Result of FASTA (ccds) for pF1KA1777
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1777, 948 aa
  1>>>pF1KA1777 948 - 948 aa - 948 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9884+/-0.0011; mu= 12.8171+/- 0.066
 mean_var=119.1511+/-23.293, 0's: 0 Z-trim(105.9): 123  B-trim: 2 in 1/53
 Lambda= 0.117497
 statistics sampled from 8569 (8706) to 8569 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.267), width:  16
 Scan time:  2.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS83279.1 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8        ( 948) 6514 1116.4       0
CCDS6093.2 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8         ( 953) 6333 1085.7       0
CCDS58083.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10       ( 934) 3305 572.5 1.4e-162
CCDS7309.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10        ( 945) 2479 432.4 1.9e-120
CCDS3643.1 UNC5C gene_id:8633|Hs108|chr4           ( 931) 1673 295.8 2.6e-79
CCDS34299.1 UNC5A gene_id:90249|Hs108|chr5         ( 842) 1124 202.7 2.5e-51
CCDS4847.1 UNC5CL gene_id:222643|Hs108|chr6        ( 518)  397 79.4 2.1e-14
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1         (5635)  407 81.7 4.5e-14
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6           (1522)  355 72.5 6.9e-12
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1651)  343 70.5   3e-11
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1551)  341 70.2 3.7e-11
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1606)  341 70.2 3.8e-11
CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15         (1170)  337 69.4 4.6e-11
CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6          (1172)  336 69.2 5.2e-11
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1378)  337 69.4 5.3e-11
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1394)  337 69.4 5.4e-11


>>CCDS83279.1 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8             (948 aa)
 initn: 6514 init1: 6514 opt: 6514  Z-score: 5972.2  bits: 1116.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6514; 100.0% identity (100.0% similar) in 948 aa overlap (1-948:1-948)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAYI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 IKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVED
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 FHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPEG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 VPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 TVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSLC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 PVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 LHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGFQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 TFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLSDIKVKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLSDIKVKV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 QSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 GVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGSEVLLSPEVTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGSEVLLSPEVTC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 GPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDESTSCYCLLDPFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDESTSCYCLLDPFA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 CHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 DERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 LHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPAQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 TGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNLW
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940        
pF1KA1 EARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
              910       920       930       940        

>>CCDS6093.2 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8              (953 aa)
 initn: 6333 init1: 6333 opt: 6333  Z-score: 5806.4  bits: 1085.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6333; 100.0% identity (100.0% similar) in 919 aa overlap (30-948:35-953)

                10        20        30        40        50         
pF1KA1  MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAY
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AATAGGGGGARRWLPWLGLCFWAAGTAAARGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAY
           10        20        30        40        50        60    

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 IIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVE
           70        80        90       100       110       120    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 DFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPE
          130       140       150       160       170       180    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 GVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLS
          190       200       210       220       230       240    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 ATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSL
          250       260       270       280       290       300    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 CPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKK
          310       320       330       340       350       360    

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA1 PLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGF
          370       380       390       400       410       420    

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA1 QTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLSDIKVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLSDIKVK
          430       440       450       460       470       480    

     480       490       500       510       520       530         
pF1KA1 VQSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VQSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRT
          490       500       510       520       530       540    

     540       550       560       570       580       590         
pF1KA1 TGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGSEVLLSPEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGSEVLLSPEVT
          550       560       570       580       590       600    

     600       610       620       630       640       650         
pF1KA1 CGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDESTSCYCLLDPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDESTSCYCLLDPF
          610       620       630       640       650       660    

     660       670       680       690       700       710         
pF1KA1 ACHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ACHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVV
          670       680       690       700       710       720    

     720       730       740       750       760       770         
pF1KA1 SDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQ
          730       740       750       760       770       780    

     780       790       800       810       820       830         
pF1KA1 PLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPA
          790       800       810       820       830       840    

     840       850       860       870       880       890         
pF1KA1 QTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNL
          850       860       870       880       890       900    

     900       910       920       930       940        
pF1KA1 WEARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 WEARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
          910       920       930       940       950   

>>CCDS58083.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10            (934 aa)
 initn: 2830 init1: 1644 opt: 3305  Z-score: 3032.5  bits: 572.5 E(32554): 1.4e-162
Smith-Waterman score: 3419; 54.4% identity (78.8% similar) in 910 aa overlap (27-923:24-922)

