Result of FASTA (omim) for pF1KB6259
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6259, 764 aa
  1>>>pF1KB6259 764 - 764 aa - 764 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2090+/-0.000517; mu= 20.8929+/- 0.032
 mean_var=69.2882+/-14.268, 0's: 0 Z-trim(107.4): 51  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.154079
 statistics sampled from 15380 (15430) to 15380 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.181), width:  16
 Scan time:  9.800

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exc ( 764) 4939 1108.0       0
XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chlo ( 764) 4939 1108.0       0
XP_005250482 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 780) 2288 518.7 3.6e-146
NP_000432 (OMIM: 274600,600791,605646) pendrin [Ho ( 780) 2288 518.7 3.6e-146
NP_945350 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform a  ( 744) 1763 402.0 4.7e-111
XP_011514472 (OMIM: 604943,613865) PREDICTED: pres ( 744) 1763 402.0 4.7e-111
NP_996766 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform b  ( 685) 1690 385.8 3.3e-106
NP_996767 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform c  ( 516) 1459 334.3 7.6e-91
NP_443166 (OMIM: 608481) solute carrier family 26  ( 791) 1393 319.8 2.8e-86
NP_599152 (OMIM: 608481) solute carrier family 26  ( 887) 1393 319.8 3.1e-86
NP_602298 (OMIM: 610068) solute carrier family 26  ( 740) 1344 308.9 5.1e-83
XP_016867807 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 754) 1312 301.8 7.1e-81
XP_006716088 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 423) 1306 300.3 1.1e-80
XP_016864680 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60 ( 739) 1293 297.5 1.3e-79
NP_000103 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60671 ( 739) 1293 297.5 1.3e-79
NP_001308716 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 653) 1251 288.2 7.6e-77
NP_001161434 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 712) 1251 288.2 8.2e-77
NP_599025 (OMIM: 610068) solute carrier family 26  ( 758) 1212 279.5 3.5e-74
NP_001035544 (OMIM: 610068) solute carrier family  ( 738) 1209 278.9 5.5e-74
NP_075062 (OMIM: 610068) solute carrier family 26  ( 759) 1209 278.9 5.6e-74
XP_011507423 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 702) 1191 274.8 8.4e-73
NP_071325 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 1180 272.4 4.6e-72
NP_998778 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 1180 272.4 4.6e-72
XP_011507426 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 466) 1119 258.7   4e-68
XP_016865724 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 970) 1111 257.2 2.5e-67
NP_443193 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 970) 1111 257.2 2.5e-67
NP_001180405 (OMIM: 606766,608480) testis anion tr ( 970) 1111 257.2 2.5e-67
NP_439897 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 656) 1073 248.6 6.3e-65
NP_001269285 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 656) 1073 248.6 6.3e-65
NP_599028 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 663) 1073 248.6 6.3e-65
XP_011507424 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 627) 1043 241.9 6.1e-63
NP_001268661 (OMIM: 610068) solute carrier family  ( 723)  961 223.7 2.1e-57
NP_001268662 (OMIM: 610068) solute carrier family  ( 651)  953 221.9 6.7e-57
NP_996768 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform d  ( 335)  921 214.6 5.4e-55
XP_011512596 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 944)  763 179.8 4.6e-44
NP_619732 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 865)  554 133.3 4.2e-30
NP_001269286 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 355)  438 107.3 1.2e-22
NP_001159820 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606)  385 95.6 6.4e-19
NP_775897 (OMIM: 610117) sodium-independent sulfat ( 606)  385 95.6 6.4e-19
NP_001159819 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606)  385 95.6 6.4e-19
NP_001159821 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606)  385 95.6 6.4e-19
NP_602297 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 224)  361 90.0 1.2e-17
XP_016879996 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630)  333 84.1   2e-15
XP_006721896 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630)  333 84.1   2e-15
XP_016879995 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 677)  333 84.1 2.1e-15
XP_016879994 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 696)  333 84.1 2.2e-15
XP_011522956 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441)  197 53.8 1.9e-06
XP_011522955 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441)  197 53.8 1.9e-06
XP_011522954 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 465)  197 53.8   2e-06


>>NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exchang  (764 aa)
 initn: 4939 init1: 4939 opt: 4939  Z-score: 5930.2  bits: 1108.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4939; 100.0% identity (100.0% similar) in 764 aa overlap (1-764:1-764)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRIVLSLFPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRIVLSLFPI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPAIIYLFFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPAIIYLFFG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDERVRVAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDERVRVAAAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 SVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLTVPSHTDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLTVPSHTDP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPIPIEFIMTVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPIPIEFIMTVIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 AGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVAFAVAFSVASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVAFAVAFSVASV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 YSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKTQIAGLIGAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKTQIAGLIGAII
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 VLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCLIWIMTFIFTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCLIWIMTFIFTI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 VLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMYEPEGVKIFRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMYEPEGVKIFRC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 PSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGLLQVTPKGFICTVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGLLQVTPKGFICTVDT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 IKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSLILDFSAVSFLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSLILDFSAVSFLD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 VSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIFFLTIHDAVLHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIFFLTIHDAVLHI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760    
pF1KB6 LMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
              730       740       750       760    

