Result of FASTA (omim) for pF1KE1028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1028, 1217 aa
  1>>>pF1KE1028 1217 - 1217 aa - 1217 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7601+/-0.000875; mu= -38.1420+/- 0.054
 mean_var=785.7173+/-160.964, 0's: 0 Z-trim(114.2): 169  B-trim: 33 in 1/54
 Lambda= 0.045755
 statistics sampled from 23735 (23858) to 23735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.28), width:  16
 Scan time: 17.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005436 (OMIM: 606062,610759) structural mainten (1217) 7753 529.1 6.5e-149
XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1099)  807 70.6 6.4e-11
XP_011516454 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1115)  807 70.6 6.4e-11
XP_011510614 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  (1216)  578 55.5 2.5e-06
NP_001275682 (OMIM: 605575) structural maintenance (1263)  578 55.5 2.5e-06
NP_001002800 (OMIM: 605575) structural maintenance (1288)  578 55.5 2.6e-06
NP_005487 (OMIM: 605575) structural maintenance of (1288)  578 55.5 2.6e-06
XP_011510613 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  (1288)  578 55.5 2.6e-06
XP_016860980 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  ( 952)  444 46.6 0.00093
XP_006713522 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  (1210)  446 46.8   0.001
XP_011516453 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  433 45.9  0.0018
XP_011516452 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  433 45.9  0.0018
XP_016869701 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  433 45.9  0.0018
XP_016869700 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  433 45.9  0.0018
XP_016869698 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  433 45.9  0.0018
XP_016869699 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  433 45.9  0.0018
NP_001036016 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197)  433 45.9  0.0018
NP_006435 (OMIM: 605576) structural maintenance of (1197)  433 45.9  0.0018
NP_001036015 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197)  433 45.9  0.0018
XP_016869695 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  433 45.9  0.0018
NP_001252531 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197)  433 45.9  0.0018
XP_016869696 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  433 45.9  0.0018
XP_011516450 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  433 45.9  0.0018
XP_016869697 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  433 45.9  0.0018
XP_006716996 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  433 45.9  0.0018
XP_011516451 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  433 45.9  0.0018
XP_011528447 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural  (1101)  423 45.3  0.0027
NP_001278430 (OMIM: 608685) structural maintenance (1161)  423 45.3  0.0028
NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural main (1211)  421 45.1  0.0032
NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural mainten (1233)  421 45.2  0.0033


>>NP_005436 (OMIM: 606062,610759) structural maintenance  (1217 aa)
 initn: 7753 init1: 7753 opt: 7753  Z-score: 2794.4  bits: 529.1 E(85289): 6.5e-149
Smith-Waterman score: 7753; 100.0% identity (100.0% similar) in 1217 aa overlap (1-1217:1-1217)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 RLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKND
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 VMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 ETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEER
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 QALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 ECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 PETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 RGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 IETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 SLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 LELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE1 SGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFY
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE1 LFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210       
pF1KE1 ITAEMAKDFVEDDTTHG
       :::::::::::::::::
NP_005 ITAEMAKDFVEDDTTHG
             1210       

>>XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural main  (1099 aa)
 initn: 348 init1: 142 opt: 807  Z-score: 317.1  bits: 70.6 E(85289): 6.4e-11
Smith-Waterman score: 958; 25.7% identity (61.6% similar) in 1124 aa overlap (1-1060:1-1061)

               10        20        30        40        50          
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLS-DEFSHLRPE
       :.::..:..::.:: ..: :. :.   :.:.: :::::::.. .: :.:. ...:..:  
XP_011 MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRAS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80         90           100       110    
pF1KE1 QRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRL-PIDKE---EVSL-RRVIGAKKDQYFLDKK
       .   :....    . .: : : :::::..  :.  :   :... :.:. . ...:...  
XP_011 NLQDLVYKNGQAGITKASVSITFDNSDKKQSPLGFEVHDEITVTRQVVIGGRNKYLINGV
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE1 MVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEE
        .... :..:. :.:.. .::.... ::.:... .    . :....:.::::.:. .:  
XP_011 NANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKK--
              130       140       150       160       170          

          180       190       200        210       220       230   
pF1KE1 SISLMKETEGKREKINELLKYIEERLH-TLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELN
        :. .:  : :. :..:.   .::..  :... ::: ..: ...:. : .:.      :.
XP_011 -IAAQKTIEKKEAKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEH------LS
       180       190       200       210       220             230 