               10        20        30         40         50        
pF1KA1 MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNG-EALPESIPSAPGT-LPHFIEEPDDA
                                 .. :::.: :.::.:.::::.  ::.:..::.::
CCDS58    MGARSGARGALLLALLLCWDPRLSQAGTDSGSEVLPDSFPSAPAEPLPYFLQEPQDA
                  10        20        30        40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA1 YIIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQV
       ::.:..:. :::.: :: ::.:::::::: ::.::..: :::..::.:::: :.:.::::
CCDS58 YIVKNKPVELRCRAFPATQIYFKCNGEWVSQNDHVTQEGLDEATGLRVREVQIEVSRQQV
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA1 EDFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPP
       :.. : :::::::::::  ::.:::.: ::::::::::.:.: :.:::..  ..:.::::
CCDS58 EELFGLEDYWCQCVAWSSAGTTKSRRAYVRIAYLRKNFDQEPLGKEVPLDHEVLLQCRPP
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 EGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSL
       ::::.:::::::::. ::  :: :.    :::::::::::::..::::.: :::::::: 
CCDS58 EGVPVAEVEWLKNEDVIDPTQDTNFLLTIDHNLIIRQARLSDTANYTCVAKNIVAKRRST
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA1 SATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTS
       .:::.::::::::::.::: :. :::::::::.:::::::::::::::::.. :: .::.
CCDS58 TATVIVYVNGGWSSWAEWSPCSNRCGRGWQKRTRTCTNPAPLNGGAFCEGQAFQKTACTT
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA1 LCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDK
       .:::::.:  ::.::.:: :: : : ::: ::::.:::. : :   .:.:::::::.   
CCDS58 ICPVDGAWTEWSKWSACSTECAHWRSRECMAPPPQNGGRDCSGTLLDSKNCTDGLCM---
       300       310       320       330       340       350       

      360       370       380        390        400       410      
pF1KA1 KPLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAV-VAVAVLV-IGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSA-L
               : .: ..: :::.:: .:. :.::.:. .::..:::.  :. .:. :::: :
CCDS58 --------QMLEASGDAALYAGLVVAIFVVVAILMAVGVVVYRRNCRDFDTDITDSSAAL
                  360       370       380       390       400      

         420       430       440        450        460       470   
pF1KA1 TGGFQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSR-TYSGPI-CLQDPLDKELMTESSLFNPL
       ::::.  ::::.: .:  ::. .. ::::.:   : ::.  :::  ::  ::.: :..::
CCDS58 TGGFHPVNFKTARPSNPQLLHPSVPPDLTASAGIYRGPVYALQDSTDKIPMTNSPLLDPL
        410       420       430       440       450       460      

           480         490       500       510       520       530 
pF1KA1 SDIKVKVQSSFMVSLG--VSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSL
        ..:::: ::  .. :  ... :.  :     :.:    ..   .: :.     :.: .:
CCDS58 PSLKVKVYSSSTTGSGPGLADGADLLGVLPPGTYPSDFARDTHFLHLRSASLGSQQLLGL
        470       480       490       500       510       520      

             540       550       560       570       580        590
pF1KA1 PTRTELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQ-SDGS
       :      ..:.:: ::::: .:.::::::.:.::::. . .:.:. ::..: .:  :.:.
CCDS58 PRDPGSSVSGTFGCLGGRLSIPGTGVSLLVPNGAIPQGKFYEMYLLINKAESTLPLSEGT
        530       540       550       560       570       580      

              600       610       620       630       640          
pF1KA1 EVLLSPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDES-
       ...::: :::::  ...  :  ::.::::.::.. : ..:: ...::.::::.....:. 
CCDS58 QTVLSPSVTCGPTGLLLCRPVILTMPHCAEVSARDWIFQLKTQAHQGHWEEVVTLDEETL
        590       600       610       620       630       640      

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pF1KA1 -TSCYCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCV
        : ::: :.: :::.:::..:::..:::  .  :::.:..:::.   :.::.:.:::::.
CCDS58 NTPCYCQLEPRACHILLDQLGTYVFTGESYSRSAVKRLQLAVFAPALCTSLEYSLRVYCL
        650       660       670       680       690       700      

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pF1KA1 DNTPCAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEV
       ..:: :..::.  ::  :: :.:::: : :: .  .:..:. :.:   :: : ..  ::.
CCDS58 EDTPVALKEVLELERTLGGYLVEEPKPLMFKDSYHNLRLSLHDLPHAHWRSKLLAKYQEI
        710       720       730       740       750       760      

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pF1KA1 PFSRVWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETI-
       :: ..: .... :::.:.:::.. ..:.:.::::.::..:. ::.:..:.. :.   .. 
CCDS58 PFYHIWSGSQKALHCTFTLERHSLASTELTCKICVRQVEGEGQIFQLHTTLAETPAGSLD
        770       780       790       800       810       820      

