Result of FASTA (ccds) for pF1KE1086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1086, 2644 aa
  1>>>pF1KE1086     2644 - 2644 aa - 2644 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2438+/-0.00146; mu= 20.9439+/- 0.087
 mean_var=73.1617+/-14.494, 0's: 0 Z-trim(97.6): 38  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.149945
 statistics sampled from 5156 (5175) to 5156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.469), E-opt: 0.2 (0.155), width:  16
 Scan time:  4.030

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS3124.1 ATR gene_id:545|Hs109|chr3              (2644) 17465 3789.2       0
CCDS31669.1 ATM gene_id:472|Hs109|chr11            (3056)  739 171.0 9.2e-41
CCDS127.1 MTOR gene_id:2475|Hs109|chr1             (2549)  625 146.3 2.1e-33
CCDS45430.1 SMG1 gene_id:23049|Hs109|chr16         (3661)  485 116.0 3.8e-24
CCDS75735.1 PRKDC gene_id:5591|Hs109|chr8          (4128)  306 77.3 1.9e-12


>>CCDS3124.1 ATR gene_id:545|Hs109|chr3                   (2644 aa)
 initn: 17465 init1: 17465 opt: 17465  Z-score: 20401.2  bits: 3789.2 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 17465; 100.0% identity (100.0% similar) in 2644 aa overlap (1-2644:1-2644)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 QLDEHMGYLQSAPLQLMSMQNLEFIEVTLLTVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYG
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLDEHMGYLQSAPLQLMSMQNLEFIEVTLLMVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 SPKIKSLAISFLTELFQLGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPKIKSLAISFLTELFQLGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 TLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLLEKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLLEKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 YESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEVDAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEVDAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 SSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIKHVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIKHVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 GLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 TKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSFEDHILEDLCGMLSLPWIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSFEDHILEDLCGMLSLPWIY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 SHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRIFLEWRTAVYNWAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRIFLEWRTAVYNWAL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 QSSHEVIRASCVSGFFILLQQQNSCNRVPKILIDKVKDDSDIVKKEFASILGQLVCTLHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QSSHEVIRASCVSGFFILLQQQNSCNRVPKILIDKVKDDSDIVKKEFASILGQLVCTLHG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 MFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSPVKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSPVKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 AFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 FIKELFVLRMKEAYTHAQISRNNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FIKELFVLRMKEAYTHAQISRNNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 ASVSGAAYTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASVSGAAYTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 KQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 LNVNRREILINNFKYIFSHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNVNRREILINNFKYIFSHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE1 LRIGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRIGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE1 SSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHVSSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHVSSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE1 RCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAAIFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAAIFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE1 LKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENVDVRIHALTSLKETLYKNQEKLIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENVDVRIHALTSLKETLYKNQEKLIK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE1 YATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQGKD
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE1 FTFVTGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDCREMETNGPGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FTFVTGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDCREMETNGPGH
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE1 QLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLIT
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE1 KVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAVLKHDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAVLKHDD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE1 QHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE1 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLY
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE1 AAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVV
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE1 KSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTW
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE1 SVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCEL
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE1 EHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMV
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE1 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE1 ELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHF
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE1 YLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYGTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYGTK
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KE1 AYEWEKAGRSDRVQMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLTAFSQLISRICHSHDEVFVVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AYEWEKAGRSDRVQMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLTAFSQLISRICHSHDEVFVVL
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KE1 MEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLEKFVGDATRLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLEKFVGDATRLTD
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE1 KLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTLPSILGTHANH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTLPSILGTHANH
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KE1 ASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLME
             2290      2300      2310      2320      2330      2340

             2350      2360      2370      2380      2390      2400
pF1KE1 FNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVY
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KE1 MTGKELRQCMLPKSAALSEKLKVFREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTGKELRQCMLPKSAALSEKLKVFREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRS
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

             2470      2480      2490      2500      2510      2520
pF1KE1 TAVMSMVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TAVMSMVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMV
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

             2530      2540      2550      2560      2570      2580
pF1KE1 NGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNET
             2530      2540      2550      2560      2570      2580

