Result of FASTA (ccds) for pF1KA0382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0382, 1544 aa
  1>>>pF1KA0382 1544 - 1544 aa - 1544 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9437+/-0.00122; mu= 12.1761+/- 0.074
 mean_var=172.8320+/-34.539, 0's: 0 Z-trim(107.8): 131  B-trim: 156 in 1/50
 Lambda= 0.097558
 statistics sampled from 9693 (9833) to 9693 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.302), width:  16
 Scan time:  3.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11     (1544) 10158 1443.5       0
CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11     (1525) 9750 1386.1       0
CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11     (1441) 9491 1349.6       0
CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1        (1522) 1687 251.3 1.8e-65
CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1        (1562) 1682 250.6 2.9e-65
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 879) 1259 190.8 1.6e-47
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 912) 1259 190.9 1.6e-47
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 927) 1259 190.9 1.6e-47
CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1         ( 958)  519 86.7 3.8e-16
CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1        ( 985)  519 86.7 3.9e-16
CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1        ( 986)  519 86.7 3.9e-16
CCDS57967.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1       ( 930)  497 83.6 3.2e-15
CCDS79.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1          (1006)  497 83.6 3.4e-15
CCDS41241.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1       (1062)  497 83.7 3.5e-15
CCDS57968.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1       (1075)  497 83.7 3.5e-15
CCDS41240.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1       (1083)  497 83.7 3.6e-15
CCDS57969.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1       (1085)  497 83.7 3.6e-15
CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19     (1173)  496 83.5 4.2e-15
CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19     (1015)  493 83.1   5e-15
CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15       (1434)  487 82.3 1.2e-14
CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15       (2813)  487 82.6   2e-14
CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15       (2817)  487 82.6   2e-14
CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5      (1392)  471 80.1 5.5e-14
CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5      (1705)  471 80.1 6.4e-14
CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5      (1731)  471 80.2 6.5e-14
CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2          (1670)  442 76.1 1.1e-12
CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2          (1697)  442 76.1 1.1e-12
CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21         (1716)  441 75.9 1.2e-12
CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21         (1721)  441 75.9 1.2e-12


>>CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11          (1544 aa)
 initn: 10158 init1: 10158 opt: 10158  Z-score: 7732.4  bits: 1443.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10158; 100.0% identity (100.0% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:1-1544)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 SRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540    
pF1KA0 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
             1510      1520      1530      1540    

>>CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11          (1525 aa)
 initn: 10035 init1: 9737 opt: 9750  Z-score: 7422.2  bits: 1386.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10001; 98.8% identity (98.8% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:1-1525)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
CCDS55 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPT-------------
               10        20        30        40                    

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 SRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ------GLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
              50        60        70        80        90       100 

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
             110       120       130       140       150       160 

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
             170       180       190       200       210       220 

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
             230       240       250       260       270       280 

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
             290       300       310       320       330       340 

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
             350       360       370       380       390       400 

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
             410       420       430       440       450       460 

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
             470       480       490       500       510       520 

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
             530       540       550       560       570       580 

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
             590       600       610       620       630       640 

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
             650       660       670       680       690       700 

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
             710       720       730       740       750       760 

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
             770       780       790       800       810       820 

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
             830       840       850       860       870       880 

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
             890       900       910       920       930       940 

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
             950       960       970       980       990      1000 

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
            1070      1080      1090      1100      1110      1120 

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
            1130      1140      1150      1160      1170      1180 

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
            1250      1260      1270      1280      1290      1300 

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
            1310      1320      1330      1340      1350      1360 

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
            1370      1380      1390      1400      1410      1420 

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
            1430      1440      1450      1460      1470      1480 

             1510      1520      1530      1540    
pF1KA0 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
            1490      1500      1510      1520     

>>CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11          (1441 aa)
 initn: 9491 init1: 9491 opt: 9491  Z-score: 7225.5  bits: 1349.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9491; 100.0% identity (100.0% similar) in 1441 aa overlap (104-1544:1-1441)