>>XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chloride  (764 aa)
 initn: 4939 init1: 4939 opt: 4939  Z-score: 5930.2  bits: 1108.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4939; 100.0% identity (100.0% similar) in 764 aa overlap (1-764:1-764)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRIVLSLFPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRIVLSLFPI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPAIIYLFFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPAIIYLFFG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDERVRVAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDERVRVAAAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 SVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLTVPSHTDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLTVPSHTDP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPIPIEFIMTVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPIPIEFIMTVIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 AGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVAFAVAFSVASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVAFAVAFSVASV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 YSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKTQIAGLIGAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKTQIAGLIGAII
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 VLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCLIWIMTFIFTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCLIWIMTFIFTI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 VLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMYEPEGVKIFRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMYEPEGVKIFRC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 PSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGLLQVTPKGFICTVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGLLQVTPKGFICTVDT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 IKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSLILDFSAVSFLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSLILDFSAVSFLD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 VSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIFFLTIHDAVLHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIFFLTIHDAVLHI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760    
pF1KB6 LMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
              730       740       750       760    

>>XP_005250482 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTED: p  (780 aa)
 initn: 2292 init1: 1395 opt: 2288  Z-score: 2745.3  bits: 518.7 E(85289): 3.6e-146
Smith-Waterman score: 2288; 48.2% identity (80.1% similar) in 720 aa overlap (5-720:16-729)

                          10        20        30        40         
pF1KB6            MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQK
                      .. .:.:.:::::  ::...:..  ...::. . :  ::::: ..
XP_005 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB6 AKRIVLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYAS
       :  .. .: ::  ::: ::.:::::::..::.:::.::.:::.:.:::. .:  ::::..
XP_005 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB6 FFPAIIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLL
       ::: . :..:::::::::::::..:.:::    ..: . .::..  . .  ..  :....
XP_005 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVG----SVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMI
              130       140           150       160       170      

     170          180       190       200       210       220      
pF1KB6 DD---ERVRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQL
       :    . .::  :...:.: ::::: :: :.:::.: ::.. :..::::::: .::::::
XP_005 DTAARDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQL
        180       190       200       210       220       230      

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB6 KFIFQLTVPSHTDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKL
       :....... ...  .::. .:  .:..:  ::.::....:....:   :::.:.::. :.
XP_005 KIVLNVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKI
        240       250       260       270       280       290      

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB6 PVPIPIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGI
       ::::::: :.:.::...::: .... .....: ..  :: ::  : :  :.. ..  :.:
XP_005 PVPIPIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSI
        300       310       320       330       340       350      

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB6 AMVAFAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQEST
       :.::.:.: ::..::. :::: .:::::.::.:..::  : :  :...:::::.::::::
XP_005 AVVAYAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQEST
        360       370       380       390       400       410      

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB6 GGKTQIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDK
       :::::.::.:.: ::.:..::.: :: :::::::::....:::::.::. .: ::::..:
XP_005 GGKTQVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNK
        420       430       440       450       460       470      

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB6 YDCLIWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDY
        : .::..: : .:.::: ::: :.. : :::.:.:.:::. . :..:  :.:::. :.:
XP_005 IDAVIWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNY
        480       490       500       510       520       530      

        530       540       550       560       570       580      
pF1KB6 YDMYEPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGL
        .. ::.::::.:  :::...:.  :.. . ..:::. .:.  :: ::::::.:: :.: 
XP_005 KNIEEPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQ
        540       550       560       570       580       590      

        590        600       610       620       630       640     
pF1KB6 LQVTPKGFIC-TVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKIS
       :..: .:.:  .:.: .  . . : ...: :: :  : .. ...:::..::....:::. 
XP_005 LRATKNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIP--TKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVP
        600       610       620       630         640       650    

         650       660       670       680       690       700     
pF1KB6 LHSLILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVK
       .:::.:: .:.::::: .::.:. :..:: :: :.::... .:  ::::..  ::: ...
XP_005 IHSLVLDCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIR
          660       670       680       690       700       710    

         710       720       730       740       750       760     
pF1KB6 SSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF 
       .. ::::.:::.:..                                             
XP_005 KDTFFLTVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEA
          720       730       740       750       760       770    

>>NP_000432 (OMIM: 274600,600791,605646) pendrin [Homo s  (780 aa)
 initn: 2292 init1: 1395 opt: 2288  Z-score: 2745.3  bits: 518.7 E(85289): 3.6e-146
Smith-Waterman score: 2288; 48.2% identity (80.1% similar) in 720 aa overlap (5-720:16-729)