             2590      2600      2610      2620      2630      2640
pF1KE1 GEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGW
             2590      2600      2610      2620      2630      2640

           
pF1KE1 TPYM
       ::::
CCDS31 TPYM
           

>>CCDS31669.1 ATM gene_id:472|Hs109|chr11                 (3056 aa)
 initn: 787 init1: 456 opt: 739  Z-score: 845.5  bits: 171.0 E(33420): 9.2e-41
Smith-Waterman score: 1223; 22.0% identity (53.1% similar) in 2138 aa overlap (737-2644:993-3056)

        710       720       730       740       750       760      
pF1KE1 FASILGQLVCTLHGMFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKA---SVC
                                     ::    .::  ...   .. . ..   .: 
CCDS31 MEDVLELLKPLSNVCSLYRRDQDVCKTILNHVLHVVKNLGQSNMDSENTRDAQGQFLTVI
            970       980       990      1000      1010      1020  

           770        780       790       800              810     
pF1KE1 KPFLFLLK-KKIPSPVKLAFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLG-------TLLNLMED
         :  : : .:    :..:... :. : .   .  ..  .  :.:       .. ... :
CCDS31 GAFWHLTKERKYIFSVRMALVNCLKTLLEADPY--SKWAILNVMGKDFPVNEVFTQFLAD
           1030      1040      1050        1060      1070      1080

         820       830       840       850        860       870    
pF1KE1 PDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDGFIKELFVLRMKE-AYTHAQISRNNELKDTLILTTG
         ..::.  . .:......  .... . . . :.... :. .: .. .. ...       
CCDS31 NHHQVRMLAAESINRLFQDTKGDSSRLLKALPLKLQQTAFENAYLKAQEGMRE-------
             1090      1100      1110      1120      1130          

          880       890       900        910        920       930  
pF1KE1 DIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKSASV-SGAAYTEIRALVA-AKSVKLQSFFSQYKKP
        ....:..  .   . .    ::.  : : : .   : .:: :  :::: ...  .  : 
CCDS31 -MSHSAENPETLDEIYNRKSVLLTLIAVVLSCSPICEKQALFALCKSVKENGLEPHLVKK
           1140      1150      1160      1170      1180      1190  

            940       950       960       970       980       990  
pF1KE1 ICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVRKQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLT
       . . . :..   ..  .  .  .   ..  .. .. :. :...  :  .... ... :  
CCDS31 VLEKVSETFGYRRLEDFMASHLDYLVLEWLNL-QDTEYNLSSFPFI--LLNYTNIEDFYR
           1200      1210      1220       1230        1240         

           1000      1010      1020      1030      1040            
pF1KE1 RTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQLNVNRREILINNFKYIFSHLV-----------
          .::.: :. ..       ......:.. . . .: . :  :. ...           
CCDS31 SCYKVLIPHLVIRSHFDE---VKSIANQIQEDWKSLLTDCFPKILVNILPYFAYEGTRDS
    1250      1260         1270      1280      1290      1300      

             1050      1060        1070      1080      1090        
pF1KE1 -CSCSKDELERALHYLKNETEI--ELGSLLRQDFQGLHNELLLRIGEHYQQVFNGLSILA
         . ...   ..  .::.:. .  ..  :. ...  .  :::. . :  ..  .  . : 
CCDS31 GMAQQRETATKVYDMLKSENLLGKQIDHLFISNLPEIVVELLMTLHEPANSSASQSTDLC
       1310      1320      1330      1340      1350      1360      

     1100      1110      1120            1130      1140            
pF1KE1 SFASSDDPYQGPRDIISPELMADYL------QPKLLGILAFFNMQLLSSS---VGIEDKK
       .:... ::  .:  . :  . : .       . :: .:: ... .  : .   ..: .. 
CCDS31 DFSGDLDPAPNPPHFPSHVIKATFAYISNCHKTKLKSILEILSKSPDSYQKILLAICEQA
       1370      1380      1390      1400      1410      1420      

    1150      1160       1170                   1180      1190     
pF1KE1 MALNSLMSLMKLMGPKHV-SSVRVKMMTT---------LR----TGLRFKDDFPE-----
          :....  ...   :.  :. .: . .         ::    : ... .. :      
CCDS31 AETNNVYKKHRILKIYHLFVSLLLKDIKSGLGGAWAFVLRDVIYTLIHYINQRPSCIMDV
       1430      1440      1450      1460      1470      1480      