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE1 ETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSA
       .     . : :. .:. .....:.. :    ::.  ..... :   ::.:...: :.:  
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        . .  . ..: :.. : :: . ..:  . : ... .: ..            :.:: ..
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        :         ::.. . .: .  .:: .:.. ...  :. . :.:... ..   ..:. 
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        .. :. .: .:.......:.:.:. .:. :.::..: :.  .:                
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pF1KE1 LQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQLMNQMQQIETQQR----KFKAS
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pF1KE1 RDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQ
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pF1KE1 LSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIITRVETYL---NENLRKRLDQVE
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pF1KE1 QELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSME
       .  .:...::  .  :::  . ::    . ::.: :  :.: .   . .  ..::.  .:
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XP_011 EDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDSF
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XP_011 ------------VDSLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHY
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pF1KE1 DPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGV-KFRN
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XP_011 KPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYKTYN
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pF1KE1 KVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
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pF1KE1                               MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVI
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NP_001 SSDAEPEPPSGRTESPATAAAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCI
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pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
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NP_001 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
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pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
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NP_001 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
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pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
       :...:.:       :  :   :. :... :    .:  .   . . ...: .:  ::.:.
NP_001 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
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pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
       . :..:..  .:: ::.   ..     . . :  .. .: ::     : . .. :. ...
NP_001 V-KMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQK
             270       280       290       300            310      

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
       :   : .... . ..   ..:.  ...:.. . :.. . .  :    : .:..   :.:.
NP_001 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
        320       330       340       350           360            

        310       320       330       340       350       360      
pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
       :.  .....:   . . :.: :. ::  ::.:: ..  :...   : ..:   :. :   
NP_001 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEK
     370       380       390       400       410          420      

        370       380       390        400       410       420     
pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
       .  .:.  :   .   .: :.  ...:  . ::: ......:. . .. . ...:.   .
NP_001 EKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLS
        430       440       450       460       470       480      

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE1 NKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAA
        ..  . : .:  . :  ..  ..:      ....:  . ..:     .:.. : : :. 
NP_001 RHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQ
        490       500       510       520           530       540  

         490         500       510       520       530       540   
pF1KE1 KREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECE
       .. ....  .. . ..  .:. :    : .:::: . ..  . ..  : .:  ....   
NP_001 EETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDAIIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAI
            550       560       570       580        590        600

           550       560       570       580       590             
pF1KE1 PAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDV-----RDT
          :  .  .  . : : .::: ... . .  ....:. : .::. :.:. :      . 
NP_001 DEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEI
              610       620       630        640       650         

      600       610       620       630       640         650      
pF1KE1 AYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGD
         ::..  .  . :.. . .. .::  ..  ::.  ... .:..:  .      .::.:.
NP_001 QTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQ
     660       670        680       690       700       710        

        660       670       680       690       700         710    
pF1KE1 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQL
        . . :..:::   . :.:.  .  .. .:::....:..:... ..  .:.. . .... 
NP_001 IIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEER
      720       730       740       750       760       770        

          720           730       740       750          760       
pF1KE1 MNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASL
       . .... : ..:    :: :: . .. . ..:. . .. : . .   : ... . :: ..
NP_001 VVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVKELEANVLATAPDKKKQKLLEENV
      780       790       800       810       820       830        

       770       780       790       800       810        820      
pF1KE1 HAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIIT
        :...  ... :: .  . ....   .  :.  : ...  ::.. . .:... .  . ::
NP_001 SAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLKA-QQDKLDKINKQLDECASAIT
      840        850       860       870        880       890      

        830          840       850        860        870       880 
pF1KE1 RVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSE
       .... .   ..::.:  :.: .  .:...::  .  :::  . ::    . ::.: :  :
NP_001 KAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAELKSLEDKAAEVVKNTNAAEE
        900       910       920       930       940       950      

             890       900       910       920       930       940 
pF1KE1 DLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMK
       .: .   . .  ..::.  .:  . ..:. . .:.   ....    ...  .:  .. ..
NP_001 SLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQIDGHIAEHNSKIKYWHKEIS
        960       970       980        990      1000      1010     

             950       960         970          980       990      
pF1KE1 KIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQ
       ::  :  . .. .:. ..:: ..:  ... .. ...   :.   :  :  :  .......
NP_001 KIS-LHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKK
         1020      1030      1040      1050      1060      1070    