            80        90       100       110       120       130   
pF1KA0 IIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76                               MRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKL
                                             10        20        30

           140       150       160       170       180       190   
pF1KA0 IKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVL
               40        50        60        70        80        90

           200       210       220       230       240       250   
pF1KA0 MGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQL
              100       110       120       130       140       150

           260       270       280       290       300       310   
pF1KA0 SKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPSSDNADSPKSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPSSDNADSPKSG
              160       170       180       190       200       210

           320       330       340       350       360       370   
pF1KA0 PKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQINGQCSCFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQINGQCSCFQ
              220       230       240       250       260       270

           380       390       400       410       420       430   
pF1KA0 SIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRS
              280       290       300       310       320       330

           440       450       460       470       480       490   
pF1KA0 AHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTL
              340       350       360       370       380       390

           500       510       520       530       540       550   
pF1KA0 AESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMK
              400       410       420       430       440       450

           560       570       580       590       600       610   
pF1KA0 HLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNS
              460       470       480       490       500       510

           620       630       640       650       660       670   
pF1KA0 AIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGA
              520       530       540       550       560       570

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pF1KA0 SFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTE
              580       590       600       610       620       630

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pF1KA0 HGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVIN
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pF1KA0 ELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVR
              700       710       720       730       740       750

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pF1KA0 KRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQ
              760       770       780       790       800       810

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pF1KA0 DAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCRQILNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCRQILNY
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pF1KA0 VNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRD
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pF1KA0 KTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATD
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pF1KA0 NKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGD
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

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pF1KA0 NDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAER
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

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pF1KA0 QFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQLGLTEKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQLGLTEKS
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          1280      1290      1300      1310      1320      1330   
pF1KA0 VQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTGDIATCYSPRTSTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTGDIATCYSPRTSTE
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pF1KA0 SFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENP
             1240      1250      1260      1270      1280      1290

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pF1KA0 SEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQ
             1300      1310      1320      1330      1340      1350

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pF1KA0 QQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQSQIMEYIHKIEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQSQIMEYIHKIEAD
             1360      1370      1380      1390      1400      1410

          1520      1530      1540    
pF1KA0 LEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
             1420      1430      1440 

>>CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1             (1522 aa)
 initn: 1744 init1: 621 opt: 1687  Z-score: 1289.0  bits: 251.3 E(32554): 1.8e-65
Smith-Waterman score: 2308; 33.2% identity (61.6% similar) in 1570 aa overlap (34-1533:7-1455)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KA0 TQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEESR-
                                     :...:..:  ..   .:. . :: :.. . 
CCDS11                         MSVRLPQSIDRLSS--LSSLGDSAPERKSPSHHRQP
                                       10          20        30    

                70        80        90       100       110         
pF1KA0 ---SEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNG
          ::  ::::::::::::..:::.:::::  :.::::.  ::::.:::. :::::::::
CCDS11 SDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG
           40        50        60        70        80        90    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP
       :.::.:.:::::::::::.:::::. :  :.:  :   ...  :.   ... .. ::  :
CCDS11 TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP
          100       110       120       130       140       150    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA0 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI
             .:::.:  .  ..  :... ..:::.::..:...:: .   :. : .::     
CCDS11 PPLPPPQRITGPKPL--QDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----P
          160         170       180       190       200            

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDA
       .:..  .       :.   :. :..  :   :     ..::.  . ..::          
CCDS11 SEGRLSLD------SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL----------
       210             220         230            240              

     300       310         320        330       340       350      
pF1KA0 SRPSSDNADSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD
          :. . :::...:    :.  ..  . :.. . .:  :..  ::.    : ::: :.:
CCDS11 ---SDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEED
             250       260       270       280           290       

         360       370       380       390       400       410     
pF1KA0 -DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNS
        : :  ... .     ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... 
CCDS11 YDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASP
       300          310       320       330       340       350    