                   1200      1210         1220         1230        
pF1KE1 ------LCCRAWDCFVRCLDHACLGSLLSH--VIVA-LLPLIHIQ---PKETAAIFHYLI
             :::   .   .     :  .: .:  :::. :.::.. :    :..  ...::.
CCDS31 SLRSFSLCCDLLSQVCQTAVTYCKDALENHLHVIVGTLIPLVYEQVEVQKQVLDLLKYLV
       1490      1500      1510      1520      1530      1540      

     1240      1250         1260      1270      1280      1290     
pF1KE1 IENRDAVQDFLHEIYFL---PDHPELKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHE
       :.:.:  ...   : .:   :::  .: .. . :. .   .  . :.   ..   ..   
CCDS31 IDNKDN-ENLYITIKLLDPFPDHVVFKDLRITQQKIKYSRGPFSLLEEINHFLSVSVYDA
       1550       1560      1570      1580      1590      1600     

        1300      1310        1320      1330      1340         1350
pF1KE1 NVDVRIHALTSLKETL--YKNQEKLIKYATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDA---NSQA
          .:...: .:.. :  .:.:   :  :....  . :. .::. ::.  . :   ... 
CCDS31 LPLTRLEGLKDLRRQLELHKDQMVDIMRASQDNPQDGIMVKLVVNLLQLSKMAINHTGEK
        1610      1620      1630      1640      1650      1660     

               1360      1370       1380         1390      1400    
pF1KE1 RLL--CGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQ-GKDFTFVTGV---EDSSFAYGLLMELTRAY
       ..:   : ::::.: ::     :::   : .:: ... ..   ::. . . ..:      
CCDS31 EVLEAVGSCLGEVGPID-----FSTIAIQHSKDASYTKALKLFEDKELQWTFIM------
        1670      1680           1690      1700      1710          

         1410      1420      1430       1440         1450      1460
pF1KE1 LAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDC-REMETNGPGHQLWRRFP---EHVREILEPHLNT
       :.: .:. ..:     ..   .   : ... ..  ::..:. .    . .   :.:  ..
CCDS31 LTYLNNTLVEDC----VKVRSAAVTCLKNILATKTGHSFWEIYKMTTDPMLAYLQPFRTS
         1720          1730      1740      1750      1760      1770

                  1470      1480      1490      1500        1510   
pF1KE1 RYKSSQ-----KSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLITK--VRHDLASKIFTC
       : :  .     : . . :.        :. :   :  . .  .. .  .. .. . .   
CCDS31 RKKFLEVPRFDKENPFEGLDDINLWIPLSENHDIWIKTLTCAFLDSGGTKCEILQLLKPM
             1780      1790      1800      1810      1820      1830

          1520      1530      1540           1550      1560        
pF1KE1 CSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQE-----VYAEIMAVLKHDDQHTINTQD
       : .  : ::  :.  ::...  .::  ..:. ..     : . . . :.: .: . .:  
CCDS31 CEV--KTDFCQTV--LPYLIHDILLQDTNESWRNLLSTHVQGFFTSCLRHFSQTSRSTTP
               1840        1850      1860      1870      1880      

     1570      1580      1590       1600      1610      1620       
pF1KE1 IASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKF-QALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVSTVDYEDYQ
         ..: . : .     ::. .: .     . .. .: : : .  :  :..   ..: .  
CCDS31 --ANLDSESEHFFRCCLDKKSQRTMLAVVDYMRRQKRPSSGTIFN--DAFWLDLNYLEVA
         1890      1900      1910      1920        1930      1940  

      1630           1640      1650          1660      1670        
pF1KE1 SVTR-----FLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFE----SFITEKKQNIQEHLG----
       .:..     :  :.  .  :  .  .    :..   :    . :.  ... .:. :    
CCDS31 KVAQSCAAHFTALLYAEIYADKKSMDDQEKRSLAFEEGSQSTTISSLSEKSKEETGISLQ
           1950      1960      1970      1980      1990      2000  

