Result of FASTA (ccds) for pF1KB9558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9558, 683 aa
  1>>>pF1KB9558 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0879+/-0.00108; mu= 14.4390+/- 0.065
 mean_var=236.2922+/-44.380, 0's: 0 Z-trim(113.6): 953  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.083435
 statistics sampled from 13185 (14212) to 13185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.437), width:  16
 Scan time:  4.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16       ( 683) 4839 596.0 5.7e-170
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1284 168.0 3.5e-41
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475) 1242 162.8   1e-39
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869) 1241 163.1 1.6e-39
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470) 1224 160.7 4.5e-39
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1199 157.9 4.5e-38
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1198 157.7 4.6e-38
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1198 157.7 4.8e-38
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1198 157.7 4.9e-38
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1198 157.8 4.9e-38
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1195 157.4 6.6e-38
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1194 157.3 6.9e-38
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1190 156.6 7.6e-38
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 539) 1188 156.4 9.8e-38
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 560) 1188 156.4   1e-37
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17       ( 761) 1187 156.5 1.3e-37
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 555) 1183 155.8 1.5e-37
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 560) 1183 155.8 1.5e-37
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1181 155.8 2.1e-37
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19       ( 537) 1178 155.2 2.3e-37
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19       ( 781) 1176 155.2 3.3e-37
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1169 154.2   5e-37
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1169 154.2 5.3e-37
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563) 1168 154.0 5.4e-37
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 503) 1166 153.7 5.9e-37
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 555) 1166 153.8 6.3e-37
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 564) 1166 153.8 6.3e-37
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 577) 1166 153.8 6.4e-37
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 616) 1166 153.8 6.7e-37
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 629) 1166 153.9 6.8e-37
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19       ( 792) 1163 153.6 9.9e-37
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19        ( 489) 1158 152.7 1.1e-36
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1154 152.3 1.6e-36
CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19      ( 570) 1155 152.5 1.6e-36
CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19      ( 571) 1155 152.5 1.6e-36
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 616) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9           ( 630) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 631) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 645) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 647) 1155 152.6 1.7e-36
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17       ( 865) 1152 152.4 2.6e-36
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678) 1150 152.0 2.7e-36
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536) 1148 151.6 2.8e-36
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 591) 1148 151.7 2.9e-36
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592) 1148 151.7 2.9e-36
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 676) 1148 151.7 3.2e-36
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 697) 1148 151.8 3.2e-36
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16       ( 743) 1147 151.7 3.6e-36
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19      ( 674) 1145 151.4 4.1e-36
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19       ( 628) 1139 150.6 6.4e-36


>>CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16            (683 aa)
 initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839  Z-score: 3164.9  bits: 596.0 E(32554): 5.7e-170
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHLRFRRFRFQEAAGPREALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHLRFRRFRFQEAAGPREALS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSRVQELHPESGEEAVTLVEDMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSRVQELHPESGEEAVTLVEDMQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RELGRLRQQVTNHGRGTEVLLEEPLPLETARESPSFKLEPMETERSPGPRLQELLGPSPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RELGRLRQQVTNHGRGTEVLLEEPLPLETARESPSFKLEPMETERSPGPRLQELLGPSPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 RDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDRSQGDWAPPPEGGMEQALAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDRSQGDWAPPPEGGMEQALAGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 SSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 FLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 QRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 ERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 KPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYK
              610       620       630       640       650       660

              670       680   
pF1KB9 CSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
       :::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
              670       680   

>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15            (614 aa)
 initn: 739 init1: 739 opt: 1284  Z-score: 852.8  bits: 168.0 E(32554): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 1328; 37.8% identity (59.8% similar) in 679 aa overlap (8-683:26-582)

                                 10        20        30        40  
pF1KB9                   MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHL
                                ::.:   .. ::.: .: ::    . ::  :    
CCDS10 MMAADIPRVTTPLSSLVQVPQEEDRQEEEVTTMI-LEDD-SWVQEAVLQEDGPESEPFPQ
               10        20        30          40        50        

             50          60        70        80        90       100
pF1KB9 RFRRFRFQEAA--GPREALSRLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSR
          .   :: .  ::. ::.::.:::. :::::..::::.:         :.::.:::. 
CCDS10 SAGKGGPQEEVTRGPQGALGRLRELCRRWLRPEVHTKEQML---------TMLPKEIQAW
       60        70        80        90                100         