         420       430       440       450       460       470     
pF1KA0 KETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPE
       :..: .  .. ..::...: :.:..:. ..:....:  .   ::  :  .   :: . ::
CCDS11 KDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPE
          360       370       380       390          400       410 

         480       490       500       510       520       530     
pF1KA0 VQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQA
       .:....:.: ::..::    .:   :: . :  :     ::  ::. .: . ..:   . 
CCDS11 IQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SK
             420       430       440            450       460      

         540       550       560         570              580      
pF1KA0 VEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQSM--KK
        :::.:. :....  ::.: :....:  : :  .:          . :.:: :.:   ::
CCDS11 YEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKK
           470       480       490       500       510       520   

          590       600       610       620          630        640
pF1KA0 DKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEP
       .:.. :  ::  . . .: :.  :.         .:..  ..:.  .:. . ..  .:::
CCDS11 EKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP
           530       540       550       560       570       580   

              650       660       670       680                    
pF1KA0 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTG
         . .:  ... ..  ..     .: : .  : : : .: .:              .:. 
CCDS11 -GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVD
            590       600           610       620       630        

        690       700        710       720       730       740     
pF1KA0 SKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDS
          ..:..   .. ...  .:.:  .. : ::.         . .. ...  .:   : .
CCDS11 MDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCT
      640       650       660       670                680         

         750        760         770       780       790       800  
pF1KA0 VAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAH
        ..     ::.  . .::: .:   :::. :...:. ::   :: ::::::::: :: .:
CCDS11 DTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH
     690       700       710       720       730       740         

            810       820       830       840       850       860  
pF1KA0 VRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVID
       .:::.::: .::::...:...   :: ..: :: .....: .  : :: .:.  :  .: 
CCDS11 LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIK
     750       760       770       780       790       800         

            870       880       890       900       910       920  
pF1KA0 QIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCR
       .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::
CCDS11 EISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCR
       810       820       830       840       850       860       

            930       940       950        960       970       980 
pF1KA0 RLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEA
       ::::.:.: ..:::::::::::..: :.::  : :.::. .: :.::.::.:::.:::..
CCDS11 RLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQT
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pF1KA0 ENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTL
       ::..::: ::.:::...:. .  : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:
CCDS11 ENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVL
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pF1KA0 LLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVIS
       ::::.::::::::..:.:.::::  ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.: 
CCDS11 LLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIIC
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

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pF1KA0 MSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMA-ASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDP
        :  :  ::::::: : :.:..:..:. . .  .... .. :.:.    ::  .  .. :
CCDS11 TSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGP
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

    1160      1170       1180      1190          1200      1210    
pF1KA0 SKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEVRDLFVAERQ
       .  . :    .:  :   :..  :  ..    . . . :       :..: ..: :    
CCDS11 TPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP--
      1110      1120      1130      1140      1150      1160       

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pF1KA0 FAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT
              ::  . .   .  ..:.:    :.  :  : .::...  :..:.. .:  : :
CCDS11 -CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHT
         1170      1180      1190         1200      1210      1220 

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pF1KA0 --EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTG
          ...::   :    :   .... :    .  ..  ..:. ..  .: ::. : .    
CCDS11 METQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQE---
            1230      1240      1250      1260      1270           

                 1330        1340      1350      1360      1370    
pF1KA0 DIATC----YSPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGL
       :.. :      ::: . ..  .:. . .:: .:.....     ...   :.   .   .:
CCDS11 DMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPAL
     1280      1290      1300       1310      1320      1330       

         1380      1390      1400      1410      1420      1430    
pF1KA0 DDSGEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVA
        .::.         :. .: : .:..         . .:: . ..  .   .::::.  :
CCDS11 PESGQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEA
      1340               1350               1360      1370         

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pF1KA0 SSLTLQPMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPS
             ::.  :  .:    :  ::   . :  .:  :                  .:: 
CCDS11 ------PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPP
          1380       1390      1400      1410                      

