Result of SIM4 for pF1KB5788

seq1 = pF1KB5788.tfa, 1056 bp
seq2 = pF1KB5788/gi568815581f_45862338.tfa (gi568815581f:45862338_46124168), 261831 bp

>pF1KB5788 1056
>gi568815581f:45862338_46124168 (Chr17)

1-133  (100001-100133)   100% ->
134-199  (116038-116103)   100% ->
200-255  (124703-124758)   100% ->
256-382  (129123-129249)   100% ->
383-648  (134062-134327)   100% ->
649-730  (151906-151987)   100% ->
731-843  (156281-156393)   100% ->
844-1056  (161619-161831)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGATCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGATCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAG         CTGAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100101 ACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGGTT...CAGCTGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116046 GCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACCCAAG         CTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 116096 GACCCAAGGTC...CAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAAGCGATGACAAAAAAGCCAAG         GGGGCTGATGGTAAAACG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 124736 GAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGTA...CAGGGGGCTGATGGTAAAACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129141 AAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACCCCGCCCGCTCCAAAGACACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129191 CAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACCCCGCCCGCTCCAAAGACACCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAGCTCTG         GTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 129241 CCAGCTCTGGTA...CAGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134094 TACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134144 GTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134194 GTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134244 CCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGAAG         GTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 134294 TGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGAAGGTG...CAGGTGCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151913 TAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTAGGCAACATCCATCATAAACCAG         GAGGTGGCCAGGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 151963 TTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGTA...TAGGAGGTGGCCAGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156297 AGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 156347 GGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844       ATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156397 ...CAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161663 GACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161713 ACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161763 ATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTC

   1100     .    :    .
   1038 CCTGGCCAAGCAGGGTTTG
        |||||||||||||||||||
 161813 CCTGGCCAAGCAGGGTTTG

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