       1000       1010        1020      1030      1040      1050   
pF1KE1 KEKLIKRQEELDR-GYK--SIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKA
       .:  ..:  :::.  :.  :. . .. :. .. . ..  :  ......: .: :. :: :
NP_001 EELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDA
         1080      1090      1100      1110      1120      1130    

          1060      1070      1080      1090      1100      1110   
pF1KE1 TLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQ
        : .                             : :.: :.  ::  :    .   ... 
NP_001 ELEL-----------------------------VDSLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIF
                                      1140       1150      1160    

          1120      1130      1140      1150      1160      1170   
pF1KE1 QLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITT
       .::::.:.: .:::.::...  :.:.:..:::: ::: .. . :. .:.: . .::::  
NP_001 NLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIII
         1170      1180      1190      1200      1210      1220    

          1180       1190      1200      1210       
pF1KE1 TFRPELLESADKFYGV-KFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
       ..: ...: .:.. :. :  : .. . :   :.:           
NP_001 SLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC      
         1230      1240      1250      1260         

>>NP_001002800 (OMIM: 605575) structural maintenance of   (1288 aa)
 initn: 497 init1: 221 opt: 578  Z-score: 234.4  bits: 55.5 E(85289): 2.6e-06
Smith-Waterman score: 868; 21.9% identity (58.5% similar) in 1264 aa overlap (1-1206:82-1283)

                                             10        20        30
pF1KE1                               MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVI
                                     ..: ... :.:.::  . :. :: .. . :
NP_001 ELDNRSLEEILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCI
              60        70        80        90       100       110 

               40        50        60        70              80    
pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
       .: ::::::: . .. ::.. . ...: ..  .:.:..   . :..      : .::  .
NP_001 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
             120       130       140       150       160       170 

           90       100          110       120       130       140 
pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
       .:.   : . .  . :.  : .:.   : .. :  : .:: :::.: :.. ..  ... :
NP_001 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
             180         190       200       210       220         

                    150       160       170          180       190 
pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
       :...:.:       :  :   :. :... :    .:  .   . . ...: .:  ::.:.
NP_001 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
     230       240       250       260       270       280         

             200       210            220       230       240      
pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
       . :..:..  .:: ::.   ..     . . :  .. .: ::     : . .. :. ...
NP_001 V-KMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQK
        290       300       310       320            330       340 

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
       :   : .... . ..   ..:.  ...:.. . :.. . .  :    : .:..   :.:.
NP_001 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
             350       360       370       380           390       

        310       320       330       340       350       360      
pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
       :.  .....:   . . :.: :. ::  ::.:: ..  :...   : ..:   :. :   
NP_001 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEK
          400       410       420       430          440       450 

        370       380       390        400       410       420     
pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
       .  .:.  :   .   .: :.  ...:  . ::: ......:. . .. . ...:.   .
NP_001 EKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLS
             460       470       480       490       500       510 

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE1 NKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAA
        ..  . : .:  . :  ..  ..:      ....:  . ..:     .:.. : : :. 
NP_001 RHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQ
             520       530       540       550           560       

         490         500       510       520       530       540   
pF1KE1 KREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECE
       .. ....  .. . ..  .:. :    : .:::: . ..  . ..  : .:  ....   
NP_001 EETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDAIIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAI
       570       580       590       600       610         620     

           550       560       570       580       590             
pF1KE1 PAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDV-----RDT
          :  .  .  . : : .::: ... . .  ....:. : .::. :.:. :      . 
NP_001 DEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEI
         630       640       650       660        670       680    

      600       610       620       630       640         650      
pF1KE1 AYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGD
         ::..  .  . :.. . .. .::  ..  ::.  ... .:..:  .      .::.:.
NP_001 QTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQ
          690       700        710       720       730       740   

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pF1KE1 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQL
        . . :..:::   . :.:.  .  .. .:::....:..:... ..  .:.. . .... 
NP_001 IIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEER
           750       760       770       780       790       800   

          720           730       740       750          760       
pF1KE1 MNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASL
       . .... : ..:    :: :: . .. . ..:. . .. : . .   : ... . :: ..
NP_001 VVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVKELEANVLATAPDKKKQKLLEENV
           810       820       830       840       850       860   