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pF1KA0 SCADSQ-SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS         
       : :  . ..:.. :...   :..:: .: ..  : . :.:                    
CCDS11 SLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWT
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CCDS11 DGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP
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>>CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1             (1562 aa)
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pF1KA0 TQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEESR-
                                     :...:..:  ..   .:. . :: :.. . 
CCDS11                         MSVRLPQSIDRLSS--LSSLGDSAPERKSPSHHRQP
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pF1KA0 ---SEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNG
          ::  ::::::::::::..:::.:::::  :.::::.  ::::.:::. :::::::::
CCDS11 SDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG
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pF1KA0 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP
       :.::.:.:::::::::::.:::::. :  :.:  :   ...  :.   ... .. ::  :
CCDS11 TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP
          100       110       120       130       140       150    

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pF1KA0 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI
             .:::.:  .  ..  :... ..:::.::..:...:: . : :.:.::. : ..:
CCDS11 PPLPPPQRITGPKPL--QDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQRICEVYSRNPASLLEEQI
          160         170       180       190       200       210  

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pF1KA0 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVV---TPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSS
       . :.... ::: .... ::.. :   .   : .::    :...  : : :   :     :
CCDS11 EGARRRVTQLQLKIQQETGGSVDILPLYGDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPS
            220       230       240       250       260       270  

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pF1KA0 GDAS---RPS--SDNA-DSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIA
        . :   : :  :: . :::...:    :.  ..  . :.. . .:  :..  ::.    
CCDS11 LSESLMNRNSVLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----
            280       290       300       310       320            

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pF1KA0 PHIIGAEDD-DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLY
       : ::: :.: : :  ... .     ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: 
CCDS11 PLIIGPEEDYDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLC
      330       340          350       360       370       380     

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pF1KA0 SDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQ
       ...:.... :..: .  .. ..::...: :.:..:. ..:....:  .   ::  :  . 
CCDS11 AEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLC
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pF1KA0 TMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKI
         :: . ::.:....:.: ::..::    .:   :: . :  :     ::  ::. .: .
CCDS11 EAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAAL
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pF1KA0 EEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPK
        ..:   .  :::.:. :....  ::.: :....:  : :  .:          . :.::
CCDS11 GDIL---SKYEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPK
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pF1KA0 IKQSM--KKDKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLST
        :.:   ::.:.. :  ::  . . .: :.  :.         .:..  ..:.  .:. .
CCDS11 TKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFEN
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pF1KA0 PSSV-SPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE---------
        ..  .:::  . .:  ... ..  ..     .: : .  : : : .: .:         
CCDS11 NQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAEN
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pF1KA0 -----NDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGT
            .:.    ..:..   .. ...  .:.:  .. : ::.         . .. ... 
CCDS11 VPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSI
     670       680       690       700       710                720

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pF1KA0 PKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVIN
        .:   : . ..     ::.  . .::: .:   :::. :...:. ::   :: ::::::
CCDS11 ESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVIN
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pF1KA0 ELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVR
       ::: :: .:.:::.::: .::::...:...   :: ..: :: .....: .  : :: .:
CCDS11 ELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLR
              790       800       810       820       830       840

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pF1KA0 KRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQ
       .  :  .: .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:
CCDS11 E--EGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQ
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pF1KA0 DAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILN
       .:::.: ::::::.:.: ..:::::::::::..: :.::  : :.::. .: :.::.::.
CCDS11 EAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILK
      900       910       920       930       940       950        

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pF1KA0 YVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNR
       :::.:::..::..::: ::.:::...:. .  : . :...:::: :::::::::.:....
CCDS11 YVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISK
      960       970       980       990      1000      1010        

           1040      1050      1060      1070      1080      1090  
pF1KA0 DKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVAT
       :::.::..:::::.::::::::..:.:.::::  ....:::.:::::.::..::.:.:::
CCDS11 DKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVAT
     1020      1030      1040      1050      1060      1070        