          1680      1690      1700      1710      1720      1730   
pF1KE1 -FLQKLYAAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQI
        .: ..: .. :::.. : .. .  .:  . .  :::.  .   : . ::    . :.. 
CCDS31 DLLLEIYRSIGEPDSLYGCGGGKMLQPITRLRTYEHEA--MWGKALVTYDLETAI-PSST
           2010      2020      2030      2040        2050          

          1740      1750      1760      1770      1780      1790   
pF1KE1 IHYHGVVKSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAA
        .  :..... .::    . . ..:.  . ..:  ::.  . .:::.  :::   . .. 
CCDS31 -RQAGIIQALQNLGLCHILSVYLKGLDYENKDWCPELEELHYQAAWRNMQWDHCTS-VSK
     2060      2070      2080      2090      2100      2110        

          1800      1810      1820      1830      1840      1850   
pF1KE1 DGKSTTWSVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVR
       . ..:..   : . : : . :....::.::: .:....  .   :.:  :    :  . :
CCDS31 EVEGTSYHESLYNALQSLRDREFSTFYESLKYARVKEVEEMCKRSLE--SVYSLYPTLSR
      2120      2130      2140      2150      2160        2170     

          1860      1870       1880      1890       1900      1910 
pF1KE1 LHMLCELEHSIKPLFQHSPGDSS-QEDSLNWVARLEMTQNS-YRAKEPILALRRALLSLN
       :. . ::: ::  ::..:    . .:  ..:  . .. ..: .  .:::.::: ..: . 
CCDS31 LQAIGELE-SIGELFSRSVTHRQLSEVYIKWQKHSQLLKDSDFSFQEPIMALRTVILEIL
        2180       2190      2200      2210      2220      2230    

            1920              1930      1940           1950        
pF1KE1 KRPDYNEMVGEC--------WLQSARVARKAGHHQTAYNALL-----NAGESRLAELYVE
        . ....   ::         .. . .::   . :    :..     :.    ..:  .:
CCDS31 MEKEMDNSQRECIKDILTKHLVELSILARTFKNTQLPERAIFQIKQYNSVSCGVSEWQLE
         2240      2250      2260      2270      2280      2290    

     1960      1970      1980          1990      2000      2010    
pF1KE1 RAKWLWSKGDVHQALIVLQKGVEL----CFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETA
       .:. .:.: .   :: .:.. ..     :  .:   :  :  : . . . . : .. :: 
CCDS31 EAQVFWAKKEQSLALSILKQMIKKLDASCAANN---PSLK--LTYTECLRVCGNWLAETC
         2300      2310      2320         2330        2340         

         2020      2030                   2040          2050       
pF1KE1 NFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGH-------------FYLAKY----YDKLMPMVTDNK
         .  .::. : . .. .    ::.             . ::..    :...  .. ...
CCDS31 LENPAVIMQTYLEKAVEVAGNYDGESSDELRNGKMKAFLSLARFSDTQYQRIENYMKSSE
    2350      2360      2370      2380      2390      2400         

      2060      2070      2080      2090                   2100    
pF1KE1 MEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLD-------------YGTKAYE-
       .:..  :..    . :   ..  :    ..  .  : ::             .  :: : 
CCDS31 FENKQALLKRAKEEVGLLREHKIQTNRYTVKVQRELELDELALRALKEDRKRFLCKAVEN
    2410      2420      2430      2440      2450      2460         

                                2110       2120                2130
pF1KE1 -------------W---------EKAGRSD-RVQMRNDLGKINK----------VITEHT
                    :         :..: :.   .:. :  ::            .    :
CCDS31 YINCLLSGEEHDMWVFRLCSLWLENSGVSEVNGMMKRDGMKIPTYKFLPLMYQLAARMGT
    2470      2480      2490      2500      2510      2520         

             2140      2150        2160        2170        2180    
pF1KE1 NYLAPYQFLTAFSQLISRIC--HSHDEVFVVLMEIIAKV--FLAYPQQAMW--MMTAVSK
       ....   :  ....:::::   : :  .:..:    :.   ::. :. :    .   : :
CCDS31 KMMGGLGFHEVLNNLISRISMDHPHHTLFIILALANANRDEFLTKPEVARRSRITKNVPK
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pF1KE1 SSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLE-KFVGDATRLTDKLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHF
       .:  .  .:  :  :. :   .: . ..: ..  : :  . : :  .:        .:..
CCDS31 QSSQLDEDRT-EAANRIICTIRSRRPQMVRSVEALCDAYIILAN--LD--------ATQW
    2590       2600      2610      2620      2630                  