                          10        20        30        40         
pF1KB6            MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQK
                      .. .:.:.:::::  ::...:..  ...::. . :  ::::: ..
NP_000 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB6 AKRIVLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYAS
       :  .. .: ::  ::: ::.:::::::..::.:::.::.:::.:.:::. .:  ::::..
NP_000 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB6 FFPAIIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLL
       ::: . :..:::::::::::::..:.:::    ..: . .::..  . .  ..  :....
NP_000 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVG----SVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMI
              130       140           150       160       170      

     170          180       190       200       210       220      
pF1KB6 DD---ERVRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQL
       :    . .::  :...:.: ::::: :: :.:::.: ::.. :..::::::: .::::::
NP_000 DTAARDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQL
        180       190       200       210       220       230      

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB6 KFIFQLTVPSHTDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKL
       :....... ...  .::. .:  .:..:  ::.::....:....:   :::.:.::. :.
NP_000 KIVLNVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKI
        240       250       260       270       280       290      

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB6 PVPIPIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGI
       ::::::: :.:.::...::: .... .....: ..  :: ::  : :  :.. ..  :.:
NP_000 PVPIPIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSI
        300       310       320       330       340       350      

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB6 AMVAFAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQEST
       :.::.:.: ::..::. :::: .:::::.::.:..::  : :  :...:::::.::::::
NP_000 AVVAYAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQEST
        360       370       380       390       400       410      

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB6 GGKTQIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDK
       :::::.::.:.: ::.:..::.: :: :::::::::....:::::.::. .: ::::..:
NP_000 GGKTQVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNK
        420       430       440       450       460       470      

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB6 YDCLIWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDY
        : .::..: : .:.::: ::: :.. : :::.:.:.:::. . :..:  :.:::. :.:
NP_000 IDAVIWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNY
        480       490       500       510       520       530      

        530       540       550       560       570       580      
pF1KB6 YDMYEPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGL
        .. ::.::::.:  :::...:.  :.. . ..:::. .:.  :: ::::::.:: :.: 
NP_000 KNIEEPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQ
        540       550       560       570       580       590      

        590        600       610       620       630       640     
pF1KB6 LQVTPKGFIC-TVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKIS
       :..: .:.:  .:.: .  . . : ...: :: :  : .. ...:::..::....:::. 
NP_000 LRATKNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIP--TKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVP
        600       610       620       630         640       650    

         650       660       670       680       690       700     
pF1KB6 LHSLILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVK
       .:::.:: .:.::::: .::.:. :..:: :: :.::... .:  ::::..  ::: ...
NP_000 IHSLVLDCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIR
          660       670       680       690       700       710    

         710       720       730       740       750       760     
pF1KB6 SSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF 
       .. ::::.:::.:..                                             
NP_000 KDTFFLTVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEA
          720       730       740       750       760       770    

>>NP_945350 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform a [Hom  (744 aa)
 initn: 1746 init1: 1117 opt: 1763  Z-score: 2114.8  bits: 402.0 E(85289): 4.7e-111
Smith-Waterman score: 1763; 39.2% identity (71.6% similar) in 735 aa overlap (8-736:15-731)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRI
                     .: : ::..:  ...:  .   .   .. :.::   .:.:.: . :
NP_945 MDHAEENEILAATQRYYVERPIFSHPVLQERLHTKDKVPDSIADKLKQAFTCTPKKIRNI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 VLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPA
       .  ..::..:::::..::..:.:.:::::::.. . ::::::.:. .::..:::.::.:.
NP_945 IYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVPPIFGLYSSFYPV
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 IIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDER
       :.: :.:::::::.::: ..:.:.:    :.. . :::  .   :. : .:..   :  :
NP_945 IMYCFLGTSRHISIGPFAVISLMIG----GVAVRLVPDDIVIPGGV-NATNGTEARDALR
              130       140           150       160        170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 VRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLT
       :.::   :::.::::::. .:. :.:::.:::.: :. ::::::::::..:.::..: . 
NP_945 VKVAM--SVTLLSGIIQFCLGVCRFGFVAIYLTEPLVRGFTTAAAVHVFTSMLKYLFGVK
         180         190       200       210       220       230   

           240          250       260       270       280       290
pF1KB6 VPSHTDPVSIFKVLYS---VFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPI
       .  ..   .::.:.::   :...... :. .: ..:.:. ..   ::.:.:::.:::.::
NP_945 TKRYS---GIFSVVYSTVAVLQNVKNLNVCSLGVGLMVFGLLLGGKEFNERFKEKLPAPI
              240       250       260       270       280       290

              300       310       320       330       340       350
pF1KB6 PIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVA
       :.::. .:...:.: : ..:. ..: ::: .  :. :: .::.  :. .  : ..::.:.
NP_945 PLEFFAVVMGTGISAGFNLKESYNVDVVGTLPLGLLPPANPDTSLFHLVYVDAIAIAIVG
              300       310       320       330       340       350