           1100       1110      1120      1130       1140      1150
pF1KA0 DNKALFVISMSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMA-ASVKEQSTKPIPLPQSTPG
       :..:.:.:  :  :  ::::::: : :.:..:..:. . .  .... .. :.:.    ::
CCDS11 DKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPG
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pF1KA0 EGDNDEEDPSKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEV
         .  .. :.  . :    .:  :   :..  :  ..    . . . :       :..: 
CCDS11 PREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEE
     1140      1150      1160      1170      1180      1190        

        1210      1220        1230      1240      1250      1260   
pF1KA0 RDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLL
       ..: :           ::  . .   .  ..:.:    :.  :  : .::...  :..:.
CCDS11 EELGVLP---CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLI
     1200         1210      1220      1230         1240      1250  

            1270           1280      1290          1300       1310 
pF1KA0 VQQL--GLT--EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EG
       . .:  : :   ...::   :    :   .... :    .  ..  ..:. ..  .: ::
CCDS11 LWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEG
           1260      1270      1280      1290      1300      1310  

            1320          1330        1340      1350      1360     
pF1KA0 HMPFRTGTGDIATC----YSPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEM
       . : .    :.. :      ::: . ..  .:. . .:: .:.....     ...   :.
CCDS11 ERPEQE---DMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEV
              1320      1330      1340       1350      1360        

        1370      1380      1390      1400      1410      1420     
pF1KA0 PTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQ
          .   .: .::.         :. .: : .:..         . .:: . ..  .   
CCDS11 AGSKVVPALPESGQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP
     1370      1380               1390               1400      1410

        1430      1440      1450      1460      1470      1480     
pF1KA0 ESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEY
       .::::.  :      ::.  :  .:    :  ::   . :  .:  :             
CCDS11 DSSTDHSEA------PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS------------
                   1420       1430      1440      1450             

        1490      1500       1510      1520      1530      1540    
pF1KA0 SCFEIQSPSSCADSQ-SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
            .:: : :  . ..:.. :...   :..:: .: ..  : . :.:           
CCDS11 -----RSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGS
                 1460      1470      1480      1490      1500      

CCDS11 FHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP
       1510      1520      1530      1540      1550      1560  

>>CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19            (879 aa)
 initn: 1606 init1: 1008 opt: 1259  Z-score: 966.8  bits: 190.8 E(32554): 1.6e-47
Smith-Waterman score: 1647; 39.2% identity (65.9% similar) in 812 aa overlap (350-1149:23-744)

     320       330       340       350       360        370        
pF1KA0 LEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELL
                                     ::::::.:: .: :  .  : : :::.: .
CCDS12         MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQV
                       10        20        30        40        50  

      380       390       400       410       420       430        
pF1KA0 KSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKV
       : ::::: ..:.::. ::.:. :.                                 :.:
CCDS12 KRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLV---------------------------------LRV
             60        70                                          

      440       450       460       470       480       490        
pF1KA0 SVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESEL
        :: ... .:.. : .:: ::..:...: . .  .  : :.:::::.:: ::.:  :.::
CCDS12 PVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQEL
      80        90       100       110       120       130         

      500       510        520       530       540       550       
pF1KA0 TKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGV
       ..:.:   .:: . : .::  ::... ..::.  :  ...:.::...  .: .::.::::
CCDS12 AQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGV
     140       150       160       170        180       190        

       560       570       580       590       600                 
pF1KA0 KVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-R
       ..:     ..: ::  :  :.  . ..:. .. :   .:. :::       : :. :. :
CCDS12 RTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR
      200          210       220          230       240       250  

     610       620       630       640       650       660         
pF1KA0 HDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSV
       : .. .        :..:   .  ..:.  :.     :. ...  : :.   :. :.  .
CCDS12 HLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVG-MPS-----RDRNIGAPGQDT---PGVSLHPL
                   260       270             280          290      

     670       680       690       700       710       720         
pF1KA0 ASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVE
        :  : ..: : .      ..:..:  :      : .:...   ::   :.  : :    
CCDS12 -SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG------PMSLESL--APPESTDEGAETE----
         300       310          320               330       340    