       770       780       790       800       810        820      
pF1KE1 HAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIIT
        :...  ... :: .  . ....   .  :.  : ...  ::.. . .:... .  . ::
NP_001 SAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLKA-QQDKLDKINKQLDECASAIT
           870        880       890       900        910       920 

        830          840       850        860        870       880 
pF1KE1 RVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSE
       .... .   ..::.:  :.: .  .:...::  .  :::  . ::    . ::.: :  :
NP_001 KAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAELKSLEDKAAEVVKNTNAAEE
             930       940       950       960       970       980 

             890       900       910       920       930       940 
pF1KE1 DLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMK
       .: .   . .  ..::.  .:  . ..:. . .:.   ....    ...  .:  .. ..
NP_001 SLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQIDGHIAEHNSKIKYWHKEIS
             990      1000      1010       1020      1030      1040

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pF1KE1 KIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQ
       ::  :  . .. .:. ..:: ..:  ... .. ...   :.   :  :  :  .......
NP_001 KIS-LHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKK
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       1000       1010        1020      1030      1040      1050   
pF1KE1 KEKLIKRQEELDR-GYK--SIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKA
       .:  ..:  :::.  :.  :. . .. :. .. . ..  :  ......: .: :. :: :
NP_001 EELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDA
    1100      1110      1120      1130      1140      1150         

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pF1KE1 TLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQ
        : .                             : :.: :.  ::  :    .   ... 
NP_001 ELEL-----------------------------VDSLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIF
    1160                                   1170       1180         

          1120      1130      1140      1150      1160      1170   
pF1KE1 QLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITT
       .::::.:.: .:::.::...  :.:.:..:::: ::: .. . :. .:.: . .::::  
NP_001 NLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIII
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          1180       1190      1200      1210       
pF1KE1 TFRPELLESADKFYGV-KFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
       ..: ...: .:.. :. :  : .. . :   :.:           
NP_001 SLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC      
    1250      1260      1270      1280              

>>NP_005487 (OMIM: 605575) structural maintenance of chr  (1288 aa)
 initn: 497 init1: 221 opt: 578  Z-score: 234.4  bits: 55.5 E(85289): 2.6e-06
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                                             10        20        30
pF1KE1                               MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVI
                                     ..: ... :.:.::  . :. :: .. . :
NP_005 ELDNRSLEEILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCI
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pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
       .: ::::::: . .. ::.. . ...: ..  .:.:..   . :..      : .::  .
NP_005 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
       .:.   : . .  . :.  : .:.   : .. :  : .:: :::.: :.. ..  ... :
NP_005 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
             180         190       200       210       220         

                    150       160       170          180       190 
pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
       :...:.:       :  :   :. :... :    .:  .   . . ...: .:  ::.:.
NP_005 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
     230       240       250       260       270       280         

             200       210            220       230       240      
pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
       . :..:..  .:: ::.   ..     . . :  .. .: ::     : . .. :. ...
NP_005 V-KMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQK
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pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
       :   : .... . ..   ..:.  ...:.. . :.. . .  :    : .:..   :.:.
NP_005 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
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pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
       :.  .....:   . . :.: :. ::  ::.:: ..  :...   : ..:   :. :   
NP_005 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEK
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        370       380       390        400       410       420     
pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
       .  .:.  :   .   .: :.  ...:  . ::: ......:. . .. . ...:.   .
NP_005 EKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLS
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pF1KE1 NKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAA
        ..  . : .:  . :  ..  ..:      ....:  . ..:     .:.. : : :. 
NP_005 RHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQ
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         490         500       510       520       530       540   
pF1KE1 KREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECE
       .. ....  .. . ..  .:. :    : .:::: . ..  . ..  : .:  ....   
NP_005 EETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDAIIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAI
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           550       560       570       580       590             
pF1KE1 PAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDV-----RDT
          :  .  .  . : : .::: ... . .  ....:. : .::. :.:. :      . 
NP_005 DEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEI
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pF1KE1 AYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGD
         ::..  .  . :.. . .. .::  ..  ::.  ... .:..:  .      .::.:.
NP_005 QTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQ
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pF1KE1 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQL
        . . :..:::   . :.:.  .  .. .:::....:..:... ..  .:.. . .... 
NP_005 IIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEER
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pF1KE1 MNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASL
       . .... : ..:    :: :: . .. . ..:. . .. : . .   : ... . :: ..
NP_005 VVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVKELEANVLATAPDKKKQKLLEENV
           810       820       830       840       850       860   