       830       840       850       860       870       880       
pF1KA1 TFFAQEDSTFPAQTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFA
       :. .   ::  .: :: ::::: ::::.:: ..:.::..:.::.::::: :..: :.:::
CCDS58 TLCSAPGSTVTTQLGPYAFKIPLSIRQKICNSLDAPNSRGNDWRMLAQKLSMDRYLNYFA
        830       840       850       860       870       880      

       890       900       910       920       930       940       
pF1KA1 TQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNG
       :..::..:::.:::: .: ::::.::: ::::.:..                        
CCDS58 TKASPTGVILDLWEALQQDDGDLNSLASALEEMGKSEMLVAVATDGDC            
        890       900       910       920       930                

        
pF1KA1 L

>>CCDS7309.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10             (945 aa)
 initn: 3180 init1: 1721 opt: 2479  Z-score: 2275.7  bits: 432.4 E(32554): 1.9e-120
Smith-Waterman score: 3457; 54.6% identity (79.5% similar) in 910 aa overlap (27-923:24-933)

               10        20        30         40         50        
pF1KA1 MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNG-EALPESIPSAPGT-LPHFIEEPDDA
                                 .. :::.: :.::.:.::::.  ::.:..::.::
CCDS73    MGARSGARGALLLALLLCWDPRLSQAGTDSGSEVLPDSFPSAPAEPLPYFLQEPQDA
                  10        20        30        40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA1 YIIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQV
       ::.:..:. :::.: :: ::.:::::::: ::.::..: :::..::.:::: :.:.::::
CCDS73 YIVKNKPVELRCRAFPATQIYFKCNGEWVSQNDHVTQEGLDEATGLRVREVQIEVSRQQV
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA1 EDFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPP
       :.. : :::::::::::  ::.:::.: ::::::::::.:.: :.:::..  ..:.::::
CCDS73 EELFGLEDYWCQCVAWSSAGTTKSRRAYVRIAYLRKNFDQEPLGKEVPLDHEVLLQCRPP
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 EGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSL
       ::::.:::::::::. ::  :: :.    :::::::::::::..::::.: :::::::: 
CCDS73 EGVPVAEVEWLKNEDVIDPTQDTNFLLTIDHNLIIRQARLSDTANYTCVAKNIVAKRRST
       180       190       200       210       220       230       

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pF1KA1 SATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTS
       .:::.::::::::::.::: :. :::::::::.:::::::::::::::::.. :: .::.
CCDS73 TATVIVYVNGGWSSWAEWSPCSNRCGRGWQKRTRTCTNPAPLNGGAFCEGQAFQKTACTT
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA1 LCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDK
       .:::::.:  ::.::.:: :: : : ::: ::::.:::. : :   .:.:::::::. .:
CCDS73 ICPVDGAWTEWSKWSACSTECAHWRSRECMAPPPQNGGRDCSGTLLDSKNCTDGLCMQNK
       300       310       320       330       340       350       

      360       370       380        390        400       410      
pF1KA1 KPLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAV-VAVAVLV-IGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSA-L
       : : . . . .: ..: :::.:: .:. :.::.:. .::..:::.  :. .:. :::: :
CCDS73 KTLSDPNSHLLEASGDAALYAGLVVAIFVVVAILMAVGVVVYRRNCRDFDTDITDSSAAL
       360       370       380       390       400       410       

         420       430       440        450        460       470   
pF1KA1 TGGFQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSR-TYSGPI-CLQDPLDKELMTESSLFNPL
       ::::.  ::::.: .:  ::. .. ::::.:   : ::.  :::  ::  ::.: :..::
CCDS73 TGGFHPVNFKTARPSNPQLLHPSVPPDLTASAGIYRGPVYALQDSTDKIPMTNSPLLDPL
       420       430       440       450       460       470       

           480         490       500       510       520       530 
pF1KA1 SDIKVKVQSSFMVSLG--VSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSL
        ..:::: ::  .. :  ... :.  :     :.:    ..   .: :.     :.: .:
CCDS73 PSLKVKVYSSSTTGSGPGLADGADLLGVLPPGTYPSDFARDTHFLHLRSASLGSQQLLGL
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             540       550       560       570       580        590
pF1KA1 PTRTELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQ-SDGS
       :      ..:.:: ::::: .:.::::::.:.::::. . .:.:. ::..: .:  :.:.
CCDS73 PRDPGSSVSGTFGCLGGRLSIPGTGVSLLVPNGAIPQGKFYEMYLLINKAESTLPLSEGT
       540       550       560       570       580       590       