              110       120       130       140       150       160
pF1KB9 VQELHPESGEEAVTLVEDMQRELGRLRQQVTNHGRGTEVLLEEPLPLETARESPSFKLEP
       .:: .:::.:::..::::. . :                            .. .:... 
CCDS10 LQEHRPESSEEAAALVEDLTQTL----------------------------QDSDFEIQ-
     110       120       130                                   140 

              170       180       190       200       210       220
pF1KB9 METERSPGPRLQELLGPSPQRDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLE
         .:           : . ..:               .:  :.    .::     ::.  
CCDS10 --SEN----------GENCNQD---------------MFENESRKIFSEM-----PEG--
                          150                      160             

              230       240       250       260       270       280
pF1KB9 DVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPS
               :   :.: ..  . ::.      ... :..: :...  :  :.:     :  
CCDS10 --------ESAQHSD-GESDFERDA------GIQRLQGHSPGED-HGEVVSQ-----DRE
                170        180             190        200          

              290       300       310       320       330       340
pF1KB9 VQSCKEGLSPRGPAPGEEKFENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDR
       : .   ::  .:   ::. .:     :. :....  .  :  . :       . :. . .
CCDS10 VGQLI-GL--QGTYLGEKPYE----CPQ-CGKTFSRKSHLITHER------THTGEKYYK
         210          220            230       240             250 

              350       360       370        380       390         
pF1KB9 SQGDWAPPPEGGMEQALAGASSGRELGRPKELQP-KKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRI
        .       : :      . :.: ...: .  .  .: . :  :::.:: ..::: ::::
CCDS10 CD-------ECG-----KSFSDGSNFSRHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRI
                         260       270       280       290         

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB9 HAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGE
       :..:.  . ..: . :. .: ... .:.: ::. ..: :::: :.. . :. ::  ::::
CCDS10 HTGEKPFQCAECGKSFSRSPNLIAHQRTHTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGE
     300       310       320       330       340       350         

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB9 KPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYK
       :::.:. ::. :: :::: :::: ::::::::: .::. :..:: :. :.: ::::.::.
CCDS10 KPYECKECGESFSYNSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQ
     360       370       380       390       400       410         

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB9 CPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLT
       : ::::::::::.:. :.:::  :. :  . ::.. :.:. .....: : .::  .::::
CCDS10 CSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKP-YECLT
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KB9 CGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDS
       ::.::  . .: .::: :::::::::. ::. ::.::.:. ::: ::::::: :  :: :
CCDS10 CGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSECGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKS
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pF1KB9 FSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG                
       ::..:  . : :.: :..::.: :::..:: .: :. ::: :::                
CCDS10 FSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKGFSWNSVLIIHQRIHTGEKPYKCPECGKGFSNS
      540       550       560       570       580       590        

CCDS10 SNFITHQRTHMKEKLY
      600       610    

>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19           (475 aa)
 initn: 695 init1: 695 opt: 1242  Z-score: 826.6  bits: 162.8 E(32554): 1e-39
Smith-Waterman score: 1242; 42.6% identity (66.0% similar) in 476 aa overlap (221-682:10-473)

              200       210       220       230       240       250
pF1KB9 LSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESY
                                     ::.. .:::::   :: .: : ::.. :.:
CCDS12                      MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENY
                                    10        20        30         

              260       270       280       290       300          
pF1KB9 ENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKFENLEG-VPSV
        :. :.  . :. .:  . . :: . :  . .  . ::     .  : :. .:.  :  .
CCDS12 GNLVSMGLYTPKPQVI-SLLEQGKEPWMVGRELTR-GLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEI
      40        50         60        70         80        90       