       770       780       790       800       810        820      
pF1KE1 HAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIIT
        :...  ... :: .  . ....   .  :.  : ...  ::.. . .:... .  . ::
NP_005 SAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLKA-QQDKLDKINKQLDECASAIT
           870        880       890       900        910       920 

        830          840       850        860        870       880 
pF1KE1 RVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSE
       .... .   ..::.:  :.: .  .:...::  .  :::  . ::    . ::.: :  :
NP_005 KAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAELKSLEDKAAEVVKNTNAAEE
             930       940       950       960       970       980 

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pF1KE1 DLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMK
       .: .   . .  ..::.  .:  . ..:. . .:.   ....    ...  .:  .. ..
NP_005 SLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQIDGHIAEHNSKIKYWHKEIS
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pF1KE1 KIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQ
       ::  :  . .. .:. ..:: ..:  ... .. ...   :.   :  :  :  .......
NP_005 KIS-LHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKK
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pF1KE1 KEKLIKRQEELDR-GYK--SIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKA
       .:  ..:  :::.  :.  :. . .. :. .. . ..  :  ......: .: :. :: :
NP_005 EELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDA
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pF1KE1 TLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQ
        : .                             : :.: :.  ::  :    .   ... 
NP_005 ELEL-----------------------------VDSLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIF
    1160                                   1170       1180         

          1120      1130      1140      1150      1160      1170   
pF1KE1 QLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITT
       .::::.:.: .:::.::...  :.:.:..:::: ::: .. . :. .:.: . .::::  
NP_005 NLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIII
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pF1KE1 TFRPELLESADKFYGV-KFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
       ..: ...: .:.. :. :  : .. . :   :.:           
NP_005 SLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC      
    1250      1260      1270      1280              

>>XP_011510613 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural main  (1288 aa)
 initn: 497 init1: 221 opt: 578  Z-score: 234.4  bits: 55.5 E(85289): 2.6e-06
Smith-Waterman score: 868; 21.9% identity (58.5% similar) in 1264 aa overlap (1-1206:82-1283)

                                             10        20        30
pF1KE1                               MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVI
                                     ..: ... :.:.::  . :. :: .. . :
XP_011 ELDNRSLEEILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCI
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pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
       .: ::::::: . .. ::.. . ...: ..  .:.:..   . :..      : .::  .
XP_011 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
             120       130       140       150       160       170 

           90       100          110       120       130       140 
pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
       .:.   : . .  . :.  : .:.   : .. :  : .:: :::.: :.. ..  ... :
XP_011 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
             180         190       200       210       220         

                    150       160       170          180       190 
pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
       :...:.:       :  :   :. :... :    .:  .   . . ...: .:  ::.:.
XP_011 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
     230       240       250       260       270       280         

             200       210            220       230       240      
pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
       . :..:..  .:: ::.   ..     . . :  .. .: ::     : . .. :. ...
XP_011 V-KMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQK
        290       300       310       320            330       340 

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
       :   : .... . ..   ..:.  ...:.. . :.. . .  :    : .:..   :.:.
XP_011 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
             350       360       370       380           390       

        310       320       330       340       350       360      
pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
       :.  .....:   . . :.: :. ::  ::.:: ..  :...   : ..:   :. :   
XP_011 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEK
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        370       380       390        400       410       420     
pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
       .  .:.  :   .   .: :.  ...:  . ::: ......:. . .. . ...:.   .
XP_011 EKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLS
             460       470       480       490       500       510 

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE1 NKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAA
        ..  . : .:  . :  ..  ..:      ....:  . ..:     .:.. : : :. 
XP_011 RHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQ
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         490         500       510       520       530       540   
pF1KE1 KREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECE
       .. ....  .. . ..  .:. :    : .:::: . ..  . ..  : .:  ....   
XP_011 EETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDAIIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAI
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pF1KE1 PAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDV-----RDT
          :  .  .  . : : .::: ... . .  ....:. : .::. :.:. :      . 
XP_011 DEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEI
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pF1KE1 AYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGD
         ::..  .  . :.. . .. .::  ..  ::.  ... .:..:  .      .::.:.
XP_011 QTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQ
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pF1KE1 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQL
        . . :..:::   . :.:.  .  .. .:::....:..:... ..  .:.. . .... 
XP_011 IIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEER
           750       760       770       780       790       800   