              600       610       620       630       640          
pF1KA1 EVLLSPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDES-
       ...::: :::::  ...  :  ::.::::.::.. : ..:: ...::.::::.....:. 
CCDS73 QTVLSPSVTCGPTGLLLCRPVILTMPHCAEVSARDWIFQLKTQAHQGHWEEVVTLDEETL
       600       610       620       630       640       650       

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pF1KA1 -TSCYCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCV
        : ::: :.: :::.:::..:::..:::  .  :::.:..:::.   :.::.:.:::::.
CCDS73 NTPCYCQLEPRACHILLDQLGTYVFTGESYSRSAVKRLQLAVFAPALCTSLEYSLRVYCL
       660       670       680       690       700       710       

      710       720       730       740       750       760        
pF1KA1 DNTPCAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEV
       ..:: :..::.  ::  :: :.:::: : :: .  .:..:. :.:   :: : ..  ::.
CCDS73 EDTPVALKEVLELERTLGGYLVEEPKPLMFKDSYHNLRLSLHDLPHAHWRSKLLAKYQEI
       720       730       740       750       760       770       

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pF1KA1 PFSRVWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETI-
       :: ..: .... :::.:.:::.. ..:.:.::::.::..:. ::.:..:.. :.   .. 
CCDS73 PFYHIWSGSQKALHCTFTLERHSLASTELTCKICVRQVEGEGQIFQLHTTLAETPAGSLD
       780       790       800       810       820       830       

       830       840       850       860       870       880       
pF1KA1 TFFAQEDSTFPAQTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFA
       :. .   ::  .: :: ::::: ::::.:: ..:.::..:.::.::::: :..: :.:::
CCDS73 TLCSAPGSTVTTQLGPYAFKIPLSIRQKICNSLDAPNSRGNDWRMLAQKLSMDRYLNYFA
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       890       900       910       920       930       940       
pF1KA1 TQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNG
       :..::..:::.:::: .: ::::.::: ::::.:..                        
CCDS73 TKASPTGVILDLWEALQQDDGDLNSLASALEEMGKSEMLVAVATDGDC            
       900       910       920       930       940                 

        
pF1KA1 L

>>CCDS3643.1 UNC5C gene_id:8633|Hs108|chr4                (931 aa)
 initn: 3207 init1: 1636 opt: 1673  Z-score: 1537.4  bits: 295.8 E(32554): 2.6e-79
Smith-Waterman score: 3178; 50.9% identity (76.8% similar) in 930 aa overlap (20-934:30-930)

                         10        20        30          40        
pF1KA1           MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNG--EALPESIPSAPGT-
                                    ::. :.  : . :.   . :::..:: :   
CCDS36 MRKGLRATAARCGLGLGYLLQMLVLPALALLSASGTGSAAQDDDFFHELPETFPSDPPEP
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KA1 LPHFIEEPDDAYIIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVR
       ::::. ::..:::.:..:. : ::: :: ::.::::.:::::..:. .: .::.::: ::
CCDS36 LPHFLIEPEEAYIVKNKPVNLYCKASPATQIYFKCNSEWVHQKDHIVDERVDETSGLIVR
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       110       120       130       140       150       160       
pF1KA1 EVFINVTRQQVEDFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPI
       :: :...:::::.. :::::::::::::  ::.::::: ::::::::.:::.: :.:: .
CCDS36 EVSIEISRQQVEELFGPEDYWCQCVAWSSAGTTKSRKAYVRIAYLRKTFEQEPLGKEVSL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KA1 EGMIVLHCRPPEGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCM
       :  ..:.::::::.:.:::::::::. ::  .:.:.    ::::::.::::::..::::.
CCDS36 EQEVLLQCRPPEGIPVAEVEWLKNEDIIDPVEDRNFYITIDHNLIIKQARLSDTANYTCV
              190       200       210       220       230       240

       230       240       250       260       270       280       
pF1KA1 AANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCE
       : ::::::.: .:::.::::::::.:::::.:: :::::.:::.::::::::::::::::
CCDS36 AKNIVAKRKSTTATVIVYVNGGWSTWTEWSVCNSRCGRGYQKRTRTCTNPAPLNGGAFCE
              250       260       270       280       290       300