       310         320            330       340          350       
pF1KB9 --CSENIHPQVL--LPDQARGEV-----PWSPELGRPHDR-SQGDWAPP--PEGGMEQAL
         :...:   .   :  .. :.:       . .:: :. . ::  ..:   :   ..  :
CCDS12 ELCQREIMGLTKHGLEYSSFGDVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFL
       100       110       120       130       140       150       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB9 AGASSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGG
       .  .   .  :: :        :  ::: ::.::..:.::::: .:.     .: ..:. 
CCDS12 TLHQIINNEDRPYE--------CKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSC
       160       170               180       190       200         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB9 NPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNL
       . .     . : ::.  .: :::: :: ...:..::: :::.:::.:. ::: ::  :::
CCDS12 GSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNL
     210       220       230       240       250       260         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB9 HRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHE
         ::: :::::::.:  ::. :..::.:..: ::::::.::.: ::::.:..::.:: :.
CCDS12 IDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQ
     270       280       290       300       310       320         

       540       550       560        570       580       590      
pF1KB9 RTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHG-AHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRT
       : :  :. :  .:::.: :...  ::::   : .::  ..:  :::.: :. .: .::: 
CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKAFSSGSA-LTNHQRIHTGEKP-YDCKECGKAFTQSSQLRQHQRI
     330       340       350        360        370       380       

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pF1KB9 HTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGE
       :.::::..:  ::. :.. :.:..:::::: :::: :.::: .:.. ::  :::: ::::
CCDS12 HAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGE
       390       400       410       420       430       440       

        660       670       680    
pF1KB9 RPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG 
       .::.:.:::..:: .: :. ::  ::  
CCDS12 KPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK
       450       460       470     

>>CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16            (869 aa)
 initn: 1252 init1: 735 opt: 1241  Z-score: 823.2  bits: 163.1 E(32554): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 1269; 41.3% identity (65.1% similar) in 504 aa overlap (188-683:4-482)

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB9 LEPMETERSPGPRLQELLGPSPQRDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPE
                                     : :: .:  .:  :: . .: .  : .  .
CCDS45                            MEPETALWGP--DLQGPEQSPNDAH-RGAESEN
                                          10          20         30

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB9 SLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLW
         :.  .  : ::    ::..   :.:... : :  .: .  .:..  : : .:... : 
CCDS45 EEESPRQESSGEEIIMGDPAQSPESKDSTEMSLER-SSQDPSVPQN--PPTPLGHSNPL-
               40        50        60         70          80       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB9 DPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKFENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPW-SPELGR
       : ..      :.:  :::  :   .     ..:  . .  .:        . : :: .  
CCDS45 DHQIP-----LDP--PAP--EVVPTPSDWTKACEASWQWGAL--------TTWNSPPVVP
         90                100       110               120         

        340       350       360        370             380         
pF1KB9 PHDRSQGDWAPPPEGGMEQALAGASSGRELGR-PKELQPKKLHL------CPLCGKNFSN
        .. :  . .    .: :.       :. ...  : :. ...:       :  :::.:..
CCDS45 ANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQ
     130       140       150       160       170       180         

     390       400       410       420       430       440         
pF1KB9 NSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHL
       .:.:..::: :..:.     :: . :. .  ... .:.: ::. .:: :: : :.:.:.:
CCDS45 SSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNL
     190       200       210       220       230       240         

     450       460       470       480       490       500         
pF1KB9 TRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQ
        .:::.:::::::.:. : . :  .:.: .:: ::::::::::::::. :... :::.::
CCDS45 IKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQ
     250       260       270       280       290       300         

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB9 RIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHK
       .::.::.::.: :::::: .::.:. :.:::  :. :   :::.. . :. .. .. .: 
CCDS45 KIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHL
     310       320       330       340       350       360         

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB9 AEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEK
        :   :.: .:::.:  .  : :::::::::.::::  ::..::  :::: ::::: ::.
CCDS45 REDP-FKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGER
     370        380       390       400       410       420        

     630       640       650       660       670       680         
pF1KB9 PYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG      
       :: : .:: ::  ::. ::: : ::::.:::::.::.:: :::.:..:.:::::      
CCDS45 PYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKC
      430       440       450       460       470       480        

CCDS45 PECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQG
      490       500       510       520       530       540        

>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1               (470 aa)
 initn: 724 init1: 724 opt: 1224  Z-score: 815.0  bits: 160.7 E(32554): 4.5e-39
Smith-Waterman score: 1339; 43.8% identity (66.9% similar) in 495 aa overlap (210-682:7-469)

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 QRDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKR
                                     :.: : : ..::.:::...:::   : ..:
CCDS23                         MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQR
                                       10        20        30      

