Result of FASTA (ccds) for pF1KB5241
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5241, 478 aa
  1>>>pF1KB5241 478 - 478 aa - 478 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1513+/-0.00114; mu= 13.8387+/- 0.068
 mean_var=80.1276+/-16.534, 0's: 0 Z-trim(103.2): 46  B-trim: 293 in 1/49
 Lambda= 0.143279
 statistics sampled from 7265 (7296) to 7265 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.224), width:  16
 Scan time:  2.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31243.1 IFIT1 gene_id:3434|Hs108|chr10         ( 478) 3153 661.8 4.3e-190
CCDS59220.1 IFIT1 gene_id:3434|Hs108|chr10         ( 447) 2932 616.1 2.3e-176
CCDS31242.1 IFIT1B gene_id:439996|Hs108|chr10      ( 474) 2143 453.1  3e-127
CCDS7403.1 IFIT5 gene_id:24138|Hs108|chr10         ( 482) 1765 374.9  1e-103
CCDS41548.1 IFIT2 gene_id:3433|Hs108|chr10         ( 472) 1348 288.7 8.9e-78
CCDS31241.1 IFIT3 gene_id:3437|Hs108|chr10         ( 490)  740 163.1 6.3e-40
CCDS7402.1 IFIT3 gene_id:3437|Hs108|chr10          ( 490)  740 163.1 6.3e-40


>>CCDS31243.1 IFIT1 gene_id:3434|Hs108|chr10              (478 aa)
 initn: 3153 init1: 3153 opt: 3153  Z-score: 3526.2  bits: 661.8 E(32554): 4.3e-190
Smith-Waterman score: 3153; 100.0% identity (100.0% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSTNGDDHQVKDSLEQLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSTNGDDHQVKDSLEQLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YAISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEAEGEKYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEAEGEKYI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYKAQMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYKAQMI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 QIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAGNHRKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAGNHRKAE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTRDKSIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTRDKSIN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470        
pF1KB5 SLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVRQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVRQGP
              430       440       450       460       470        

>>CCDS59220.1 IFIT1 gene_id:3434|Hs108|chr10              (447 aa)
 initn: 2932 init1: 2932 opt: 2932  Z-score: 3279.7  bits: 616.1 E(32554): 2.3e-176
Smith-Waterman score: 2932; 100.0% identity (100.0% similar) in 447 aa overlap (32-478:1-447)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB5 STNGDDHQVKDSLEQLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAYV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                               MPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAYV
                                             10        20        30

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB5 KHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDKV
               40        50        60        70        80        90

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB5 ENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAGY
              100       110       120       130       140       150

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB5 AISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEAEGEKYIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEAEGEKYIE
              160       170       180       190       200       210

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB5 EALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYKAQMIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYKAQMIQ
              220       230       240       250       260       270

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB5 IKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAGNHRKAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAGNHRKAEE
              280       290       300       310       320       330

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB5 NFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTRDKSINS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTRDKSINS
              340       350       360       370       380       390

             430       440       450       460       470        
pF1KB5 LKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVRQGP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVRQGP
              400       410       420       430       440       

>>CCDS31242.1 IFIT1B gene_id:439996|Hs108|chr10           (474 aa)
 initn: 2203 init1: 2143 opt: 2143  Z-score: 2397.9  bits: 453.1 E(32554): 3e-127
Smith-Waterman score: 2143; 67.9% identity (88.3% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSTNGDDHQVKDSLEQLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAY
       :: ..: . ..::: ::::::::.: :.  :.::::::. ..:.::::::.:::::::::
CCDS31 MSEESDGKLIEDSLIQLRCHFTWKLLIEAPEIPDLENRIWEEIQFLDTKYNVGIHNLLAY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDK
       :::::::::::: :::.::.:.:.:: :::..:::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 VKHLKGQNEEALVSLKKAEDLIQKEHANQADIRSLVTWGNFAWVYYHMGRLAEAQTYLDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAG
       ::: :::..:: ::::::::.:::::::: :::::::::::.::::.:: .::::: ..:
CCDS31 VENTCKKFANPSRYRMECPEVDCEEGWALAKCGGKNYERAKTCFEKALEGNPENPEFNTG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YAISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEAEGEKYI
       :::..:::: :. :.  .: :::  :..:::::::. ::.::::::::::::::::::::
CCDS31 YAITVYRLDKFNTASGRNKAFSLHVLKRAVRLNPDDVYIRVLLALKLQDEGQEAEGEKYI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYKAQMI
       ::::...:::.:::.:::::::::::::::::::: ::. ::::..::::.::::.::::
CCDS31 EEALTSISSQAYVFQYAAKFYRRKGSVDKALELLKMALETTPTSAFLHHQMGLCYRAQMI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 QIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAGNHRKAE
       ::::::. :::::.:: .:.... :: .::...  : :::.:..:::. : : :.:::::
CCDS31 QIKEATNWQPRGQDRETVDRLVQLAICKFEKTIMLKRTFEMAYVDLAETYAEIGHHRKAE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTRDKSIN
       :.::: : ::   ..  :.::.::::::: . ::. .:: ::::..:::. : .:.: .:
CCDS31 EHFQKGLRMKIFEDQLKQEIHYHYGRFQEHHGKSQDKAITHYLKGLKIEKMSHSREKLLN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470        
pF1KB5 SLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVRQGP
       .:.::. : .....  .::.::::...::.:....::  ::::::::::.        
CCDS31 ALEKLAKRCIHQNVRVVESVSLLGLIHKLKGEVSDALLCYERALRLAADLNPIF    
              430       440       450       460       470        