       290       300       310       320       330       340       
pF1KA1 GMSVQKITCTSLCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESE
       :.:::::.::.:::::: :  ::.::.:. :: : : :::::: :.:::: :.::  .:.
CCDS36 GQSVQKIACTTLCPVDGRWTPWSKWSTCGTECTHWRRRECTAPAPKNGGKDCDGLVLQSK
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA1 NCTDGLCILDKKPLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVV---AVAVLVIGVTLYRRSQSD
       :::::::.           :.  ...:.::: :.  ::.   :..: :... .::... :
CCDS36 NCTDGLCM-----------QTAPDSDDVALYVGIVIAVIVCLAISV-VVALFVYRKNHRD
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pF1KA1 YGVDVIDSSALTGGFQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLT-VSRTYSGPI-CLQDPLDKE
       .  :.::::::.::::  :.:..::  .::   :. :::: ..  : ::.  :.:  :: 
CCDS36 FESDIIDSSALNGGFQPVNIKAARQ--DLL---AVPPDLTSAAAMYRGPVYALHDVSDKI
      410       420       430            440       450       460   

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pF1KA1 LMTESSLFNPLSDIKVKVQSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKM
        ::.: ...:: ..:.:: ..  .    .. .:.     :.  :.    . : .  .:. 
CCDS36 PMTNSPILDPLPNLKIKVYNTSGAVTPQDDLSEFT----SKLSPQ---MTQSLL--ENEA
           470       480       490           500          510      

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pF1KA1 PYIQNLSSLPTRTELRTT--GVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQ
         ..: .::  .:.   :  : :. :::.:..::.::::::: ::::.   .:.:.....
CCDS36 LSLKN-QSLARQTDPSCTAFGSFNSLGGHLIVPNSGVSLLIPAGAIPQGRVYEMYVTVHR
           520       530       540       550       560       570   

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pF1KA1 GE---PSLQSDGSEVLLSPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQG
        :   : .  : :..::.: :.::::  ..: : .::. :::: ..: :.: ::... ::
CCDS36 KETMRPPM--DDSQTLLTPVVSCGPPGALLTRPVVLTMHHCADPNTEDWKILLKNQAAQG
           580         590       600       610       620       630 

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pF1KA1 KWEEVMSVEDE--STSCYCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMS
       .::.:. : .:  .: ::  ::  :::.: ....::::.:.  :  :.:.::.:.:: . 
CCDS36 QWEDVVVVGEENFTTPCYIQLDAEACHILTENLSTYALVGHSTTKAAAKRLKLAIFGPLC
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pF1KA1 CNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPF
       :.::.:..::::.:.:  :..:..  ::..::::::::: :::::.: .:..:. ::   
CCDS36 CSSLEYSIRVYCLDDTQDALKEILHLERQMGGQLLEEPKALHFKGSTHNLRLSIHDIAHS
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pF1KA1 LWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQV
       ::. : ..  ::.:: .:: .... :::.:.:::.. .:..: ::.:.::..:. ::.:.
CCDS36 LWKSKLLAKYQEIPFYHVWSGSQRNLHCTFTLERFSLNTVELVCKLCVRQVEGEGQIFQL
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pF1KA1 QTSILESERETITFFAQEDSTFPAQTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQ
       . .. :        . .  .:. . :::.::.::  :::..:...:.:...:.::.:::.
CCDS36 NCTVSEEPTGIDLPLLDPANTITTVTGPSAFSIPLPIRQKLCSSLDAPQTRGHDWRMLAH
             820       830       840       850       860       870 

         880       890       900       910       920       930     
pF1KA1 KNSINRNLSYFATQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQL
       : ...: :.::::.:::..:::.::::..  ::.:. :: .:::.:: .: .:  .:.: 
CCDS36 KLNLDRYLNYFATKSSPTGVILDLWEAQNFPDGNLSMLAAVLEEMGRHETVVSLAAEGQY
             880       890       900       910       920       930 

         940        
pF1KA1 DEADFNYSRQNGL

>>CCDS34299.1 UNC5A gene_id:90249|Hs108|chr5              (842 aa)
 initn: 2251 init1: 1001 opt: 1124  Z-score: 1035.1  bits: 202.7 E(32554): 2.5e-51
Smith-Waterman score: 2377; 41.4% identity (67.1% similar) in 913 aa overlap (30-934:24-841)

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pF1KA1 MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSA-PGTLPHFIEEPDDAY
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CCDS34       MAVRPGLWPALLGIVLAAWLRGSGAQQSATVANPVPGANPDLLPHFLVEPEDVY
                     10        20        30        40        50    

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pF1KA1 IIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVE
       :.:..:. : ::: :: :::::::::::.: .:: :.. : :::: . :: :::.:::::
CCDS34 IVKNKPVLLVCKAVPATQIFFKCNGEWVRQVDHVIERSTDGSSGLPTMEVRINVSRQQVE
           60        70        80        90       100       110    

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pF1KA1 DFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPE
          : :.:::::::::  ::.::.:: .:::::::::::.: ..:: .:  ::: :::::
CCDS34 KVFGLEEYWCQCVAWSSSGTTKSQKAYIRIAYLRKNFEQEPLAKEVSLEQGIVLPCRPPE
          120       130       140       150       160       170    

