Result of FASTA (omim) for pF1KB9044
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9044, 530 aa
  1>>>pF1KB9044 530 - 530 aa - 530 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5373+/-0.000924; mu= 14.3120+/- 0.057
 mean_var=345.2690+/-71.166, 0's: 0 Z-trim(111.1): 2069  B-trim: 93 in 1/47
 Lambda= 0.069023
 statistics sampled from 17195 (19577) to 17195 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  7.640

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2848 299.2 2.2e-80
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2848 299.2 2.2e-80
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2669 281.4 5.2e-75
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2655 280.0 1.3e-74
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2599 274.4 6.5e-73
XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2584 273.2 2.2e-72
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2547 269.2 2.3e-71
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2525 267.0   1e-70
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2525 267.0   1e-70
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2525 267.0   1e-70
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2525 267.0   1e-70
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2525 267.0   1e-70
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2514 266.1 2.4e-70
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2504 265.2 5.3e-70
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2489 264.0 1.8e-69
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2469 261.5 5.2e-69
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 2463 260.8 7.4e-69
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2454 260.2 1.7e-68
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2413 256.2 2.8e-67
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2409 255.4 3.1e-67
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2412 256.1 3.1e-67
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2361 250.7 8.4e-66
XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 537) 2360 250.6 9.1e-66
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2330 248.2   1e-64
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2324 246.9 1.1e-64
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2330 248.3 1.1e-64


>>XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro  (569 aa)
 initn: 2848 init1: 2848 opt: 2848  Z-score: 1564.2  bits: 299.2 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 2848; 76.0% identity (89.0% similar) in 529 aa overlap (2-530:26-554)

                                       10        20        30      
pF1KB9                         MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRN
                                :: ::::::::::::::::::::::::::::.:.:
XP_016 MSSAPRGPPSVAPLPAGIGRSTAKTPGLPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTSQQN
               10        20        30        40        50        60

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB9 LYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPHLITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWP
       :::.::..::::::::::::::: ::::::::::: : ::. :::::::. :::..::::
XP_016 LYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWP
               70        80        90       100       110       120

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 EHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENLQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQC
       ....:::::::::: ::: :::::::: .:::.:: :: :.::: ::::: :::::::::
XP_016 KQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADEHKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQC
              130       140       150       160       170       180

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 DKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKKVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECG
       ::::::.::::::: ::::.:::: ::::::::: :.::.:::: .  :: : :::. ::
XP_016 DKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSCCILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCG
              190       200       210       220       230       240

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 KVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFS
       :..: ::.: ::: ::   .:::::::::::::: :: :::::: ::::.:::.:::.::
XP_016 KAFNQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSLTLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFS
              250       260       270       280       290       300

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB9 LFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECHKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSN
       .::.:.:::::::: :::.:.:: :.:. :.:::.:: :::::::.::.:::: ::  :.
XP_016 VFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSST
              310       320       330       340       350       360

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB9 LTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEH
       :::::.::::::::::::::::::: ..::::: .::::: :::::::::: .:..::.:
XP_016 LTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKH
              370       380       390       400       410       420

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB9 MRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSSLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIH
        ::.: :::::::::::::.  :.::.:: :::  . :::::::..:  :::::.:: .:
XP_016 KRIYTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVH
              430       440       450       460       470       480

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 TGEKSYKCDECGNVFNWPATLANHKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEK
       :::: :::.:::..::: .::..:::::. :::::::::::::::::.::::::::::::
XP_016 TGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEK
              490       500       510       520       530       540

        520       530               
pF1KB9 LYKPEKCDNNFDNT               
        :::..::. ::::               
XP_016 PYKPKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEKS
              550       560         

>>NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [Homo  (569 aa)
 initn: 2848 init1: 2848 opt: 2848  Z-score: 1564.2  bits: 299.2 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 2848; 76.0% identity (89.0% similar) in 529 aa overlap (2-530:26-554)

                                       10        20        30      
pF1KB9                         MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRN
                                :: ::::::::::::::::::::::::::::.:.:
NP_066 MSSAPRGPPSVAPLPAGIGRSTAKTPGLPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTSQQN
               10        20        30        40        50        60