     730       740       750       760       770       780         
pF1KA0 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ
             .:.:    :    :.:  : :  :      ::.:..::  ..: .:   ..:::
CCDS12 ------SPEP---GDEGEPGRSGLELEPEE------PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQ
                       350       360             370       380     

     790       800       810       820        830       840        
pF1KA0 EVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNE
       :::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. : .. :  ::..:: .:......: . :..
CCDS12 EVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-ECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDR
         390       400       410        420       430       440    

       850       860       870       880       890       900       
pF1KA0 QMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSR
        ::  :...   .:..::. ::. :.:     ... .. ::: : ::::..:..:.:: :
CCDS12 LMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPR
            450       460       470       480       490       500  

       910       920       930       940       950       960       
pF1KA0 FQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHC
       : .:::.::: : ::::::::.:::.:::::::::::..:.. :: :::::::. ::. :
CCDS12 FCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECC
            510       520       530       540       550       560  

       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KA0 RQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLV
       :.::..:::::.. :.  ::.::::::: : :. :  : . :..:::.::.:..:::::.
CCDS12 REILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLT
            570       580       590       600       610       620  

      1030      1040      1050      1060      1070      1080       
pF1KA0 WKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLV
       :.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.:  . ::..:.....
CCDS12 WRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMT
            630       640       650       660       670       680  

      1090      1100      1110      1120      1130      1140       
pF1KA0 RQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQS
       :.::::.::..:.   :. :::::::::::::.  :  :: . :.:.:  .    : :. 
CCDS12 REVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRP
            690       700       710       720       730       740  

      1150      1160      1170      1180      1190      1200       
pF1KA0 TPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRD
       .:                                                          
CCDS12 SPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLK
            750       760       770       780       790       800  

>>CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19            (912 aa)
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Smith-Waterman score: 1811; 40.6% identity (68.8% similar) in 812 aa overlap (350-1149:23-777)

     320       330       340       350       360        370        
pF1KA0 LEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELL
                                     ::::::.:: .: :  .  : : :::.: .
CCDS12         MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQV
                       10        20        30        40        50  

      380       390       400       410       420       430        
pF1KA0 KSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKV
       : ::::: ..:.::. ::.:. ::: :..:.    . ::... ::.:.. ::...: :.:
CCDS12 KRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRV
             60        70        80        90       100       110  

      440       450       460       470       480       490        
pF1KA0 SVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESEL
        :: ... .:.. : .:: ::..:...: . .  .  : :.:::::.:: ::.:  :.::
CCDS12 PVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQEL
            120       130       140       150       160       170  

      500       510        520       530       540       550       
pF1KA0 TKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGV
       ..:.:   .:: . : .::  ::... ..::.  :  ...:.::...  .: .::.::::
CCDS12 AQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGV
            180       190       200        210       220       230 

       560       570       580       590       600                 
pF1KA0 KVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-R
       ..:     ..: ::  :  :.  . ..:. .. :   .:. :::       : :. :. :
CCDS12 RTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR
                240       250       260          270       280     

     610       620       630       640       650       660         
pF1KA0 HDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSV
       : .. .        :..:   .  ..:.  :.     :. ...  : :.   :. :.  .
CCDS12 HLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVG-MPS-----RDRNIGAPGQDT---PGVSLHPL
         290              300             310       320            

     670       680       690       700       710       720         
pF1KA0 ASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVE
        :  : ..: : .      ..:..:  :      : .:...   ::   :.  : :    
CCDS12 -SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG------PMSLESL--APPESTDEGAETE----
      330       340          350             360         370       

     730       740       750       760       770       780         
pF1KA0 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ
             .:.:    :    :.:  : :  :      ::.:..::  ..: .:   ..:::
CCDS12 ------SPEP---GDEGEPGRSGLELEPEE------PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQ
                    380       390             400       410        

     790       800       810       820        830       840        
pF1KA0 EVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNE
       :::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. : .. :  ::..:: .:......: . :..
CCDS12 EVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-ECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDR
      420       430       440        450       460       470       