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pF1KA1 GVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLS
       :.: ::::::.::. .:   : :.    .:.:..:::::.:..::::.: ::::.::: :
CCDS34 GIPPAEVEWLRNEDLVDPSLDPNVYITREHSLVVRQARLADTANYTCVAKNIVARRRSAS
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KA1 ATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSL
       :.:.:::.:.:: :..::::..                                      
CCDS34 AAVIVYVDGSWSPWSKWSACGL--------------------------------------
          240       250                                            

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 CPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKK
                         .: : : :::. : :::::. :.: . ...:::. ::.    
CCDS34 ------------------DCTHWRSRECSDPAPRNGGEECQGTDLDTRNCTSDLCV----
                          260       270       280       290        

     360       370       380        390       400       410        
pF1KA1 PLHEIKPQSIENASDIALYSGLGA-AVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGG
              ..  .  :.::: :: : ::  : .:.. . .: :..     :: ::: ::.:
CCDS34 -------HTASGPEDVALYVGLIAVAVCLVLLLLVLILVYCRKKEGLDSDVADSSILTSG
                 300       310       320       330       340       

      420       430       440        450         460       470     
pF1KA1 FQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDL-TVSRTYSGPIC-LQD-PLDKELMTESSLFNPLSD
       ::  ..:  .  :  ::  ..:::: :.. ::.: .:  :: :  :  .:.. :..::. 
CCDS34 FQPVSIKPSKADNPHLL--TIQPDLSTTTTTYQGSLCPRQDGPSPKFQLTNGHLLSPLGG
       350       360         370       380       390       400     

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pF1KA1 IKVKVQSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRT
        .                   :  .::   : .. . : .     ..   . . :::  :
CCDS34 GR-------------------HTLHHSS--PTSEAEEFVS-----RLSTQNYFRSLPRGT
                            410         420            430         

         540       550       560       570       580        590    
pF1KA1 ELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEP-SLQSDGSEVLL
          : :.:. :::::..::::.:::::  :::. . .:::..... :   :   : ..::
CCDS34 SNMTYGTFNFLGGRLMIPNTGISLLIPPDAIPRGKIYEIYLTLHKPEDVRLPLAGCQTLL
     440       450       460       470       480       490         

          600       610       620       630       640       650    
pF1KA1 SPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDESTSC--
       :: :.:::: ...: :  :.. ::.. : . :...:::.. .:.::.:. . .:. :   
CCDS34 SPIVSCGPPGVLLTRPVILAMDHCGEPSPDSWSLRLKKQSCEGSWEDVLHLGEEAPSHLY
     500       510       520       530       540       550         

            660       670       680       690       700       710  
pF1KA1 YCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCVDNTP
       :: :.  ::.:. ...: .::.:: ..  :.:.::. .:. ..:.::.::.::::. .: 
CCDS34 YCQLEASACYVFTEQLGRFALVGEALSVAAAKRLKLLLFAPVACTSLEYNIRVYCLHDTH
     560       570       580       590       600       610         

            720       730       740       750       760       770  
pF1KA1 CAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSR
        :..:::. :.. ::::..::..:::: .  .:..:. :.:  ::. : ... ::.:: .
CCDS34 DALKEVVQLEKQLGGQLIQEPRVLHFKDSYHNLRLSIHDVPSSLWKSKLLVSYQEIPFYH
     620       630       640       650       660       670         

            780       790       800       810       820       830  
pF1KA1 VWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQ
       .: .... :::.:.::: .:.:..:.::. . :..:  : .... .: .. : .  .  .
CCDS34 IWNGTQRYLHCTFTLERVSPSTSDLACKLWVWQVEGDGQSFSINFNITKDTRFAELLALE
     680       690       700       710       720       730         

            840       850       860       870       880       890  
pF1KA1 EDSTFPAQTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSP
        ..  :: .::.:::::. :::.: ...: :  .: ::. ::::  .. .::.::.. ::
CCDS34 SEAGVPALVGPSAFKIPFLIRQKIISSLDPPCRRGADWRTLAQKLHLDSHLSFFASKPSP
     740       750       760       770       780       790         

            900       910       920       930       940        
pF1KA1 SAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
       .:.:::::::::  .:.:..:: :.  .:.  . : ..::..              
CCDS34 TAMILNLWEARHFPNGNLSQLAAAVAGLGQPDAGLFTVSEAEC             
     800       810       820       830       840               