              360       370       380       390       400       410
pF1KB6 FAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKT
       :.:..:.:.. . :. : .::::::::::: : . ..:. :. : .:::: :::.:::::
NP_945 FSVTISMAKTLANKHGYQVDGNQELIALGLCNSIGSLFQTFSISCSLSRSLVQEGTGGKT
              360       370       380       390       400       410

              420       430       440       450       460       470
pF1KB6 QIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCL
       :.:: ......:.:.:: :::.  : ..::.:... :::::.:::...  .:: .: .  
NP_945 QLAGCLASLMILLVILATGFLFESLPQAVLSAIVIVNLKGMFMQFSDLPFFWRTSKIELT
              420       430       440       450       460       470

              480       490       500       510       520       530
pF1KB6 IWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMY
       ::. ::. .. :::  :: ..: . :::...::: :. ..:... .:..: .   : .. 
NP_945 IWLTTFVSSLFLGLDYGLITAVIIALLTVIYRTQSPSYKVLGKLPETDVYIDIDAYEEVK
              480       490       500       510       520       530

              540       550       560       570       580          
pF1KB6 EPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRK-LQKQGLLQV
       :  :.:::.  .:::.::  ..   :   .: .:  :.  : ::.::  : . . .. ..
NP_945 EIPGIKIFQINAPIYYANSDLYSNALKRKTGVNPAVIMGARRKAMRKYAKEVGNANMANA
              540       550       560       570       580       590

     590       600       610       620       630       640         
pF1KB6 TPKGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSL
       :       ::    .  : ......     :..:   :  . .  .:     :  ..:..
NP_945 TVVKADAEVDGEDATKPEEEDGEVKYPPIVIKST---FPEEMQRFMP-----PGDNVHTV
              600       610       620          630            640  

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB6 ILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIF
       ::::. :.:.:  .:. : .:..:.  . . ::..: . . .. :.: .::.. .   ..
NP_945 ILDFTQVNFIDSVGVKTLAGIVKEYGDVGIYVYLAGCSAQVVNDLTRNRFFENPALWELL
            650       660       670       680       690       700  

     710       720       730         740       750       760    
pF1KB6 FLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFN--PSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
       : .::::::   ...  . .. .  ::::                            
NP_945 FHSIHDAVLGSQLREALAEQEASAPPSQEDLEPNATPATPEA               
            710       720       730       740                   

>>XP_011514472 (OMIM: 604943,613865) PREDICTED: prestin   (744 aa)
 initn: 1746 init1: 1117 opt: 1763  Z-score: 2114.8  bits: 402.0 E(85289): 4.7e-111
Smith-Waterman score: 1763; 39.2% identity (71.6% similar) in 735 aa overlap (8-736:15-731)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRI
                     .: : ::..:  ...:  .   .   .. :.::   .:.:.: . :
XP_011 MDHAEENEILAATQRYYVERPIFSHPVLQERLHTKDKVPDSIADKLKQAFTCTPKKIRNI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 VLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPA
       .  ..::..:::::..::..:.:.:::::::.. . ::::::.:. .::..:::.::.:.
XP_011 IYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVPPIFGLYSSFYPV
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 IIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDER
       :.: :.:::::::.::: ..:.:.:    :.. . :::  .   :. : .:..   :  :
XP_011 IMYCFLGTSRHISIGPFAVISLMIG----GVAVRLVPDDIVIPGGV-NATNGTEARDALR
              130       140           150       160        170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 VRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLT
       :.::   :::.::::::. .:. :.:::.:::.: :. ::::::::::..:.::..: . 
XP_011 VKVAM--SVTLLSGIIQFCLGVCRFGFVAIYLTEPLVRGFTTAAAVHVFTSMLKYLFGVK
         180         190       200       210       220       230   

           240          250       260       270       280       290
pF1KB6 VPSHTDPVSIFKVLYS---VFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPI
       .  ..   .::.:.::   :...... :. .: ..:.:. ..   ::.:.:::.:::.::
XP_011 TKRYS---GIFSVVYSTVAVLQNVKNLNVCSLGVGLMVFGLLLGGKEFNERFKEKLPAPI
              240       250       260       270       280       290

              300       310       320       330       340       350
pF1KB6 PIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVA
       :.::. .:...:.: : ..:. ..: ::: .  :. :: .::.  :. .  : ..::.:.
XP_011 PLEFFAVVMGTGISAGFNLKESYNVDVVGTLPLGLLPPANPDTSLFHLVYVDAIAIAIVG
              300       310       320       330       340       350

              360       370       380       390       400       410
pF1KB6 FAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKT
       :.:..:.:.. . :. : .::::::::::: : . ..:. :. : .:::: :::.:::::
XP_011 FSVTISMAKTLANKHGYQVDGNQELIALGLCNSIGSLFQTFSISCSLSRSLVQEGTGGKT
              360       370       380       390       400       410