     240       250       260         270       280       290       
pF1KB9 ALSRDTVQESYENVDSLESHIPSQ-EV-PGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPG-
        : ::..::.: :: ::. .: :. :: :  ....       .::    : . . :: . 
CCDS23 DLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISE-------DVQ---FGTTSERPAENA
         40        50        60        70                  80      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB9 EEKFENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDRSQGDWAPPPEGGMEQA
       ::. :. ::  :             :  :.:  :.       : .  .:.  :   . . 
CCDS23 EENPESEEGFES------------GD--RSERQWG-------DLTAEEWVSYPLQPVTDL
         90                   100                110       120     

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pF1KB9 LAG------------ASSGRELGRPKEL-QPKKLHL------CPLCGKNFSNNSNLIRHQ
       :.             .  :. ... ..: . .: :       :  :::.:: .:.::.::
CCDS23 LVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQ
         130       140       150       160       170       180     

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB9 RIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHT
       : :..::     .: . :: . .... .  : ::. ::: :::: : . .:: .:::::.
CCDS23 RTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHS
         190       200       210       220       230       240     

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB9 GEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERP
       :::::.:. ::: :: .:.: .:::::::::::.: :::. :.. :.:..: :.::::::
CCDS23 GEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERP
         250       260       270       280       290       300     

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB9 YKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFEC
       ::: ::::.::..: :: :.:.:  :. :  .::::  :  . .. .. .: .::  .::
CCDS23 YKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKP-YEC
         310       320       330       340       350       360     

       580       590       600       610       620       630       
pF1KB9 LTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECG
        .::::: .. ::  ::. :::::::.:. : ..:..::.::.::: ::::::: : .::
CCDS23 NACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCG
          370       380       390       400       410       420    

       640       650       660       670       680   
pF1KB9 DSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
        .:..::: : : :.::::.::.:.:: .:::::: :..:.:.:: 
CCDS23 KGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
          430       440       450       460       470

>>CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19            (670 aa)
 initn: 1183 init1: 673 opt: 1199  Z-score: 797.1  bits: 157.9 E(32554): 4.5e-38
Smith-Waterman score: 1199; 52.3% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (378-683:335-639)

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB9 PPEGGMEQALAGASSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCM
                                     : :  : :.:: .::::.:::.:..::   
CCDS12 RPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSNLIEHQRVHTGERPYE
          310       320       330       340       350       360    

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB9 GVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNIC
         .: . :  .  ..  .:.: ::. ..: :::: : :  .: ::.:.:::: ::::. :
CCDS12 CGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQCCECGKSFRQIFNLIRHRRVHTGEMPYQCSDC
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pF1KB9 GKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSF
       :: :::.:.: .::: :.::.::.: :::. : . :::.::. ::::.:::.: :: :::
CCDS12 GKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIHTGDRPYECSECEKSF
          430       440       450       460       470       480    

       530       540       550       560       570       580       
pF1KB9 SRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQG
       ::.  :. :.:.:  :: :  ::::.. . .. .. ..  : . .  .::  ::::::: 
CCDS12 SRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQHRRIHTGTRP-YECSECGKSFRQR
          490       500       510       520       530        540   

       590       600       610       620       630       640       
pF1KB9 MHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRI
         : .:.: ::::.::.:. ::..::. ..::.:::.::::.:: : ::: :::.::. :
CCDS12 SGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLI
           550       560       570       580       590       600   

       650       660       670       680                           
pF1KB9 RHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG                        
       .: : :::::::.::.::. :...: :..:::.:::                        
CCDS12 QHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSRKSNLIRHRR
           610       620       630       640       650       660   

CCDS12 VHTEERP
           670

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 709 init1: 709 opt: 1198  Z-score: 796.8  bits: 157.7 E(32554): 4.6e-38
Smith-Waterman score: 1209; 41.0% identity (63.9% similar) in 490 aa overlap (195-682:76-531)

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB9 RSPGPRLQELLGPSPQRDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAM
                                     : .:.  .:  :: :       ::::..:.
CCDS74 ETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRG--EDTEGHWEWSCESLESLAV
          50        60        70        80          90       100   