>>CCDS4847.1 UNC5CL gene_id:222643|Hs108|chr6             (518 aa)
 initn: 278 init1: 103 opt: 397  Z-score: 372.2  bits: 79.4 E(32554): 2.1e-14
Smith-Waterman score: 397; 26.3% identity (57.8% similar) in 391 aa overlap (545-920:110-481)

          520       530       540       550       560           570
pF1KA1 TMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIP----EEN
                                     : :: :.. .::.::::: ::.     :. 
CCDS48 YQELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDTGISLLIPPGAVAVGRQERV
      80        90       100       110       120       130         

              580        590       600       610       620         
pF1KA1 SWEIYMSINQGEPSL-QSDGSEVLLSPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIH
       :  .  ..... ::: :..:   :.:: :.:::       : .::. :::.  :.  .  
CCDS48 SLILVWDLSDA-PSLSQAQG---LVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSHARTYS
     140       150           160       170       180       190     

     630        640       650       660       670        680       
pF1KA1 LKKRTQQGK-WEEVMSVEDESTSCYCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGE-PITDCAVKQLK
        .    ..: :. .     ...      :   :.. :. :. :. . : :.   : : :.
CCDS48 SNTTLLDAKVWRPLGRPGAHASR-----DE--CRIHLSHFSLYTCVLEAPVGREARKWLQ
         200       210            220         230       240        

       690         700       710       720       730       740     
pF1KA1 VAVFGC--MSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSL
       .::: :  .  ..   .::.: ..:::::.: ....:. .::.:    .:. :.:   . 
CCDS48 LAVF-CSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNGARGDQ
      250        260       270       280       290       300       

         750       760       770       780       790       800     
pF1KA1 QISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQ
        ...  :    :.    ..:: ::  ..:  .. :.. .: ..: .   .. .:.    .
CCDS48 CLKLTYISEG-WENVDDSSCQLVPHLHIW-HGKCPFR-SFCFRRKAADENE-DCSALTNE
       310        320       330        340        350        360   

         810       820        830           840       850       860
pF1KA1 LKGHEQILQVQTSILESER-ETITFFAQEDSTF----PAQTGPKAFKIPYSIRQRICATF
       .    . .:   . ::..  : . : :.:. ..    :..  :   ..:  . ...   .
CCDS48 IIVTMHTFQ---DGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPPVSQPPPCNRLPPELFEQLRMLL
           370          380       390       400       410       420

              870        880       890       900       910         
pF1KA1 DTPNAKGKDWQMLAQKNSI-NRNLSYFATQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEE
       .  .  :.::. ::.. .. . .. ... : ::.:.::.:.: ..    .:  :  ..:.
CCDS48 EPNSITGNDWRRLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMER
              430       440       450       460       470       480

     920       930       940                 
pF1KA1 IGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL         
       .                                     
CCDS48 LDCASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
              490       500       510        

>>CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1              (5635 aa)
 initn: 507 init1: 218 opt: 407  Z-score: 366.1  bits: 81.7 E(32554): 4.5e-14
Smith-Waterman score: 478; 35.4% identity (62.6% similar) in 198 aa overlap (169-362:4455-4643)

      140       150       160       170       180       190        
pF1KA1 TSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPEGVPAAEVEWLKNEEPIDSE
                                     : :.:.:.   : :   . : .. . :.  
CCDS30 AGVVERSMSLTLQSPPIITLEPVETVINAGGKIILNCQAT-GEPQPTITWSRQGHSIS--
         4430      4440      4450      4460       4470      4480   

      200       210       220       230       240       250        
pF1KA1 QDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSA
        :. ... ....: : .:.  :.... :.: :....   . . :.: :.::.:.:. : :
CCDS30 WDDRVNVLSNNSLYIADAQKEDTSEFECVARNLMGSVL-VRVPVIVQVHGGFSQWSAWRA
            4490      4500      4510       4520      4530      4540

      260       270       280       290        300       310       
pF1KA1 CNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSL-CPVDGSWEVWSEWSVCSP
       :.: ::.: ::::: :..: : :::  :.: ...  .: .  :::::::  :: :  :. 
CCDS30 CSVTCGKGIQKRSRLCNQPLPANGGKPCQGSDLEMRNCQNKPCPVDGSWSEWSLWEECTR
             4550      4560      4570      4580      4590      4600

          320       330       340       350       360       370    
pF1KA1 EC---EHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKPLHEIKPQSIENASD
        :   .. : : :. :  ..::. ::: . :   :.   :     :.:            
CCDS30 SCGRGNQTRTRTCNNPSVQHGGRPCEGNAVEIIMCNIRPC-----PVHGAWSAWQPWGTC
             4610      4620      4630      4640           4650     