       850       860       870       880       890       900       
pF1KA0 QMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSR
        ::  :...   .:..::. ::. :.:     ... .. ::: : ::::..:..:.:: :
CCDS12 LMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPR
       480         490       500       510       520       530     

       910       920       930       940       950       960       
pF1KA0 FQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHC
       : .:::.::: : ::::::::.:::.:::::::::::..:.. :: :::::::. ::. :
CCDS12 FCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECC
         540       550       560       570       580       590     

       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KA0 RQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLV
       :.::..:::::.. :.  ::.::::::: : :. :  : . :..:::.::.:..:::::.
CCDS12 REILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLT
         600       610       620       630       640       650     

      1030      1040      1050      1060      1070      1080       
pF1KA0 WKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLV
       :.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.:  . ::..:.....
CCDS12 WRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMT
         660       670       680       690       700       710     

      1090      1100      1110      1120      1130      1140       
pF1KA0 RQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQS
       :.::::.::..:.   :. :::::::::::::.  :  :: . :.:.:  .    : :. 
CCDS12 REVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRP
         720       730       740       750       760       770     

      1150      1160      1170      1180      1190      1200       
pF1KA0 TPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRD
       .:                                                          
CCDS12 SPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLK
         780       790       800       810       820       830     

>>CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19            (927 aa)
 initn: 1755 init1: 1008 opt: 1259  Z-score: 966.5  bits: 190.9 E(32554): 1.6e-47
Smith-Waterman score: 1818; 40.0% identity (67.9% similar) in 841 aa overlap (323-1149:9-792)

            300       310       320       330       340         350
pF1KA0 DCSSGDASRPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTR-IAP-HI
                                     .: . . ..:    .   .::   ..:  :
CCDS12                       MASLSTWSSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGLVPVSI
                                     10        20        30        

              360        370       380       390       400         
pF1KA0 IGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDL
       :::::.:: .: :  .  : : :::.: .: ::::: ..:.::. ::.:. ::: :..:.
CCDS12 IGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADM
       40        50        60        70        80        90        

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 YKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQ
           . ::... ::.:.. ::...: :.: :: ... .:.. : .:: ::..:...: . 
CCDS12 LGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVV
      100       110       120       130       140       150        

     470       480       490       500       510        520        
pF1KA0 ERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEE
       .  .  : :.:::::.:: ::.:  :.::..:.:   .:: . : .::  ::... ..::
CCDS12 QSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEE
      160       170       180       190       200       210        

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 VLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEG
       .  :  ...:.::...  .: .::.::::..:     ..: ::  :  :.  . ..:. .
CCDS12 MQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPA
      220        230       240       250          260       270    

      590       600               610       620       630       640
pF1KA0 EEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-RHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEP
       . :   .:. :::       : :. :. :: .. .        :..:   .  ..:.   
CCDS12 KTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVGMPS
             280       290       300              310       320    

              650       660       670       680       690       700
pF1KA0 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTL
       .:    :. :    : :.   :. :.  . :  : ..: : .      ..:..:  :   
CCDS12 RD----RNIG--APGQDT---PGVSLHPL-SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG---
              330            340        350          360           

              710       720       730       740       750       760
pF1KA0 DGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFEN
          : .:...   ::   :.  : :          .:.:    :    :.:  : :  : 
CCDS12 ---PMSLESL--APPESTDEGAETE----------SPEPG---DEGEPGRSGLELEPEE-
         370         380                 390          400          

              770       780       790       800       810       820
pF1KA0 DLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSRE
            ::.:..::  ..: .:   ..::::::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. :
CCDS12 -----PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-E
          410       420       430       440       450       460    

               830       840        850       860       870        
pF1KA0 GILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEE
        .. :  ::..:: .:......: . :.. ::  :...   .:..::. ::. :.:    
CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGS
           470       480       490         500       510       520 