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pF1KE1 KMLKKLVEEATFSEI--LIPLQSVMIPTLPSILGTHANHASHEPFPGHWAYIAGFDDMVE
       :  .: ..  . . :  :  :..:..::.      ...:...    :. . : .:    .
CCDS31 KTQRKGINIPADQPITKLKNLEDVVVPTME----IKVDHTGEY---GNLVTIQSFKAEFR
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pF1KE1 ILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLMEFNSLINKCLRKDAESRRRELH
       . .... :: :.  :::::   .. : .::::.:  ...  .. :  :....:.:.:.: 
CCDS31 LAGGVNLPKIIDCVGSDGKERRQLVKGRDDLRQDAVMQQVFQMCNTLLQRNTETRKRKLT
            2700      2710      2720      2730      2740      2750 

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pF1KE1 IRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVYMTGKE----LRQC----MLPK
       : :: :.::... :..:: ..:. .  .:..  .: :..   .       ::    :  .
CCDS31 ICTYKVVPLSQRSGVLEWCTGTVPIGEFLVN--NEDGAHKRYRPNDFSAFQCQKKMMEVQ
            2760      2770      2780        2790      2800         

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pF1KE1 SAALSEKLKVFREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRSTAVMSMVGYILGL
       . .. :: .:: . .     :.:. . .. : ::. :. .: :: ::.:. :.:::::::
CCDS31 KKSFEEKYEVFMD-VCQNFQPVFRYFCMEKFLDPAIWFEKRLAYTRSVATSSIVGYILGL
    2810      2820       2830      2840      2850      2860        

          2480      2490      2500      2510      2520      2530   
pF1KE1 GDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEGLFR
       :::: .:::..  ..: ::.:..  :..:. . .:: ::::::...:.:::  :.::.::
CCDS31 GDRHVQNILINEQSAELVHIDLGVAFEQGKILPTPETVPFRLTRDIVDGMGITGVEGVFR
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pF1KE1 RACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWS-KPVKG-------HSKAPLNETGEVVN
       : :: ::..::...: :.......:.::: .:. .:.:.       .... :. : .. .
CCDS31 RCCEKTMEVMRNSQETLLTIVEVLLYDPLFDWTMNPLKALYLQQRPEDETELHPTLNADD
     2930      2940      2950      2960      2970      2980        

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pF1KE1 EKAKTHVLDIEQRLQGV-----IKTRNRVTGLP----LSIEGHVHYLIQEATDENLLCQM
       .. : .. ::.: .. :     .. .... :.     ::. :.:. :::.: : . : ..
CCDS31 QECKRNLSDIDQSFNKVAERVLMRLQEKLKGVEEGTVLSVGGQVNLLIQQAIDPKNLSRL
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       2640    
pF1KE1 YLGWTPYM
       . ::  ..
CCDS31 FPGWKAWV
     3050      

