Result of SIM4 for pF1KB5768

seq1 = pF1KB5768.tfa, 2280 bp
seq2 = pF1KB5768/gi568815596r_162070982.tfa (gi568815596r:162070982_162342994), 272013 bp

>pF1KB5768 2280
>gi568815596r:162070982_162342994 (Chr2)

(complement)

1-91  (99997-100087)   98% ->
92-190  (116374-116472)   100% ->
191-285  (117418-117512)   100% ->
286-360  (118455-118529)   100% ->
361-413  (119335-119387)   100% ->
414-486  (123070-123142)   100% ->
487-607  (123812-123932)   100% ->
608-762  (124855-125009)   100% ->
763-866  (126994-127097)   100% ->
867-1002  (128922-129057)   100% ->
1003-1047  (132999-133043)   100% ->
1048-1152  (139850-139954)   100% ->
1153-1223  (140053-140123)   100% ->
1224-1277  (142376-142429)   100% ->
1278-1402  (144114-144238)   100% ->
1403-1450  (148247-148294)   100% ->
1451-1549  (153241-153339)   100% ->
1550-1619  (153823-153892)   100% ->
1620-1814  (154632-154826)   100% ->
1815-1869  (159527-159581)   100% ->
1870-1969  (168029-168128)   100% ->
1970-2034  (169208-169272)   100% ->
2035-2107  (169774-169846)   100% ->
2108-2181  (170111-170184)   100% ->
2182-2280  (171915-172013)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGACTTGGGTAAAAATCGTATTTGGAGTTGCCACCTCTGCTGTGCT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 ATGTAGACTTGGGTAAAAATCGTATTTGGAGTTGCCACCTCTGCTGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCTTATTGGTGATGTGCATTGTCTTACGCCCTTCAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100047 TGCCTTATTGGTGATGTGCATTGTCTTACGCCCTTCAAGAGGTA...AAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCATAACTCTGAAGAAAATACAATGAGAGCACTCACACTGAAGGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116374 TTCATAACTCTGAAGAAAATACAATGAGAGCACTCACACTGAAGGATATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTAAATGGAACATTTTCTTATAAAACATTTTTTCCAAACTGGATTTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116424 TTAAATGGAACATTTTCTTATAAAACATTTTTTCCAAACTGGATTTCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         GACAAGAATATCTTCATCAATCTGCAGATAACAATATAGTAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116474 TA...AAGGACAAGAATATCTTCATCAATCTGCAGATAACAATATAGTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTTATAATATTGAAACAGGACAATCATATACCATTTTGAGTAATAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117460 TTTATAATATTGAAACAGGACAATCATATACCATTTTGAGTAATAGAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATG         AAAAGTGTGAATGCTTCAAATTACGGCTTATCACCTGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117510 ATGGTA...CAGAAAAGTGTGAATGCTTCAAATTACGGCTTATCACCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGGCAATTTGTATATCTAGAAAGTGATTATTCAAAG         CTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118493 TCGGCAATTTGTATATCTAGAAAGTGATTATTCAAAGGTA...CAGCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GGAGATACTCTTACACAGCAACATATTACATCTATGACCTTAGCAATGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 119339 GGAGATACTCTTACACAGCAACATATTACATCTATGACCTTAGCAATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414         AGAATTTGTAAGAGGAAATGAGCTTCCTCGTCCAATTCAGTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119389 TA...TAGAGAATTTGTAAGAGGAAATGAGCTTCCTCGTCCAATTCAGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TTTATGCTGGTCGCCTGTTGGGAGTAAATTA         GCATATGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 123112 TTTATGCTGGTCGCCTGTTGGGAGTAAATTAGTA...TAGGCATATGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 ATCAAAACAATATCTATTTGAAACAAAGACCAGGAGATCCACCTTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123822 ATCAAAACAATATCTATTTGAAACAAAGACCAGGAGATCCACCTTTTCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ATAACATTTAATGGAAGAGAAAATAAAATATTTAATGGAATCCCAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123872 ATAACATTTAATGGAAGAGAAAATAAAATATTTAATGGAATCCCAGACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGTTTATGAAG         AGGAAATGCTTGCTACAAAATATGCTCTCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 123922 GGTTTATGAAGGTA...CAGAGGAAATGCTTGCTACAAAATATGCTCTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GGTGGTCTCCTAATGGAAAATTTTTGGCATATGCGGAATTTAATGATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124885 GGTGGTCTCCTAATGGAAAATTTTTGGCATATGCGGAATTTAATGATACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GATATACCAGTTATTGCCTATTCCTATTATGGCGATGAACAATATCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124935 GATATACCAGTTATTGCCTATTCCTATTATGGCGATGAACAATATCCTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AACAATAAATATTCCATACCCAAAG         GCTGGAGCTAAGAATC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124985 AACAATAAATATTCCATACCCAAAGGTA...CAGGCTGGAGCTAAGAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCGTTGTTCGGATATTTATTATCGATACCACTTACCCTGCGTATGTAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127010 CCGTTGTTCGGATATTTATTATCGATACCACTTACCCTGCGTATGTAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCCCAGGAAGTGCCTGTTCCAGCAATGATAGCCTCAAG         TGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 127060 CCCCAGGAAGTGCCTGTTCCAGCAATGATAGCCTCAAGGTA...CAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TTATTATTTCAGTTGGCTCACGTGGGTTACTGATGAACGAGTATGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128925 TTATTATTTCAGTTGGCTCACGTGGGTTACTGATGAACGAGTATGTTTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGTGGCTAAAAAGAGTCCAGAATGTTTCGGTCCTGTCTATATGTGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128975 AGTGGCTAAAAAGAGTCCAGAATGTTTCGGTCCTGTCTATATGTGACTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AGGGAAGACTGGCAGACATGGGATTGTCCAAAG         ACCCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129025 AGGGAAGACTGGCAGACATGGGATTGTCCAAAGGTA...TAGACCCAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCATATAGAAGAAAGCAGAACTGGATGGGCTGGTGGA         TTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 133007 GCATATAGAAGAAAGCAGAACTGGATGGGCTGGTGGAGTA...CAGTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TTGTTTCAACACCAGTTTTCAGCTATGATGCCATTTCGTACTACAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139854 TTGTTTCAACACCAGTTTTCAGCTATGATGCCATTTCGTACTACAAAATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TTTAGTGACAAGGATGGCTACAAACATATTCACTATATCAAAGACACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139904 TTTAGTGACAAGGATGGCTACAAACATATTCACTATATCAAAGACACTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 G         GAAAATGCTATTCAAATTACAAGTGGCAAGTGGGAGGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139954 GGTA...TAGGAAAATGCTATTCAAATTACAAGTGGCAAGTGGGAGGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TAAATATATTCAGAGTAACACAGGATTCACT         GTTTTATTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 140093 TAAATATATTCAGAGTAACACAGGATTCACTGTA...CAGGTTTTATTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 AGCAATGAATTTGAAGAATACCCTGGAAGAAGAAACATCTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 142386 AGCAATGAATTTGAAGAATACCCTGGAAGAAGAAACATCTACAGGTA...