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pF1KB9 YISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESY-ENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQS
        ..        : :  . ..  .... ::. ::.  .: :  : :   :. . :    . 
CCDS74 PVAFT------PVKTPVLEQWQRNGFGENI-SLNPDLPHQ--PMTPERQSPHTWGTRGKR
                 110       120        130         140       150    

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 CKEGLSPRGPAPGEEKFENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDRSQG
        :  :.    .  .::       :  :.:          .: ..   :  : . :    :
CCDS74 EKPDLNVLQKTCVKEK-------PYKCQEC--------GKAFSH---SSALIEHHRTHTG
          160       170                      180          190      

           350       360       370        380       390       400  
pF1KB9 DWAPPPEGGMEQALAGASSGRELGRPKELQP-KKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAA
       .   : :   .. : :  ..  : . ....  .: . :  ::..:.. . ::.::: :..
CCDS74 ER--PYE--CHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
          200         210       220       230       240       250  

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB9 ERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPY
       :.     .: . :.    : . .:.: ::. ..: :::: : :. :::.: : :::::::
CCDS74 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
            260       270       280       290       300       310  

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pF1KB9 QCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPE
       ::. ::: :: .:.: .::: :::::::.: :::. :.. . :..::: ::::.::.: :
CCDS74 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
            320       330       340       350       360       370  

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 CGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGK
       :::.::.:. :. :.: :  :. :  .:::.. : :. .  .. .: .::  .::  :::
CCDS74 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP-YECSQCGK
            380       390       400       410       420        430 

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pF1KB9 SFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSH
       .:::. :::.::: :::::::.:. ::. ::: :.: .::::::::::: :..:: .::.
CCDS74 AFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQ
             440       450       460       470       480       490 

            650       660       670       680                      
pF1KB9 SSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG                   
        .  :.: : ::::.::.:..::..::.:: :. ::: ::                    
CCDS74 LAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSL
             500       510       520       530       540       550 

CCDS74 SQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQ
             560       570       580       590       600       610 

>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 709 init1: 709 opt: 1198  Z-score: 796.5  bits: 157.7 E(32554): 4.8e-38
Smith-Waterman score: 1234; 40.5% identity (64.0% similar) in 516 aa overlap (216-683:11-518)

         190       200       210         220       230       240   
pF1KB9 VKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPE--SLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSR
                                     ::  ..:::.. .::::::.  :..:.: :
CCDS74                     MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYR
                                   10        20        30        40

           250       260       270       280        290       300  
pF1KB9 DTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQS-CKEGLSPRGPAPGEEKFEN
       :.. .... . :.   .:. .:  . . : ..::  .:.:   .:. :   .  . :.  
CCDS74 DVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVI-SLLEQEAELW--AVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSV
               50        60         70          80        90       

             310       320                    330                  
pF1KB9 L-EGVPSVCSENIHPQVLLPDQ--------ARGE-----VPWSPE----LGRP-------
       : .:.    ::.:  .:.: ..         :::       :: :    :. :       
CCDS74 LKQGI----SEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK
       100           110       120       130       140       150   

            340                350         360       370           
pF1KB9 -----HDRSQG---------DWAPPPEGGMEQA--LAGASSGRELGRPKELQP----KKL
            . . .:         :    :    .:.    :. . ::    . ::     .: 
CCDS74 TPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKP
           160       170       180       190       200       210   

       380       390       400       410       420       430       
pF1KB9 HLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCL
       . :  ::: ::..: ::.:.: :..::     .: . : ..  . . .: : ::. .:: 
CCDS74 YKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCT
           220       230       240       250       260       270   

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB9 ECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGE
       .::. :.: . : .:::::::::::.:. ::: ::  :.. .:.:::::::::.: :::.
CCDS74 QCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGK
           280       290       300       310       320       330   

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB9 IFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSD
        : .: .: .: ::::::.::.: ::::.::.:: :. :.: :  :. :   :::.: ..
CCDS74 AFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQ
           340       350       360       370       380       390   

       560       570       580       590       600       610       
pF1KB9 STPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSN
        ::.. .. .: .::  .::  :::.: :.  ::.:.: ::::::: :. ::..::: :.
CCDS74 ITPLIQHQRTHTGEKP-YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
           400        410       420       430       440       450  