>>CCDS127.1 MTOR gene_id:2475|Hs109|chr1                  (2549 aa)
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       1620      1630      1640      1650      1660      1670      
pF1KE1 MVSTVDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFL
                                     . .::..: .:..  .  .:      :  :
CCDS12 NLAEFMEHSDKGPLPLRDDNGIVLLGERAAKCRAYAKA-LHYKE-LEFQKGPTPAILESL
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pF1KE1 QKLYAAMHEPDGVAGV-SAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIH
        ..   ...:...:::     :    :. :   .:.:   .:: . ::. .. . :.   
CCDS12 ISINNKLQQPEAAAGVLEYAMKHFGELEIQATWYEKLHEWEDALVAYDKKMDTNKDDPEL
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pF1KE1 YHGVVKSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTD-ELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAA-
       . : .. . .::. . .  :     .  .. :. ..  . . ::: :.::: .:.:    
CCDS12 MLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEKWTLVNDETQAKMARMAAAAAWGLGQWDSMEEYTCMI
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               1800      1810      1820      1830      1840        
pF1KE1 -----DGKSTTWSVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGY
            ::      . : : :.:  .. :    :   :. ::    :.: . :  ::.:.:
CCDS12 PRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLAQQCIDKARD---LLDAE----LTAMAGE--SYSRAY
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     1850      1860      1870      1880      1890      1900        
pF1KE1 EYIVRLHMLCELEHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALL
         .:  ::: :::. :.  ..  : .  .     :  ::.  :   .  . :: .:  ..
CCDS12 GAMVSCHMLSELEEVIQ--YKLVP-ERREIIRQIWWERLQGCQRIVEDWQKILMVRSLVV
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pF1KE1 SLNKRPDYNEMVGECWLQSARVARKAGHHQTAYNAL---LNAGESR-----LAELY--VE
       :    : ...:  . ::. : .  :.:.   :...:   :..  ::     :  ..  : 
CCDS12 S----P-HEDM--RTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVDPSRQLDHPLPTVHPQVT
              1650        1660      1670      1680      1690       

     1960           1970          1980      1990      2000         
pF1KE1 RA--KWLWS---KGDVHQALI----VLQKGVELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRF
        :  : .:.   : :. : .     ..:. ..  .  ..   . .   . .: .: .:..
CCDS12 YAYMKNMWKSARKIDAFQHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHKQELHKLMARCFLKLGEW
      1700      1710      1720      1730      1740      1750       

    2010      2020      2030                2040      2050         
pF1KE1 MEETANFESNAIMKKYKDVTACLPE----------WEDGHFYLAKYYDKLMPMVTDNK--
       . .  ... ..: :  .  .:   .          :   .:  . .: : . .. :.:  
CCDS12 QLNLQGINESTIPKVLQYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEAVLHY-KHQNQARDEKKK
      1760      1770      1780      1790      1800       1810      

                                                      2060         
pF1KE1 ------------------------------------------------MEKQ--GDLIRY
                                                       ..:.   :: . 
CCDS12 LRHASGANITNATTAATTAATATTTASTEGSNSESEAESTENSPTPSPLQKKVTEDLSKT
       1820      1830      1840      1850      1860      1870      

      2070               2080      2090                  2100      
pF1KE1 IVLH-------FGRS--LQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYG------------TKAYE---
       ....       : ::  :. ::..  :.  :.::::.:::            .:: .   
CCDS12 LLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNL--QDTLRVLTLWFDYGHWPDVNEALVEGVKAIQIDT
       1880      1890      1900        1910      1920      1930    

               2110               2120      2130      2140         
pF1KE1 WEKA-----GRSD-------RV--QMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLTAF----SQL
       : ..     .: :       :.  :. .:.:. .     .   .:  .  ::     ...
CCDS12 WLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVASKSTTTARHNAANKI
         1940      1950      1960      1970      1980      1990    

        2150       2160      2170        2180      2190       2200 
pF1KE1 ISRIC-HSHDEVFVVLMEIIAKVFLAYPQQAMWM--MTAVSKSSYPMR-VNRCKEILNKA
       .. .: ::.  :  ..:     . .:   . ::   .  .:.  .  : :.   :.: . 
CCDS12 LKNMCEHSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVL-EP
         2000      2010      2020      2030      2040      2050    

                 2210      2220        2230       2240             
pF1KE1 IH--MKK---SLEKFVGDATRLTDKL--LELCNKPV-DGSSSTLSMS----TH-FKMLKK
       .:  :..   .:..   . .   : .   : : : . .:. . :...     : :. ..:
CCDS12 LHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRISK
          2060      2070      2080      2090      2100      2110   

     2250       2260      2270      2280      2290      2300       
pF1KE1 LVEEATFSEI-LIPLQSVMIPTLPSILGTHANHASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQ
        . . :  :.  .  . .:   :   :.. ...  ..:.      : ..   .....: :
CCDS12 QLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLE--LAVPGTYDPNQPI----IRIQSIAPSLQVITSKQ
          2120      2130        2140      2150          2160       