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1278    AATTAGCATTGGAAGCTATCCTCCAAGCAAGAAGTGTGTTACTTGCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144111 TAGAATTAGCATTGGAAGCTATCCTCCAAGCAAGAAGTGTGTTACTTGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 ATCTAAGGAAAGAAAGGTGCCAATATTACACAGCAAGTTTCAGCGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144161 ATCTAAGGAAAGAAAGGTGCCAATATTACACAGCAAGTTTCAGCGACTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GCCAAGTACTATGCACTTGTCTGCTACG         GCCCAGGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 144211 GCCAAGTACTATGCACTTGTCTGCTACGGTA...CAGGCCCAGGCATCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CATTTCCACCCTTCATGATGGACGCACTGATCAAG         AAATTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 148260 CATTTCCACCCTTCATGATGGACGCACTGATCAAGGTA...CAGAAATTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 AAATCCTGGAAGAAAACAAGGAATTGGAAAATGCTTTGAAAAATATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153247 AAATCCTGGAAGAAAACAAGGAATTGGAAAATGCTTTGAAAAATATCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 CTGCCTAAAGAGGAAATTAAGAAACTTGAAGTAGATGAAATTA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 153297 CTGCCTAAAGAGGAAATTAAGAAACTTGAAGTAGATGAAATTAGTA...A

