGLAGAAAAAAAAAAAAEAGL-HVSALGPHPPAAHLRSLK
          40        50         60        70         80        90   

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB9 STQP-GLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNI
       : .:   :    .: :  . :: .::.  :::.:::.:::::: ..  .::::  :.: .
CCDS11 SLEPEDEVEDDPKVTLEAKELWDQFHKLGTEMVITKSGRRMFPPFKVRVSGLDKKAKYIL
           100       110       120       130       140       150   

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB9 FVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLT
       ..:.. ::  ...:....:.  :::: ..  .:.:.::::: :: .:: . ..: :::::
CCDS11 LMDIVAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEMP-KRMYIHPDSPATGEQWMAKPVAFHKLKLT
           160       170       180        190       200       210  

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB9 NNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAY
       ::   :...: ...:.:.::::::.:.:..:.      :     .:..::::.:::::::
CCDS11 NN--ISDKHG-FTILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYST---FRTYVFPETDFIAVTAY
              220        230       240          250       260      

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB9 QNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFL
       ::  :::::::.:::::::::                                       
CCDS11 QNDKITQLKIDNNPFAKGFRDTGNGRREKRKQLTLPSLRLYEEHCKPERDGAESDASSCD
        270       280       290       300       310       320      

>>CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (495 aa)
 initn: 592 init1: 254 opt: 651  Z-score: 528.1  bits: 107.7 E(32554): 4.3e-23
Smith-Waterman score: 658; 33.2% identity (52.5% similar) in 539 aa overlap (105-607:13-495)

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB9 PGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAPSAMFPYPGQHGPAH
                                     .  :. :.  .:.  :.:  :    .:: .
CCDS13                   MHFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPRE
                                 10        20        30        40  

          140       150       160       170               180      
pF1KB9 PAFSIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYP--------TAGYPYPQQYGHSYQG
       :      : ::    :  . .: ..      :..::        :..   :.  : :  .
CCDS13 PP---PPPPRY---DPC-AAAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAA
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