       620       630       640       650       660       670       
pF1KB9 LIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSH
       : .:.: ::::::: : .:: .: .:..  .: : ::::.::.:..::..::.:: : .:
CCDS74 LSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKH
            460       470       480       490       500       510  

       680                                                         
pF1KB9 QRTHTG                                                      
       :: :::                                                      
CCDS74 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIH
            520       530       540       550       560       570  

>--
 initn: 521 init1: 521 opt: 541  Z-score: 369.1  bits: 78.7 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 594; 52.7% identity (65.1% similar) in 169 aa overlap (459-627:519-658)

      430       440       450       460       470       480        
pF1KB9 LGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEK
                                     ::::.:: ::. ::  . : .::: :::::
CCDS74 TGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEK
      490       500       510       520       530       540        

      490       500       510       520       530       540        
pF1KB9 PYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPF
       ::.: .::. :..:: :..:::::: :.:: : :::::::.:: :  :::::  :. :  
CCDS74 PYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPY--
      550       560       570       580       590       600        

      550       560       570       580       590       600        
pF1KB9 SECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLC
                                  ::  :::::::. :::.:.: ::::::: :  :
CCDS74 ---------------------------ECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDC
                                   610       620       630         

      610       620       630       640       650       660        
pF1KB9 GENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESF
       :. :.: :.: .::: :::                                         
CCDS74 GKAFTHSSSLTKHQRTHTG                                         
     640       650                                                 

>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 709 init1: 709 opt: 1198  Z-score: 796.4  bits: 157.7 E(32554): 4.9e-38
Smith-Waterman score: 1233; 40.3% identity (63.3% similar) in 526 aa overlap (216-683:11-530)

         190       200       210         220       230       240   
pF1KB9 VKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPE--SLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSR
                                     ::  ..:::.. .::::::.  :..:.: :
CCDS12                     MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYR
                                   10        20        30        40

           250       260       270       280        290       300  
pF1KB9 DTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQS-CKEGLSPRGPAPGEEKF--
       :.. .... . :.   .:. .:  . . : ..::  .:.:   .:. :.    :. .:  
CCDS12 DVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVI-SLLEQEAELW--AVESRLPQGVYPE--IKGHFQFLL
               50        60         70          80          90     

                       310       320                    330        
pF1KB9 -ENLEGVPSV--------CSENIHPQVLLPDQ--------ARGE-----VPWSPE----L
         .::  :.:         ::.:  .:.: ..         :::       :: :    :
CCDS12 LSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESL
         100       110       120       130       140       150     

                      340                350         360       370 
pF1KB9 GRP------------HDRSQG---------DWAPPPEGGMEQA--LAGASSGRELGRPKE
       . :            . . .:         :    :    .:.    :. . ::    . 
CCDS12 AVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNV
         160       170       180       190       200       210     

                 380       390       400       410       420       
pF1KB9 LQP----KKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRA
       ::     .: . :  ::: ::..: ::.:.: :..::     .: . : ..  . . .: 
CCDS12 LQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRI
         220       230       240       250       260       270     

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB9 HLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGE
       : ::. .:: .::. :.: . : .:::::::::::.:. ::: ::  :.. .:.::::::
CCDS12 HTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGE
         280       290       300       310       320       330     

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB9 KPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYP
       :::.: :::. : .: .: .: ::::::.::.: ::::.::.:: :. :.: :  :. : 
CCDS12 KPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYE
         340       350       360       370       380       390     

       550       560       570       580       590       600       
pF1KB9 FSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTL
         :::.: .. ::.. .. .: .::  .::  :::.: :.  ::.:.: ::::::: :. 
CCDS12 CHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP-YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNE
         400       410       420        430       440       450    

       610       620       630       640       650       660       
pF1KB9 CGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGES
       ::..::: :.: .:.: ::::::: : .:: .: .:..  .: : ::::.::.:..::..
CCDS12 CGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKA
          460       470       480       490       500       510    

       670       680                                               
pF1KB9 FSRSSRLMSHQRTHTG                                            
       ::.:: : .::: :::                                            
CCDS12 FSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQS
          520       530       540       550       560       570    