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB9 LYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPHLITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWP
       :::.::..::::::::::::::: ::::::::::: : ::. :::::::. :::..::::
NP_066 LYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWP
               70        80        90       100       110       120

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 EHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENLQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQC
       ....:::::::::: ::: :::::::: .:::.:: :: :.::: ::::: :::::::::
NP_066 KQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADEHKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQC
              130       140       150       160       170       180

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 DKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKKVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECG
       ::::::.::::::: ::::.:::: ::::::::: :.::.:::: .  :: : :::. ::
NP_066 DKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSCCILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCG
              190       200       210       220       230       240

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 KVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFS
       :..: ::.: ::: ::   .:::::::::::::: :: :::::: ::::.:::.:::.::
NP_066 KAFNQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSLTLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFS
              250       260       270       280       290       300

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB9 LFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECHKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSN
       .::.:.:::::::: :::.:.:: :.:. :.:::.:: :::::::.::.:::: ::  :.
NP_066 VFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSST
              310       320       330       340       350       360

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB9 LTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEH
       :::::.::::::::::::::::::: ..::::: .::::: :::::::::: .:..::.:
NP_066 LTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKH
              370       380       390       400       410       420

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB9 MRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSSLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIH
        ::.: :::::::::::::.  :.::.:: :::  . :::::::..:  :::::.:: .:
NP_066 KRIYTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVH
              430       440       450       460       470       480

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 TGEKSYKCDECGNVFNWPATLANHKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEK
       :::: :::.:::..::: .::..:::::. :::::::::::::::::.::::::::::::
NP_066 TGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEK
              490       500       510       520       530       540

        520       530               
pF1KB9 LYKPEKCDNNFDNT               
        :::..::. ::::               
NP_066 PYKPKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEKS
              550       560         

>>NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 isofor  (586 aa)
 initn: 4464 init1: 2669 opt: 2669  Z-score: 1467.7  bits: 281.4 E(85289): 5.2e-75
Smith-Waterman score: 2669; 74.1% identity (85.2% similar) in 521 aa overlap (10-530:1-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPH
                ::::::::: :::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::: 
NP_689          MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLGIAVSKPD
                        10        20        30        40        50 

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENL
       ::: ::::::::: ::.::: : ::. :::..:.:::::::::::::::: ::: :::::
NP_689 LITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENL
              60        70        80        90       100       110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKK
       ::: . ::::  ::.: ::: ::::: ::.:::::::::::::::: : : .: :.::::
NP_689 QLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKK
             120       130       140       150       160       170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 VFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKC
        ::::. ::::::::.:::: .::::: :::::::::..:: : : ::: :: :::::::
NP_689 PFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKC
             180       190       200       210       220       230 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 EECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECH
       ::::::::.::.: ::: ::  :::.:::::::::.  : :.::: ::: .:::::.:: 
NP_689 EECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECG
             240       250       260       270       280       290 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFN
       :::: :. :..:::::  .::.::::::: :  :: : ::: ::::::::::::::::::
NP_689 KAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFN
             300       310       320       330       340       350 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 QFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSS
       ::.:::.:: :::::: :::.:::::: :::.::.: ::::::::::::::::::.  :.
NP_689 QFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSST
             360       370       380       390       400       410 

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLANH
       ::.:: ::: :. ::::.:::.:.  :..:.::  :  .: :::.:::..:.  .::..:
NP_689 LTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKH
             420       430       440       450       460       470 

              490       500       510       520       530          
pF1KB9 KRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT          
       : ::.:::::::::::::::.:: .:.:: :::  : :: ::: : :...          
NP_689 KIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIY
             480       490       500       510       520       530 

NP_689 TGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
             540       550       560       570       580      