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1550   CTTTATGGTACAAGATGATTCTTCCTCCTCAATTTGACAGATCAAAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153821 AGCTTTATGGTACAAGATGATTCTTCCTCCTCAATTTGACAGATCAAAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 AGTATCCCTTGCTAATTCAAGT         GTATGGTGGTCCCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 153871 AGTATCCCTTGCTAATTCAAGTGTA...TAGGTATGGTGGTCCCTGCAGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 CAGAGTGTAAGGTCTGTATTTGCTGTTAATTGGATATCTTATCTTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154651 CAGAGTGTAAGGTCTGTATTTGCTGTTAATTGGATATCTTATCTTGCAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 TAAGGAAGGGATGGTCATTGCCTTGGTGGATGGTCGAGGAACAGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154701 TAAGGAAGGGATGGTCATTGCCTTGGTGGATGGTCGAGGAACAGCTTTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 AAGGTGACAAACTCCTCTATGCAGTGTATCGAAAGCTGGGTGTTTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154751 AAGGTGACAAACTCCTCTATGCAGTGTATCGAAAGCTGGGTGTTTATGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GTTGAAGACCAGATTACAGCTGTCAG         AAAATTCATAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 154801 GTTGAAGACCAGATTACAGCTGTCAGGTG...TAGAAAATTCATAGAAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 GGGTTTCATTGATGAAAAAAGAATAGCCATATGGGGCTGG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 159542 GGGTTTCATTGATGAAAAAAGAATAGCCATATGGGGCTGGGTG...CAGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1871 CCTATGGAGGATACGTTTCATCACTGGCCCTTGCATCTGGAACTGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168030 CCTATGGAGGATACGTTTCATCACTGGCCCTTGCATCTGGAACTGGTCTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921 TTCAAATGTGGTATAGCAGTGGCTCCAGTCTCCAGCTGGGAATATTACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 168080 TTCAAATGTGGTATAGCAGTGGCTCCAGTCTCCAGCTGGGAATATTACGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970         CGTCTGTCTACACAGAGAGATTCATGGGTCTCCCAACAAAGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168130 TA...TAGCGTCTGTCTACACAGAGAGATTCATGGGTCTCCCAACAAAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2012 ATGATAATCTTGAGCACTATAAG         AATTCAACTGTGATGGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 169250 ATGATAATCTTGAGCACTATAAGGTA...CAGAATTCAACTGTGATGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2053 AGAGCAGAATATTTCAGAAATGTAGACTATCTTCTCATCCACGGAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169792 AGAGCAGAATATTTCAGAAATGTAGACTATCTTCTCATCCACGGAACAGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2103 AGATG         ATAATGTGCACTTTCAAAACTCAGCACAGATTGCTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169842 AGATGGTG...CAGATAATGTGCACTTTCAAAACTCAGCACAGATTGCTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2144 AAGCTCTGGTTAATGCACAAGTGGATTTCCAGGCAATG         TGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 170147 AAGCTCTGGTTAATGCACAAGTGGATTTCCAGGCAATGGTA...CAGTGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2185 TACTCTGACCAGAACCACGGCTTATCCGGCCTGTCCACGAACCACTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171918 TACTCTGACCAGAACCACGGCTTATCCGGCCTGTCCACGAACCACTTATA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2235 CACCCACATGACCCACTTCCTAAAGCAGTGTTTCTCTTTGTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171968 CACCCACATGACCCACTTCCTAAAGCAGTGTTTCTCTTTGTCAGAC

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