>--
 initn: 521 init1: 521 opt: 541  Z-score: 369.0  bits: 78.7 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 594; 52.7% identity (65.1% similar) in 169 aa overlap (459-627:531-670)

      430       440       450       460       470       480        
pF1KB9 LGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEK
                                     ::::.:: ::. ::  . : .::: :::::
CCDS12 TGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEK
              510       520       530       540       550       560

      490       500       510       520       530       540        
pF1KB9 PYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPF
       ::.: .::. :..:: :..:::::: :.:: : :::::::.:: :  :::::  :. :  
CCDS12 PYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPY--
              570       580       590       600       610          

      550       560       570       580       590       600        
pF1KB9 SECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLC
                                  ::  :::::::. :::.:.: ::::::: :  :
CCDS12 ---------------------------ECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDC
                                 620       630       640       650 

      610       620       630       640       650       660        
pF1KB9 GENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESF
       :. :.: :.: .::: :::                                         
CCDS12 GKAFTHSSSLTKHQRTHTG                                         
             660       670                                         

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 709 init1: 709 opt: 1198  Z-score: 796.3  bits: 157.8 E(32554): 4.9e-38
Smith-Waterman score: 1231; 40.2% identity (63.4% similar) in 522 aa overlap (218-683:27-542)

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 ERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQ
                                     ..:::.. .::::::.  :..:.: ::.. 
CCDS54     MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVML
                   10        20        30        40        50      

       250       260       270       280        290       300      
pF1KB9 ESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQS-CKEGLSPRGPAPGEEKF---ENL
       .... . :.   .:. .:  . . : ..::  .:.:   .:. :.    :. .:    .:
CCDS54 DTFRLLVSVGHWLPKPNVI-SLLEQEAELW--AVESRLPQGVYPE--IKGHFQFLLLSDL
         60        70         80          90         100       110 

                   310       320                    330            
pF1KB9 EGVPSV--------CSENIHPQVLLPDQ--------ARGE-----VPWSPE----LGRP-
       :  :.:         ::.:  .:.: ..         :::       :: :    :. : 
CCDS54 ETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPV
             120       130       140       150       160       170 

                  340                350         360       370     
pF1KB9 -----------HDRSQG---------DWAPPPEGGMEQA--LAGASSGRELGRPKELQP-
                  . . .:         :    :    .:.    :. . ::    . ::  
CCDS54 AFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKT
             180       190       200       210       220       230 

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 ---KKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGE
          .: . :  ::: ::..: ::.:.: :..::     .: . : ..  . . .: : ::
CCDS54 CVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
             240       250       260       270       280       290 

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 EAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYK
       . .:: .::. :.: . : .:::::::::::.:. ::: ::  :.. .:.:::::::::.
CCDS54 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
             300       310       320       330       340       350 

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB9 CPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSEC
       : :::. : .: .: .: ::::::.::.: ::::.::.:: :. :.: :  :. :   ::
CCDS54 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
             360       370       380       390       400       410 

             560       570       580       590       600       610 
pF1KB9 GEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGEN
       :.: .. ::.. .. .: .::  .::  :::.: :.  ::.:.: ::::::: :. ::..
CCDS54 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP-YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKT
             420       430        440       450       460       470

             620       630       640       650       660       670 
pF1KB9 FSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRS
       ::: :.: .:.: ::::::: : .:: .: .:..  .: : ::::.::.:..::..::.:
CCDS54 FSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHS
              480       490       500       510       520       530

             680                                                   
pF1KB9 SRLMSHQRTHTG                                                
       : : .::: :::                                                
CCDS54 SSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLI
              540       550       560       570       580       590

>--
 initn: 521 init1: 521 opt: 541  Z-score: 368.9  bits: 78.7 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 594; 52.7% identity (65.1% similar) in 169 aa overlap (459-627:543-682)

      430       440       450       460       470       480        
pF1KB9 LGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEK
                                     ::::.:: ::. ::  . : .::: :::::
CCDS54 TGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEK
            520       530       540       550       560       570  

      490       500       510       520       530       540        
pF1KB9 PYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPF
       ::.: .::. :..:: :..:::::: :.:: : :::::::.:: :  :::::  :. :  
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CCDS54 GKAFTHSSSLTKHQRTHTG                                         
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