      2310      2320      2330      2340      2350      2360       
pF1KE1 KPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLMEFNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAV
       .:.:..: ::.:. .... : ..:::.: :.:.. .:.:  : .:  : :..: :. :::
CCDS12 RPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNLSIQRYAV
      2170      2180      2190      2200      2210      2220       

      2370      2380      2390      2400        2410        2420   
pF1KE1 IPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVYMTGKELRQC--MLPKSAALS--EKLKV
       :::. . :.: :: .   :. .. . :.::   . . : :    : :    :.  .:..:
CCDS12 IPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALI-RDYREKKKILLNIEHRIMLRMAPDYDHLTLMQKVEV
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pF1KE1 FREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRSTAVMSMVGYILGLGDRHGENILF
       :.. .       . . .    :.   :.. :. : :: ::::::::::::::::  :...
CCDS12 FEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYILGLGDRHPSNLML
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pF1KE1 DSLTGECVHVDFNCLFNKGETFE-VPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEGLFRRACEVTMRL
       : :.:. .:.::.  :. . : :  :: .:::::. ..:.:   : .: .: .:...:..
CCDS12 DRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITCHTVMEV
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pF1KE1 MRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNETGEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGV
       .:.... .:.::..:..:::..:                                     
CCDS12 LREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDGVELGEP
       2410      2420      2430      2440      2450      2460      

>>CCDS45430.1 SMG1 gene_id:23049|Hs109|chr16              (3661 aa)
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pF1KE1 LPSILGTHANHASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPK
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CCDS45 WLAAMTNTEIALPGEVSARDTVTIHSVGGTITILPTKTKPKKLLFLGSDGKSYPYLFKGL
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pF1KE1 DDLRKDCRLMEFNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGL---
       .::. : :.:.: :..:  .    ...  ..: : :.: ::. . :.:.::.... :   
CCDS45 EDLHLDERIMQFLSIVNTMFATINRQETPRFHARHYSVTPLGTRSGLIQWVDGATPLFGL
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pF1KE1 ------RPILTKLYKEKGVYMTGK---------ELRQCML-P--KSAALS----------
             :    .  : .  :.: .         ::    . :  :...::          
CCDS45 YKRWQQREAALQAQKAQDSYQTPQNPGIVPRPSELYYSKIGPALKTVGLSLDVSRRDWPL
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       . .:.  : :.   :: .. . .  .   :  :.   ..: ::::::::::::.::::::
CCDS45 HVMKAVLEELMEATPPNLLAKELWSSCTTPDEWWRVTQSYARSTAVMSMVGYIIGLGDRH
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pF1KE1 GENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEGLFRRACE
        .:.:.:  ::: ::.:.:  :.::....::: ::::.:.:. ...:  :.::.:: .::
CCDS45 LDNVLIDMTTGEVVHIDYNVCFEKGKSLRVPEKVPFRMTQNIETALGVTGVEGVFRLSCE
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pF1KE1 VTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNETGEVVNEKAKTHVLDIEQ
        ....::  :: :...:..:..::::.:.                               
CCDS45 QVLHIMRRGRETLLTLLEAFVYDPLVDWTAGGEAGFAGAVYGGGGQQAESKQSKREMERE
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>>CCDS75735.1 PRKDC gene_id:5591|Hs109|chr8               (4128 aa)
 initn: 511 init1: 274 opt: 306  Z-score: 337.0  bits: 77.3 E(33420): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 522; 29.2% identity (60.9% similar) in 325 aa overlap (2284-2586:3710-4030)

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CCDS75 LKECSPWMSDFKVEFLRNELEIPGQYDGRGKPLPEYHVRIAGFDERVTVMASLRRPKRII
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       ..: : . . .. :  .:::.: :. .. ...:  : .:.   .: :..:::.:.:....
CCDS75 IRGHDEREHPFLVKGGEDLRQDQRVEQLFQVMNGILAQDSACSQRALQLRTYSVVPMTSR
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pF1KE1 CGIIEWVNNTAGLRPIL--TKLYKEKGVYMTGKELRQC-------------------MLP
        :.:::..::. :. .:  :   .::..:..  .   :                   .. 
CCDS75 LGLIEWLENTVTLKDLLLNTMSQEEKAAYLSDPRAPPCEYKDWLTKMSGKHDVGAYMLMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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