              420       430       440       450       460       470
pF1KB6 QIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCL
       :.:: ......:.:.:: :::.  : ..::.:... :::::.:::...  .:: .: .  
XP_011 QLAGCLASLMILLVILATGFLFESLPQAVLSAIVIVNLKGMFMQFSDLPFFWRTSKIELT
              420       430       440       450       460       470

              480       490       500       510       520       530
pF1KB6 IWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMY
       ::. ::. .. :::  :: ..: . :::...::: :. ..:... .:..: .   : .. 
XP_011 IWLTTFVSSLFLGLDYGLITAVIIALLTVIYRTQSPSYKVLGKLPETDVYIDIDAYEEVK
              480       490       500       510       520       530

              540       550       560       570       580          
pF1KB6 EPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRK-LQKQGLLQV
       :  :.:::.  .:::.::  ..   :   .: .:  :.  : ::.::  : . . .. ..
XP_011 EIPGIKIFQINAPIYYANSDLYSNALKRKTGVNPAVIMGARRKAMRKYAKEVGNANMANA
              540       550       560       570       580       590

     590       600       610       620       630       640         
pF1KB6 TPKGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSL
       :       ::    .  : ......     :..:   :  . .  .:     :  ..:..
XP_011 TVVKADAEVDGEDATKPEEEDGEVKYPPIVIKST---FPEEMQRFMP-----PGDNVHTV
              600       610       620          630            640  

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB6 ILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIF
       ::::. :.:.:  .:. : .:..:.  . . ::..: . . .. :.: .::.. .   ..
XP_011 ILDFTQVNFIDSVGVKTLAGIVKEYGDVGIYVYLAGCSAQVVNDLTRNRFFENPALWELL
            650       660       670       680       690       700  

     710       720       730         740       750       760    
pF1KB6 FLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFN--PSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
       : .::::::   ...  . .. .  ::::                            
XP_011 FHSIHDAVLGSQLREALAEQEASAPPSQEDLEPNATPATPEA               
            710       720       730       740                   

>>NP_996766 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform b [Hom  (685 aa)
 initn: 1584 init1: 1117 opt: 1690  Z-score: 2027.7  bits: 385.8 E(85289): 3.3e-106
Smith-Waterman score: 1690; 39.9% identity (72.0% similar) in 690 aa overlap (8-693:15-685)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRI
                     .: : ::..:  ...:  .   .   .. :.::   .:.:.: . :
NP_996 MDHAEENEILAATQRYYVERPIFSHPVLQERLHTKDKVPDSIADKLKQAFTCTPKKIRNI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 VLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPA
       .  ..::..:::::..::..:.:.:::::::.. . ::::::.:. .::..:::.::.:.
NP_996 IYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVPPIFGLYSSFYPV
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 IIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDER
       :.: :.:::::::.::: ..:.:.:    :.. . :::  .   :. : .:..   :  :
NP_996 IMYCFLGTSRHISIGPFAVISLMIG----GVAVRLVPDDIVIPGGV-NATNGTEARDALR
              130       140           150       160        170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 VRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLT
       :.::   :::.::::::. .:. :.:::.:::.: :. ::::::::::..:.::..: . 
NP_996 VKVAM--SVTLLSGIIQFCLGVCRFGFVAIYLTEPLVRGFTTAAAVHVFTSMLKYLFGVK
         180         190       200       210       220       230   

           240          250       260       270       280       290
pF1KB6 VPSHTDPVSIFKVLYS---VFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPI
       .  ..   .::.:.::   :...... :. .: ..:.:. ..   ::.:.:::.:::.::
NP_996 TKRYS---GIFSVVYSTVAVLQNVKNLNVCSLGVGLMVFGLLLGGKEFNERFKEKLPAPI
              240       250       260       270       280       290

              300       310       320       330       340       350
pF1KB6 PIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVA
       :.::. .:...:.: : ..:. ..: ::: .  :. :: .::.  :. .  : ..::.:.
NP_996 PLEFFAVVMGTGISAGFNLKESYNVDVVGTLPLGLLPPANPDTSLFHLVYVDAIAIAIVG
              300       310       320       330       340       350

              360       370       380       390       400       410
pF1KB6 FAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKT
       :.:..:.:.. . :. : .::::::::::: : . ..:. :. : .:::: :::.:::::
NP_996 FSVTISMAKTLANKHGYQVDGNQELIALGLCNSIGSLFQTFSISCSLSRSLVQEGTGGKT
              360       370       380       390       400       410

              420       430       440       450       460       470
pF1KB6 QIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCL
       :.:: ......:.:.:: :::.  : ..::.:... :::::.:::...  .:: .: .  
NP_996 QLAGCLASLMILLVILATGFLFESLPQAVLSAIVIVNLKGMFMQFSDLPFFWRTSKIELT
              420       430       440       450       460       470