>>CCDS7403.1 IFIT5 gene_id:24138|Hs108|chr10              (482 aa)
 initn: 1800 init1: 1016 opt: 1765  Z-score: 1975.5  bits: 374.9 E(32554): 1e-103
Smith-Waterman score: 1765; 57.3% identity (82.1% similar) in 464 aa overlap (10-473:9-469)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSTNGDDHQVKDSLEQLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAY
                .:  : .:.:::::.:  .: .. ..:. . .:.::: ::  ....:::::
CCDS74  MSEIRKDTLKAILLELECHFTWNLLKEDIDLFEVEDTIGQQLEFLTTKSRLALYNLLAY
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDK
       ::::::::..::. :..::...:.::... .:::::::::.::.:::: .: ::: :  :
CCDS74 VKHLKGQNKDALECLEQAEEIIQQEHSDKEEVRSLVTWGNYAWVYYHMDQLEEAQKYTGK
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAG
       . :.:::::.:  :..:::: :::.:::::: ::: :..::: :::.:::.:.::: . :
CCDS74 IGNVCKKLSSPSNYKLECPETDCEKGWALLKFGGKYYQKAKAAFEKALEVEPDNPEFNIG
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YAISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEAEGEKYI
       :::..::::  .    . : ::: :::.:: :::::.::::.:::::::   ::::::::
CCDS74 YAITVYRLDD-SDREGSVKSFSLGPLRKAVTLNPDNSYIKVFLALKLQDVHAEAEGEKYI
     180        190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYKAQMI
       :: : ..::: ::.::::::::::.: .::::::::::. :::: .::::.::::.::::
CCDS74 EEILDQISSQPYVLRYAAKFYRRKNSWNKALELLKKALEVTPTSSFLHHQMGLCYRAQMI
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KB5 QIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAGNHRKAE
       :::.::...:.:... :.:..: ::::::..:.:.   :  :. ::: :: :.:.. .::
CCDS74 QIKKATHNRPKGKDKLKVDELISSAIFHFKAAMERDSMFAFAYTDLANMYAEGGQYSNAE
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KB5 ENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTRDKSIN
       . :.: : .. ....  ..::.::::::::..::. .:: :::.:.:... :  : :  .
CCDS74 DIFRKALRLENITDDHKHQIHYHYGRFQEFHRKSENTAIHHYLEALKVKDRSPLRTKLTS
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KB5 SLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVRQGP  
       .::::  ..: ..:::..::: :::::::::.  .: ::::.: ..  : ::.       
CCDS74 ALKKLSTKRLCHNALDVQSLSALGFVYKLEGEKRQAAEYYEKAQKI--DPENAEFLTALC
      420       430       440       450       460         470      

CCDS74 ELRLSI
        480  

>>CCDS41548.1 IFIT2 gene_id:3433|Hs108|chr10              (472 aa)
 initn: 941 init1: 512 opt: 1348  Z-score: 1509.8  bits: 288.7 E(32554): 8.9e-78
Smith-Waterman score: 1348; 46.5% identity (76.3% similar) in 469 aa overlap (1-464:1-457)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSTNGDDHQVKDSLEQLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHNLLAY
       :: : . .....::.::.:::::.:   .. . :.:..:. . :: . .... . :::::
CCDS41 MSEN-NKNSLESSLRQLKCHFTWNLMEGENSLDDFEDKVFYRTEFQNREFKATMCNLLAY
                10        20        30        40        50         