      880       890       900       910       920       930        
pF1KA0 KLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLT
        ... .. ::: : ::::..:..:.:: :: .:::.::: : ::::::::.:::.:::::
CCDS12 WFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLT
             530       540       550       560       570       580 

      940       950       960       970       980       990        
pF1KA0 KYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSS
       ::::::..:.. :: :::::::. ::. ::.::..:::::.. :.  ::.::::::: : 
CCDS12 KYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSH
             590       600       610       620       630       640 

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KA0 LKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLV
       :. :  : . :..:::.::.:..:::::.:.:..::......:::.:.:.:::.::.::.
CCDS12 LRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLL
             650       660       670       680       690       700 

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KA0 LRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVS
       :. ::. :. : :.:  . ::..:.....:.::::.::..:.   :. ::::::::::::
CCDS12 LKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVS
             710       720       730       740       750       760 

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KA0 EKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPD
       :.  :  :: . :.:.:  .    : :. .:                             
CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTER
             770       780       790       800       810       820 

     1180      1190      1200      1210      1220      1230        
pF1KA0 RDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPD
                                                                   
CCDS12 ILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPAR
             830       840       850       860       870       880 

>>CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1              (958 aa)
 initn: 420 init1: 203 opt: 519  Z-score: 403.4  bits: 86.7 E(32554): 3.8e-16
Smith-Waterman score: 592; 25.5% identity (57.3% similar) in 546 aa overlap (643-1181:80-576)

            620       630       640       650       660       670  
pF1KA0 SAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASG
                                     :..::..    :  ...  :..:. .   :
CCDS11 NRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLG
      50        60        70        80        90       100         

            680       690       700       710       720       730  
pF1KA0 ASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVT
       .    . :. . . .:.:. :.  :   : .:  :  ...     :. ....   :: . 
CCDS11 S----RRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLN-MRNRTLSVESLI
     110           120       130       140       150        160    

            740       750       760       770       780       790  
pF1KA0 EHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVI
       .          . : ..: .:. :. :.:. .:  .:.  :.   :   :   .:.:.::
CCDS11 D----------EEVIYSELMSDFEMDEKDFAAD--SWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVI
                    170       180         190       200       210  

            800       810       820       830       840       850  
pF1KA0 NELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAV
        ::. ::  ::::::.. ..:   . .:  : :. .. .:  .... ..:  .  :.   
CCDS11 YELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLER
            220       230       240       250       260       270  

                  860       870       880       890       900      
pF1KA0 RKR------NETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDS
       :..      ... :: ..:. :.. ::::. :.. .. . ::: .  ::.. :    .:.
CCDS11 RRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDK
            280       290       300       310       320       330  

        910       920       930       940       950        960     
pF1KA0 RFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEW-PTEREKVKKAAD
       ::: :.. .    . .:  ... :    ::.::::::.. : ....    ::. .  :  
CCDS11 RFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALG
            340       350       360       370       380       390  

         970       980       990      1000      1010      1020     
pF1KA0 HCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGP
         ...:. :.... . :.  ::..   :.:  .   .  :.   .   .: .::.::.: 
CCDS11 LVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQ--TPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC
            400       410       420         430       440       450

        1030      1040      1050      1060      1070      1080     
pF1KA0 LVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTV
       :.::.   .  :. .::. :.::.::..:.. ..         : :.      :..:...
CCDS11 LLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIF--------PTLDKPS----VVSLQNL
              460       470       480               490            

        1090      1100      1110      1120      1130      1140     
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       .::..:...:..:.:: .    ..::. . . .....:  .:        .::..  :  
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       .. :    .::    ..: :        ::. :: :                        
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       .          . : ..: .:. :. :.:. .:  .:.  :.   :   :   .:.:.::
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        ::. ::  ::::::.. ..:   . .:  : :. .. .:  .... ..:  .  :.   
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       :..      ... :: ..:. :.. ::::. :.. .. . ::: .  ::.. :    .:.
CCDS53 RRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDK
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       ::: :.. .    . .:  ... :    ::.::::::.. : ....    ::. .  :  
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