              480       490       500       510       520       530
pF1KB6 IWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMY
       ::. ::. .. :::  :: ..: . :::...::: :. ..:... .:..: .   : .. 
NP_996 IWLTTFVSSLFLGLDYGLITAVIIALLTVIYRTQSPSYKVLGKLPETDVYIDIDAYEEVK
              480       490       500       510       520       530

              540       550       560       570       580          
pF1KB6 EPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRK-LQKQGLLQV
       :  :.:::.  .:::.::  ..   :   .: .:  :.  : ::.::  : . . .. ..
NP_996 EIPGIKIFQINAPIYYANSDLYSNALKRKTGVNPAVIMGARRKAMRKYAKEVGNANMANA
              540       550       560       570       580       590

     590       600       610       620       630       640         
pF1KB6 TPKGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKISLHSL
       :       ::    .  : ......     :..:   :  . .  .:     :  ..:..
NP_996 TVVKADAEVDGEDATKPEEEDGEVKYPPIVIKST---FPEEMQRFMP-----PGDNVHTV
              600       610       620          630            640  

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB6 ILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLNRYEFFDGEVKSSIF
       ::::. :.:.:  .:. : .:..:.  . . ::..: .  ::..                
NP_996 ILDFTQVNFIDSVGVKTLAGIVKEYGDVGIYVYLAGCSA-FIQR                
            650       660       670       680                      

     710       720       730       740       750       760    
pF1KB6 FLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF

>>NP_996767 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform c [Hom  (516 aa)
 initn: 1437 init1: 970 opt: 1459  Z-score: 1751.9  bits: 334.3 E(85289): 7.6e-91
Smith-Waterman score: 1459; 44.8% identity (77.2% similar) in 500 aa overlap (8-504:15-504)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRI
                     .: : ::..:  ...:  .   .   .. :.::   .:.:.: . :
NP_996 MDHAEENEILAATQRYYVERPIFSHPVLQERLHTKDKVPDSIADKLKQAFTCTPKKIRNI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 VLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPA
       .  ..::..:::::..::..:.:.:::::::.. . ::::::.:. .::..:::.::.:.
NP_996 IYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVPPIFGLYSSFYPV
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 IIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDDER
       :.: :.:::::::.::: ..:.:.:    :.. . :::  .   :. : .:..   :  :
NP_996 IMYCFLGTSRHISIGPFAVISLMIG----GVAVRLVPDDIVIPGGV-NATNGTEARDALR
              130       140           150       160        170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 VRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLT
       :.::   :::.::::::. .:. :.:::.:::.: :. ::::::::::..:.::..: . 
NP_996 VKVA--MSVTLLSGIIQFCLGVCRFGFVAIYLTEPLVRGFTTAAAVHVFTSMLKYLFGVK
           180       190       200       210       220       230   

           240          250       260       270       280       290
pF1KB6 VPSHTDPVSIFKVLYS---VFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPI
       .  ..   .::.:.::   :...... :. .: ..:.:. ..   ::.:.:::.:::.::
NP_996 TKRYS---GIFSVVYSTVAVLQNVKNLNVCSLGVGLMVFGLLLGGKEFNERFKEKLPAPI
              240       250       260       270       280       290

              300       310       320       330       340       350
pF1KB6 PIEFIMTVIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVA
       :.::. .:...:.: : ..:. ..: ::: .  :. :: .::.  :. .  : ..::.:.
NP_996 PLEFFAVVMGTGISAGFNLKESYNVDVVGTLPLGLLPPANPDTSLFHLVYVDAIAIAIVG
              300       310       320       330       340       350

              360       370       380       390       400       410
pF1KB6 FAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKT
       :.:..:.:.. . :. : .::::::::::: : . ..:. :. : .:::: :::.:::::
NP_996 FSVTISMAKTLANKHGYQVDGNQELIALGLCNSIGSLFQTFSISCSLSRSLVQEGTGGKT
              360       370       380       390       400       410

              420       430       440       450       460       470
pF1KB6 QIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCL
       :.:: ......:.:.:: :::.  : ..::.:... :::::.:::...  .:: .: .  
NP_996 QLAGCLASLMILLVILATGFLFESLPQAVLSAIVIVNLKGMFMQFSDLPFFWRTSKIELT
              420       430       440       450       460       470

              480       490       500       510       520       530
pF1KB6 IWIMTFIFTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMY
       ::. ::. .. :::  :: ..: . :::...:::                          
NP_996 IWLTTFVSSLFLGLDYGLITAVIIALLTVIYRTQSFHTEMTRRWRP              
              480       490       500       510                    

              540       550       560       570       580       590
pF1KB6 EPEGVKIFRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRKLQKQGLLQVT