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pF1KB5 VKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQTYLDK
       .:::::::: ::. :..::.:.:.:: .::..::::::::.::.:::::::...: :.::
CCDS41 LKHLKGQNEAALECLRKAEELIQQEHADQAEIRSLVTWGNYAWVYYHMGRLSDVQIYVDK
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pF1KB5 VENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPESSAG
       :...:.:.:.:  ::.: ::.::::::. :::::.. ::::.::::.::  :.::: ..:
CCDS41 VKHVCEKFSSP--YRIESPELDCEEGWTRLKCGGNQNERAKVCFEKALEKKPKNPEFTSG
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pF1KB5 YAISAYRLDGFKLATKNHKPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQ---DEGQE-AEG
        ::..::::..   ..:    .. :::::.:::::: :.::::::::.   .::.: .::
CCDS41 LAIASYRLDNWP-PSQN----AIDPLRQAIRLNPDNQYLKVLLALKLHKMREEGEEEGEG
       180        190           200       210       220       230  

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pF1KB5 EKYIEEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLCYK
       :: .:::: .  . : :.: ::::::::   :::.:::::::.  :... :: ::: ::.
CCDS41 EKLVEEALEKAPGVTDVLRSAAKFYRRKDEPDKAIELLKKALEYIPNNAYLHCQIGCCYR
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KB5 AQMIQIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPT-FEVAHLDLARMYIEAGN
       :...:. .  ..   :  ..:: ..:  :. :...: : . . :.:  . :: ..  : .
CCDS41 AKVFQVMNLRENGMYG--KRKLLELIGHAVAHLKKADEANDNLFRVCSI-LASLHALADQ
            300         310       320       330        340         

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB5 HRKAEENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLTR
       .. ::  ::: .  : ..  . : .:..:: :: .: : . .:: :.....::.: :  .
CCDS41 YEDAEYYFQKEFS-KELTPVAKQLLHLRYGNFQLYQMKCEDKAIHHFIEGVKINQKSREK
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pF1KB5 DKSINSLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERALRLAADFENSVR
       .:  ..:.:..  .: ... : :.: .:.:. .:. .:..: :  ::.:           
CCDS41 EKMKDKLQKIAKMRLSKNGADSEALHVLAFLQELNEKMQQADEDSERGLESGSLIPSASS
      410       420       430       440       450       460        

           
pF1KB5 QGP 
           
CCDS41 WNGE
      470  

>>CCDS31241.1 IFIT3 gene_id:3437|Hs108|chr10              (490 aa)
 initn: 1028 init1: 527 opt: 740  Z-score: 830.3  bits: 163.1 E(32554): 6.3e-40
Smith-Waterman score: 1225; 44.6% identity (73.0% similar) in 471 aa overlap (11-474:6-453)

               10            20        30        40        50      
pF1KB5 MSTNGDDHQVKDSLE----QLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHN
                 :.:::    ::.:::::.:  .:.   :::.:: .:::::.:.... ..:
CCDS31      MSEVTKNSLEKILPQLKCHFTWNLFKEDSVSRDLEDRVCNQIEFLNTEFKATMYN
                    10        20        30        40        50     

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pF1KB5 LLAYVKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQT
       ::::.::: :.:: ::. :..::.:.:.:: .::..::::::::.::.:::.:::..:: 
CCDS31 LLAYIKHLDGNNEAALECLRQAEELIQQEHADQAEIRSLVTWGNYAWVYYHLGRLSDAQI
          60        70        80        90       100       110     

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pF1KB5 YLDKVENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPE
       :.:::.. :::.:::  : .:  :.::::::. :::: .: ::::.::::.::  :.:::
CCDS31 YVDKVKQTCKKFSNP--YSIEYSELDCEEGWTQLKCG-RN-ERAKVCFEKALEEKPNNPE
         120       130         140       150         160       170 

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pF1KB5 SSAGYAISAYRLDGFKLATKNH--KPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEA
        :.: ::. :.::       ::  : ::   :.::..:.::: :.::::.::::  ..::
CCDS31 FSSGLAIAMYHLD-------NHPEKQFSTDVLKQAIELSPDNQYVKVLLGLKLQKMNKEA
             180              190       200       210       220    

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 EGEKYIEEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLC
       :::...:::: .   :: :.: :::::::::..:::.::....:. ::..  :.:::: :
CCDS31 EGEQFVEEALEKSPCQTDVLRSAAKFYRRKGDLDKAIELFQRVLESTPNNGYLYHQIGCC
          230       240       250       260       270       280    

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 YKAQMIQIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAG
       :::.. :.... ...  : :.: .. . . :. . ..:.::  .   :. :::. ..:. 
CCDS31 YKAKVRQMQNTGESEASG-NKEMIEALKQYAMDYSNKALEKGLNPLNAYSDLAE-FLET-
          290       300        310       320       330        340  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 NHRKAEENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLT
             : .:  .  : : .   :. : .:  .:... ::. .:. : :....: . :  
CCDS31 ------ECYQTPFN-KEVPDAEKQQSHQRYCNLQKYNGKSEDTAVQHGLEGLSISKKSTD
                    350       360       370       380       390    

