Result of SIM4 for pF1KB7278

seq1 = pF1KB7278.tfa, 2067 bp
seq2 = pF1KB7278/gi568815594f_80100081.tfa (gi568815594f:80100081_80303529), 203449 bp

>pF1KB7278 2067
>gi568815594f:80100081_80303529 (Chr4)

1-219  (100001-100219)   100% ->
220-451  (101210-101441)   100% ->
452-2067  (101834-103449)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGATACTGGCATCCAGCGAGGCATCTGGGATGGAGATGCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGATACTGGCATCCAGCGAGGCATCTGGGATGGAGATGCCAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCCAACAATGTCTGACAGATATTTTTACCAGCGTTTACACCACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCCAACAATGTCTGACAGATATTTTTACCAGCGTTTACACCACCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATCCCTGAGAATGCTATATTTGGTCCCTGTGTCCTGAGCCATACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATCCCTGAGAATGCTATATTTGGTCCCTGTGTCCTGAGCCATACTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTATATGACAGCATAGCTTTCATAGCTCTCAAGTCTACTGACAAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTATATGACAGCATAGCTTTCATAGCTCTCAAGTCTACTGACAAGAGAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTACCGTATATCTTTCGG         GTAGACACCTCAGCAGCAAATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100201 AGTACCGTATATCTTTCGGGTA...CAGGTAGACACCTCAGCAGCAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTCCTCAGAAGGTCTCATGTGGCTGCGGTTGGTCCAATCGGCCAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101232 GTTCCTCAGAAGGTCTCATGTGGCTGCGGTTGGTCCAATCGGCCAGAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGGAAGAGCAGAACCTTGAAGCCTACATAAAAAACGGACAGCTGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101282 AAGGAAGAGCAGAACCTTGAAGCCTACATAAAAAACGGACAGCTGTTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGCTCTCTCCGCAGGATTGCCAAAGACGAGGAGTTACTAGTTTGGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101332 CCGCTCTCTCCGCAGGATTGCCAAAGACGAGGAGTTACTAGTTTGGTACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAAAGAACTGACTGAGTTACTCTTGCTCTGCCCCTCTAGATCCCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101382 GGAAAGAACTGACTGAGTTACTCTTGCTCTGCCCCTCTAGATCCCACAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAAATGAATG         GGTCGTCCCCTTACACATGCCTGGAATGCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101432 AAAATGAATGGTA...CAGGGTCGTCCCCTTACACATGCCTGGAATGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCAACGTTTCCAGTTTGAGTTCCCCTATGTGGCGCATCTGCGTTTCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101865 CCAACGTTTCCAGTTTGAGTTCCCCTATGTGGCGCATCTGCGTTTCCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCCCCAAGAGACTTCACAGCGCTGATATAAGTCCCCAAGACGAACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101915 GCCCCAAGAGACTTCACAGCGCTGATATAAGTCCCCAAGACGAACAAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCGGCGTGGGCACCAAGGACCACGGGGGCGGCGGCGGCGGTGGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101965 GGCGGCGTGGGCACCAAGGACCACGGGGGCGGCGGCGGCGGTGGCAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGCACCTTTAGGCCCGGGTCCCAAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102015 CCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGCACCTTTAGGCCCGGGTCCCAAGTTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCAAAGCCGGCCCCCTCCACCACTACCCATCCCCCTCCCCGGAAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102065 GCAAAGCCGGCCCCCTCCACCACTACCCATCCCCCTCCCCGGAAAGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AACCCATCCGCTGCCGCCGGCGGCAGCAGCGCGAAGCCATCCACAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102115 AACCCATCCGCTGCCGCCGGCGGCAGCAGCGCGAAGCCATCCACAGACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCACAACCTGGCCAGGGAGCTGGAAAACTCCCGGGGAGGCAGCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 CCACAACCTGGCCAGGGAGCTGGAAAACTCCCGGGGAGGCAGCAGCTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCCCAGCCCAGAGCCTCAGCAGCGGTAGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102215 CCCCAGCCCAGAGCCTCAGCAGCGGTAGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CACCAGGAGGCGGAGCTGAGTCCCGACGGCATCGCCACGGGCGGCGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 CACCAGGAGGCGGAGCTGAGTCCCGACGGCATCGCCACGGGCGGCGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGGAAAGAGGAAATTCCCGGAGGAGGCGGCGGAGGGCGGCGGTGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 AGGAAAGAGGAAATTCCCGGAGGAGGCGGCGGAGGGCGGCGGTGGCGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTCTGGTAGGGGGCCGGGGCCGCTTCGTAGAGCGGCCCCTCCCGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102365 