          380       390       400       410       420       430    
pF1KA1 IALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGFQTFNFKTVRQGNSLL
                                                                   
CCDS30 SESCGKGTQTRARLCNNPPPAFGGSYCDGAETQMQVCNERNCPIHGKWATWASWSACSVS
        4660      4670      4680      4690      4700      4710     

>--
 initn: 477 init1: 218 opt: 407  Z-score: 366.1  bits: 81.7 E(32554): 4.5e-14
Smith-Waterman score: 407; 42.2% identity (66.4% similar) in 116 aa overlap (246-357:4699-4814)

         220       230       240       250       260       270     
pF1KA1 ARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCT
                                     ..: :..:. ::::.: :: : ..:.: :.
CCDS30 LCNNPPPAFGGSYCDGAETQMQVCNERNCPIHGKWATWASWSACSVSCGGGARQRTRGCS
     4670      4680      4690      4700      4710      4720        

         280       290        300       310          320       330 
pF1KA1 NPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSL-CPVDGSWEVWSEWSVCSPEC---EHLRIRECTAPP
       .:.:  ::  ::: .::.  :.:  ::. :.:  :: :..::  :   .  : : :  ::
CCDS30 DPVPQYGGRKCEGSDVQSDFCNSDPCPTHGNWSPWSGWGTCSRTCNGGQMRRYRTCDNPP
     4730      4740      4750      4760      4770      4780        

             340       350       360       370       380       390 
pF1KA1 PRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKPLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVL
       : :::. : : ... . :.  .: .:                                  
CCDS30 PSNGGRACGGPDSQIQRCNTDMCPVDGSWGSWHSWSQCSASCGGGEKTRKRLCDHPVPVK
     4790      4800      4810      4820      4830      4840        

>>CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6                (1522 aa)
 initn: 350 init1: 153 opt: 355  Z-score: 326.8  bits: 72.5 E(32554): 6.9e-12
Smith-Waterman score: 355; 42.3% identity (61.8% similar) in 123 aa overlap (236-354:334-452)

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA1 RADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGR
                                     :  . :..  :.: :  :. :: :.  :::
CCDS49 SVTCGQGSQVRTRTCVSPYGTHCSGPLRESRVCNNTALCPVHGVWEEWSPWSLCSFTCGR
           310       320       330       340       350       360   

         270       280       290        300       310       320    
pF1KA1 GWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCT-SLCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEH---
       : . :.:.:: : :  ::  :::  ...  :. .::::::.:. :: :: ::  : .   
CCDS49 GQRTRTRSCT-P-PQYGGRPCEGPETHHKPCNIALCPVDGQWQEWSSWSQCSVTCSNGTQ
           370         380       390       400       410       420 

             330       340       350       360       370       380 
pF1KA1 LRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKPLHEIKPQSIENASDIALYSGL
        : :.:::    .::. :.:   ::..: .  :                           
CCDS49 QRSRQCTAAA--HGGSECRGPWAESRECYNPECTANGQWNQWGHWSGCSKSCDGGWERRI
             430         440       450       460       470         

             390       400       410       420       430       440 
pF1KA1 GAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGFQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQP
                                                                   
CCDS49 RTCQGAVITGQQCEGTGEEVRRCNEQRCPAPYEICPEDYLMSMVWKRTPAGDLAFNQCPL
     480       490       500       510       520       530         

>>CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3               (1651 aa)
 initn: 340 init1: 184 opt: 343  Z-score: 315.3  bits: 70.5 E(32554): 3e-11
Smith-Waterman score: 343; 31.7% identity (59.8% similar) in 224 aa overlap (27-244:46-258)

                   10        20        30        40        50      
pF1KA1     MILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPD
                                     :: . ::. .   :        :...:.:.
CCDS54 SLSPNHLFLAQLIPDPEDVERGNDHGTPIPTSDNDDNSLGYTGSRLRQEDFPPRIVEHPS
          20        30        40        50        60        70     

         60        70          80        90       100       110    
pF1KA1 DAYIIKSNPIALRCKA--RPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVT
       :  . :..: .: :::  ::.  :      :: . .:.:  .  :  :    : .. . .
CCDS54 DLIVSKGEPATLNCKAEGRPTPTI------EWYKGGERVETDKDDPRSH---RMLLPSGS
          80        90             100       110          120      

          120           130       140       150       160       170
pF1KA1 RQQVEDFHG----PEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGM
          ..  ::    :..    ::: ..:: . :..::...: :: .:.:.:.   : .   
CCDS54 LFFLRIVHGRKSRPDEGVYVCVARNYLGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEP
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