>>NP_443166 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 memb  (791 aa)
 initn: 1450 init1: 1020 opt: 1393  Z-score: 1670.0  bits: 319.8 E(85289): 2.8e-86
Smith-Waterman score: 1496; 34.5% identity (68.5% similar) in 737 aa overlap (8-718:7-735)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRIVLSLFPI
              .:.: : .:: . :... .:  : . .  ..:.    ::  : : .:..:.:.
NP_443  MSQPRPRYVVDRAAYSLTLFDDEFEKKDRTYPVG-EKLRNAFRCSSAKIKAVVFGLLPV
                10        20        30         40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPAIIYLFFG
        :::: :..:.... :...:.: : . : ::.:::::...: : :::.:::: . :.:.:
NP_443 LSWLPKYKIKDYIIPDLLGGLSGGSIQVPQGMAFALLANLPAVNGLYSSFFPLLTYFFLG
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170          
pF1KB6 TSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDD---ERVRVA
         ...  : : ..:..::    .   . .:.   . . . ::..: : .:    :  :. 
NP_443 GVHQMVPGTFAVISILVG----NICLQLAPE---SKFQVFNNATNESYVDTAAMEAERLH
      120       130           140          150       160       170 

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 AAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLTVPSH
       ..:... :..:::...:....:::.::::::.: :: :::....:.: ::.:: ::.::.
NP_443 VSATLACLTAIIQMGLGFMQFGFVAIYLSESFIRGFMTAAGLQILISVLKYIFGLTIPSY
             180       190       200       210       220       230 

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 TDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPIPIEFIMT
       : : ::  .. .. ... .::::.:. :::    . .:::.: :.  :.  ::: :.:..
NP_443 TGPGSIVFTFIDICKNLPHTNIASLIFALISGAFLVLVKELNARYMHKIRFPIPTEMIVV
             240       250       260       270       280       290 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 VIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVAFAVAFSV
       :.:...: :: . ..... .::... ::  :..: :  ... .:  :..:.:.... ...
NP_443 VVATAISGGCKMPKKYHMQIVGEIQRGFPTPVSPVVSQWKDMIGTAFSLAIVSYVINLAM
             300       310       320       330       340       350 

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB6 ASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKTQIAGLIG
       . . . :. : .:.:::.:::: .:.  . :.  .   ::: . . ...:::.:.:.:  
NP_443 GRTLANKHGYDVDSNQEMIALGCSNFFGSFFKIHVICCALSVTLAVDGAGGKSQVASLCV
             360       370       380       390       400       410 

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB6 AIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCLIWIMTFI
       ...:.:..:..:. : :: ::::.::   :::. : :...   ::::.: :: ::...:.
NP_443 SLVVMITMLVLGIYLYPLPKSVLGALIAVNLKNSLKQLTDPYYLWRKSKLDCCIWVVSFL
             420       430       440       450       460       470 

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB6 FTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMYEPEGVKI
        .. :.:  :.:..:::..:..::.::: .  .::..  :.:: : : :    . .:.::
NP_443 SSFFLSLPYGVAVGVAFSVLVVVFQTQFRNGYALAQVMDTDIYVNPKTYNRAQDIQGIKI
             480       490       500       510       520       530 

       540       550       560       570       580             590 
pF1KB6 FRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRK------LQKQGLLQVTP
       .   ::.::::  .::.:.:  .:..: ..:  ..: :.: .:       :...:.. : 
NP_443 ITYCSPLYFANSEIFRQKVIAKTGMDPQKVLLAKQKYLKKQEKRRMRPTQQRRSLFMKTK
             540       550       560       570       580       590 

             600       610       620       630           640       
pF1KB6 KGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWND----DLPLNIEVPK----
          .  ..   ..    : :. ..  .  ... . :  : ..    . : . :.:     
NP_443 TVSLQELQQDFENAPPTDPNNNQTPANGTSVSYITFSPDSSSPAQSEPPASAEAPGEPSD
             600       610       620       630       640       650 

                   650       660       670       680       690     
pF1KB6 --------ISLHSLILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLN
               ...:.::::.:.:::.:. ....: .. . . .: : :..:.   .  . ..
NP_443 MLASVPPFVTFHTLILDMSGVSFVDLMGIKALAKLSSTYGKIGVKVFLVNIHAQVYNDIS
             660       670       680       690       700       710 

         700        710       720       730       740       750    
pF1KB6 RYEFF-DGEVKSSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNR
       .   : :: .. .  : .::::::                                    
NP_443 HGGVFEDGSLECKHVFPSIHDAVLFAQANARDVTPGHNFQGAPGDAELSLYDSEEDIRSY
             720       730       740       750       760       770 

