Result of SIM4 for pF1KE1051

seq1 = pF1KE1051.tfa, 1335 bp
seq2 = pF1KE1051/gi568815587r_61773817.tfa (gi568815587r:61773817_61991381), 217565 bp

>pF1KE1051 1335
>gi568815587r:61773817_61991381 (Chr11)

(complement)

1-213  (100001-100213)   99% ->
214-324  (111231-111341)   100% ->
325-522  (111873-112070)   100% ->
523-624  (112535-112636)   100% ->
625-747  (112748-112870)   100% ->
748-808  (113167-113227)   100% ->
809-885  (113795-113871)   100% ->
886-983  (114419-114516)   100% ->
984-1080  (114927-115023)   100% ->
1081-1160  (115192-115271)   100% ->
1161-1286  (115406-115531)   100% ->
1287-1335  (117517-117565)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGGCGTCGGGGAGCCGGGACCGCGGGAGGGACCCGCGCAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGGCGTCGGGGAGCCGGGACCGCGGGAGGGACCCGCGCAGCCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCACCGCTGCCCACCTTCTGCTGGGAGCAGATCCGCGCGCACGACCAGC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCCGCTGCCCACCTTCTGCTGGGAGCAGATCCGCGCGCACGACCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGCGACAAGTGGCTGGTCATCGAGCGCCGCGTCTACGACATCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGCGACAAGTGGCTGGTCATCGAGCGCCGCGTCTACGACATCAGCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGGCACAGCGGCACCCAGGGGGCAGCCGCCTCATCGGCCACCACGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGGCACAGCGGCACCCAGGGGGCAGCCGCCTCATCGGCCACCACGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGACGCCACG         GATGCCTTCCGTGCCTTCCATCAAGATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGGACGCCACGGTA...CAGGATGCCTTCCGTGCCTTCCATCAAGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAATTTTGTGCGCAAGTTCCTACAGCCCCTGTTGATTGGAGAGCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111259 TCAATTTTGTGCGCAAGTTCCTACAGCCCCTGTTGATTGGAGAGCTGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCGGAAGAACCCAGCCAGGATGGACCCCTGAAT         GCGCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 111309 CCGGAAGAACCCAGCCAGGATGGACCCCTGAATGTG...CAGGCGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTCGAGGACTTCCGAGCCCTGCACCAGGCAGCCGAGGACATGAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111881 GGTCGAGGACTTCCGAGCCCTGCACCAGGCAGCCGAGGACATGAAGCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGATGCCAGTCCCACCTTCTTTGCTTTCCTACTGGGCCACATCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111931 TTGATGCCAGTCCCACCTTCTTTGCTTTCCTACTGGGCCACATCCTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGGAGGTGCTGGCCTGGCTCCTTATCTACCTCCTGGGTCCTGGCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111981 ATGGAGGTGCTGGCCTGGCTCCTTATCTACCTCCTGGGTCCTGGCTGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCCAGTGCCCTGGCCGCCTTCATCCTGGCCATCTCTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112031 GCCCAGTGCCCTGGCCGCCTTCATCCTGGCCATCTCTCAGGTG...CAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCAGTCCTGGTGTCTGCAGCATGACCTGGGCCATGCCTCCATCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112536 CTCAGTCCTGGTGTCTGCAGCATGACCTGGGCCATGCCTCCATCTTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGTCCTGGTGGAACCACGTGGCCCAGAAGTTCGTGATGGGGCAGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112586 AAGTCCTGGTGGAACCACGTGGCCCAGAAGTTCGTGATGGGGCAGCTAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 G         GGCTTCTCCGCCCACTGGTGGAACTTCCGCCACTTCCAGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112636 GGTG...CAGGGCTTCTCCGCCCACTGGTGGAACTTCCGCCACTTCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACCACGCCAAGCCCAACATCTTCCACAAAGACCCAGACGTGACGGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112788 ACCACGCCAAGCCCAACATCTTCCACAAAGACCCAGACGTGACGGTGGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCCGTCTTCCTCCTGGGGGAGTCATCCGTCGAG         TATGGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 112838 CCCGTCTTCCTCCTGGGGGAGTCATCCGTCGAGGTG...CAGTATGGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGAAACGCAGATACCTACCCTACAACCAGCAGCACCTGTACTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113175 GAAGAAACGCAGATACCTACCCTACAACCAGCAGCACCTGTACTTCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGA         TCGGCCCGCCGCTGCTCACCCTGGTGAACTTTGAAGTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113225 TGAGTG...CAGTCGGCCCGCCGCTGCTCACCCTGGTGAACTTTGAAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAAATCTGGCGTACATGCTGGTGTGCATGCAGTGGGCG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113833 GAAAATCTGGCGTACATGCTGGTGTGCATGCAGTGGGCGGTG...CAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TTTGCTCTGGGCCGCCAGCTTCTATGCCCGCTTCTTCTTATCCTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114421 TTTGCTCTGGGCCGCCAGCTTCTATGCCCGCTTCTTCTTATCCTACCTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCTTCTACGGCGTCCCTGGGGTGCTGCTCTTCTTTGTTGCTGTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 114471 CCTTCTACGGCGTCCCTGGGGTGCTGCTCTTCTTTGTTGCTGTCAGGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984      GGTCCTGGAAAGCCACTGGTTCGTGTGGATCACACAGATGAACCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114521 ..CAGGGTCCTGGAAAGCCACTGGTTCGTGTGGATCACACAGATGAACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CATCCCCAAGGAGATCGGCCACGAGAAGCACCGGGACTGGGTCAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114972 CATCCCCAAGGAGATCGGCCACGAGAAGCACCGGGACTGGGTCAGCTCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AG         CTGGCAGCCACCTGCAACGTGGAGCCCTCACTTTTCACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115022 AGGTG...CAGCTGGCAGCCACCTGCAACGTGGAGCCCTCACTTTTCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AACTGGTTCAGCGGGCACCTCAACTTCCAGATCGAGCACCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 115231 AACTGGTTCAGCGGGCACCTCAACTTCCAGATCGAGCACCAGTG...CAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CCTCTTCCCCAGGATGCCGAGACACAACTACAGCCGGGTGGCCCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115406 CCTCTTCCCCAGGATGCCGAGACACAACTACAGCCGGGTGGCCCCGCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCAAGTCGCTGTGTGCCAAGCACGGCCTCAGCTACGAAGTGAAGCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115456 TCAAGTCGCTGTGTGCCAAGCACGGCCTCAGCTACGAAGTGAAGCCCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CTCACCGCGCTGGTGGACATCGTCAG         GTCCCTGAAGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 115506 CTCACCGCGCTGGTGGACATCGTCAGGTG...CAGGTCCCTGAAGAAGTC

   1400     .    :    .    :    .    :
   1302 TGGTGACATCTGGCTGGACGCCTACCTCCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117532 TGGTGACATCTGGCTGGACGCCTACCTCCATCAG

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