          420       430       440       450       460        470   
pF1KB5 RDKSINSLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERAL-RLAADFENS
       ...  .. ...    : ..: .   :.  :...: .:.. .: . ::. : ::  :  ..
CCDS31 KEEIKDQPQNVSENLLPQNAPNYWYLQ--GLIHKQNGDLLQAAKCYEKELGRLLRDAPSG
          400       410       420         430       440       450  

                                             
pF1KB5 VRQGP                                 
       .                                     
CCDS31 IGSIFLSASELEDGSEEMGQGAVSSSPRELLSNSEQLN
            460       470       480       490

>>CCDS7402.1 IFIT3 gene_id:3437|Hs108|chr10               (490 aa)
 initn: 1028 init1: 527 opt: 740  Z-score: 830.3  bits: 163.1 E(32554): 6.3e-40
Smith-Waterman score: 1225; 44.6% identity (73.0% similar) in 471 aa overlap (11-474:6-453)

               10            20        30        40        50      
pF1KB5 MSTNGDDHQVKDSLE----QLRCHFTWELSIDDDEMPDLENRVLDQIEFLDTKYSVGIHN
                 :.:::    ::.:::::.:  .:.   :::.:: .:::::.:.... ..:
CCDS74      MSEVTKNSLEKILPQLKCHFTWNLFKEDSVSRDLEDRVCNQIEFLNTEFKATMYN
                    10        20        30        40        50     

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB5 LLAYVKHLKGQNEEALKSLKEAENLMQEEHDNQANVRSLVTWGNFAWMYYHMGRLAEAQT
       ::::.::: :.:: ::. :..::.:.:.:: .::..::::::::.::.:::.:::..:: 
CCDS74 LLAYIKHLDGNNEAALECLRQAEELIQQEHADQAEIRSLVTWGNYAWVYYHLGRLSDAQI
          60        70        80        90       100       110     

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pF1KB5 YLDKVENICKKLSNPFRYRMECPEIDCEEGWALLKCGGKNYERAKACFEKVLEVDPENPE
       :.:::.. :::.:::  : .:  :.::::::. :::: .: ::::.::::.::  :.:::
CCDS74 YVDKVKQTCKKFSNP--YSIEYSELDCEEGWTQLKCG-RN-ERAKVCFEKALEEKPNNPE
         120       130         140       150         160       170 

        180       190         200       210       220       230    
pF1KB5 SSAGYAISAYRLDGFKLATKNH--KPFSLLPLRQAVRLNPDNGYIKVLLALKLQDEGQEA
        :.: ::. :.::       ::  : ::   :.::..:.::: :.::::.::::  ..::
CCDS74 FSSGLAIAMYHLD-------NHPEKQFSTDVLKQAIELSPDNQYVKVLLGLKLQKMNKEA
             180              190       200       210       220    

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pF1KB5 EGEKYIEEALANMSSQTYVFRYAAKFYRRKGSVDKALELLKKALQETPTSVLLHHQIGLC
       :::...:::: .   :: :.: :::::::::..:::.::....:. ::..  :.:::: :
CCDS74 EGEQFVEEALEKSPCQTDVLRSAAKFYRRKGDLDKAIELFQRVLESTPNNGYLYHQIGCC
          230       240       250       260       270       280    

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 YKAQMIQIKEATKGQPRGQNREKLDKMIRSAIFHFESAVEKKPTFEVAHLDLARMYIEAG
       :::.. :.... ...  : :.: .. . . :. . ..:.::  .   :. :::. ..:. 
CCDS74 YKAKVRQMQNTGESEASG-NKEMIEALKQYAMDYSNKALEKGLNPLNAYSDLAE-FLET-
          290       300        310       320       330        340  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 NHRKAEENFQKLLCMKPVVEETMQDIHFHYGRFQEFQKKSDVNAIIHYLKAIKIEQASLT
             : .:  .  : : .   :. : .:  .:... ::. .:. : :....: . :  
CCDS74 ------ECYQTPFN-KEVPDAEKQQSHQRYCNLQKYNGKSEDTAVQHGLEGLSISKKSTD
                    350       360       370       380       390    

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pF1KB5 RDKSINSLKKLVLRKLRRKALDLESLSLLGFVYKLEGNMNEALEYYERAL-RLAADFENS
       ...  .. ...    : ..: .   :.  :...: .:.. .: . ::. : ::  :  ..
CCDS74 KEEIKDQPQNVSENLLPQNAPNYWYLQ--GLIHKQNGDLLQAAKCYEKELGRLLRDAPSG
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pF1KB5 VRQGP                                 
       .                                     
CCDS74 IGSIFLSASELEDGSEEMGQGAVSSSPRELLSNSEQLN
            460       470       480       490




478 residues in 1 query   sequences
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