>>NP_599152 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 memb  (887 aa)
 initn: 1450 init1: 1020 opt: 1393  Z-score: 1669.2  bits: 319.8 E(85289): 3.1e-86
Smith-Waterman score: 1496; 34.5% identity (68.5% similar) in 737 aa overlap (8-718:7-735)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQKAKRIVLSLFPI
              .:.: : .:: . :... .:  : . .  ..:.    ::  : : .:..:.:.
NP_599  MSQPRPRYVVDRAAYSLTLFDDEFEKKDRTYPVG-EKLRNAFRCSSAKIKAVVFGLLPV
                10        20        30         40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYASFFPAIIYLFFG
        :::: :..:.... :...:.: : . : ::.:::::...: : :::.:::: . :.:.:
NP_599 LSWLPKYKIKDYIIPDLLGGLSGGSIQVPQGMAFALLANLPAVNGLYSSFFPLLTYFFLG
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170          
pF1KB6 TSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLLDD---ERVRVA
         ...  : : ..:..::    .   . .:.   . . . ::..: : .:    :  :. 
NP_599 GVHQMVPGTFAVISILVG----NICLQLAPE---SKFQVFNNATNESYVDTAAMEAERLH
      120       130           140          150       160       170 

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 AAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQLKFIFQLTVPSH
       ..:... :..:::...:....:::.::::::.: :: :::....:.: ::.:: ::.::.
NP_599 VSATLACLTAIIQMGLGFMQFGFVAIYLSESFIRGFMTAAGLQILISVLKYIFGLTIPSY
             180       190       200       210       220       230 

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 TDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKLPVPIPIEFIMT
       : : ::  .. .. ... .::::.:. :::    . .:::.: :.  :.  ::: :.:..
NP_599 TGPGSIVFTFIDICKNLPHTNIASLIFALISGAFLVLVKELNARYMHKIRFPIPTEMIVV
             240       250       260       270       280       290 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 VIAAGVSYGCDFKNRFKVAVVGDMNPGFQPPITPDVETFQNTVGDCFGIAMVAFAVAFSV
       :.:...: :: . ..... .::... ::  :..: :  ... .:  :..:.:.... ...
NP_599 VVATAISGGCKMPKKYHMQIVGEIQRGFPTPVSPVVSQWKDMIGTAFSLAIVSYVINLAM
             300       310       320       330       340       350 

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB6 ASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQESTGGKTQIAGLIG
       . . . :. : .:.:::.:::: .:.  . :.  .   ::: . . ...:::.:.:.:  
NP_599 GRTLANKHGYDVDSNQEMIALGCSNFFGSFFKIHVICCALSVTLAVDGAGGKSQVASLCV
             360       370       380       390       400       410 

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB6 AIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDKYDCLIWIMTFI
       ...:.:..:..:. : :: ::::.::   :::. : :...   ::::.: :: ::...:.
NP_599 SLVVMITMLVLGIYLYPLPKSVLGALIAVNLKNSLKQLTDPYYLWRKSKLDCCIWVVSFL
             420       430       440       450       460       470 

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB6 FTIVLGLGLGLAASVAFQLLTIVFRTQFPKCSTLANIGRTNIYKNKKDYYDMYEPEGVKI
        .. :.:  :.:..:::..:..::.::: .  .::..  :.:: : : :    . .:.::
NP_599 SSFFLSLPYGVAVGVAFSVLVVVFQTQFRNGYALAQVMDTDIYVNPKTYNRAQDIQGIKI
             480       490       500       510       520       530 

       540       550       560       570       580             590 
pF1KB6 FRCPSPIYFANIGFFRRKLIDAVGFSPLRILRKRNKALRKIRK------LQKQGLLQVTP
       .   ::.::::  .::.:.:  .:..: ..:  ..: :.: .:       :...:.. : 
NP_599 ITYCSPLYFANSEIFRQKVIAKTGMDPQKVLLAKQKYLKKQEKRRMRPTQQRRSLFMKTK
             540       550       560       570       580       590 

             600       610       620       630           640       
pF1KB6 KGFICTVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWND----DLPLNIEVPK----
          .  ..   ..    : :. ..  .  ... . :  : ..    . : . :.:     
NP_599 TVSLQELQQDFENAPPTDPNNNQTPANGTSVSYITFSPDSSSPAQSEPPASAEAPGEPSD
             600       610       620       630       640       650 

                   650       660       670       680       690     
pF1KB6 --------ISLHSLILDFSAVSFLDVSSVRGLKSILQEFIRIKVDVYIVGTDDDFIEKLN
               ...:.::::.:.:::.:. ....: .. . . .: : :..:.   .  . ..
NP_599 MLASVPPFVTFHTLILDMSGVSFVDLMGIKALAKLSSTYGKIGVKVFLVNIHAQVYNDIS
             660       670       680       690       700       710 

         700        710       720       730       740       750    
pF1KB6 RYEFF-DGEVKSSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNR
       .   : :: .. .  : .::::::                                    
NP_599 HGGVFEDGSLECKHVFPSIHDAVLFAQANARDVTPGHNFQGAPGDAELSLYDSEEDIRSY
             720       730       740       750       760       770 




764 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 08:20:18 2016 done: Sat Nov  5 08:20:19 2016
 Total Scan time:  9.800 Total Display time:  0.200

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com