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pF1KE1 MNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASL
       . .... : ..:    :: :: . .. . ..:. . .. : . .   : ... . :: ..
XP_011 VVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVKELEANVLATAPDKKKQKLLEENV
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pF1KE1 HAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIIT
        :...  ... :: .  . ....   .  :.  : ...  ::.. . .:... .  . ::
XP_011 SAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLKA-QQDKLDKINKQLDECASAIT
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        830          840       850        860        870       880 
pF1KE1 RVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSE
       .... .   ..::.:  :.: .  .:...::  .  :::  . ::    . ::.: :  :
XP_011 KAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAELKSLEDKAAEVVKNTNAAEE
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pF1KE1 DLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMK
       .: .   . .  ..::.  .:  . ..:. . .:.   ....    ...  .:  .. ..
XP_011 SLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQIDGHIAEHNSKIKYWHKEIS
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pF1KE1 KIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQ
       ::  :  . .. .:. ..:: ..:  ... .. ...   :.   :  :  :  .......
XP_011 KIS-LHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKK
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       1000       1010        1020      1030      1040      1050   
pF1KE1 KEKLIKRQEELDR-GYK--SIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKA
       .:  ..:  :::.  :.  :. . .. :. .. . ..  :  ......: .: :. :: :
XP_011 EELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDA
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pF1KE1 TLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQ
        : .                             : :.: :.  ::  :    .   ... 
XP_011 ELEL-----------------------------VDSLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIF
    1160                                   1170       1180         

          1120      1130      1140      1150      1160      1170   
pF1KE1 QLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITT
       .::::.:.: .:::.::...  :.:.:..:::: ::: .. . :. .:.: . .::::  
XP_011 NLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIII
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          1180       1190      1200      1210       
pF1KE1 TFRPELLESADKFYGV-KFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
       ..: ...: .:.. :. :  : .. . :   :.:           
XP_011 SLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC      
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>>XP_016860980 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural main  (952 aa)
 initn: 311 init1: 221 opt: 444  Z-score: 188.5  bits: 46.6 E(85289): 0.00093
Smith-Waterman score: 631; 21.3% identity (58.5% similar) in 989 aa overlap (255-1206:4-947)

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pF1KE1 YTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAM
                                     : .  ..:...  :  .    :.:.: . .
XP_016                            METQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDV
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pF1KE1 KEEKEQLSAERQ--EQIKQR-TKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQ
       :. ...:.   .  :. :.. :.:.:.  .....:   . . :.: :. ::  ::.:: .
XP_016 KDTEKKLNKITKFIEENKEKFTQLDLEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFK
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pF1KE1 KELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELK
       .  :...   : ..:   :. :   .  .:.  :   .   .: :.  ...:  . ::: 
XP_016 SIPAKSN---NIINETTTRNNALEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELM
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pF1KE1 SLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKN
       ......:. . .. . ...:.   . ..  . : .:  . :  ..  ..:      ....
XP_016 GFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEG
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pF1KE1 KKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDH
       :  . ..:     .:.. : : :. .. ....  .. . ..  .:. :    : .:::: 
XP_016 KLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQEETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDA
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pF1KE1 FRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNK
       . ..  . ..  : .:  ....      :  .  .  . : : .::: ... . .  ...
XP_016 IIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAIDEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKR
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pF1KE1 MNLPGEVTFLPLNKLDV-----RDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLIC
       .:. : .::. :.:. :      .   ::..  .  . :.. . .. .::  ..  ::. 
XP_016 QNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEIQTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVA
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pF1KE1 RSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGE
        ... .:..:  .      .::.:. . . :..:::   . :.:.  .  .. .:::...
XP_016 DNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNK
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pF1KE1 LEAKLNENLRR--NIERINNEIDQLMNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEK
       .:..:... ..  .:.. . .... . .... : ..:    :: :: . .. . ..:. .
XP_016 MESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQ
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pF1KE1 RQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALND
        .. : . .   : ... . :: .. :...  ... :: .  . ....   .  :.  : 
XP_016 VKELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNH
            510       520       530        540       550       560 

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pF1KE1 EIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIITRVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV
       ...  ::.. . .:... .  . ::.... .   ..::.:  :.: .  .:...::  . 
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        :::  . ::    . ::.: :  :.: .   . .  ..::.  .:  . ..:. . .:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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