>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho  (572 aa)
 initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655  Z-score: 1460.3  bits: 280.0 E(85289): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 2655; 71.7% identity (85.1% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPH
       :::: :::::: :::::::.::::::::::::::.::::.::.::::::::.:::.::: 
NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASKPD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENL
       ::::::::::::: ::.:::..:::.::.:..::::... :. ::::::: : :::.:::
NP_001 LITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNYFQKVILRTYKKCGRENL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKK
       :::  :::.:: :: :: :: ::::: :::.:::: :::::::::::::: ::  .::::
NP_001 QLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 VFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKC
        :::::: :::::::::.:: :::. :. :::.::::. :  :.:  :: :: :.:::::
NP_001 SFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 EECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECH
       ::::::::. : :  :: ::  .::.:::::::::.  . :. :: ::::.:::::.:: 
NP_001 EECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFN
       .::.  .::: :: ::.::::.::::::: :.: :.:: :: :::::: ::::::::::.
NP_001 RAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 QFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSS
       ....:: ::.::.::: :::::::::: :::.:: : :::.::: :::: :.:::.  : 
NP_001 RLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLANH
       :: :::::: :. ::::::::.:.: : ::.::.:::::: :::.:::..::  .::..:
NP_001 LTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530          
pF1KB9 KRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT          
       : ::. ::::::::::::::.::::: :: :::::: :: :.: . :.:.          
NP_001 KVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIH
              490       500       510       520       530       540

NP_001 TGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
              550       560       570  

>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor  (595 aa)
 initn: 3957 init1: 2200 opt: 2599  Z-score: 1430.0  bits: 274.4 E(85289): 6.5e-73
Smith-Waterman score: 2599; 71.5% identity (84.9% similar) in 522 aa overlap (10-530:1-522)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPH
                :::::::::::::::.::::::::::::::.::.:::::::::::.:::: 
NP_003          MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPD
                        10        20        30        40        50 

               70         80        90       100       110         
pF1KB9 LITCLEQGKEPWNRKRQE-MVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHEN
       :::::::::: :. ::.: ::::: :. :::..:::::..:::::::: :. :::: :::
NP_003 LITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHEN
              60        70        80        90       100       110 

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 LQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGK
       : :: .:.:.:: :. : : : ::::: .:::::::::::::: ::::::: :. :.: :
NP_003 LPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKK
             120       130       140       150       160       170 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 KVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYK
       : ::: .::::: :.: ::.: ::::: : ::::::::..:: : : ::: :: ::::::
NP_003 KPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYK
             180       190       200       210       220       230 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB9 CEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDEC
       ::::::::::::.::::::::  :::.:::::::.:. :: :. :::::::.::::: ::
NP_003 CEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKEC
             240       250       260       270       280       290 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB9 HKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAF
        ::::  .:::.:..:::::::.::::::: :.: :::: :: ::::::::::..:::::
NP_003 GKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAF
             300       310       320       330       340       350 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB9 NQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCS
       :: :.:: :. :::::: ::::.::::: . :.:: :  ::::::::::.::::::.  :
NP_003 NQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSS
             360       370       380       390       400       410 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB9 SLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLAN
       .::.:: ::: :. :::.:: :.:.  : ::.:: :::::: :.:..::..::  ..:. 
NP_003 TLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTR
             420       430       440       450       460       470 

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB9 HKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT         
       ::. :..:::::::::::.:.  : :: :: :::::: :: :.: . :...         
NP_003 HKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKI
             480       490       500       510       520       530 

NP_003 HTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGE
             540       550       560       570       580       590 

>--
 initn: 383 init1: 383 opt: 383  Z-score: 237.4  bits: 53.8 E(85289): 1.7e-06
Smith-Waterman score: 383; 80.0% identity (87.1% similar) in 70 aa overlap (335-404:523-592)

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB9 WFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFAN
                                     :.:::::::::::::: :::::::::: .:
NP_003 WPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSN
            500       510       520       530       540       550  

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB9 LTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSSLTRH
       ::.::.:::::: :::::: :::  :: ::.:  ::::::                    
NP_003 LTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI                 
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XP_016                               MLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP
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XP_016                               MLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP
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XP_016 HKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIV
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XP_016                               MLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP
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XP_016 CNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE
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XP_016                               MLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP
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       ::::: :::::::::: .:..::.: ::.: :::::::::::::.  :.::.:: :::  
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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