GTCTGGTAGGGGGCCGGGGCCGCTTCGTAGAGCGGCCCCTCCCGGCCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAGGAGGATCTGGTGTGCACACCGCAGCAGTACCGAGCCTCGGGCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102415 AAGGAGGATCTGGTGTGCACACCGCAGCAGTACCGAGCCTCGGGCAGCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTTCGGCCTGGAAGAGAACGGCCGCCTCTTCGCGCCGCCAAGTCCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 CTTCGGCCTGGAAGAGAACGGCCGCCTCTTCGCGCCGCCAAGTCCCGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CGGGCGAGGCGAAGCGCAGCGCCTTCGTGGAGGTGAAGAAGGCTGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102515 CGGGCGAGGCGAAGCGCAGCGCCTTCGTGGAGGTGAAGAAGGCTGCCCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GCGGCCAGCCTGCAGGAGGAGGGGACAGCCGACGGCGCGGGAGTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102565 GCGGCCAGCCTGCAGGAGGAGGGGACAGCCGACGGCGCGGGAGTCGCCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CGAGGACCAGGACGCTGGCGGCGGCGGCGGCTCCTCCACGCCCGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102615 CGAGGACCAGGACGCTGGCGGCGGCGGCGGCTCCTCCACGCCCGCGGCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CGTCACCGGTGGGCGCCGAGAAGCTGCTGGCCCCGCGGCCTGGGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102665 CGTCACCGGTGGGCGCCGAGAAGCTGCTGGCCCCGCGGCCTGGGGGCCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CTGCCCAGCCGGCTCGAGGGCGGCAGTCCTGCGAGGGGCAGCGCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102715 CTGCCCAGCCGGCTCGAGGGCGGCAGTCCTGCGAGGGGCAGCGCCTTCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TTCGGTGCCGCAGCTGGGCAGCGCGGGCAGCACCAGCGGTGGGGGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102765 TTCGGTGCCGCAGCTGGGCAGCGCGGGCAGCACCAGCGGTGGGGGCGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 CGGGCGCCGGGGCCGCAGGCGGCGCGGGCGGGGGCCAGGGCGCCGCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102815 CGGGCGCCGGGGCCGCAGGCGGCGCGGGCGGGGGCCAGGGCGCCGCGTCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 GACGAGCGCAAAAGCGCCTTCTCGCAGCCAGCACGCTCTTTCTCGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102865 GACGAGCGCAAAAGCGCCTTCTCGCAGCCAGCACGCTCTTTCTCGCAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GTCCCCGCTGGTGCTGGGCCAGAAGCTGGGCGCGCTCGAGCCATGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102915 GTCCCCGCTGGTGCTGGGCCAGAAGCTGGGCGCGCTCGAGCCATGCCACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CCGCCGACGGCGTGGGCCCCACCAGACTCTATCCCGCCGCCGCGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102965 CCGCCGACGGCGTGGGCCCCACCAGACTCTATCCCGCCGCCGCGGACCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CTAGCGGTGAAGCTCCAGGGGGCCGCGGACCTGAACGGAGGTTGCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103015 CTAGCGGTGAAGCTCCAGGGGGCCGCGGACCTGAACGGAGGTTGCGGGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 CCTGCCGAGCGGCGGCGGCGGCCTGCCTAAGCAGAGCCCCTTCCTGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103065 CCTGCCGAGCGGCGGCGGCGGCCTGCCTAAGCAGAGCCCCTTCCTGTACG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 CCACCGCCTTCTGGCCCAAGAGCTCCGCTGCCGCTGCAGCCGCGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103115 CCACCGCCTTCTGGCCCAAGAGCTCCGCTGCCGCTGCAGCCGCGGCTGCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 GCGGCGGCCGCGGGGCCCTTGCAGCTGCAGCTGCCCTCGGCGCTCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103165 GCGGCGGCCGCGGGGCCCTTGCAGCTGCAGCTGCCCTCGGCGCTCACGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 GCTGCCGCCCTCCTTCACCTCGCTGTGTCTGCCCGCGCAGAACTGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103215 GCTGCCGCCCTCCTTCACCTCGCTGTGTCTGCCCGCGCAGAACTGGTGCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 CCAAGTGCAATGCCTCCTTCCGCATGACCTCCGACCTGGTGTACCATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103265 CCAAGTGCAATGCCTCCTTCCGCATGACCTCCGACCTGGTGTACCATATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 AGGTCGCACCACAAAAAGGAGTATGCGATGGAGCCCTTGGTGAAGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 103315 AGGTCGCACCACAAAAAGGAGTATGCGATGGAGCCCTTGGTGAAGCGGCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1983 GCGAGAGGAGAAACTCAAGTGCCCCATCTGCAATGAGTCCTTCAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103365 GCGAGAGGAGAAACTCAAGTGCCCCATCTGCAATGAGTCCTTCAGGGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .
   2033 GCCACCACCTCTCCAGGCACATGACCTCGCATAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103415 GCCACCACCTCTCCAGGCACATGACCTCGCATAAT

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